MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae NTUH-K2044 plasmid pK2044

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006625	CGGTA	2	10	3770	3779	20 %	20 %	40 %	20 %	168998572
2	NC_006625	TAACA	2	10	4989	4998	60 %	20 %	0 %	20 %	168998573
3	NC_006625	GATCA	2	10	5249	5258	40 %	20 %	20 %	20 %	168998574
4	NC_006625	GCAAA	2	10	5291	5300	60 %	0 %	20 %	20 %	168998574
5	NC_006625	CCTTA	2	10	9676	9685	20 %	40 %	0 %	40 %	168998581
6	NC_006625	TCCTT	2	10	13468	13477	0 %	60 %	0 %	40 %	168998585
7	NC_006625	ACTCC	2	10	14689	14698	20 %	20 %	0 %	60 %	168998586
8	NC_006625	GTCAA	2	10	16294	16303	40 %	20 %	20 %	20 %	168998587
9	NC_006625	GCGCC	2	10	16334	16343	0 %	0 %	40 %	60 %	168998587
10	NC_006625	CAGCC	2	10	18045	18054	20 %	0 %	20 %	60 %	168998588
11	NC_006625	CCACG	2	10	19341	19350	20 %	0 %	20 %	60 %	168998588
12	NC_006625	CCGTC	2	10	20285	20294	0 %	20 %	20 %	60 %	168998588
13	NC_006625	TCCTT	2	10	23538	23547	0 %	60 %	0 %	40 %	168998591
14	NC_006625	TCAGT	2	10	26083	26092	20 %	40 %	20 %	20 %	168998594
15	NC_006625	GGTGC	2	10	27688	27697	0 %	20 %	60 %	20 %	168998595
16	NC_006625	GTACA	2	10	28645	28654	40 %	20 %	20 %	20 %	168998595
17	NC_006625	TCCAG	2	10	29057	29066	20 %	20 %	20 %	40 %	168998595
18	NC_006625	ACCAG	2	10	37359	37368	40 %	0 %	20 %	40 %	168998610
19	NC_006625	ACCGA	2	10	37602	37611	40 %	0 %	20 %	40 %	168998610
20	NC_006625	CAACG	2	10	39454	39463	40 %	0 %	20 %	40 %	168998615
21	NC_006625	CACTG	2	10	39715	39724	20 %	20 %	20 %	40 %	168998615
22	NC_006625	TCACG	2	10	41193	41202	20 %	20 %	20 %	40 %	168998616
23	NC_006625	TTTGG	2	10	41684	41693	0 %	60 %	40 %	0 %	168998616
24	NC_006625	ATTTG	2	10	43584	43593	20 %	60 %	20 %	0 %	168998618
25	NC_006625	GGACA	2	10	45825	45834	40 %	0 %	40 %	20 %	168998620
26	NC_006625	GGCCG	2	10	46172	46181	0 %	0 %	60 %	40 %	168998621
27	NC_006625	GCAGG	2	10	46777	46786	20 %	0 %	60 %	20 %	168998624
28	NC_006625	TGGAA	2	10	50722	50731	40 %	20 %	40 %	0 %	168998627
29	NC_006625	AGCAA	2	10	53561	53570	60 %	0 %	20 %	20 %	168998630
30	NC_006625	ATTTT	2	10	56278	56287	20 %	80 %	0 %	0 %	168998634
31	NC_006625	CGTAT	2	10	60969	60978	20 %	40 %	20 %	20 %	168998639
32	NC_006625	TCGAT	2	10	62051	62060	20 %	40 %	20 %	20 %	168998640
33	NC_006625	TTCCT	2	10	62347	62356	0 %	60 %	0 %	40 %	168998640
34	NC_006625	CAGTC	2	10	62614	62623	20 %	20 %	20 %	40 %	168998641
35	NC_006625	CTTGT	2	10	63856	63865	0 %	60 %	20 %	20 %	168998642
36	NC_006625	GCGGT	2	10	64591	64600	0 %	20 %	60 %	20 %	168998642
37	NC_006625	TGAAG	2	10	70369	70378	40 %	20 %	40 %	0 %	168998652
38	NC_006625	ATAGC	2	10	70679	70688	40 %	20 %	20 %	20 %	168998652
39	NC_006625	ATAAG	2	10	71222	71231	60 %	20 %	20 %	0 %	168998653
40	NC_006625	ATGTT	2	10	71265	71274	20 %	60 %	20 %	0 %	168998653
41	NC_006625	GTTTT	2	10	72154	72163	0 %	80 %	20 %	0 %	168998655
42	NC_006625	GACTG	2	10	72566	72575	20 %	20 %	40 %	20 %	168998655
43	NC_006625	CTTCT	2	10	75806	75815	0 %	60 %	0 %	40 %	168998663
44	NC_006625	GATCA	2	10	76585	76594	40 %	20 %	20 %	20 %	168998665
45	NC_006625	GCAAA	2	10	76627	76636	60 %	0 %	20 %	20 %	168998665
46	NC_006625	CGTCT	2	10	78443	78452	0 %	40 %	20 %	40 %	168998667
47	NC_006625	CGATG	2	10	80140	80149	20 %	20 %	40 %	20 %	168998667
48	NC_006625	CAGCG	2	10	83645	83654	20 %	0 %	40 %	40 %	168998670
49	NC_006625	AGACC	2	10	87126	87135	40 %	0 %	20 %	40 %	168998673
50	NC_006625	CATCG	2	10	87433	87442	20 %	20 %	20 %	40 %	168998673
51	NC_006625	TTCCC	2	10	88519	88528	0 %	40 %	0 %	60 %	168998675
52	NC_006625	AGTTA	2	10	88650	88659	40 %	40 %	20 %	0 %	168998675
53	NC_006625	GGTCA	2	10	92319	92328	20 %	20 %	40 %	20 %	168998678
54	NC_006625	CGTAT	2	10	93660	93669	20 %	40 %	20 %	20 %	168998681
55	NC_006625	ACGCA	2	10	94476	94485	40 %	0 %	20 %	40 %	168998683
56	NC_006625	GACAG	2	10	96504	96513	40 %	0 %	40 %	20 %	168998683
57	NC_006625	ATTCG	2	10	97025	97034	20 %	40 %	20 %	20 %	168998684
58	NC_006625	CGTCG	2	10	98609	98618	0 %	20 %	40 %	40 %	168998685
59	NC_006625	CTGTC	2	10	98740	98749	0 %	40 %	20 %	40 %	168998685
60	NC_006625	AGCTC	2	10	105049	105058	20 %	20 %	20 %	40 %	168998690
61	NC_006625	TTATC	2	10	106175	106184	20 %	60 %	0 %	20 %	168998690
62	NC_006625	AATCC	2	10	107219	107228	40 %	20 %	0 %	40 %	168998692
63	NC_006625	TGATA	2	10	107946	107955	40 %	40 %	20 %	0 %	168998693
64	NC_006625	ACCCA	2	10	108468	108477	40 %	0 %	0 %	60 %	168998693
65	NC_006625	TGGAA	2	10	111049	111058	40 %	20 %	40 %	0 %	168998695
66	NC_006625	GCAGC	2	10	112090	112099	20 %	0 %	40 %	40 %	168998697
67	NC_006625	AACCA	2	10	115980	115989	60 %	0 %	0 %	40 %	168998699
68	NC_006625	AAATT	2	10	116018	116027	60 %	40 %	0 %	0 %	168998699
69	NC_006625	TGGAC	2	10	117196	117205	20 %	20 %	40 %	20 %	168998702
70	NC_006625	GGCGA	2	10	117288	117297	20 %	0 %	60 %	20 %	168998702
71	NC_006625	CGAGT	2	10	120353	120362	20 %	20 %	40 %	20 %	168998706
72	NC_006625	ACCTG	2	10	121635	121644	20 %	20 %	20 %	40 %	168998709
73	NC_006625	GATCT	2	10	123882	123891	20 %	40 %	20 %	20 %	168998713
74	NC_006625	GCAGA	2	10	124313	124322	40 %	0 %	40 %	20 %	168998714
75	NC_006625	ATGAC	2	10	125008	125017	40 %	20 %	20 %	20 %	168998715
76	NC_006625	GACTG	2	10	125433	125442	20 %	20 %	40 %	20 %	168998717
77	NC_006625	CTTCT	2	10	128235	128244	0 %	60 %	0 %	40 %	168998720
78	NC_006625	TTGTC	2	10	129086	129095	0 %	60 %	20 %	20 %	168998720
79	NC_006625	CGCTG	2	10	134436	134445	0 %	20 %	40 %	40 %	168998728
80	NC_006625	GCCGG	2	10	134983	134992	0 %	0 %	60 %	40 %	168998728
81	NC_006625	GCTCT	2	10	135091	135100	0 %	40 %	20 %	40 %	168998728
82	NC_006625	GCAAA	2	10	135606	135615	60 %	0 %	20 %	20 %	168998728
83	NC_006625	ATGGA	2	10	136766	136775	40 %	20 %	40 %	0 %	168998730
84	NC_006625	TGCAA	2	10	138853	138862	40 %	20 %	20 %	20 %	168998733
85	NC_006625	AAAGA	2	10	141406	141415	80 %	0 %	20 %	0 %	168998738
86	NC_006625	TGTCC	2	10	142150	142159	0 %	40 %	20 %	40 %	168998740
87	NC_006625	ACCCA	2	10	142643	142652	40 %	0 %	0 %	60 %	168998740
88	NC_006625	CAGAC	2	10	142979	142988	40 %	0 %	20 %	40 %	168998740
89	NC_006625	TAAAT	2	10	143399	143408	60 %	40 %	0 %	0 %	168998742
90	NC_006625	ATGAC	2	10	147614	147623	40 %	20 %	20 %	20 %	168998745
91	NC_006625	AGCGC	2	10	151264	151273	20 %	0 %	40 %	40 %	168998750
92	NC_006625	AGCCG	2	10	152506	152515	20 %	0 %	40 %	40 %	168998751
93	NC_006625	GCACG	2	10	154218	154227	20 %	0 %	40 %	40 %	168998753
94	NC_006625	GGCCT	2	10	159926	159935	0 %	20 %	40 %	40 %	168998760
95	NC_006625	CGAAG	2	10	160629	160638	40 %	0 %	40 %	20 %	168998761
96	NC_006625	ACGCA	2	10	161424	161433	40 %	0 %	20 %	40 %	168998763
97	NC_006625	GCTCA	2	10	161777	161786	20 %	20 %	20 %	40 %	168998764
98	NC_006625	ACTTT	2	10	165267	165276	20 %	60 %	0 %	20 %	168998768
99	NC_006625	GCGCC	2	10	168067	168076	0 %	0 %	40 %	60 %	168998770
100	NC_006625	TTCAT	2	10	170117	170126	20 %	60 %	0 %	20 %	168998773
101	NC_006625	AAGAT	2	10	173601	173610	60 %	20 %	20 %	0 %	168998776
102	NC_006625	GTTCA	2	10	174121	174130	20 %	40 %	20 %	20 %	168998777
103	NC_006625	CCTGA	2	10	175855	175864	20 %	20 %	20 %	40 %	168998779
104	NC_006625	ATGAT	2	10	177056	177065	40 %	40 %	20 %	0 %	168998780
105	NC_006625	CTGGG	2	10	181187	181196	0 %	20 %	60 %	20 %	168998786
106	NC_006625	CTGTC	2	10	182490	182499	0 %	40 %	20 %	40 %	168998787
107	NC_006625	GATCA	2	10	184445	184454	40 %	20 %	20 %	20 %	168998789
108	NC_006625	GCAAA	2	10	184487	184496	60 %	0 %	20 %	20 %	168998789
109	NC_006625	CGCTG	2	10	184743	184752	0 %	20 %	40 %	40 %	168998789
110	NC_006625	GAAGC	2	10	185632	185641	40 %	0 %	40 %	20 %	168998791
111	NC_006625	TAACG	2	10	188429	188438	40 %	20 %	20 %	20 %	168998794
112	NC_006625	TTTGA	2	10	188808	188817	20 %	60 %	20 %	0 %	168998794
113	NC_006625	ACAGC	2	10	193995	194004	40 %	0 %	20 %	40 %	168998798
114	NC_006625	TTCTT	2	10	194005	194014	0 %	80 %	0 %	20 %	168998798
115	NC_006625	AAAAC	2	10	194182	194191	80 %	0 %	0 %	20 %	168998798
116	NC_006625	TTTCG	2	10	194885	194894	0 %	60 %	20 %	20 %	168998799
117	NC_006625	GGGCT	2	10	195812	195821	0 %	20 %	60 %	20 %	168998801
118	NC_006625	ACAGA	2	10	195824	195833	60 %	0 %	20 %	20 %	168998801
119	NC_006625	CGCAG	2	10	201597	201606	20 %	0 %	40 %	40 %	168998807
120	NC_006625	CGTCC	2	10	202461	202470	0 %	20 %	20 %	60 %	168998810
121	NC_006625	TTTCC	2	10	203197	203206	0 %	60 %	0 %	40 %	168998812
122	NC_006625	GTTCT	2	10	203320	203329	0 %	60 %	20 %	20 %	168998812
123	NC_006625	AGAAA	2	10	204309	204318	80 %	0 %	20 %	0 %	168998813
124	NC_006625	CAGCG	2	10	207400	207409	20 %	0 %	40 %	40 %	168998817
125	NC_006625	ATTCT	2	10	208111	208120	20 %	60 %	0 %	20 %	168998818
126	NC_006625	CCAGC	2	10	210246	210255	20 %	0 %	20 %	60 %	168998822
127	NC_006625	CGCAG	2	10	214775	214784	20 %	0 %	40 %	40 %	168998824
128	NC_006625	TGCGG	2	10	215751	215760	0 %	20 %	60 %	20 %	168998825
129	NC_006625	GGGAA	2	10	218211	218220	40 %	0 %	60 %	0 %	168998827
130	NC_006625	GTGGC	2	10	218555	218564	0 %	20 %	60 %	20 %	168998827
131	NC_006625	TGTGG	2	10	219845	219854	0 %	40 %	60 %	0 %	168998829
132	NC_006625	TTGGC	2	10	220890	220899	0 %	40 %	40 %	20 %	168998831
133	NC_006625	AGTGA	2	10	221421	221430	40 %	20 %	40 %	0 %	168998832
134	NC_006625	CCAAT	2	10	222498	222507	40 %	20 %	0 %	40 %	168998835
135	NC_006625	ATTTT	2	10	223140	223149	20 %	80 %	0 %	0 %	168998836

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.