MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus clausii KSM-K16

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006582	TAAATA	2	12	17202	17213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006582	CAGCGC	2	12	112821	112832	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006582	TTTTTG	2	12	142398	142409	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006582	AGTCAA	2	12	149025	149036	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_006582	ATGCAT	2	12	166528	166539	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_006582	ATAAGC	2	12	232404	232415	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_006582	TGGCAA	2	12	263232	263243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_006582	TTGCTT	2	12	307968	307979	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_006582	ATTTAC	2	12	373333	373344	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_006582	TTTTTC	2	12	433825	433836	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_006582	TTTGTT	2	12	467285	467296	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006582	TAAAGA	2	12	485754	485765	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006582	GAAAAA	2	12	501512	501523	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006582	AAAAGG	2	12	511984	511995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006582	CAATAC	2	12	513571	513582	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006582	AATGAG	2	12	514567	514578	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006582	TGTTTA	2	12	540584	540595	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006582	ATTTGA	2	12	541881	541892	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006582	GAGAAG	2	12	545929	545940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006582	GAATAG	2	12	546802	546813	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006582	AAACGG	2	12	566100	566111	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_006582	AAGGAG	2	12	569053	569064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006582	CTGAAA	2	12	581349	581360	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_006582	TTTTTG	2	12	588252	588263	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006582	GTAGTG	2	12	664245	664256	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006582	GAAAAG	2	12	664505	664516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006582	GGAAGA	2	12	705877	705888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006582	AAAGTT	2	12	772563	772574	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006582	GAAAAG	2	12	811022	811033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006582	GACAAA	2	12	834751	834762	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_006582	AATACG	2	12	906582	906593	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_006582	GCTGTT	2	12	932131	932142	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_006582	CAAAAC	2	12	951291	951302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006582	AAACGG	2	12	951517	951528	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_006582	TGAATG	2	12	977839	977850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006582	CGAGTA	2	12	978243	978254	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_006582	GTCCGC	2	12	1007649	1007660	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006582	ATTGTT	2	12	1041028	1041039	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006582	TTTTAT	2	12	1068853	1068864	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006582	CGCTAA	2	12	1092706	1092717	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006582	AAAACC	2	12	1098364	1098375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006582	ATGAAA	2	12	1099825	1099836	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006582	AGGTTA	2	12	1113330	1113341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006582	ATCACA	2	12	1115481	1115492	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006582	GTTTTC	2	12	1136350	1136361	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_006582	TGAGTA	2	12	1145900	1145911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006582	AATTAA	2	12	1153033	1153044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006582	GATGCC	2	12	1170016	1170027	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006582	GCTCTT	2	12	1172091	1172102	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006582	AATGAT	2	12	1175589	1175600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006582	CTTTTT	2	12	1203047	1203058	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_006582	GCTCTT	2	12	1221857	1221868	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006582	TAGTTG	2	12	1306731	1306742	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006582	GCTGTT	2	12	1326425	1326436	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_006582	TTGAAT	2	12	1391094	1391105	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006582	AAAAGA	2	12	1414401	1414412	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006582	ACAAAA	2	12	1447090	1447101	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_006582	GTTTAA	2	12	1478461	1478472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006582	TACTGA	2	12	1493125	1493136	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_006582	CTATCT	2	12	1507671	1507682	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006582	GCTGCA	2	12	1510054	1510065	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006582	AACCAA	2	12	1515844	1515855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006582	TCTTTG	2	12	1529510	1529521	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_006582	TAATGT	2	12	1535728	1535739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006582	ATGAAG	2	12	1541106	1541117	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006582	ATAATT	2	12	1543549	1543560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006582	AGGGAA	2	12	1568722	1568733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006582	CTCTTG	2	12	1594414	1594425	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006582	GTTTGT	2	12	1641369	1641380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006582	GCGCTT	2	12	1664337	1664348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006582	TTTTTG	2	12	1779844	1779855	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006582	GGCTTT	2	12	1790075	1790086	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_006582	GACATG	2	12	1798692	1798703	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_006582	CTTATT	2	12	1816635	1816646	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_006582	ATTTTT	2	12	1816701	1816712	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006582	AGCGAG	2	12	1848447	1848458	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_006582	ATTCAA	2	12	1852131	1852142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_006582	CTTTTG	2	12	1860894	1860905	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_006582	TTCCAT	2	12	1871788	1871799	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006582	AAAGGA	2	12	1873281	1873292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006582	TCTATG	2	12	1900711	1900722	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_006582	GAAAAA	2	12	1922444	1922455	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006582	TTGAGT	2	12	2011568	2011579	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006582	AATCGA	2	12	2021294	2021305	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_006582	TCATTA	2	12	2035472	2035483	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_006582	TGCTCG	2	12	2071641	2071652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006582	GCCAAC	2	12	2077209	2077220	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_006582	ACGGAG	2	12	2079777	2079788	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_006582	ACGAAT	2	12	2103306	2103317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_006582	TATTGA	2	12	2145831	2145842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006582	ACAAAG	2	12	2180577	2180588	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_006582	AGCTAT	2	12	2196563	2196574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_006582	TTTGTT	2	12	2202541	2202552	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006582	ATACAA	2	12	2205060	2205071	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_006582	AATGTC	2	12	2211337	2211348	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_006582	TGTTTT	2	12	2213865	2213876	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006582	CGTTGC	2	12	2223547	2223558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006582	TCCTTC	2	12	2263177	2263188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_006582	CACGAA	2	12	2265362	2265373	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006582	GCTTTC	2	12	2268259	2268270	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006582	GAAAAA	2	12	2282345	2282356	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006582	CATTTT	2	12	2290001	2290012	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_006582	AGGCAA	2	12	2291641	2291652	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_006582	AAAACA	2	12	2314711	2314722	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_006582	CATTTC	2	12	2428464	2428475	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006582	AAAAAC	2	12	2473342	2473353	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_006582	ACAATA	2	12	2526830	2526841	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_006582	TATAAC	2	12	2571258	2571269	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_006582	TGTTTT	2	12	2632791	2632802	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006582	ATTTAT	2	12	2677132	2677143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006582	AATAAA	2	12	2681499	2681510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006582	TATTTT	2	12	2681519	2681530	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006582	ATGAAA	2	12	2702650	2702661	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006582	AAACTG	2	12	2794609	2794620	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_006582	CAATTT	2	12	2838420	2838431	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_006582	CCTATG	2	12	2866034	2866045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006582	CTCTCA	2	12	2896131	2896142	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_006582	GACGAA	2	12	2930754	2930765	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_006582	ATTTTT	2	12	2941290	2941301	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006582	TTATAC	2	12	2975307	2975318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_006582	AATCAA	2	12	2978290	2978301	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_006582	TTTTAT	2	12	2995642	2995653	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006582	GTTCCC	2	12	3004029	3004040	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_006582	GCAAAG	2	12	3011373	3011384	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_006582	TTGCCT	2	12	3015848	3015859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006582	ATGTGA	2	12	3058506	3058517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006582	CCCTTT	2	12	3075671	3075682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_006582	ATCATT	2	12	3088492	3088503	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_006582	CATTTT	2	12	3092376	3092387	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_006582	TACTTA	2	12	3151479	3151490	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_006582	CATTTA	2	12	3210446	3210457	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_006582	TTGCTT	2	12	3323082	3323093	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_006582	CCTCTT	2	12	3372223	3372234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_006582	CGTTAA	2	12	3388539	3388550	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_006582	AAAAAT	2	12	3395530	3395541	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006582	ATCGCC	2	12	3416531	3416542	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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139	NC_006582	GAAGGA	2	12	3457329	3457340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006582	AGGTTA	2	12	3458730	3458741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_006582	TAAGCA	2	12	3686235	3686246	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.