MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus clausii KSM-K16

Total Repeats: 3001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006582	TGCAT	2	10	896	905	20 %	40 %	20 %	20 %	56961783
2	NC_006582	ACGAA	2	10	3978	3987	60 %	0 %	20 %	20 %	56961786
3	NC_006582	GGTAA	2	10	11936	11945	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006582	TCGTG	2	10	12754	12763	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006582	GAGAA	2	10	15232	15241	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006582	ATAAA	2	10	18052	18061	80 %	20 %	0 %	0 %	56961792
7	NC_006582	TAAAG	2	10	18644	18653	60 %	20 %	20 %	0 %	56961793
8	NC_006582	CTGAC	2	10	19195	19204	20 %	20 %	20 %	40 %	56961793
9	NC_006582	GGAAC	2	10	20890	20899	40 %	0 %	40 %	20 %	56961794
10	NC_006582	ACGAA	2	10	25279	25288	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_006582	AAAGG	2	10	26565	26574	60 %	0 %	40 %	0 %	56961798
12	NC_006582	TCGAT	2	10	26740	26749	20 %	40 %	20 %	20 %	56961798
13	NC_006582	CTTCA	2	10	29382	29391	20 %	40 %	0 %	40 %	56961800
14	NC_006582	GAAGA	2	10	33633	33642	60 %	0 %	40 %	0 %	56961804
15	NC_006582	GACCG	2	10	35538	35547	20 %	0 %	40 %	40 %	56961806
16	NC_006582	ACAGA	2	10	36888	36897	60 %	0 %	20 %	20 %	56961806
17	NC_006582	GGCGG	2	10	37852	37861	0 %	0 %	80 %	20 %	56961808
18	NC_006582	ATCGA	2	10	38176	38185	40 %	20 %	20 %	20 %	56961808
19	NC_006582	ACGGA	2	10	39214	39223	40 %	0 %	40 %	20 %	56961809
20	NC_006582	ACATC	2	10	39391	39400	40 %	20 %	0 %	40 %	56961810
21	NC_006582	GCCAA	2	10	42561	42570	40 %	0 %	20 %	40 %	56961813
22	NC_006582	GAAAC	2	10	43604	43613	60 %	0 %	20 %	20 %	56961814
23	NC_006582	ACCTT	2	10	46926	46935	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_006582	TTTTA	2	10	47338	47347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006582	GAAAT	2	10	49881	49890	60 %	20 %	20 %	0 %	56961819
26	NC_006582	AAATG	2	10	50312	50321	60 %	20 %	20 %	0 %	56961819
27	NC_006582	GGTAA	2	10	52625	52634	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006582	TCGTG	2	10	53443	53452	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_006582	GAGAA	2	10	56045	56054	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006582	ATGTT	2	10	58005	58014	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006582	GTACA	2	10	61198	61207	40 %	20 %	20 %	20 %	56961827
32	NC_006582	TTTAT	2	10	61840	61849	20 %	80 %	0 %	0 %	56961827
33	NC_006582	AGAGA	2	10	62528	62537	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006582	GTGTT	2	10	63637	63646	0 %	60 %	40 %	0 %	56961828
35	NC_006582	CTGCA	2	10	66964	66973	20 %	20 %	20 %	40 %	56961831
36	NC_006582	TTTTA	2	10	70724	70733	20 %	80 %	0 %	0 %	56961835
37	NC_006582	AAATG	2	10	74739	74748	60 %	20 %	20 %	0 %	56961841
38	NC_006582	GAAGT	2	10	75442	75451	40 %	20 %	40 %	0 %	56961842
39	NC_006582	CGCAA	2	10	76416	76425	40 %	0 %	20 %	40 %	56961842
40	NC_006582	ACCGT	2	10	78322	78331	20 %	20 %	20 %	40 %	56961843
41	NC_006582	AAAGA	2	10	79190	79199	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006582	ATGGC	2	10	84571	84580	20 %	20 %	40 %	20 %	56961848
43	NC_006582	TGATT	2	10	86960	86969	20 %	60 %	20 %	0 %	56961850
44	NC_006582	AACAA	2	10	87590	87599	80 %	0 %	0 %	20 %	56961850
45	NC_006582	AATGA	2	10	88153	88162	60 %	20 %	20 %	0 %	56961851
46	NC_006582	AGGCA	2	10	92122	92131	40 %	0 %	40 %	20 %	56961856
47	NC_006582	AGTCG	2	10	93183	93192	20 %	20 %	40 %	20 %	56961857
48	NC_006582	GAAGC	2	10	94228	94237	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_006582	TGTGC	2	10	94772	94781	0 %	40 %	40 %	20 %	56961860
50	NC_006582	TAAAA	2	10	96669	96678	80 %	20 %	0 %	0 %	56961861
51	NC_006582	AAAGG	2	10	97600	97609	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006582	ACTTG	2	10	97748	97757	20 %	40 %	20 %	20 %	56961863
53	NC_006582	TGAAT	2	10	98456	98465	40 %	40 %	20 %	0 %	56961864
54	NC_006582	GAAGA	2	10	98839	98848	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006582	AGCGC	2	10	99168	99177	20 %	0 %	40 %	40 %	56961865
56	NC_006582	TTATG	2	10	105883	105892	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006582	TAAAG	2	10	107502	107511	60 %	20 %	20 %	0 %	56961870
58	NC_006582	GCGGA	2	10	107805	107814	20 %	0 %	60 %	20 %	56961871
59	NC_006582	ACGGC	2	10	107944	107953	20 %	0 %	40 %	40 %	56961871
60	NC_006582	CTAAA	2	10	111691	111700	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_006582	GGCAT	2	10	112108	112117	20 %	20 %	40 %	20 %	56961876
62	NC_006582	ACTTA	2	10	113365	113374	40 %	40 %	0 %	20 %	56961877
63	NC_006582	TATTT	2	10	114102	114111	20 %	80 %	0 %	0 %	56961879
64	NC_006582	GCAAG	2	10	114985	114994	40 %	0 %	40 %	20 %	56961881
65	NC_006582	TAAGA	2	10	115831	115840	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006582	AGAAA	2	10	116477	116486	80 %	0 %	20 %	0 %	56961882
67	NC_006582	AAAAG	2	10	119027	119036	80 %	0 %	20 %	0 %	56961883
68	NC_006582	AATCA	2	10	119513	119522	60 %	20 %	0 %	20 %	56961883
69	NC_006582	TGGAA	2	10	121825	121834	40 %	20 %	40 %	0 %	56961886
70	NC_006582	CGTGC	2	10	122014	122023	0 %	20 %	40 %	40 %	56961886
71	NC_006582	TTTCA	2	10	122907	122916	20 %	60 %	0 %	20 %	56961886
72	NC_006582	CTTCA	2	10	123099	123108	20 %	40 %	0 %	40 %	56961886
73	NC_006582	CCGCT	2	10	123127	123136	0 %	20 %	20 %	60 %	56961886
74	NC_006582	TGATT	2	10	123379	123388	20 %	60 %	20 %	0 %	56961887
75	NC_006582	GTGAA	2	10	123462	123471	40 %	20 %	40 %	0 %	56961887
76	NC_006582	AGCAA	2	10	124289	124298	60 %	0 %	20 %	20 %	56961888
77	NC_006582	AATCC	2	10	125641	125650	40 %	20 %	0 %	40 %	56961888
78	NC_006582	AAAAC	2	10	127962	127971	80 %	0 %	0 %	20 %	56961891
79	NC_006582	GAGCT	2	10	128026	128035	20 %	20 %	40 %	20 %	56961891
80	NC_006582	AGCAG	2	10	130201	130210	40 %	0 %	40 %	20 %	56961892
81	NC_006582	ATCAC	2	10	131259	131268	40 %	20 %	0 %	40 %	56961894
82	NC_006582	AGGGC	2	10	131470	131479	20 %	0 %	60 %	20 %	56961894
83	NC_006582	AAAGG	2	10	134789	134798	60 %	0 %	40 %	0 %	56961899
84	NC_006582	AAAGA	2	10	135548	135557	80 %	0 %	20 %	0 %	56961899
85	NC_006582	CTGAT	2	10	136084	136093	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_006582	GGTAA	2	10	136666	136675	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006582	TCGTG	2	10	137484	137493	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_006582	GAGAA	2	10	140085	140094	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006582	GGTAA	2	10	143198	143207	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006582	TCGTG	2	10	144016	144025	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_006582	GAGAA	2	10	146494	146503	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006582	TGATT	2	10	149072	149081	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006582	AAATA	2	10	149326	149335	80 %	20 %	0 %	0 %	56961900
94	NC_006582	AAGAA	2	10	152450	152459	80 %	0 %	20 %	0 %	56961903
95	NC_006582	CTGAA	2	10	153253	153262	40 %	20 %	20 %	20 %	56961903
96	NC_006582	GAAAA	2	10	153595	153604	80 %	0 %	20 %	0 %	56961903
97	NC_006582	ATCAG	2	10	154285	154294	40 %	20 %	20 %	20 %	56961904
98	NC_006582	TGAAA	2	10	154654	154663	60 %	20 %	20 %	0 %	56961904
99	NC_006582	GTGAT	2	10	155789	155798	20 %	40 %	40 %	0 %	56961905
100	NC_006582	GGCGA	2	10	156232	156241	20 %	0 %	60 %	20 %	56961905
101	NC_006582	TGGAT	2	10	156769	156778	20 %	40 %	40 %	0 %	56961906
102	NC_006582	TTTAA	2	10	157268	157277	40 %	60 %	0 %	0 %	56961906
103	NC_006582	ATTAA	2	10	158389	158398	60 %	40 %	0 %	0 %	56961907
104	NC_006582	TTTCA	2	10	159499	159508	20 %	60 %	0 %	20 %	56961909
105	NC_006582	GGATG	2	10	159702	159711	20 %	20 %	60 %	0 %	56961909
106	NC_006582	TGCCT	2	10	161306	161315	0 %	40 %	20 %	40 %	56961910
107	NC_006582	TAGAA	2	10	161962	161971	60 %	20 %	20 %	0 %	56961911
108	NC_006582	GGACA	2	10	165063	165072	40 %	0 %	40 %	20 %	56961915
109	NC_006582	GGGCG	2	10	165343	165352	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
110	NC_006582	GTGCT	2	10	165407	165416	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_006582	CGCGG	2	10	167310	167319	0 %	0 %	60 %	40 %	56961920
112	NC_006582	AATAG	2	10	167872	167881	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006582	CGTGA	2	10	170220	170229	20 %	20 %	40 %	20 %	56961924
114	NC_006582	CATCG	2	10	171335	171344	20 %	20 %	20 %	40 %	56961924
115	NC_006582	TGGAA	2	10	171470	171479	40 %	20 %	40 %	0 %	56961924
116	NC_006582	GCTTG	2	10	177274	177283	0 %	40 %	40 %	20 %	56961925
117	NC_006582	GTATT	2	10	179236	179245	20 %	60 %	20 %	0 %	56961929
118	NC_006582	ATCCA	2	10	179326	179335	40 %	20 %	0 %	40 %	56961929
119	NC_006582	CATCC	2	10	180455	180464	20 %	20 %	0 %	60 %	56961929
120	NC_006582	AAAGC	2	10	180531	180540	60 %	0 %	20 %	20 %	56961929
121	NC_006582	AAATC	2	10	181013	181022	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_006582	CAAAA	2	10	182533	182542	80 %	0 %	0 %	20 %	56961931
123	NC_006582	ACTTG	2	10	184068	184077	20 %	40 %	20 %	20 %	56961933
124	NC_006582	ACTGA	2	10	184194	184203	40 %	20 %	20 %	20 %	56961934
125	NC_006582	AAGCG	2	10	184327	184336	40 %	0 %	40 %	20 %	56961934
126	NC_006582	GCAAA	2	10	188927	188936	60 %	0 %	20 %	20 %	56961945
127	NC_006582	GGAAT	2	10	192218	192227	40 %	20 %	40 %	0 %	56961952
128	NC_006582	ACTTG	2	10	192861	192870	20 %	40 %	20 %	20 %	56961952
129	NC_006582	AATTT	2	10	193060	193069	40 %	60 %	0 %	0 %	56961953
130	NC_006582	GCTTG	2	10	193188	193197	0 %	40 %	40 %	20 %	56961953
131	NC_006582	GCATG	2	10	195542	195551	20 %	20 %	40 %	20 %	56961958
132	NC_006582	AAGGG	2	10	197833	197842	40 %	0 %	60 %	0 %	56961961
133	NC_006582	CCATC	2	10	198875	198884	20 %	20 %	0 %	60 %	56961962
134	NC_006582	CTTTG	2	10	199199	199208	0 %	60 %	20 %	20 %	56961963
135	NC_006582	ATTAC	2	10	199449	199458	40 %	40 %	0 %	20 %	56961963
136	NC_006582	TGAAA	2	10	200419	200428	60 %	20 %	20 %	0 %	56961964
137	NC_006582	GTGAC	2	10	203508	203517	20 %	20 %	40 %	20 %	56961969
138	NC_006582	TTTAG	2	10	204430	204439	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006582	TCTAG	2	10	205381	205390	20 %	40 %	20 %	20 %	56961972
140	NC_006582	ATTTA	2	10	209177	209186	40 %	60 %	0 %	0 %	56961976
141	NC_006582	TGCTT	2	10	210409	210418	0 %	60 %	20 %	20 %	56961977
142	NC_006582	GAAAG	2	10	211292	211301	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006582	GATAA	2	10	211646	211655	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006582	AATAA	2	10	212899	212908	80 %	20 %	0 %	0 %	56961979
145	NC_006582	TTTAC	2	10	213567	213576	20 %	60 %	0 %	20 %	56961980
146	NC_006582	TTGCT	2	10	215411	215420	0 %	60 %	20 %	20 %	56961982
147	NC_006582	GGTAA	2	10	218334	218343	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006582	TCGTG	2	10	219152	219161	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_006582	GAGAA	2	10	221753	221762	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006582	TATGA	2	10	226006	226015	40 %	40 %	20 %	0 %	56961987
151	NC_006582	CTCTA	2	10	226294	226303	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_006582	CCATT	2	10	226438	226447	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
153	NC_006582	AGAAA	2	10	227024	227033	80 %	0 %	20 %	0 %	56961988
154	NC_006582	AAGAA	2	10	228363	228372	80 %	0 %	20 %	0 %	56961989
155	NC_006582	ATAAA	2	10	229409	229418	80 %	20 %	0 %	0 %	56961990
156	NC_006582	GAAAT	2	10	232536	232545	60 %	20 %	20 %	0 %	56961994
157	NC_006582	AGGTT	2	10	233770	233779	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
158	NC_006582	AAACA	2	10	234441	234450	80 %	0 %	0 %	20 %	56961997
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161	NC_006582	CTACT	2	10	237286	237295	20 %	40 %	0 %	40 %	56962001
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163	NC_006582	CCTTT	2	10	241267	241276	0 %	60 %	0 %	40 %	56962004
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165	NC_006582	TTCAT	2	10	241963	241972	20 %	60 %	0 %	20 %	56962005
166	NC_006582	ATGTG	2	10	242312	242321	20 %	40 %	40 %	0 %	56962005
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171	NC_006582	TGGAG	2	10	246932	246941	20 %	20 %	60 %	0 %	56962007
172	NC_006582	CTATT	2	10	247189	247198	20 %	60 %	0 %	20 %	56962007
173	NC_006582	CTTGT	2	10	247952	247961	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
174	NC_006582	TATGG	2	10	248011	248020	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
175	NC_006582	CTTGC	2	10	249847	249856	0 %	40 %	20 %	40 %	56962009
176	NC_006582	TTTCC	2	10	251422	251431	0 %	60 %	0 %	40 %	56962011
177	NC_006582	CTACT	2	10	253015	253024	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
178	NC_006582	AAACG	2	10	253668	253677	60 %	0 %	20 %	20 %	56962013
179	NC_006582	TTTGC	2	10	253997	254006	0 %	60 %	20 %	20 %	56962013
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184	NC_006582	GATAA	2	10	259966	259975	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_006582	AATCA	2	10	260080	260089	60 %	20 %	0 %	20 %	56962018
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188	NC_006582	CTATT	2	10	263001	263010	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
189	NC_006582	TGAGC	2	10	264065	264074	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_006582	GATTA	2	10	264246	264255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_006582	CCATC	2	10	265148	265157	20 %	20 %	0 %	60 %	56962022
193	NC_006582	CGTTT	2	10	265651	265660	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
194	NC_006582	CATTG	2	10	266585	266594	20 %	40 %	20 %	20 %	56962024
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212	NC_006582	TTTAT	2	10	292384	292393	20 %	80 %	0 %	0 %	56962044
213	NC_006582	ATCAT	2	10	293765	293774	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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220	NC_006582	CTTTT	2	10	308501	308510	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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232	NC_006582	TCGTA	2	10	331552	331561	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
233	NC_006582	ACGTT	2	10	331610	331619	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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240	NC_006582	TCACT	2	10	336713	336722	20 %	40 %	0 %	40 %	56962087
241	NC_006582	CAAGC	2	10	336950	336959	40 %	0 %	20 %	40 %	56962087
242	NC_006582	GGAAA	2	10	341389	341398	60 %	0 %	40 %	0 %	56962092
243	NC_006582	TTTTG	2	10	343794	343803	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
244	NC_006582	GATGA	2	10	344008	344017	40 %	20 %	40 %	0 %	56962094
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250	NC_006582	TTTAT	2	10	348781	348790	20 %	80 %	0 %	0 %	56962098
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252	NC_006582	TTATG	2	10	350873	350882	20 %	60 %	20 %	0 %	56962100
253	NC_006582	GAAAC	2	10	352523	352532	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
254	NC_006582	GCGAG	2	10	354999	355008	20 %	0 %	60 %	20 %	56962106
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258	NC_006582	GATTG	2	10	357711	357720	20 %	40 %	40 %	0 %	56962108
259	NC_006582	GGAAA	2	10	358913	358922	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
260	NC_006582	TTTAT	2	10	359513	359522	20 %	80 %	0 %	0 %	56962109
261	NC_006582	TGATT	2	10	360394	360403	20 %	60 %	20 %	0 %	56962110
262	NC_006582	GCTAA	2	10	360509	360518	40 %	20 %	20 %	20 %	56962110
263	NC_006582	AGTGT	2	10	361204	361213	20 %	40 %	40 %	0 %	56962110
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266	NC_006582	CTTGA	2	10	365505	365514	20 %	40 %	20 %	20 %	56962114
267	NC_006582	ACGGA	2	10	365871	365880	40 %	0 %	40 %	20 %	56962115
268	NC_006582	CCGTT	2	10	374701	374710	0 %	40 %	20 %	40 %	56962123
269	NC_006582	TTGAT	2	10	375265	375274	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
270	NC_006582	CAAAA	2	10	377715	377724	80 %	0 %	0 %	20 %	56962125
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272	NC_006582	GCTTG	2	10	377926	377935	0 %	40 %	40 %	20 %	56962125
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402	NC_006582	GTTTT	2	10	591052	591061	0 %	80 %	20 %	0 %	56962317
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