MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 plasmid pBT9727

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006578	CTTCC	2	10	230	239	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_006578	ACAGT	2	10	1016	1025	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_006578	TTTTC	2	10	1290	1299	0 %	80 %	0 %	20 %	56899874
4	NC_006578	CTTTT	2	10	2052	2061	0 %	80 %	0 %	20 %	56899874
5	NC_006578	TAAAA	2	10	2698	2707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006578	ATTTC	2	10	2796	2805	20 %	60 %	0 %	20 %	56899877
7	NC_006578	TTTCT	2	10	4965	4974	0 %	80 %	0 %	20 %	56899879
8	NC_006578	TTCTT	2	10	6447	6456	0 %	80 %	0 %	20 %	56899879
9	NC_006578	TTTCA	2	10	8013	8022	20 %	60 %	0 %	20 %	56899883
10	NC_006578	ATTTC	2	10	9075	9084	20 %	60 %	0 %	20 %	56899884
11	NC_006578	CCTTT	2	10	12605	12614	0 %	60 %	0 %	40 %	56899885
12	NC_006578	ATTCT	2	10	14014	14023	20 %	60 %	0 %	20 %	56899885
13	NC_006578	TTTAA	2	10	14859	14868	40 %	60 %	0 %	0 %	56899886
14	NC_006578	CTTTG	2	10	15255	15264	0 %	60 %	20 %	20 %	56899886
15	NC_006578	AATTC	2	10	15460	15469	40 %	40 %	0 %	20 %	56899886
16	NC_006578	GAATA	2	10	16275	16284	60 %	20 %	20 %	0 %	56899887
17	NC_006578	GTCCA	2	10	16412	16421	20 %	20 %	20 %	40 %	56899887
18	NC_006578	TCTTT	2	10	18913	18922	0 %	80 %	0 %	20 %	56899891
19	NC_006578	TAAAA	2	10	20821	20830	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006578	CAAAT	2	10	23284	23293	60 %	20 %	0 %	20 %	56899895
21	NC_006578	ATTAA	2	10	26978	26987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006578	CCTTT	2	10	27578	27587	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_006578	ATTCC	2	10	28400	28409	20 %	40 %	0 %	40 %	56899899
24	NC_006578	TTTTC	2	10	30696	30705	0 %	80 %	0 %	20 %	56899904
25	NC_006578	TACAA	2	10	32668	32677	60 %	20 %	0 %	20 %	56899907
26	NC_006578	TCAAC	2	10	33874	33883	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_006578	TTTTC	2	10	35015	35024	0 %	80 %	0 %	20 %	56899909
28	NC_006578	TTTTG	2	10	36658	36667	0 %	80 %	20 %	0 %	56899910
29	NC_006578	TTTCA	2	10	36675	36684	20 %	60 %	0 %	20 %	56899910
30	NC_006578	CGGTT	2	10	37684	37693	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_006578	AATAA	2	10	37750	37759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006578	GCAAA	2	10	38052	38061	60 %	0 %	20 %	20 %	56899911
33	NC_006578	CTTCT	2	10	40025	40034	0 %	60 %	0 %	40 %	56899913
34	NC_006578	GAAAA	2	10	40924	40933	80 %	0 %	20 %	0 %	56899913
35	NC_006578	TAATT	2	10	41363	41372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006578	AATAG	2	10	43207	43216	60 %	20 %	20 %	0 %	56899915
37	NC_006578	TTTCC	2	10	43600	43609	0 %	60 %	0 %	40 %	56899916
38	NC_006578	CTGTA	2	10	44937	44946	20 %	40 %	20 %	20 %	56899916
39	NC_006578	CTTAT	2	10	45924	45933	20 %	60 %	0 %	20 %	56899917
40	NC_006578	TCTAA	2	10	47517	47526	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_006578	GAAAG	2	10	48218	48227	60 %	0 %	40 %	0 %	56899921
42	NC_006578	TTAAG	2	10	50402	50411	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006578	ATTTT	2	10	50599	50608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006578	ATTTC	2	10	50658	50667	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_006578	CAATT	2	10	51086	51095	40 %	40 %	0 %	20 %	56899925
46	NC_006578	TTGTT	2	10	52253	52262	0 %	80 %	20 %	0 %	56899925
47	NC_006578	TTCAT	2	10	52410	52419	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_006578	CTTCT	2	10	54148	54157	0 %	60 %	0 %	40 %	56899928
49	NC_006578	ACAAA	2	10	56915	56924	80 %	0 %	0 %	20 %	56899929
50	NC_006578	TCATA	2	10	57421	57430	40 %	40 %	0 %	20 %	56899929
51	NC_006578	TAATA	2	10	59319	59328	60 %	40 %	0 %	0 %	56899931
52	NC_006578	ATATC	2	10	60586	60595	40 %	40 %	0 %	20 %	56899933
53	NC_006578	ATTTT	2	10	60856	60865	20 %	80 %	0 %	0 %	56899933
54	NC_006578	TCTAT	2	10	61168	61177	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_006578	TAATT	2	10	61756	61765	40 %	60 %	0 %	0 %	56899934
56	NC_006578	CTTCT	2	10	62082	62091	0 %	60 %	0 %	40 %	56899935
57	NC_006578	CTTTA	2	10	65303	65312	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_006578	ATGCT	2	10	65723	65732	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_006578	TTCAA	2	10	66452	66461	40 %	40 %	0 %	20 %	56899939
60	NC_006578	ATTTC	2	10	67364	67373	20 %	60 %	0 %	20 %	56899941
61	NC_006578	CCAGC	2	10	67394	67403	20 %	0 %	20 %	60 %	56899941
62	NC_006578	CCTTT	2	10	67925	67934	0 %	60 %	0 %	40 %	56899941
63	NC_006578	TGTAA	2	10	68238	68247	40 %	40 %	20 %	0 %	56899941
64	NC_006578	AAATA	2	10	71730	71739	80 %	20 %	0 %	0 %	56899944
65	NC_006578	TTCTC	2	10	72991	73000	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_006578	TTTCT	2	10	76075	76084	0 %	80 %	0 %	20 %	56899949

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.