MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 plasmid pBT9727

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006578	GA	3	6	223	228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006578	AT	3	6	656	661	50 %	50 %	0 %	0 %	56899873
3	NC_006578	AT	3	6	782	787	50 %	50 %	0 %	0 %	56899873
4	NC_006578	TC	3	6	927	932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_006578	AT	3	6	1359	1364	50 %	50 %	0 %	0 %	56899874
6	NC_006578	TA	3	6	2325	2330	50 %	50 %	0 %	0 %	56899875
7	NC_006578	TC	3	6	2517	2522	0 %	50 %	0 %	50 %	56899876
8	NC_006578	AT	3	6	3363	3368	50 %	50 %	0 %	0 %	56899877
9	NC_006578	TA	3	6	3848	3853	50 %	50 %	0 %	0 %	56899878
10	NC_006578	TA	3	6	4456	4461	50 %	50 %	0 %	0 %	56899878
11	NC_006578	TC	5	10	4853	4862	0 %	50 %	0 %	50 %	56899879
12	NC_006578	AT	3	6	4873	4878	50 %	50 %	0 %	0 %	56899879
13	NC_006578	TA	3	6	6357	6362	50 %	50 %	0 %	0 %	56899879
14	NC_006578	AC	4	8	6719	6726	50 %	0 %	0 %	50 %	56899880
15	NC_006578	AG	3	6	7183	7188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006578	CT	3	6	7202	7207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006578	AT	3	6	10236	10241	50 %	50 %	0 %	0 %	56899884
18	NC_006578	AT	3	6	10527	10532	50 %	50 %	0 %	0 %	56899884
19	NC_006578	TA	3	6	11464	11469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006578	AT	3	6	11743	11748	50 %	50 %	0 %	0 %	56899885
21	NC_006578	TA	3	6	12401	12406	50 %	50 %	0 %	0 %	56899885
22	NC_006578	CA	3	6	13176	13181	50 %	0 %	0 %	50 %	56899885
23	NC_006578	AG	3	6	13273	13278	50 %	0 %	50 %	0 %	56899885
24	NC_006578	TA	3	6	15284	15289	50 %	50 %	0 %	0 %	56899886
25	NC_006578	AT	3	6	15505	15510	50 %	50 %	0 %	0 %	56899886
26	NC_006578	AG	3	6	15527	15532	50 %	0 %	50 %	0 %	56899886
27	NC_006578	TA	3	6	15811	15816	50 %	50 %	0 %	0 %	56899886
28	NC_006578	TA	3	6	16147	16152	50 %	50 %	0 %	0 %	56899886
29	NC_006578	TA	3	6	16523	16528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006578	CA	4	8	16949	16956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_006578	CT	3	6	17021	17026	0 %	50 %	0 %	50 %	56899889
32	NC_006578	TA	3	6	18117	18122	50 %	50 %	0 %	0 %	56899890
33	NC_006578	AT	3	6	18313	18318	50 %	50 %	0 %	0 %	56899891
34	NC_006578	TA	3	6	18519	18524	50 %	50 %	0 %	0 %	56899891
35	NC_006578	TC	3	6	18738	18743	0 %	50 %	0 %	50 %	56899891
36	NC_006578	AT	3	6	19991	19996	50 %	50 %	0 %	0 %	56899892
37	NC_006578	AT	3	6	20079	20084	50 %	50 %	0 %	0 %	56899892
38	NC_006578	TC	3	6	20801	20806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006578	TA	3	6	20881	20886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006578	CA	3	6	21512	21517	50 %	0 %	0 %	50 %	56899894
41	NC_006578	AT	3	6	21667	21672	50 %	50 %	0 %	0 %	56899895
42	NC_006578	TA	3	6	22415	22420	50 %	50 %	0 %	0 %	56899895
43	NC_006578	TA	4	8	22752	22759	50 %	50 %	0 %	0 %	56899895
44	NC_006578	GT	3	6	24269	24274	0 %	50 %	50 %	0 %	56899895
45	NC_006578	CT	3	6	24727	24732	0 %	50 %	0 %	50 %	56899895
46	NC_006578	AT	3	6	24966	24971	50 %	50 %	0 %	0 %	56899895
47	NC_006578	AG	3	6	25834	25839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006578	AT	3	6	25944	25949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006578	TA	3	6	27492	27497	50 %	50 %	0 %	0 %	56899898
50	NC_006578	AT	3	6	29063	29068	50 %	50 %	0 %	0 %	56899901
51	NC_006578	TC	3	6	29453	29458	0 %	50 %	0 %	50 %	56899902
52	NC_006578	TA	3	6	30550	30555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006578	CA	3	6	30596	30601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_006578	CT	3	6	31543	31548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_006578	CT	3	6	31684	31689	0 %	50 %	0 %	50 %	56899905
56	NC_006578	TA	3	6	32072	32077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006578	TA	3	6	32385	32390	50 %	50 %	0 %	0 %	56899907
58	NC_006578	CT	3	6	32626	32631	0 %	50 %	0 %	50 %	56899907
59	NC_006578	CT	3	6	32655	32660	0 %	50 %	0 %	50 %	56899907
60	NC_006578	TA	3	6	33328	33333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006578	AT	3	6	33675	33680	50 %	50 %	0 %	0 %	56899908
62	NC_006578	AC	3	6	34094	34099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_006578	AT	3	6	34851	34856	50 %	50 %	0 %	0 %	56899909
64	NC_006578	AT	3	6	35100	35105	50 %	50 %	0 %	0 %	56899909
65	NC_006578	TC	3	6	35183	35188	0 %	50 %	0 %	50 %	56899909
66	NC_006578	TA	3	6	35229	35234	50 %	50 %	0 %	0 %	56899909
67	NC_006578	AT	3	6	35450	35455	50 %	50 %	0 %	0 %	56899909
68	NC_006578	CA	3	6	35516	35521	50 %	0 %	0 %	50 %	56899909
69	NC_006578	TA	3	6	36204	36209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006578	AT	3	6	36212	36217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006578	TA	3	6	36562	36567	50 %	50 %	0 %	0 %	56899910
72	NC_006578	TC	3	6	36916	36921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_006578	AT	3	6	37148	37153	50 %	50 %	0 %	0 %	56899951
74	NC_006578	TA	3	6	37533	37538	50 %	50 %	0 %	0 %	56899951
75	NC_006578	TA	3	6	37664	37669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006578	GA	3	6	38002	38007	50 %	0 %	50 %	0 %	56899911
77	NC_006578	TA	4	8	38097	38104	50 %	50 %	0 %	0 %	56899911
78	NC_006578	CT	3	6	39107	39112	0 %	50 %	0 %	50 %	56899912
79	NC_006578	TA	3	6	39670	39675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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81	NC_006578	TA	3	6	40697	40702	50 %	50 %	0 %	0 %	56899913
82	NC_006578	AT	4	8	41460	41467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006578	TA	4	8	41492	41499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006578	AT	3	6	42032	42037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006578	GA	3	6	42210	42215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006578	AT	4	8	42287	42294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006578	AT	3	6	42754	42759	50 %	50 %	0 %	0 %	56899915
88	NC_006578	TA	3	6	42975	42980	50 %	50 %	0 %	0 %	56899915
89	NC_006578	TA	3	6	43232	43237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006578	CT	4	8	43522	43529	0 %	50 %	0 %	50 %	56899916
91	NC_006578	TA	3	6	43622	43627	50 %	50 %	0 %	0 %	56899916
92	NC_006578	TG	3	6	43898	43903	0 %	50 %	50 %	0 %	56899916
93	NC_006578	TC	3	6	44386	44391	0 %	50 %	0 %	50 %	56899916
94	NC_006578	GA	3	6	44399	44404	50 %	0 %	50 %	0 %	56899916
95	NC_006578	TA	3	6	44672	44677	50 %	50 %	0 %	0 %	56899916
96	NC_006578	TA	4	8	45359	45366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006578	AT	3	6	47662	47667	50 %	50 %	0 %	0 %	56899919
98	NC_006578	TA	3	6	47773	47778	50 %	50 %	0 %	0 %	56899919
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101	NC_006578	AT	3	6	49543	49548	50 %	50 %	0 %	0 %	56899924
102	NC_006578	AT	3	6	49674	49679	50 %	50 %	0 %	0 %	56899924
103	NC_006578	GC	3	6	49787	49792	0 %	0 %	50 %	50 %	56899924
104	NC_006578	CT	3	6	49801	49806	0 %	50 %	0 %	50 %	56899924
105	NC_006578	CT	3	6	49949	49954	0 %	50 %	0 %	50 %	56899924
106	NC_006578	AT	3	6	50421	50426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_006578	TA	3	6	52145	52150	50 %	50 %	0 %	0 %	56899925
110	NC_006578	TA	3	6	52232	52237	50 %	50 %	0 %	0 %	56899925
111	NC_006578	TC	3	6	52303	52308	0 %	50 %	0 %	50 %	56899925
112	NC_006578	CT	3	6	52394	52399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_006578	TA	3	6	52429	52434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006578	AT	3	6	52762	52767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006578	TA	3	6	52977	52982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006578	TG	3	6	53072	53077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006578	CG	3	6	53228	53233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_006578	AG	3	6	53255	53260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006578	CA	3	6	54076	54081	50 %	0 %	0 %	50 %	56899928
120	NC_006578	AT	3	6	54484	54489	50 %	50 %	0 %	0 %	56899928
121	NC_006578	CA	3	6	54513	54518	50 %	0 %	0 %	50 %	56899928
122	NC_006578	TC	3	6	54847	54852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_006578	AT	4	8	54949	54956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006578	TC	3	6	55252	55257	0 %	50 %	0 %	50 %	56899952
125	NC_006578	TA	3	6	55777	55782	50 %	50 %	0 %	0 %	56899952
126	NC_006578	AT	3	6	56640	56645	50 %	50 %	0 %	0 %	56899929
127	NC_006578	AT	4	8	57089	57096	50 %	50 %	0 %	0 %	56899929
128	NC_006578	AC	3	6	57305	57310	50 %	0 %	0 %	50 %	56899929
129	NC_006578	AT	3	6	57608	57613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006578	AC	3	6	58974	58979	50 %	0 %	0 %	50 %	56899930
131	NC_006578	CT	3	6	59224	59229	0 %	50 %	0 %	50 %	56899931
132	NC_006578	TC	3	6	59928	59933	0 %	50 %	0 %	50 %	56899933
133	NC_006578	TC	3	6	60503	60508	0 %	50 %	0 %	50 %	56899933
134	NC_006578	TA	3	6	60789	60794	50 %	50 %	0 %	0 %	56899933
135	NC_006578	TA	3	6	61178	61183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006578	AG	3	6	61399	61404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006578	GA	3	6	61594	61599	50 %	0 %	50 %	0 %	56899934
138	NC_006578	TA	3	6	61611	61616	50 %	50 %	0 %	0 %	56899934
139	NC_006578	CA	3	6	61678	61683	50 %	0 %	0 %	50 %	56899934
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144	NC_006578	CT	3	6	64215	64220	0 %	50 %	0 %	50 %	56899936
145	NC_006578	TA	3	6	64752	64757	50 %	50 %	0 %	0 %	56899937
146	NC_006578	TC	3	6	64867	64872	0 %	50 %	0 %	50 %	56899937
147	NC_006578	AT	3	6	64904	64909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006578	AT	3	6	64970	64975	50 %	50 %	0 %	0 %	56899938
149	NC_006578	AT	3	6	65191	65196	50 %	50 %	0 %	0 %	56899938
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.