MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 plasmid pBT9727

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006578	AT	3	6	656	661	50 %	50 %	0 %	0 %	56899873
2	NC_006578	AT	3	6	782	787	50 %	50 %	0 %	0 %	56899873
3	NC_006578	AT	3	6	1359	1364	50 %	50 %	0 %	0 %	56899874
4	NC_006578	TA	3	6	2325	2330	50 %	50 %	0 %	0 %	56899875
5	NC_006578	TC	3	6	2517	2522	0 %	50 %	0 %	50 %	56899876
6	NC_006578	AT	3	6	3363	3368	50 %	50 %	0 %	0 %	56899877
7	NC_006578	TA	3	6	3848	3853	50 %	50 %	0 %	0 %	56899878
8	NC_006578	TA	3	6	4456	4461	50 %	50 %	0 %	0 %	56899878
9	NC_006578	TC	5	10	4853	4862	0 %	50 %	0 %	50 %	56899879
10	NC_006578	AT	3	6	4873	4878	50 %	50 %	0 %	0 %	56899879
11	NC_006578	TA	3	6	6357	6362	50 %	50 %	0 %	0 %	56899879
12	NC_006578	AC	4	8	6719	6726	50 %	0 %	0 %	50 %	56899880
13	NC_006578	AT	3	6	10236	10241	50 %	50 %	0 %	0 %	56899884
14	NC_006578	AT	3	6	10527	10532	50 %	50 %	0 %	0 %	56899884
15	NC_006578	AT	3	6	11743	11748	50 %	50 %	0 %	0 %	56899885
16	NC_006578	TA	3	6	12401	12406	50 %	50 %	0 %	0 %	56899885
17	NC_006578	CA	3	6	13176	13181	50 %	0 %	0 %	50 %	56899885
18	NC_006578	AG	3	6	13273	13278	50 %	0 %	50 %	0 %	56899885
19	NC_006578	TA	3	6	15284	15289	50 %	50 %	0 %	0 %	56899886
20	NC_006578	AT	3	6	15505	15510	50 %	50 %	0 %	0 %	56899886
21	NC_006578	AG	3	6	15527	15532	50 %	0 %	50 %	0 %	56899886
22	NC_006578	TA	3	6	15811	15816	50 %	50 %	0 %	0 %	56899886
23	NC_006578	TA	3	6	16147	16152	50 %	50 %	0 %	0 %	56899886
24	NC_006578	CT	3	6	17021	17026	0 %	50 %	0 %	50 %	56899889
25	NC_006578	TA	3	6	18117	18122	50 %	50 %	0 %	0 %	56899890
26	NC_006578	AT	3	6	18313	18318	50 %	50 %	0 %	0 %	56899891
27	NC_006578	TA	3	6	18519	18524	50 %	50 %	0 %	0 %	56899891
28	NC_006578	TC	3	6	18738	18743	0 %	50 %	0 %	50 %	56899891
29	NC_006578	AT	3	6	19991	19996	50 %	50 %	0 %	0 %	56899892
30	NC_006578	AT	3	6	20079	20084	50 %	50 %	0 %	0 %	56899892
31	NC_006578	CA	3	6	21512	21517	50 %	0 %	0 %	50 %	56899894
32	NC_006578	AT	3	6	21667	21672	50 %	50 %	0 %	0 %	56899895
33	NC_006578	TA	3	6	22415	22420	50 %	50 %	0 %	0 %	56899895
34	NC_006578	TA	4	8	22752	22759	50 %	50 %	0 %	0 %	56899895
35	NC_006578	GT	3	6	24269	24274	0 %	50 %	50 %	0 %	56899895
36	NC_006578	CT	3	6	24727	24732	0 %	50 %	0 %	50 %	56899895
37	NC_006578	AT	3	6	24966	24971	50 %	50 %	0 %	0 %	56899895
38	NC_006578	TA	3	6	27492	27497	50 %	50 %	0 %	0 %	56899898
39	NC_006578	AT	3	6	29063	29068	50 %	50 %	0 %	0 %	56899901
40	NC_006578	TC	3	6	29453	29458	0 %	50 %	0 %	50 %	56899902
41	NC_006578	CT	3	6	31684	31689	0 %	50 %	0 %	50 %	56899905
42	NC_006578	TA	3	6	32385	32390	50 %	50 %	0 %	0 %	56899907
43	NC_006578	CT	3	6	32626	32631	0 %	50 %	0 %	50 %	56899907
44	NC_006578	CT	3	6	32655	32660	0 %	50 %	0 %	50 %	56899907
45	NC_006578	AT	3	6	33675	33680	50 %	50 %	0 %	0 %	56899908
46	NC_006578	AT	3	6	34851	34856	50 %	50 %	0 %	0 %	56899909
47	NC_006578	AT	3	6	35100	35105	50 %	50 %	0 %	0 %	56899909
48	NC_006578	TC	3	6	35183	35188	0 %	50 %	0 %	50 %	56899909
49	NC_006578	TA	3	6	35229	35234	50 %	50 %	0 %	0 %	56899909
50	NC_006578	AT	3	6	35450	35455	50 %	50 %	0 %	0 %	56899909
51	NC_006578	CA	3	6	35516	35521	50 %	0 %	0 %	50 %	56899909
52	NC_006578	TA	3	6	36562	36567	50 %	50 %	0 %	0 %	56899910
53	NC_006578	AT	3	6	37148	37153	50 %	50 %	0 %	0 %	56899951
54	NC_006578	TA	3	6	37533	37538	50 %	50 %	0 %	0 %	56899951
55	NC_006578	GA	3	6	38002	38007	50 %	0 %	50 %	0 %	56899911
56	NC_006578	TA	4	8	38097	38104	50 %	50 %	0 %	0 %	56899911
57	NC_006578	CT	3	6	39107	39112	0 %	50 %	0 %	50 %	56899912
58	NC_006578	CA	3	6	40035	40040	50 %	0 %	0 %	50 %	56899913
59	NC_006578	TA	3	6	40697	40702	50 %	50 %	0 %	0 %	56899913
60	NC_006578	AT	3	6	42754	42759	50 %	50 %	0 %	0 %	56899915
61	NC_006578	TA	3	6	42975	42980	50 %	50 %	0 %	0 %	56899915
62	NC_006578	CT	4	8	43522	43529	0 %	50 %	0 %	50 %	56899916
63	NC_006578	TA	3	6	43622	43627	50 %	50 %	0 %	0 %	56899916
64	NC_006578	TG	3	6	43898	43903	0 %	50 %	50 %	0 %	56899916
65	NC_006578	TC	3	6	44386	44391	0 %	50 %	0 %	50 %	56899916
66	NC_006578	GA	3	6	44399	44404	50 %	0 %	50 %	0 %	56899916
67	NC_006578	TA	3	6	44672	44677	50 %	50 %	0 %	0 %	56899916
68	NC_006578	AT	3	6	47662	47667	50 %	50 %	0 %	0 %	56899919
69	NC_006578	TA	3	6	47773	47778	50 %	50 %	0 %	0 %	56899919
70	NC_006578	AC	3	6	48012	48017	50 %	0 %	0 %	50 %	56899920
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72	NC_006578	AT	3	6	49543	49548	50 %	50 %	0 %	0 %	56899924
73	NC_006578	AT	3	6	49674	49679	50 %	50 %	0 %	0 %	56899924
74	NC_006578	GC	3	6	49787	49792	0 %	0 %	50 %	50 %	56899924
75	NC_006578	CT	3	6	49801	49806	0 %	50 %	0 %	50 %	56899924
76	NC_006578	CT	3	6	49949	49954	0 %	50 %	0 %	50 %	56899924
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79	NC_006578	TA	3	6	52145	52150	50 %	50 %	0 %	0 %	56899925
80	NC_006578	TA	3	6	52232	52237	50 %	50 %	0 %	0 %	56899925
81	NC_006578	TC	3	6	52303	52308	0 %	50 %	0 %	50 %	56899925
82	NC_006578	CA	3	6	54076	54081	50 %	0 %	0 %	50 %	56899928
83	NC_006578	AT	3	6	54484	54489	50 %	50 %	0 %	0 %	56899928
84	NC_006578	CA	3	6	54513	54518	50 %	0 %	0 %	50 %	56899928
85	NC_006578	TC	3	6	55252	55257	0 %	50 %	0 %	50 %	56899952
86	NC_006578	TA	3	6	55777	55782	50 %	50 %	0 %	0 %	56899952
87	NC_006578	AT	3	6	56640	56645	50 %	50 %	0 %	0 %	56899929
88	NC_006578	AT	4	8	57089	57096	50 %	50 %	0 %	0 %	56899929
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90	NC_006578	AC	3	6	58974	58979	50 %	0 %	0 %	50 %	56899930
91	NC_006578	CT	3	6	59224	59229	0 %	50 %	0 %	50 %	56899931
92	NC_006578	TC	3	6	59928	59933	0 %	50 %	0 %	50 %	56899933
93	NC_006578	TC	3	6	60503	60508	0 %	50 %	0 %	50 %	56899933
94	NC_006578	TA	3	6	60789	60794	50 %	50 %	0 %	0 %	56899933
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96	NC_006578	TA	3	6	61611	61616	50 %	50 %	0 %	0 %	56899934
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99	NC_006578	TA	4	8	62289	62296	50 %	50 %	0 %	0 %	56899935
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104	NC_006578	AT	3	6	64970	64975	50 %	50 %	0 %	0 %	56899938
105	NC_006578	AT	3	6	65191	65196	50 %	50 %	0 %	0 %	56899938
106	NC_006578	TA	3	6	67614	67619	50 %	50 %	0 %	0 %	56899941
107	NC_006578	TA	4	8	68031	68038	50 %	50 %	0 %	0 %	56899941
108	NC_006578	AG	3	6	68365	68370	50 %	0 %	50 %	0 %	56899941
109	NC_006578	TA	3	6	68681	68686	50 %	50 %	0 %	0 %	56899941
110	NC_006578	TC	3	6	69151	69156	0 %	50 %	0 %	50 %	56899941
111	NC_006578	TC	3	6	69397	69402	0 %	50 %	0 %	50 %	56899942
112	NC_006578	TC	3	6	69439	69444	0 %	50 %	0 %	50 %	56899942
113	NC_006578	TG	3	6	71773	71778	0 %	50 %	50 %	0 %	56899944
114	NC_006578	AT	3	6	72301	72306	50 %	50 %	0 %	0 %	56899945
115	NC_006578	AT	3	6	72930	72935	50 %	50 %	0 %	0 %	56899945
116	NC_006578	AC	3	6	74003	74008	50 %	0 %	0 %	50 %	56899946
117	NC_006578	TC	3	6	74508	74513	0 %	50 %	0 %	50 %	56899946
118	NC_006578	AT	3	6	75005	75010	50 %	50 %	0 %	0 %	56899947
119	NC_006578	AT	3	6	75068	75073	50 %	50 %	0 %	0 %	56899948
120	NC_006578	TA	3	6	75392	75397	50 %	50 %	0 %	0 %	56899948
121	NC_006578	GT	3	6	76952	76957	0 %	50 %	50 %	0 %	56899949

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.