MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4 chromosome

Total Repeats: 920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006570	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707188
2	NC_006570	TATTTC	2	12	2865	2876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_006570	GTTTTA	2	12	8663	8674	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006570	TATATC	2	12	12043	12054	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	56707193
5	NC_006570	CTGCTT	2	12	14899	14910	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56707196
6	NC_006570	TACTGA	2	12	15065	15076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707196
7	NC_006570	AGATGG	2	12	17164	17175	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	56707198
8	NC_006570	TTATAT	2	12	17509	17520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707198
9	NC_006570	TCAAGA	2	12	18078	18089	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707199
10	NC_006570	GAAGCA	2	12	18303	18314	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56707200
11	NC_006570	GAGTAT	2	12	20300	20311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707201
12	NC_006570	CCAGAT	2	12	20438	20449	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56707201
13	NC_006570	GTAAAG	2	12	20982	20993	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	56707201
14	NC_006570	CAAATC	2	12	26597	26608	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	56707207
15	NC_006570	AGCTAA	2	12	28087	28098	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707208
16	NC_006570	ATGATA	2	12	30291	30302	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006570	TACTCG	2	12	31876	31887	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56707212
18	NC_006570	TGGTGC	2	12	34946	34957	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56707216
19	NC_006570	TGCAAA	2	12	36006	36017	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707217
20	NC_006570	ATATTG	2	12	37467	37478	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707217
21	NC_006570	TAACAT	2	12	40101	40112	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	56707220
22	NC_006570	TCAGTC	2	12	40239	40250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56707221
23	NC_006570	TGCAAA	2	12	42272	42283	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707222
24	NC_006570	TTGGTA	2	12	43055	43066	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	56707223
25	NC_006570	TATTGG	2	12	43743	43754	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	56707223
26	NC_006570	TCCATG	2	12	46938	46949	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_006570	TTTTGA	2	12	49123	49134	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707227
28	NC_006570	TGAAGA	2	12	49389	49400	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	56707228
29	NC_006570	GGCAAA	2	12	59122	59133	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56707235
30	NC_006570	ATTATG	2	12	59781	59792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707236
31	NC_006570	ATAAAT	2	12	61255	61266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707238
32	NC_006570	AGGCTA	2	12	61503	61514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56707239
33	NC_006570	AGCAAG	2	12	66478	66489	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56707244
34	NC_006570	GTTAGA	2	12	76210	76221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707253
35	NC_006570	AAAGCT	2	12	77460	77471	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707255
36	NC_006570	TAAAGC	2	12	77660	77671	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707255
37	NC_006570	ATTATA	2	12	78829	78840	50 %	50 %	0 %	0 %	56707255
38	NC_006570	AAATGC	2	12	78907	78918	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707255
39	NC_006570	AGATAC	2	12	81132	81143	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707256
40	NC_006570	GGAGCA	2	12	84258	84269	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	56707260
41	NC_006570	TTTATA	2	12	85246	85257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006570	TGGTGT	2	12	89426	89437	0 %	50 %	50 %	0 %	56707265
43	NC_006570	ATCCGT	2	12	90951	90962	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56707265
44	NC_006570	TGATGT	2	12	91391	91402	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	56707265
45	NC_006570	AGCTTG	2	12	94348	94359	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56707268
46	NC_006570	GTTGAG	2	12	99935	99946	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56707271
47	NC_006570	AAAAAC	2	12	100152	100163	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	56707271
48	NC_006570	GCAAAT	2	12	109742	109753	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707279
49	NC_006570	CAAATA	2	12	110253	110264	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	56707279
50	NC_006570	CAACAT	2	12	111366	111377	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	56707279
51	NC_006570	CAATAG	2	12	113477	113488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707280
52	NC_006570	TAAATA	2	12	114164	114175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707281
53	NC_006570	TGCAGC	2	12	116377	116388	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56707283
54	NC_006570	TTATAG	2	12	117842	117853	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707284
55	NC_006570	AGATAA	2	12	117864	117875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	56707284
56	NC_006570	GAAAGT	2	12	119471	119482	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	56707285
57	NC_006570	CTGGTA	2	12	119659	119670	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56707285
58	NC_006570	GCAAAT	2	12	127900	127911	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707292
59	NC_006570	TAGGTG	2	12	130813	130824	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56707294
60	NC_006570	TAGTGC	2	12	135500	135511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_006570	ATTTTT	2	12	136158	136169	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006570	TTAATA	2	12	142543	142554	50 %	50 %	0 %	0 %	56707301
63	NC_006570	ACTTTG	2	12	144842	144853	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56707303
64	NC_006570	ATTGTT	2	12	147423	147434	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707305
65	NC_006570	AGCAAC	2	12	148416	148427	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	56707306
66	NC_006570	TAGATC	2	12	149379	149390	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707306
67	NC_006570	GCTGTT	2	12	154503	154514	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	56707313
68	NC_006570	AGAAAA	2	12	155520	155531	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	56707314
69	NC_006570	TTGATT	2	12	155788	155799	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707314
70	NC_006570	GGTAAA	2	12	156243	156254	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	56707314
71	NC_006570	TATATG	2	12	158643	158654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707314
72	NC_006570	GTTGAG	2	12	159322	159333	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56707315
73	NC_006570	TCCACA	2	12	164726	164737	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006570	TGCCTA	2	12	169490	169501	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56707322
75	NC_006570	TGATTT	2	12	172524	172535	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707327
76	NC_006570	ATAAAC	2	12	173953	173964	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	56707328
77	NC_006570	ATTAAA	2	12	175499	175510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707330
78	NC_006570	TTTCAT	2	12	177213	177224	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	56707333
79	NC_006570	TGTTTT	2	12	182269	182280	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006570	GTTTTA	2	12	186304	186315	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707340
81	NC_006570	TCCTTG	2	12	191934	191945	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56707343
82	NC_006570	AGCTAT	2	12	192861	192872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707344
83	NC_006570	TAAAAG	2	12	196643	196654	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	56707345
84	NC_006570	AAATAA	2	12	197230	197241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	56707346
85	NC_006570	ATTTCC	2	12	200164	200175	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_006570	TTATGA	2	12	201369	201380	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707350
87	NC_006570	ATCAAA	2	12	203894	203905	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	56707353
88	NC_006570	GTACAG	2	12	204067	204078	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56707353
89	NC_006570	TATTGA	2	12	208269	208280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707356
90	NC_006570	CAAAGT	2	12	208399	208410	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707356
91	NC_006570	TAAAGA	2	12	210879	210890	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006570	AAATGC	2	12	211752	211763	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707359
93	NC_006570	ATAGCT	2	12	212898	212909	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707360
94	NC_006570	TTTCAT	2	12	220377	220388	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_006570	CAGATA	2	12	222452	222463	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707367
96	NC_006570	ATCGTA	2	12	222674	222685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707368
97	NC_006570	AAGGTA	2	12	222705	222716	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	56707368
98	NC_006570	ATCGCT	2	12	225070	225081	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006570	TATAAA	2	12	225270	225281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006570	TTGTGT	2	12	226419	226430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707371
101	NC_006570	GTTGCT	2	12	230084	230095	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	56707374
102	NC_006570	TAGTAT	2	12	230164	230175	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707374
103	NC_006570	TCATTA	2	12	230911	230922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	56707375
104	NC_006570	GACAAG	2	12	233874	233885	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56707376
105	NC_006570	GTTTTA	2	12	234570	234581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707377
106	NC_006570	ACCTTA	2	12	235396	235407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006570	GCCATT	2	12	236062	236073	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56707378
108	NC_006570	ACTGTT	2	12	237465	237476	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56707379
109	NC_006570	AATTAT	2	12	239088	239099	50 %	50 %	0 %	0 %	56707380
110	NC_006570	ATCAAT	2	12	240726	240737	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	56707382
111	NC_006570	TTTGTC	2	12	246867	246878	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	56707389
112	NC_006570	AGCTGG	2	12	247398	247409	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56707390
113	NC_006570	AGCCAA	2	12	250742	250753	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	56707395
114	NC_006570	TTTAAA	2	12	254773	254784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006570	ATAATT	2	12	254985	254996	50 %	50 %	0 %	0 %	56707400
116	NC_006570	ATTGAT	2	12	255248	255259	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707400
117	NC_006570	GTTTTA	2	12	259881	259892	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707403
118	NC_006570	TATCAG	2	12	261172	261183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707405
119	NC_006570	GGTATT	2	12	261438	261449	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	56707405
120	NC_006570	TTATAA	2	12	271779	271790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006570	TTGAGA	2	12	273261	273272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707413
122	NC_006570	TTAGGC	2	12	274118	274129	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56707413
123	NC_006570	TATTTT	2	12	277357	277368	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	56707417
124	NC_006570	TAAGTA	2	12	278281	278292	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006570	ATAAAT	2	12	278695	278706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006570	AAATAT	2	12	284743	284754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707424
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138	NC_006570	TACTGC	2	12	314346	314357	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56707452
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144	NC_006570	TTTTGT	2	12	319921	319932	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006570	AATTTC	2	12	322009	322020	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	56707460
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149	NC_006570	ATTTTT	2	12	327770	327781	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	56707465
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179	NC_006570	ATTTTT	2	12	385516	385527	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_006570	TTTGGC	2	12	387766	387777	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	56707534
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228	NC_006570	GAAAAA	2	12	484055	484066	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	56707609
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231	NC_006570	GGTGGC	2	12	490965	490976	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56707615
232	NC_006570	TGGTGA	2	12	491126	491137	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56707615
233	NC_006570	TTATCT	2	12	495260	495271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	56707619
234	NC_006570	TTTATC	2	12	496368	496379	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	56707620
235	NC_006570	AAAATC	2	12	501126	501137	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
236	NC_006570	ATTTTT	2	12	503030	503041	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	56707625
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238	NC_006570	TCGAGC	2	12	505611	505622	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56707628
239	NC_006570	TGATTT	2	12	510362	510373	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707632
240	NC_006570	TCAATA	2	12	511109	511120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	56707632
241	NC_006570	TTCCAT	2	12	512263	512274	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	56707634
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245	NC_006570	AAAAAT	2	12	518928	518939	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_006570	GTTCTT	2	12	560630	560641	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	56707672
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345	NC_006570	CTTTTT	2	12	725745	725756	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	56707826
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348	NC_006570	AATGAA	2	12	727234	727245	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	56707827
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350	NC_006570	ACTAAA	2	12	730834	730845	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	56707831
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352	NC_006570	GCTTTA	2	12	733966	733977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
353	NC_006570	TATTGA	2	12	734883	734894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707834
354	NC_006570	GTCAAG	2	12	736214	736225	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56707834
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356	NC_006570	ATCTAA	2	12	739418	739429	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	56707837
357	NC_006570	TAGCTT	2	12	739878	739889	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56707838
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474	NC_006570	ACCAGC	2	12	977515	977526	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	56708059
475	NC_006570	TGCTAA	2	12	977779	977790	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56708059
476	NC_006570	TAATTA	2	12	978163	978174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_006570	TATTAA	2	12	978965	978976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_006570	TTAGTT	2	12	979618	979629	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56708061
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