MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4 chromosome

Total Repeats: 1126

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006570	AAGAA	2	10	1226	1235	80 %	0 %	20 %	0 %	56707188
2	NC_006570	CATCT	2	10	3558	3567	20 %	40 %	0 %	40 %	56707190
3	NC_006570	TTCTT	2	10	3630	3639	0 %	80 %	0 %	20 %	56707190
4	NC_006570	TTTGC	2	10	4736	4745	0 %	60 %	20 %	20 %	56707191
5	NC_006570	CGTAC	2	10	4880	4889	20 %	20 %	20 %	40 %	56707191
6	NC_006570	TTCAA	2	10	5251	5260	40 %	40 %	0 %	20 %	56707191
7	NC_006570	TTGCG	2	10	5339	5348	0 %	40 %	40 %	20 %	56707191
8	NC_006570	ATGCA	2	10	7386	7395	40 %	20 %	20 %	20 %	56707192
9	NC_006570	TTTCT	2	10	11649	11658	0 %	80 %	0 %	20 %	56707193
10	NC_006570	AAATA	2	10	11737	11746	80 %	20 %	0 %	0 %	56707193
11	NC_006570	ACAGT	2	10	13710	13719	40 %	20 %	20 %	20 %	56707195
12	NC_006570	TAATG	2	10	14615	14624	40 %	40 %	20 %	0 %	56707196
13	NC_006570	TAGGT	2	10	16928	16937	20 %	40 %	40 %	0 %	56707198
14	NC_006570	TTTGA	2	10	17926	17935	20 %	60 %	20 %	0 %	56707199
15	NC_006570	TAGAT	2	10	18200	18209	40 %	40 %	20 %	0 %	56707200
16	NC_006570	GATTA	2	10	20040	20049	40 %	40 %	20 %	0 %	56707201
17	NC_006570	GATGT	2	10	20196	20205	20 %	40 %	40 %	0 %	56707201
18	NC_006570	GTATG	2	10	26120	26129	20 %	40 %	40 %	0 %	56707207
19	NC_006570	GCTAA	2	10	27329	27338	40 %	20 %	20 %	20 %	56707208
20	NC_006570	ATTCT	2	10	30000	30009	20 %	60 %	0 %	20 %	56707209
21	NC_006570	GTTTT	2	10	30245	30254	0 %	80 %	20 %	0 %	56707209
22	NC_006570	CAAGG	2	10	33253	33262	40 %	0 %	40 %	20 %	56707214
23	NC_006570	ACCAA	2	10	35809	35818	60 %	0 %	0 %	40 %	56707217
24	NC_006570	TACAG	2	10	39231	39240	40 %	20 %	20 %	20 %	56707219
25	NC_006570	ATTTT	2	10	39644	39653	20 %	80 %	0 %	0 %	56707220
26	NC_006570	ATTTT	2	10	40068	40077	20 %	80 %	0 %	0 %	56707220
27	NC_006570	TATTC	2	10	43213	43222	20 %	60 %	0 %	20 %	56707223
28	NC_006570	TAGTT	2	10	44568	44577	20 %	60 %	20 %	0 %	56707224
29	NC_006570	AAGCT	2	10	45878	45887	40 %	20 %	20 %	20 %	56707225
30	NC_006570	AAAAT	2	10	49592	49601	80 %	20 %	0 %	0 %	56707228
31	NC_006570	TAATT	2	10	50622	50631	40 %	60 %	0 %	0 %	56707228
32	NC_006570	TGAAA	2	10	52934	52943	60 %	20 %	20 %	0 %	56707229
33	NC_006570	TAAAT	2	10	54434	54443	60 %	40 %	0 %	0 %	56707231
34	NC_006570	CAAAC	2	10	55558	55567	60 %	0 %	0 %	40 %	56707232
35	NC_006570	GCAAA	2	10	56606	56615	60 %	0 %	20 %	20 %	56707233
36	NC_006570	TTTAG	2	10	57513	57522	20 %	60 %	20 %	0 %	56707234
37	NC_006570	AAACA	2	10	58176	58185	80 %	0 %	0 %	20 %	56707234
38	NC_006570	TAAGA	2	10	59166	59175	60 %	20 %	20 %	0 %	56707235
39	NC_006570	AATAA	2	10	60102	60111	80 %	20 %	0 %	0 %	56707237
40	NC_006570	TACTG	2	10	62601	62610	20 %	40 %	20 %	20 %	56707241
41	NC_006570	GTGAA	2	10	63280	63289	40 %	20 %	40 %	0 %	56707241
42	NC_006570	GTGCA	2	10	65868	65877	20 %	20 %	40 %	20 %	56707243
43	NC_006570	GCATA	2	10	66291	66300	40 %	20 %	20 %	20 %	56707244
44	NC_006570	ATAAA	2	10	68355	68364	80 %	20 %	0 %	0 %	56707245
45	NC_006570	TATCT	2	10	71976	71985	20 %	60 %	0 %	20 %	56707249
46	NC_006570	AAAAT	2	10	72289	72298	80 %	20 %	0 %	0 %	56707250
47	NC_006570	TCACT	2	10	74218	74227	20 %	40 %	0 %	40 %	56707251
48	NC_006570	TTATC	2	10	74365	74374	20 %	60 %	0 %	20 %	56707252
49	NC_006570	AAGAA	2	10	76048	76057	80 %	0 %	20 %	0 %	56707253
50	NC_006570	ATAGA	2	10	77743	77752	60 %	20 %	20 %	0 %	56707255
51	NC_006570	TAATG	2	10	77990	77999	40 %	40 %	20 %	0 %	56707255
52	NC_006570	ACTCT	2	10	79174	79183	20 %	40 %	0 %	40 %	56707255
53	NC_006570	TAAAT	2	10	79998	80007	60 %	40 %	0 %	0 %	56707255
54	NC_006570	GAACC	2	10	83301	83310	40 %	0 %	20 %	40 %	56707258
55	NC_006570	GTCTT	2	10	84350	84359	0 %	60 %	20 %	20 %	56707260
56	NC_006570	TTTGA	2	10	86247	86256	20 %	60 %	20 %	0 %	56707262
57	NC_006570	GTATT	2	10	87421	87430	20 %	60 %	20 %	0 %	56707263
58	NC_006570	TAGTA	2	10	89849	89858	40 %	40 %	20 %	0 %	56707265
59	NC_006570	TGATA	2	10	91674	91683	40 %	40 %	20 %	0 %	56707266
60	NC_006570	ATAGA	2	10	91757	91766	60 %	20 %	20 %	0 %	56707266
61	NC_006570	ATTAG	2	10	92311	92320	40 %	40 %	20 %	0 %	56707266
62	NC_006570	TATCA	2	10	93766	93775	40 %	40 %	0 %	20 %	56707267
63	NC_006570	TTAAC	2	10	97449	97458	40 %	40 %	0 %	20 %	56707269
64	NC_006570	GTCAA	2	10	97591	97600	40 %	20 %	20 %	20 %	56707269
65	NC_006570	CAGAT	2	10	100492	100501	40 %	20 %	20 %	20 %	56707272
66	NC_006570	CATCT	2	10	102569	102578	20 %	40 %	0 %	40 %	56707274
67	NC_006570	TTCTT	2	10	102641	102650	0 %	80 %	0 %	20 %	56707274
68	NC_006570	TTTCT	2	10	103733	103742	0 %	80 %	0 %	20 %	56707275
69	NC_006570	ATTTA	2	10	104837	104846	40 %	60 %	0 %	0 %	56707276
70	NC_006570	CATAT	2	10	105083	105092	40 %	40 %	0 %	20 %	56707276
71	NC_006570	CATTT	2	10	105239	105248	20 %	60 %	0 %	20 %	56707276
72	NC_006570	ACAAT	2	10	105440	105449	60 %	20 %	0 %	20 %	56707276
73	NC_006570	AAACT	2	10	108577	108586	60 %	20 %	0 %	20 %	56707278
74	NC_006570	TTCAT	2	10	110009	110018	20 %	60 %	0 %	20 %	56707279
75	NC_006570	AGCAC	2	10	110909	110918	40 %	0 %	20 %	40 %	56707279
76	NC_006570	CTCTA	2	10	111535	111544	20 %	40 %	0 %	40 %	56707279
77	NC_006570	AAACT	2	10	111681	111690	60 %	20 %	0 %	20 %	56707279
78	NC_006570	TTTTC	2	10	115121	115130	0 %	80 %	0 %	20 %	56707282
79	NC_006570	GTTTG	2	10	115154	115163	0 %	60 %	40 %	0 %	56707282
80	NC_006570	TAAAA	2	10	117354	117363	80 %	20 %	0 %	0 %	56707284
81	NC_006570	CAAGC	2	10	119185	119194	40 %	0 %	20 %	40 %	56707285
82	NC_006570	GCTTT	2	10	119284	119293	0 %	60 %	20 %	20 %	56707285
83	NC_006570	CAAAA	2	10	122694	122703	80 %	0 %	0 %	20 %	56707287
84	NC_006570	TTTTA	2	10	124962	124971	20 %	80 %	0 %	0 %	56707289
85	NC_006570	TGTAT	2	10	125493	125502	20 %	60 %	20 %	0 %	56707290
86	NC_006570	TGCAA	2	10	125961	125970	40 %	20 %	20 %	20 %	56707290
87	NC_006570	GTATT	2	10	130765	130774	20 %	60 %	20 %	0 %	56707294
88	NC_006570	ATTAC	2	10	140004	140013	40 %	40 %	0 %	20 %	56707299
89	NC_006570	CTGGT	2	10	142351	142360	0 %	40 %	40 %	20 %	56707301
90	NC_006570	CATCT	2	10	143921	143930	20 %	40 %	0 %	40 %	56707302
91	NC_006570	TTCTT	2	10	143993	144002	0 %	80 %	0 %	20 %	56707302
92	NC_006570	ATCTT	2	10	144924	144933	20 %	60 %	0 %	20 %	56707303
93	NC_006570	CTTAT	2	10	146251	146260	20 %	60 %	0 %	20 %	56707304
94	NC_006570	AAATC	2	10	148254	148263	60 %	20 %	0 %	20 %	56707306
95	NC_006570	GGTAA	2	10	153471	153480	40 %	20 %	40 %	0 %	56707311
96	NC_006570	AATGA	2	10	153916	153925	60 %	20 %	20 %	0 %	56707312
97	NC_006570	TTCCT	2	10	156934	156943	0 %	60 %	0 %	40 %	56707314
98	NC_006570	CTAAG	2	10	160202	160211	40 %	20 %	20 %	20 %	56707315
99	NC_006570	TACAT	2	10	160335	160344	40 %	40 %	0 %	20 %	56707315
100	NC_006570	CTATA	2	10	160582	160591	40 %	40 %	0 %	20 %	56707315
101	NC_006570	GTGAT	2	10	162089	162098	20 %	40 %	40 %	0 %	56707315
102	NC_006570	ATGGT	2	10	162500	162509	20 %	40 %	40 %	0 %	56707315
103	NC_006570	ACTAC	2	10	168930	168939	40 %	20 %	0 %	40 %	56707322
104	NC_006570	TGCTA	2	10	169243	169252	20 %	40 %	20 %	20 %	56707322
105	NC_006570	AGAGA	2	10	169830	169839	60 %	0 %	40 %	0 %	56707323
106	NC_006570	AGCTA	2	10	170358	170367	40 %	20 %	20 %	20 %	56707324
107	NC_006570	TAAAA	2	10	173746	173755	80 %	20 %	0 %	0 %	56707328
108	NC_006570	AGCTA	2	10	174582	174591	40 %	20 %	20 %	20 %	56707329
109	NC_006570	AGTAA	2	10	174772	174781	60 %	20 %	20 %	0 %	56707329
110	NC_006570	GCATG	2	10	176653	176662	20 %	20 %	40 %	20 %	56707332
111	NC_006570	TACCT	2	10	177169	177178	20 %	40 %	0 %	40 %	56707333
112	NC_006570	GATGA	2	10	178738	178747	40 %	20 %	40 %	0 %	56707333
113	NC_006570	CAAAA	2	10	179469	179478	80 %	0 %	0 %	20 %	56707334
114	NC_006570	GTAAT	2	10	180937	180946	40 %	40 %	20 %	0 %	56707335
115	NC_006570	TTTTC	2	10	181340	181349	0 %	80 %	0 %	20 %	56707335
116	NC_006570	TTGCT	2	10	181705	181714	0 %	60 %	20 %	20 %	56707336
117	NC_006570	TTACT	2	10	181737	181746	20 %	60 %	0 %	20 %	56707336
118	NC_006570	TAAAA	2	10	182571	182580	80 %	20 %	0 %	0 %	56707337
119	NC_006570	TAAGA	2	10	183402	183411	60 %	20 %	20 %	0 %	56707337
120	NC_006570	AAAGA	2	10	186339	186348	80 %	0 %	20 %	0 %	56707340
121	NC_006570	GATTT	2	10	188694	188703	20 %	60 %	20 %	0 %	56707341
122	NC_006570	ATTTT	2	10	192752	192761	20 %	80 %	0 %	0 %	56707344
123	NC_006570	TTTAC	2	10	196462	196471	20 %	60 %	0 %	20 %	56707345
124	NC_006570	TAGTT	2	10	198155	198164	20 %	60 %	20 %	0 %	56707347
125	NC_006570	CTTCT	2	10	198614	198623	0 %	60 %	0 %	40 %	56707348
126	NC_006570	TGATC	2	10	199039	199048	20 %	40 %	20 %	20 %	56707348
127	NC_006570	TTAAC	2	10	199269	199278	40 %	40 %	0 %	20 %	56707348
128	NC_006570	TAGCA	2	10	199600	199609	40 %	20 %	20 %	20 %	56707348
129	NC_006570	CAAAG	2	10	202062	202071	60 %	0 %	20 %	20 %	56707351
130	NC_006570	TAAGT	2	10	203702	203711	40 %	40 %	20 %	0 %	56707352
131	NC_006570	AAGAA	2	10	209079	209088	80 %	0 %	20 %	0 %	56707357
132	NC_006570	GTATG	2	10	210426	210435	20 %	40 %	40 %	0 %	56707357
133	NC_006570	AAATC	2	10	211909	211918	60 %	20 %	0 %	20 %	56707359
134	NC_006570	TAAAA	2	10	211950	211959	80 %	20 %	0 %	0 %	56707359
135	NC_006570	TAAAA	2	10	212237	212246	80 %	20 %	0 %	0 %	56707359
136	NC_006570	ATTCT	2	10	212736	212745	20 %	60 %	0 %	20 %	56707360
137	NC_006570	AAACT	2	10	212793	212802	60 %	20 %	0 %	20 %	56707360
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