Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 258

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_006569CCGAGG21254255316.67 %0 %50 %33.33 %56709230
2NC_006569ACCTGC2122657266816.67 %16.67 %16.67 %50 %56708793
3NC_006569GCTATG2122861287216.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56708793
4NC_006569GCAAGC2123765377633.33 %0 %33.33 %33.33 %56708794
5NC_006569TGGCGG212549455050 %16.67 %66.67 %16.67 %56708797
6NC_006569CATTGC2126698670916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %56708799
7NC_006569GCTGGC212832983400 %16.67 %50 %33.33 %56708801
8NC_006569GGCCGG21211688116990 %0 %66.67 %33.33 %56708804
9NC_006569CCGGTG21213416134270 %16.67 %50 %33.33 %56708806
10NC_006569GGTGCC21213436134470 %16.67 %50 %33.33 %56708806
11NC_006569CCGAGG212146191463016.67 %0 %50 %33.33 %56708807
12NC_006569CAGGAA212150471505850 %0 %33.33 %16.67 %56708808
13NC_006569CAGCGC212165241653516.67 %0 %33.33 %50 %56708809
14NC_006569CAGCGC212165931660416.67 %0 %33.33 %50 %56708809
15NC_006569GCCAGC212171491716016.67 %0 %33.33 %50 %56708810
16NC_006569GTCCTC21218466184770 %33.33 %16.67 %50 %56708812
17NC_006569GTGTCA212193141932516.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56708812
18NC_006569GCGCCT21219502195130 %16.67 %33.33 %50 %56708811
19NC_006569ACCTCG212212872129816.67 %16.67 %16.67 %50 %56708815
20NC_006569TTGCTG21222450224610 %50 %33.33 %16.67 %56708816
21NC_006569TTCCAG212225992261016.67 %33.33 %16.67 %33.33 %56708816
22NC_006569TCATAG212226932270433.33 %33.33 %16.67 %16.67 %56708816
23NC_006569TGCCGG21225313253240 %16.67 %50 %33.33 %56708818
24NC_006569AATACG212261832619450 %16.67 %16.67 %16.67 %56708818
25NC_006569GATGGC212294692948016.67 %16.67 %50 %16.67 %56708822
26NC_006569TGATCG212295612957216.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56708823
27NC_006569GCATCG212323893240016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56708826
28NC_006569GCCACA212357883579933.33 %0 %16.67 %50 %56708829
29NC_006569GGCCTC21238554385650 %16.67 %33.33 %50 %56708833
30NC_006569CGGCTC21247280472910 %16.67 %33.33 %50 %56708841
31NC_006569CGGCAT212478684787916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56708841
32NC_006569TGTCGA212490694908016.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56708842
33NC_006569CGCCAT212542755428616.67 %16.67 %16.67 %50 %56708849
34NC_006569GCCGAG212549875499816.67 %0 %50 %33.33 %56708849
35NC_006569CGAGGC212582555826616.67 %0 %50 %33.33 %56708851
36NC_006569GTCCTC21258609586200 %33.33 %16.67 %50 %56708851
37NC_006569CGGTGC21260364603750 %16.67 %50 %33.33 %56708852
38NC_006569CCAGGA212613316134233.33 %0 %33.33 %33.33 %56708853
39NC_006569GGCCGG21263668636790 %0 %66.67 %33.33 %56708854
40NC_006569GGCTGG21264871648820 %16.67 %66.67 %16.67 %56708855
41NC_006569TCGGGC21267739677500 %16.67 %50 %33.33 %56708858
42NC_006569CTTCGG21269315693260 %33.33 %33.33 %33.33 %56708860
43NC_006569TGATGC212696506966116.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56708860
44NC_006569TGGCGC21270000700110 %16.67 %50 %33.33 %56708861
45NC_006569CGACAC212712257123633.33 %0 %16.67 %50 %56708862
46NC_006569GGCACC212713797139016.67 %0 %33.33 %50 %56708863
47NC_006569AGGTCA212743107432133.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56708867
48NC_006569CGCGCC21274647746580 %0 %33.33 %66.67 %56708868
49NC_006569CGACCT212756117562216.67 %16.67 %16.67 %50 %56709231
50NC_006569CGAAGC212785007851133.33 %0 %33.33 %33.33 %56708870
51NC_006569TCGCAG212786397865016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56708870
52NC_006569ACCATC212842888429933.33 %16.67 %0 %50 %56708874
53NC_006569GATCGA212958629587333.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56708882
54NC_006569CGCTGG21296685966960 %16.67 %50 %33.33 %56708883
55NC_006569TGCCGT21297202972130 %33.33 %33.33 %33.33 %56708883
56NC_006569CCAGCG212986229863316.67 %0 %33.33 %50 %56708884
57NC_006569CGATCA212988739888433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %56708885
58NC_006569GAAGCC21210152410153533.33 %0 %33.33 %33.33 %56708888
59NC_006569TCGGTA21210290510291616.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56708889
60NC_006569TGGGGA21210892210893316.67 %16.67 %66.67 %0 %56708895
61NC_006569TTCGCC2121092651092760 %33.33 %16.67 %50 %56708895
62NC_006569TCCTTT2121107881107990 %66.67 %0 %33.33 %56709232
63NC_006569GGCCTC2121117911118020 %16.67 %33.33 %50 %56708896
64NC_006569CCGTCC2121121331121440 %16.67 %16.67 %66.67 %56708897
65NC_006569TGCGCC2121126321126430 %16.67 %33.33 %50 %56708897
66NC_006569GGTGAA21211272611273733.33 %16.67 %50 %0 %56708897
67NC_006569GATCGA21211437811438933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56708898
68NC_006569TCTCCC2121157771157880 %33.33 %0 %66.67 %56708898
69NC_006569ACGAAC21211984711985850 %0 %16.67 %33.33 %56708901
70NC_006569TGTCGA21212112512113616.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56708903
71NC_006569CGGATG21212212012213116.67 %16.67 %50 %16.67 %56708904
72NC_006569CGTGAT21212442612443716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56708906
73NC_006569TGATCC21212473712474816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %56708906
74NC_006569TTCCTG2121336791336900 %50 %16.67 %33.33 %56708911
75NC_006569ACTGGA21213397813398933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56708911
76NC_006569TTCAGG21213742813743916.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56708914
77NC_006569GCGGCC2121405901406010 %0 %50 %50 %56708917
78NC_006569TCGACC21214063814064916.67 %16.67 %16.67 %50 %56708917
79NC_006569CATCCT21214071414072516.67 %33.33 %0 %50 %56708917
80NC_006569CAGGCC21214099814100916.67 %0 %33.33 %50 %56708917
81NC_006569CCAAAG21214107314108450 %0 %16.67 %33.33 %56708917
82NC_006569GCAGGG21214148414149516.67 %0 %66.67 %16.67 %56708917
83NC_006569TCACCC21214212414213516.67 %16.67 %0 %66.67 %56708918
84NC_006569CGCGGG2121428381428490 %0 %66.67 %33.33 %56708919
85NC_006569TGCCCG2121429331429440 %16.67 %33.33 %50 %56708919
86NC_006569CGCTGA21214777814778916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56708923
87NC_006569CGAGGG21214828914830016.67 %0 %66.67 %16.67 %56708923
88NC_006569CACCGC21214983514984616.67 %0 %16.67 %66.67 %56708925
89NC_006569ATCTTC21215477415478516.67 %50 %0 %33.33 %56708930
90NC_006569ACCGGG21215479215480316.67 %0 %50 %33.33 %56708930
91NC_006569GCCAGC21215957615958716.67 %0 %33.33 %50 %56708934
92NC_006569CGCCAG21215968015969116.67 %0 %33.33 %50 %56708934
93NC_006569CAGCGC21215998315999416.67 %0 %33.33 %50 %56708934
94NC_006569GCCACC21216043516044616.67 %0 %16.67 %66.67 %56708935
95NC_006569AACCGG21216228316229433.33 %0 %33.33 %33.33 %56708936
96NC_006569CTGCCG2121631111631220 %16.67 %33.33 %50 %56708937
97NC_006569ATCGCC21216516716517816.67 %16.67 %16.67 %50 %56708939
98NC_006569GGCGCT2121653731653840 %16.67 %50 %33.33 %56708939
99NC_006569ACGCTG21216624316625416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56708940
100NC_006569TCTCGA21216749916751016.67 %33.33 %16.67 %33.33 %56708941
101NC_006569GCGCTG2121694181694290 %16.67 %50 %33.33 %56708941
102NC_006569CGATCA21217071517072633.33 %16.67 %16.67 %33.33 %56708941
103NC_006569CATTGG21217086517087616.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56708941
104NC_006569GCTTGG2121743051743160 %33.33 %50 %16.67 %56708944
105NC_006569CTCGGC2121748011748120 %16.67 %33.33 %50 %56708944
106NC_006569CAGGAT21217612717613833.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56708946
107NC_006569CCCGAT21217618417619516.67 %16.67 %16.67 %50 %56708946
108NC_006569TGAACA21217735317736450 %16.67 %16.67 %16.67 %56708946
109NC_006569GGCACC21218262518263616.67 %0 %33.33 %50 %56708951
110NC_006569GCTGGG2121859311859420 %16.67 %66.67 %16.67 %56708953
111NC_006569AGCTGG21219072019073116.67 %16.67 %50 %16.67 %56708960
112NC_006569GCCAGG21219599019600116.67 %0 %50 %33.33 %56708966
113NC_006569TCGGCC2122003562003670 %16.67 %33.33 %50 %56708971
114NC_006569GGCAAT21220046620047733.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56708971
115NC_006569GCCAAA21220272720273850 %0 %16.67 %33.33 %56708974
116NC_006569CAGCGT21220849420850516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56708982
117NC_006569GCCCCA21220889520890616.67 %0 %16.67 %66.67 %56708982
118NC_006569GGCAAA21220955320956450 %0 %33.33 %16.67 %56708982
119NC_006569CCACAG21220982020983133.33 %0 %16.67 %50 %56708982
120NC_006569CATGGG21221196321197416.67 %16.67 %50 %16.67 %56708984
121NC_006569GGCCCC2122181142181250 %0 %33.33 %66.67 %56708987
122NC_006569CGGTGC2122236922237030 %16.67 %50 %33.33 %56708989
123NC_006569CGACCC21222775622776716.67 %0 %16.67 %66.67 %56708991
124NC_006569CCCGGC2122283772283880 %0 %33.33 %66.67 %56708992
125NC_006569GGGCAT21223101823102916.67 %16.67 %50 %16.67 %56708993
126NC_006569GTCATC21223598723599816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %56708998
127NC_006569GCCTCG2122366362366470 %16.67 %33.33 %50 %56708998
128NC_006569CAAAGG21223824323825450 %0 %33.33 %16.67 %56709000
129NC_006569GAACAG21223855923857050 %0 %33.33 %16.67 %56709000
130NC_006569GGTCGA21223942623943716.67 %16.67 %50 %16.67 %56709001
131NC_006569CGCCAG21224110424111516.67 %0 %33.33 %50 %56709003
132NC_006569ATCGAC21224262424263533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %56709004
133NC_006569CGTCAA21224307624308733.33 %16.67 %16.67 %33.33 %56709004
134NC_006569GGGCGC2122466452466560 %0 %66.67 %33.33 %56709008
135NC_006569CCCGAA21224773024774133.33 %0 %16.67 %50 %56709010
136NC_006569CGACGC21224885824886916.67 %0 %33.33 %50 %56709011
137NC_006569GGGCGA21224969324970416.67 %0 %66.67 %16.67 %56709012
138NC_006569CCGATC21225166925168016.67 %16.67 %16.67 %50 %56709014
139NC_006569GTCGGG2122535572535680 %16.67 %66.67 %16.67 %56709016
140NC_006569AGGGCC21225588625589716.67 %0 %50 %33.33 %56709017
141NC_006569CGGAAC21225780625781733.33 %0 %33.33 %33.33 %56709019
142NC_006569GCGACA21225988825989933.33 %0 %33.33 %33.33 %56709020
143NC_006569ACCGGC21226048926050016.67 %0 %33.33 %50 %56709021
144NC_006569TTCTGG2122631842631950 %50 %33.33 %16.67 %56709024
145NC_006569ATAGGC21227168427169533.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56709031
146NC_006569CATGGC21227742927744016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56709037
147NC_006569TCAGGT21227932027933116.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56709038
148NC_006569CAGGGC21228200128201216.67 %0 %50 %33.33 %56709041
149NC_006569CCAGAA21228347828348950 %0 %16.67 %33.33 %56709042
150NC_006569CAGGGC21228366228367316.67 %0 %50 %33.33 %56709042
151NC_006569GCACCT21228900428901516.67 %16.67 %16.67 %50 %56709046
152NC_006569TGCCGA21229162429163516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56709049
153NC_006569GATCGG21229257929259016.67 %16.67 %50 %16.67 %56709050
154NC_006569TGGTGA21229270429271516.67 %33.33 %50 %0 %56709050
155NC_006569TTCCAG21229330729331816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %56709051
156NC_006569CCGATC21229495229496316.67 %16.67 %16.67 %50 %56709052
157NC_006569CTCGGT2122955242955350 %33.33 %33.33 %33.33 %56709053
158NC_006569CATCTT21229561729562816.67 %50 %0 %33.33 %56709053
159NC_006569CTGGGC2122965452965560 %16.67 %50 %33.33 %56709053
160NC_006569AGATCG21229962729963833.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56709056
161NC_006569CTTGCC2123008703008810 %33.33 %16.67 %50 %56709057
162NC_006569ATGGTG21230600730601816.67 %33.33 %50 %0 %56709062
163NC_006569AACAGC21230744930746050 %0 %16.67 %33.33 %56709063
164NC_006569TGCGGG2123092723092830 %16.67 %66.67 %16.67 %56709065
165NC_006569GCACCC21230955730956816.67 %0 %16.67 %66.67 %56709065
166NC_006569CGGCAG21231035931037016.67 %0 %50 %33.33 %56709066
167NC_006569GGTCGA21231063731064816.67 %16.67 %50 %16.67 %56709066
168NC_006569CGATCT21231538931540016.67 %33.33 %16.67 %33.33 %56709070
169NC_006569CCACCG21231551531552616.67 %0 %16.67 %66.67 %56709071
170NC_006569CTGCCG2123165063165170 %16.67 %33.33 %50 %56709071
171NC_006569GGTGAT21231947531948616.67 %33.33 %50 %0 %56709073
172NC_006569CCCGAG21232399732400816.67 %0 %33.33 %50 %56709078
173NC_006569GGCGCA21233211733212816.67 %0 %50 %33.33 %56709086
174NC_006569CGACAG21233728833729933.33 %0 %33.33 %33.33 %56709090
175NC_006569GCAAGC21234110934112033.33 %0 %33.33 %33.33 %56709091
176NC_006569GGCCAT21234453634454716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56709093
177NC_006569GGCATG21235528435529516.67 %16.67 %50 %16.67 %56709098
178NC_006569GGCGAG21235620635621716.67 %0 %66.67 %16.67 %56709099
179NC_006569GCGGGC2123598853598960 %0 %66.67 %33.33 %56709101
180NC_006569GCGCCT2123643683643790 %16.67 %33.33 %50 %56709107
181NC_006569GGACAA21236871436872550 %0 %33.33 %16.67 %56709110
182NC_006569ATGTGG21237057137058216.67 %33.33 %50 %0 %56709111
183NC_006569TCGCAA21237198437199533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %56709113
184NC_006569TGCGAT21237408537409616.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56709114
185NC_006569ACCGCG21237637837638916.67 %0 %33.33 %50 %56709117
186NC_006569ACGGCA21238459638460733.33 %0 %33.33 %33.33 %56709123
187NC_006569TCGTCA21238626638627716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %56709125
188NC_006569CCAGGC21238674938676016.67 %0 %33.33 %50 %56709126
189NC_006569GCCGCT2123897993898100 %16.67 %33.33 %50 %56709129
190NC_006569CGATGA21239078639079733.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56709130
191NC_006569GCTGCC2124004754004860 %16.67 %33.33 %50 %56709140
192NC_006569GCGCCC2124020234020340 %0 %33.33 %66.67 %56709141
193NC_006569GCGCCT2124030994031100 %16.67 %33.33 %50 %56709142
194NC_006569CCCGCG2124033794033900 %0 %33.33 %66.67 %56709142
195NC_006569CGGATG21240407240408316.67 %16.67 %50 %16.67 %56709143
196NC_006569TGGCGC2124049504049610 %16.67 %50 %33.33 %56709144
197NC_006569GTGATC21240846140847216.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56709147
198NC_006569CCGGCG2124085094085200 %0 %50 %50 %56709147
199NC_006569GCATCT21241180941182016.67 %33.33 %16.67 %33.33 %56709149
200NC_006569GGGTCA21241319441320516.67 %16.67 %50 %16.67 %56709151
201NC_006569ACAGGT21241326341327433.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56709151
202NC_006569GCCATC21241361641362716.67 %16.67 %16.67 %50 %56709151
203NC_006569CGGCCT2124144054144160 %16.67 %33.33 %50 %56709152
204NC_006569CCATGC21241455841456916.67 %16.67 %16.67 %50 %56709152
205NC_006569CAGCCG21241487741488816.67 %0 %33.33 %50 %56709152
206NC_006569GATCAG21241814541815633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56709155
207NC_006569GCACCG21241879541880616.67 %0 %33.33 %50 %56709156
208NC_006569CCTATC21241992341993416.67 %33.33 %0 %50 %56709157
209NC_006569CGATGG21242028142029216.67 %16.67 %50 %16.67 %56709157
210NC_006569AGACCA21242380742381850 %0 %16.67 %33.33 %56709159
211NC_006569GTCGAG21242434042435116.67 %16.67 %50 %16.67 %56709160
212NC_006569GTGGAT21242588142589216.67 %33.33 %50 %0 %56709161
213NC_006569CAGGCG21242603142604216.67 %0 %50 %33.33 %56709161
214NC_006569CGGGGC2124273434273540 %0 %66.67 %33.33 %56709162
215NC_006569GCCAGC21242980342981416.67 %0 %33.33 %50 %56709164
216NC_006569GACCGC21243231643232716.67 %0 %33.33 %50 %56709167
217NC_006569TCTGGA21243369943371016.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56709168
218NC_006569GGCTGG2124339114339220 %16.67 %66.67 %16.67 %56709168
219NC_006569GACCGA21243482543483633.33 %0 %33.33 %33.33 %56709168
220NC_006569CTCGCC2124391504391610 %16.67 %16.67 %66.67 %56709172
221NC_006569CCGCGC2124392394392500 %0 %33.33 %66.67 %56709172
222NC_006569GGGCGC2124398614398720 %0 %66.67 %33.33 %56709172
223NC_006569TGGCCG2124433064433170 %16.67 %50 %33.33 %56709176
224NC_006569CGGGTG2124439254439360 %16.67 %66.67 %16.67 %56709177
225NC_006569ACGAGG21244527944529033.33 %0 %50 %16.67 %56709179
226NC_006569CGATGG21244598444599516.67 %16.67 %50 %16.67 %56709180
227NC_006569CGATGG21244635844636916.67 %16.67 %50 %16.67 %56709181
228NC_006569ATGGCC21244675544676616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56709182
229NC_006569CAAAGG21244905244906350 %0 %33.33 %16.67 %56709184
230NC_006569CATCCA21244947044948133.33 %16.67 %0 %50 %56709185
231NC_006569GGCGCG2124502844502950 %0 %66.67 %33.33 %56709185
232NC_006569GCCTCG2124504904505010 %16.67 %33.33 %50 %56709186
233NC_006569CGCGCC2124508434508540 %0 %33.33 %66.67 %56709186
234NC_006569AGGGCA21245167945169033.33 %0 %50 %16.67 %56709187
235NC_006569GGCGAT21245201145202216.67 %16.67 %50 %16.67 %56709187
236NC_006569CCCGCG2124520304520410 %0 %33.33 %66.67 %56709187
237NC_006569CGCAGG21245360445361516.67 %0 %50 %33.33 %56709229
238NC_006569TGAAGG21245417845418933.33 %16.67 %50 %0 %56709229
239NC_006569ATCAGC21245531745532833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %56709189
240NC_006569AGGCCG21245539645540716.67 %0 %50 %33.33 %56709189
241NC_006569ATGCCC21246051946053016.67 %16.67 %16.67 %50 %56709195
242NC_006569TGGCGC2124612304612410 %16.67 %50 %33.33 %56709195
243NC_006569GCCTCG2124613164613270 %16.67 %33.33 %50 %56709195
244NC_006569CCGCTG2124621414621520 %16.67 %33.33 %50 %56709195
245NC_006569CCTCGA21246428546429616.67 %16.67 %16.67 %50 %56709198
246NC_006569CTGGCC2124656464656570 %16.67 %33.33 %50 %56709199
247NC_006569GTCATA21246995546996633.33 %33.33 %16.67 %16.67 %56709205
248NC_006569GCTCCG2124716164716270 %16.67 %33.33 %50 %56709205
249NC_006569ATGGCG21247191247192316.67 %16.67 %50 %16.67 %56709206
250NC_006569GATGTC21247201347202416.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56709206
251NC_006569TGTCGG2124723364723470 %33.33 %50 %16.67 %56709206
252NC_006569GGTGGC2124737654737760 %16.67 %66.67 %16.67 %56709207
253NC_006569ACCTCG21247835347836416.67 %16.67 %16.67 %50 %56709211
254NC_006569GATCAG21247881347882433.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56709212
255NC_006569CCTCGT2124845064845170 %33.33 %16.67 %50 %56709217
256NC_006569GTCAGC21248625148626216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56709220
257NC_006569CCAGAC21248976348977433.33 %0 %16.67 %50 %56709225
258NC_006569GGTCGG2124909684909790 %16.67 %66.67 %16.67 %56709227