MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 1155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006569	CGCC	2	8	239	246	0 %	0 %	25 %	75 %	56709230
2	NC_006569	GGCA	2	8	1051	1058	25 %	0 %	50 %	25 %	56708792
3	NC_006569	CGAG	2	8	1288	1295	25 %	0 %	50 %	25 %	56708792
4	NC_006569	GCCT	2	8	1748	1755	0 %	25 %	25 %	50 %	56708792
5	NC_006569	AGCG	2	8	1933	1940	25 %	0 %	50 %	25 %	56708793
6	NC_006569	CCCG	2	8	2894	2901	0 %	0 %	25 %	75 %	56708793
7	NC_006569	GCTG	2	8	3171	3178	0 %	25 %	50 %	25 %	56708793
8	NC_006569	GGAT	2	8	4145	4152	25 %	25 %	50 %	0 %	56708795
9	NC_006569	GGGC	2	8	4617	4624	0 %	0 %	75 %	25 %	56708796
10	NC_006569	ACCG	2	8	4954	4961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006569	GAAC	2	8	5444	5451	50 %	0 %	25 %	25 %	56708797
12	NC_006569	TGCA	2	8	6089	6096	25 %	25 %	25 %	25 %	56708798
13	NC_006569	GGCT	2	8	6166	6173	0 %	25 %	50 %	25 %	56708798
14	NC_006569	GGCC	2	8	6610	6617	0 %	0 %	50 %	50 %	56708799
15	NC_006569	AACC	2	8	7072	7079	50 %	0 %	0 %	50 %	56708800
16	NC_006569	TGGG	2	8	7678	7685	0 %	25 %	75 %	0 %	56708800
17	NC_006569	TGAT	2	8	7762	7769	25 %	50 %	25 %	0 %	56708800
18	NC_006569	TGGC	2	8	7919	7926	0 %	25 %	50 %	25 %	56708801
19	NC_006569	GGCG	2	8	8113	8120	0 %	0 %	75 %	25 %	56708801
20	NC_006569	GGGC	3	12	8389	8400	0 %	0 %	75 %	25 %	56708801
21	NC_006569	CTGG	2	8	8638	8645	0 %	25 %	50 %	25 %	56708801
22	NC_006569	GCGG	3	12	8762	8773	0 %	0 %	75 %	25 %	56708801
23	NC_006569	GGCC	2	8	9049	9056	0 %	0 %	50 %	50 %	56708801
24	NC_006569	AACC	2	8	9725	9732	50 %	0 %	0 %	50 %	56708802
25	NC_006569	GCTG	2	8	10093	10100	0 %	25 %	50 %	25 %	56708802
26	NC_006569	CCGG	2	8	11000	11007	0 %	0 %	50 %	50 %	56708803
27	NC_006569	CGAC	2	8	11117	11124	25 %	0 %	25 %	50 %	56708803
28	NC_006569	TGCG	2	8	11671	11678	0 %	25 %	50 %	25 %	56708804
29	NC_006569	GTCG	2	8	11757	11764	0 %	25 %	50 %	25 %	56708804
30	NC_006569	CCGC	2	8	12090	12097	0 %	0 %	25 %	75 %	56708805
31	NC_006569	CTGG	2	8	12261	12268	0 %	25 %	50 %	25 %	56708805
32	NC_006569	TGGC	2	8	12655	12662	0 %	25 %	50 %	25 %	56708805
33	NC_006569	AGAA	2	8	12839	12846	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006569	TTGC	2	8	13473	13480	0 %	50 %	25 %	25 %	56708806
35	NC_006569	CGGG	2	8	13749	13756	0 %	0 %	75 %	25 %	56708806
36	NC_006569	AGTG	2	8	15401	15408	25 %	25 %	50 %	0 %	56708808
37	NC_006569	GCGG	2	8	16826	16833	0 %	0 %	75 %	25 %	56708810
38	NC_006569	GCAG	2	8	16870	16877	25 %	0 %	50 %	25 %	56708810
39	NC_006569	GCCA	2	8	16951	16958	25 %	0 %	25 %	50 %	56708810
40	NC_006569	TCGG	2	8	17125	17132	0 %	25 %	50 %	25 %	56708810
41	NC_006569	GGCG	2	8	17336	17343	0 %	0 %	75 %	25 %	56708810
42	NC_006569	CAGA	2	8	17475	17482	50 %	0 %	25 %	25 %	56708810
43	NC_006569	TGCC	2	8	17585	17592	0 %	25 %	25 %	50 %	56708810
44	NC_006569	CACC	2	8	17597	17604	25 %	0 %	0 %	75 %	56708810
45	NC_006569	CGAC	2	8	18129	18136	25 %	0 %	25 %	50 %	56708812
46	NC_006569	CATG	2	8	18801	18808	25 %	25 %	25 %	25 %	56708812
47	NC_006569	GTCG	2	8	19569	19576	0 %	25 %	50 %	25 %	56708811
48	NC_006569	CCCG	2	8	20196	20203	0 %	0 %	25 %	75 %	56708813
49	NC_006569	CGGG	2	8	20503	20510	0 %	0 %	75 %	25 %	56708814
50	NC_006569	GGCG	2	8	21208	21215	0 %	0 %	75 %	25 %	56708814
51	NC_006569	CGGG	2	8	21738	21745	0 %	0 %	75 %	25 %	56708815
52	NC_006569	CCGC	2	8	21965	21972	0 %	0 %	25 %	75 %	56708815
53	NC_006569	TTTC	2	8	22970	22977	0 %	75 %	0 %	25 %	56708816
54	NC_006569	GGTG	2	8	23007	23014	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006569	CCGC	2	8	23423	23430	0 %	0 %	25 %	75 %	56708817
56	NC_006569	CAAG	2	8	23607	23614	50 %	0 %	25 %	25 %	56708817
57	NC_006569	TTGA	2	8	23642	23649	25 %	50 %	25 %	0 %	56708817
58	NC_006569	TAAA	2	8	24563	24570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006569	CCGC	2	8	24626	24633	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_006569	TAGG	2	8	24849	24856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006569	GGCG	2	8	25509	25516	0 %	0 %	75 %	25 %	56708818
62	NC_006569	GTCG	2	8	25518	25525	0 %	25 %	50 %	25 %	56708818
63	NC_006569	CTGG	2	8	25555	25562	0 %	25 %	50 %	25 %	56708818
64	NC_006569	GATC	2	8	25805	25812	25 %	25 %	25 %	25 %	56708818
65	NC_006569	GCGG	2	8	25817	25824	0 %	0 %	75 %	25 %	56708818
66	NC_006569	GAAG	2	8	26794	26801	50 %	0 %	50 %	0 %	56708819
67	NC_006569	GCGT	2	8	26848	26855	0 %	25 %	50 %	25 %	56708819
68	NC_006569	TGGA	2	8	26990	26997	25 %	25 %	50 %	0 %	56708819
69	NC_006569	GCCT	2	8	27047	27054	0 %	25 %	25 %	50 %	56708819
70	NC_006569	GCCA	2	8	27260	27267	25 %	0 %	25 %	50 %	56708819
71	NC_006569	GTCT	2	8	27537	27544	0 %	50 %	25 %	25 %	56708820
72	NC_006569	TCGG	2	8	28161	28168	0 %	25 %	50 %	25 %	56708820
73	NC_006569	AAGA	2	8	28262	28269	75 %	0 %	25 %	0 %	56708821
74	NC_006569	GGCG	2	8	29385	29392	0 %	0 %	75 %	25 %	56708822
75	NC_006569	CCGA	2	8	29791	29798	25 %	0 %	25 %	50 %	56708823
76	NC_006569	GAAC	2	8	30129	30136	50 %	0 %	25 %	25 %	56708823
77	NC_006569	CCGG	2	8	30238	30245	0 %	0 %	50 %	50 %	56708823
78	NC_006569	GCTG	2	8	30492	30499	0 %	25 %	50 %	25 %	56708823
79	NC_006569	TGCT	2	8	31397	31404	0 %	50 %	25 %	25 %	56708825
80	NC_006569	GCCC	2	8	31483	31490	0 %	0 %	25 %	75 %	56708825
81	NC_006569	TGTT	2	8	33183	33190	0 %	75 %	25 %	0 %	56708828
82	NC_006569	GGGC	2	8	33432	33439	0 %	0 %	75 %	25 %	56708828
83	NC_006569	GATC	2	8	34018	34025	25 %	25 %	25 %	25 %	56708828
84	NC_006569	GAGT	2	8	34324	34331	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006569	CCCG	2	8	34572	34579	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_006569	ATCG	2	8	35231	35238	25 %	25 %	25 %	25 %	56708829
87	NC_006569	GGTC	2	8	36235	36242	0 %	25 %	50 %	25 %	56708829
88	NC_006569	AGAA	2	8	36679	36686	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006569	TTTC	2	8	36702	36709	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_006569	ATGC	2	8	37105	37112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_006569	AGCC	2	8	37352	37359	25 %	0 %	25 %	50 %	56708831
92	NC_006569	AGGA	2	8	37403	37410	50 %	0 %	50 %	0 %	56708831
93	NC_006569	GCGG	2	8	37519	37526	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_006569	CGTG	2	8	37700	37707	0 %	25 %	50 %	25 %	56708832
95	NC_006569	CCGC	2	8	37713	37720	0 %	0 %	25 %	75 %	56708832
96	NC_006569	GCCA	2	8	37989	37996	25 %	0 %	25 %	50 %	56708832
97	NC_006569	CGGG	2	8	38008	38015	0 %	0 %	75 %	25 %	56708832
98	NC_006569	GGGA	2	8	38029	38036	25 %	0 %	75 %	0 %	56708832
99	NC_006569	GGGC	2	8	39339	39346	0 %	0 %	75 %	25 %	56708834
100	NC_006569	CCGC	3	12	39496	39507	0 %	0 %	25 %	75 %	56708834
101	NC_006569	GCGG	2	8	39764	39771	0 %	0 %	75 %	25 %	56708834
102	NC_006569	TGCT	2	8	39970	39977	0 %	50 %	25 %	25 %	56708835
103	NC_006569	TCGA	2	8	40649	40656	25 %	25 %	25 %	25 %	56708836
104	NC_006569	CAGC	2	8	40876	40883	25 %	0 %	25 %	50 %	56708836
105	NC_006569	ATCC	2	8	41233	41240	25 %	25 %	0 %	50 %	56708836
106	NC_006569	CGCC	2	8	41250	41257	0 %	0 %	25 %	75 %	56708836
107	NC_006569	TGCG	2	8	41420	41427	0 %	25 %	50 %	25 %	56708836
108	NC_006569	ATGA	2	8	41456	41463	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006569	CGGG	2	8	41691	41698	0 %	0 %	75 %	25 %	56708837
110	NC_006569	GTGA	2	8	41865	41872	25 %	25 %	50 %	0 %	56708837
111	NC_006569	CCCG	2	8	42119	42126	0 %	0 %	25 %	75 %	56708837
112	NC_006569	GATG	2	8	42749	42756	25 %	25 %	50 %	0 %	56708838
113	NC_006569	CGCC	2	8	42763	42770	0 %	0 %	25 %	75 %	56708838
114	NC_006569	CCAT	2	8	43152	43159	25 %	25 %	0 %	50 %	56708839
115	NC_006569	CGCC	2	8	43434	43441	0 %	0 %	25 %	75 %	56708839
116	NC_006569	GGCT	2	8	44450	44457	0 %	25 %	50 %	25 %	56708839
117	NC_006569	CCCG	2	8	44783	44790	0 %	0 %	25 %	75 %	56708839
118	NC_006569	CGAA	2	8	44901	44908	50 %	0 %	25 %	25 %	56708839
119	NC_006569	CCTG	2	8	44916	44923	0 %	25 %	25 %	50 %	56708839
120	NC_006569	CGCC	2	8	46629	46636	0 %	0 %	25 %	75 %	56708840
121	NC_006569	CGGG	2	8	47074	47081	0 %	0 %	75 %	25 %	56708841
122	NC_006569	CCGC	2	8	47333	47340	0 %	0 %	25 %	75 %	56708841
123	NC_006569	GACC	2	8	48294	48301	25 %	0 %	25 %	50 %	56708842
124	NC_006569	ATCC	2	8	48394	48401	25 %	25 %	0 %	50 %	56708842
125	NC_006569	CGCC	2	8	48547	48554	0 %	0 %	25 %	75 %	56708842
126	NC_006569	GCCA	2	8	48800	48807	25 %	0 %	25 %	50 %	56708842
127	NC_006569	ACCG	2	8	48833	48840	25 %	0 %	25 %	50 %	56708842
128	NC_006569	GCTG	2	8	49193	49200	0 %	25 %	50 %	25 %	56708843
129	NC_006569	GGCG	2	8	49371	49378	0 %	0 %	75 %	25 %	56708843
130	NC_006569	CTGG	2	8	49674	49681	0 %	25 %	50 %	25 %	56708843
131	NC_006569	CGCC	2	8	49883	49890	0 %	0 %	25 %	75 %	56708843
132	NC_006569	GGCG	2	8	50309	50316	0 %	0 %	75 %	25 %	56708844
133	NC_006569	GCCC	2	8	50563	50570	0 %	0 %	25 %	75 %	56708845
134	NC_006569	CGGG	2	8	50897	50904	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_006569	CGAG	2	8	50930	50937	25 %	0 %	50 %	25 %	56708846
136	NC_006569	CGCC	2	8	51014	51021	0 %	0 %	25 %	75 %	56708846
137	NC_006569	GAGC	2	8	51706	51713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_006569	CGGG	2	8	52853	52860	0 %	0 %	75 %	25 %	56708847
139	NC_006569	CACC	2	8	53527	53534	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_006569	CGTG	2	8	55526	55533	0 %	25 %	50 %	25 %	56708849
141	NC_006569	GATG	2	8	56384	56391	25 %	25 %	50 %	0 %	56708849
142	NC_006569	GCCC	2	8	56544	56551	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_006569	GATG	2	8	57357	57364	25 %	25 %	50 %	0 %	56708850
144	NC_006569	TGCC	2	8	58356	58363	0 %	25 %	25 %	50 %	56708851
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