MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 1280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006569	TG	3	6	436	441	0 %	50 %	50 %	0 %	56709230
2	NC_006569	GC	4	8	623	630	0 %	0 %	50 %	50 %	56709230
3	NC_006569	GC	3	6	688	693	0 %	0 %	50 %	50 %	56709230
4	NC_006569	GC	3	6	823	828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_006569	CG	3	6	1216	1221	0 %	0 %	50 %	50 %	56708792
6	NC_006569	CG	3	6	2228	2233	0 %	0 %	50 %	50 %	56708793
7	NC_006569	GC	4	8	2919	2926	0 %	0 %	50 %	50 %	56708793
8	NC_006569	GC	3	6	3509	3514	0 %	0 %	50 %	50 %	56708794
9	NC_006569	CA	3	6	3569	3574	50 %	0 %	0 %	50 %	56708794
10	NC_006569	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006569	CG	3	6	4498	4503	0 %	0 %	50 %	50 %	56708795
12	NC_006569	GC	3	6	5200	5205	0 %	0 %	50 %	50 %	56708797
13	NC_006569	CG	3	6	5872	5877	0 %	0 %	50 %	50 %	56708797
14	NC_006569	CG	4	8	6235	6242	0 %	0 %	50 %	50 %	56708798
15	NC_006569	GC	3	6	6976	6981	0 %	0 %	50 %	50 %	56708800
16	NC_006569	GC	3	6	7590	7595	0 %	0 %	50 %	50 %	56708800
17	NC_006569	CG	3	6	8167	8172	0 %	0 %	50 %	50 %	56708801
18	NC_006569	GC	3	6	8228	8233	0 %	0 %	50 %	50 %	56708801
19	NC_006569	GC	3	6	8378	8383	0 %	0 %	50 %	50 %	56708801
20	NC_006569	GC	4	8	8460	8467	0 %	0 %	50 %	50 %	56708801
21	NC_006569	GC	3	6	8684	8689	0 %	0 %	50 %	50 %	56708801
22	NC_006569	CG	4	8	8980	8987	0 %	0 %	50 %	50 %	56708801
23	NC_006569	CG	3	6	10283	10288	0 %	0 %	50 %	50 %	56708802
24	NC_006569	CG	3	6	10462	10467	0 %	0 %	50 %	50 %	56708802
25	NC_006569	GC	3	6	10744	10749	0 %	0 %	50 %	50 %	56708803
26	NC_006569	GC	3	6	11087	11092	0 %	0 %	50 %	50 %	56708803
27	NC_006569	GC	3	6	11925	11930	0 %	0 %	50 %	50 %	56708804
28	NC_006569	CG	3	6	11966	11971	0 %	0 %	50 %	50 %	56708804
29	NC_006569	GC	3	6	12043	12048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006569	CG	3	6	12467	12472	0 %	0 %	50 %	50 %	56708805
31	NC_006569	GC	3	6	12556	12561	0 %	0 %	50 %	50 %	56708805
32	NC_006569	CG	3	6	12638	12643	0 %	0 %	50 %	50 %	56708805
33	NC_006569	GC	3	6	12924	12929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_006569	GC	3	6	13118	13123	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
35	NC_006569	GC	3	6	13354	13359	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
36	NC_006569	CG	3	6	13654	13659	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
37	NC_006569	GC	4	8	13841	13848	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
38	NC_006569	GC	3	6	13889	13894	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
39	NC_006569	GC	3	6	14016	14021	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
40	NC_006569	GC	3	6	14027	14032	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
41	NC_006569	CG	3	6	14384	14389	0 %	0 %	50 %	50 %	56708807
42	NC_006569	GC	3	6	14527	14532	0 %	0 %	50 %	50 %	56708807
43	NC_006569	GC	3	6	14551	14556	0 %	0 %	50 %	50 %	56708807
44	NC_006569	GC	3	6	14662	14667	0 %	0 %	50 %	50 %	56708807
45	NC_006569	CG	4	8	14712	14719	0 %	0 %	50 %	50 %	56708807
46	NC_006569	GC	3	6	14750	14755	0 %	0 %	50 %	50 %	56708807
47	NC_006569	GC	3	6	14922	14927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006569	AC	3	6	16048	16053	50 %	0 %	0 %	50 %	56708809
49	NC_006569	GC	3	6	16110	16115	0 %	0 %	50 %	50 %	56708809
50	NC_006569	CG	4	8	16121	16128	0 %	0 %	50 %	50 %	56708809
51	NC_006569	CA	3	6	16428	16433	50 %	0 %	0 %	50 %	56708809
52	NC_006569	CG	3	6	16472	16477	0 %	0 %	50 %	50 %	56708809
53	NC_006569	CG	3	6	16924	16929	0 %	0 %	50 %	50 %	56708810
54	NC_006569	GC	3	6	16981	16986	0 %	0 %	50 %	50 %	56708810
55	NC_006569	CG	4	8	17304	17311	0 %	0 %	50 %	50 %	56708810
56	NC_006569	GC	3	6	18062	18067	0 %	0 %	50 %	50 %	56708812
57	NC_006569	GC	3	6	18245	18250	0 %	0 %	50 %	50 %	56708812
58	NC_006569	CG	3	6	18400	18405	0 %	0 %	50 %	50 %	56708812
59	NC_006569	TC	3	6	18498	18503	0 %	50 %	0 %	50 %	56708812
60	NC_006569	GC	3	6	19287	19292	0 %	0 %	50 %	50 %	56708812
61	NC_006569	GC	3	6	19693	19698	0 %	0 %	50 %	50 %	56708811
62	NC_006569	GC	4	8	19753	19760	0 %	0 %	50 %	50 %	56708813
63	NC_006569	GC	4	8	20291	20298	0 %	0 %	50 %	50 %	56708813
64	NC_006569	CG	3	6	20315	20320	0 %	0 %	50 %	50 %	56708813
65	NC_006569	CG	3	6	20438	20443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006569	GC	3	6	20780	20785	0 %	0 %	50 %	50 %	56708814
67	NC_006569	GC	3	6	20874	20879	0 %	0 %	50 %	50 %	56708814
68	NC_006569	TG	3	6	21100	21105	0 %	50 %	50 %	0 %	56708814
69	NC_006569	CG	3	6	21982	21987	0 %	0 %	50 %	50 %	56708815
70	NC_006569	CG	4	8	22643	22650	0 %	0 %	50 %	50 %	56708816
71	NC_006569	GC	3	6	22835	22840	0 %	0 %	50 %	50 %	56708816
72	NC_006569	CG	3	6	22995	23000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_006569	GC	4	8	23217	23224	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
74	NC_006569	CG	4	8	23343	23350	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
75	NC_006569	GC	3	6	23452	23457	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
76	NC_006569	GC	4	8	23676	23683	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
77	NC_006569	CG	3	6	23927	23932	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
78	NC_006569	CG	3	6	24111	24116	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
79	NC_006569	CA	3	6	24213	24218	50 %	0 %	0 %	50 %	56708817
80	NC_006569	GC	3	6	24272	24277	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
81	NC_006569	GC	3	6	24361	24366	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
82	NC_006569	GA	3	6	24396	24401	50 %	0 %	50 %	0 %	56708817
83	NC_006569	GT	3	6	24720	24725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006569	GC	3	6	24756	24761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_006569	GC	4	8	25148	25155	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
86	NC_006569	GC	3	6	25705	25710	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
87	NC_006569	GC	4	8	26082	26089	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
88	NC_006569	GC	3	6	26126	26131	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
89	NC_006569	GC	3	6	26742	26747	0 %	0 %	50 %	50 %	56708819
90	NC_006569	GC	3	6	27294	27299	0 %	0 %	50 %	50 %	56708819
91	NC_006569	GC	3	6	27437	27442	0 %	0 %	50 %	50 %	56708819
92	NC_006569	CG	3	6	27792	27797	0 %	0 %	50 %	50 %	56708820
93	NC_006569	GA	3	6	28240	28245	50 %	0 %	50 %	0 %	56708820
94	NC_006569	GC	3	6	29744	29749	0 %	0 %	50 %	50 %	56708823
95	NC_006569	GC	4	8	30446	30453	0 %	0 %	50 %	50 %	56708823
96	NC_006569	TG	3	6	30647	30652	0 %	50 %	50 %	0 %	56708823
97	NC_006569	GC	3	6	31035	31040	0 %	0 %	50 %	50 %	56708824
98	NC_006569	CG	4	8	31051	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	56708824
99	NC_006569	CT	3	6	31821	31826	0 %	50 %	0 %	50 %	56708826
100	NC_006569	GC	3	6	32161	32166	0 %	0 %	50 %	50 %	56708826
101	NC_006569	CG	3	6	32356	32361	0 %	0 %	50 %	50 %	56708826
102	NC_006569	GC	3	6	32416	32421	0 %	0 %	50 %	50 %	56708826
103	NC_006569	CG	4	8	32987	32994	0 %	0 %	50 %	50 %	56708827
104	NC_006569	TG	3	6	33093	33098	0 %	50 %	50 %	0 %	56708828
105	NC_006569	GA	3	6	33358	33363	50 %	0 %	50 %	0 %	56708828
106	NC_006569	GC	4	8	33732	33739	0 %	0 %	50 %	50 %	56708828
107	NC_006569	GC	3	6	33823	33828	0 %	0 %	50 %	50 %	56708828
108	NC_006569	GC	3	6	34118	34123	0 %	0 %	50 %	50 %	56708828
109	NC_006569	GA	3	6	34179	34184	50 %	0 %	50 %	0 %	56708828
110	NC_006569	GC	4	8	34817	34824	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
111	NC_006569	CG	4	8	35204	35211	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
112	NC_006569	GC	3	6	35539	35544	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
113	NC_006569	GC	3	6	35629	35634	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
114	NC_006569	CG	3	6	36269	36274	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
115	NC_006569	CG	4	8	36420	36427	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
116	NC_006569	GC	3	6	36511	36516	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
117	NC_006569	GC	3	6	36561	36566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_006569	TG	3	6	37706	37711	0 %	50 %	50 %	0 %	56708832
119	NC_006569	GC	3	6	37920	37925	0 %	0 %	50 %	50 %	56708832
120	NC_006569	GC	3	6	38096	38101	0 %	0 %	50 %	50 %	56708832
121	NC_006569	TG	4	8	38157	38164	0 %	50 %	50 %	0 %	56708832
122	NC_006569	CG	3	6	38607	38612	0 %	0 %	50 %	50 %	56708833
123	NC_006569	CG	3	6	38873	38878	0 %	0 %	50 %	50 %	56708833
124	NC_006569	GC	3	6	39597	39602	0 %	0 %	50 %	50 %	56708834
125	NC_006569	CG	3	6	39846	39851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_006569	GC	3	6	39916	39921	0 %	0 %	50 %	50 %	56708835
127	NC_006569	CA	3	6	40581	40586	50 %	0 %	0 %	50 %	56708836
128	NC_006569	GC	3	6	40685	40690	0 %	0 %	50 %	50 %	56708836
129	NC_006569	GC	3	6	40755	40760	0 %	0 %	50 %	50 %	56708836
130	NC_006569	CG	3	6	41094	41099	0 %	0 %	50 %	50 %	56708836
131	NC_006569	TC	3	6	41433	41438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_006569	CG	4	8	41573	41580	0 %	0 %	50 %	50 %	56708837
133	NC_006569	GC	3	6	41824	41829	0 %	0 %	50 %	50 %	56708837
134	NC_006569	CG	3	6	42262	42267	0 %	0 %	50 %	50 %	56708837
135	NC_006569	CG	3	6	42915	42920	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
136	NC_006569	GC	3	6	43387	43392	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
137	NC_006569	CG	3	6	43409	43414	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
138	NC_006569	GC	3	6	43611	43616	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
139	NC_006569	GC	3	6	43984	43989	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
140	NC_006569	CG	4	8	44227	44234	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
141	NC_006569	GC	3	6	44990	44995	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
142	NC_006569	CG	4	8	45198	45205	0 %	0 %	50 %	50 %	56708840
143	NC_006569	CG	4	8	47460	47467	0 %	0 %	50 %	50 %	56708841
144	NC_006569	AC	3	6	48879	48884	50 %	0 %	0 %	50 %	56708842
145	NC_006569	GC	3	6	48935	48940	0 %	0 %	50 %	50 %	56708842
146	NC_006569	GC	3	6	49256	49261	0 %	0 %	50 %	50 %	56708843
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