MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 1156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006569	TG	3	6	436	441	0 %	50 %	50 %	0 %	56709230
2	NC_006569	GC	4	8	623	630	0 %	0 %	50 %	50 %	56709230
3	NC_006569	GC	3	6	688	693	0 %	0 %	50 %	50 %	56709230
4	NC_006569	CG	3	6	1216	1221	0 %	0 %	50 %	50 %	56708792
5	NC_006569	CG	3	6	2228	2233	0 %	0 %	50 %	50 %	56708793
6	NC_006569	GC	4	8	2919	2926	0 %	0 %	50 %	50 %	56708793
7	NC_006569	GC	3	6	3509	3514	0 %	0 %	50 %	50 %	56708794
8	NC_006569	CA	3	6	3569	3574	50 %	0 %	0 %	50 %	56708794
9	NC_006569	CG	3	6	4498	4503	0 %	0 %	50 %	50 %	56708795
10	NC_006569	GC	3	6	5200	5205	0 %	0 %	50 %	50 %	56708797
11	NC_006569	CG	3	6	5872	5877	0 %	0 %	50 %	50 %	56708797
12	NC_006569	CG	4	8	6235	6242	0 %	0 %	50 %	50 %	56708798
13	NC_006569	GC	3	6	6976	6981	0 %	0 %	50 %	50 %	56708800
14	NC_006569	GC	3	6	7590	7595	0 %	0 %	50 %	50 %	56708800
15	NC_006569	CG	3	6	8167	8172	0 %	0 %	50 %	50 %	56708801
16	NC_006569	GC	3	6	8228	8233	0 %	0 %	50 %	50 %	56708801
17	NC_006569	GC	3	6	8378	8383	0 %	0 %	50 %	50 %	56708801
18	NC_006569	GC	4	8	8460	8467	0 %	0 %	50 %	50 %	56708801
19	NC_006569	GC	3	6	8684	8689	0 %	0 %	50 %	50 %	56708801
20	NC_006569	CG	4	8	8980	8987	0 %	0 %	50 %	50 %	56708801
21	NC_006569	CG	3	6	10283	10288	0 %	0 %	50 %	50 %	56708802
22	NC_006569	CG	3	6	10462	10467	0 %	0 %	50 %	50 %	56708802
23	NC_006569	GC	3	6	10744	10749	0 %	0 %	50 %	50 %	56708803
24	NC_006569	GC	3	6	11087	11092	0 %	0 %	50 %	50 %	56708803
25	NC_006569	GC	3	6	11925	11930	0 %	0 %	50 %	50 %	56708804
26	NC_006569	CG	3	6	11966	11971	0 %	0 %	50 %	50 %	56708804
27	NC_006569	CG	3	6	12467	12472	0 %	0 %	50 %	50 %	56708805
28	NC_006569	GC	3	6	12556	12561	0 %	0 %	50 %	50 %	56708805
29	NC_006569	CG	3	6	12638	12643	0 %	0 %	50 %	50 %	56708805
30	NC_006569	GC	3	6	13118	13123	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
31	NC_006569	GC	3	6	13354	13359	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
32	NC_006569	CG	3	6	13654	13659	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
33	NC_006569	GC	4	8	13841	13848	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
34	NC_006569	GC	3	6	13889	13894	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
35	NC_006569	GC	3	6	14016	14021	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
36	NC_006569	GC	3	6	14027	14032	0 %	0 %	50 %	50 %	56708806
37	NC_006569	CG	3	6	14384	14389	0 %	0 %	50 %	50 %	56708807
38	NC_006569	GC	3	6	14527	14532	0 %	0 %	50 %	50 %	56708807
39	NC_006569	GC	3	6	14551	14556	0 %	0 %	50 %	50 %	56708807
40	NC_006569	GC	3	6	14662	14667	0 %	0 %	50 %	50 %	56708807
41	NC_006569	CG	4	8	14712	14719	0 %	0 %	50 %	50 %	56708807
42	NC_006569	GC	3	6	14750	14755	0 %	0 %	50 %	50 %	56708807
43	NC_006569	AC	3	6	16048	16053	50 %	0 %	0 %	50 %	56708809
44	NC_006569	GC	3	6	16110	16115	0 %	0 %	50 %	50 %	56708809
45	NC_006569	CG	4	8	16121	16128	0 %	0 %	50 %	50 %	56708809
46	NC_006569	CA	3	6	16428	16433	50 %	0 %	0 %	50 %	56708809
47	NC_006569	CG	3	6	16472	16477	0 %	0 %	50 %	50 %	56708809
48	NC_006569	CG	3	6	16924	16929	0 %	0 %	50 %	50 %	56708810
49	NC_006569	GC	3	6	16981	16986	0 %	0 %	50 %	50 %	56708810
50	NC_006569	CG	4	8	17304	17311	0 %	0 %	50 %	50 %	56708810
51	NC_006569	GC	3	6	18062	18067	0 %	0 %	50 %	50 %	56708812
52	NC_006569	GC	3	6	18245	18250	0 %	0 %	50 %	50 %	56708812
53	NC_006569	CG	3	6	18400	18405	0 %	0 %	50 %	50 %	56708812
54	NC_006569	TC	3	6	18498	18503	0 %	50 %	0 %	50 %	56708812
55	NC_006569	GC	3	6	19287	19292	0 %	0 %	50 %	50 %	56708812
56	NC_006569	GC	3	6	19693	19698	0 %	0 %	50 %	50 %	56708811
57	NC_006569	GC	4	8	19753	19760	0 %	0 %	50 %	50 %	56708813
58	NC_006569	GC	4	8	20291	20298	0 %	0 %	50 %	50 %	56708813
59	NC_006569	CG	3	6	20315	20320	0 %	0 %	50 %	50 %	56708813
60	NC_006569	GC	3	6	20780	20785	0 %	0 %	50 %	50 %	56708814
61	NC_006569	GC	3	6	20874	20879	0 %	0 %	50 %	50 %	56708814
62	NC_006569	TG	3	6	21100	21105	0 %	50 %	50 %	0 %	56708814
63	NC_006569	CG	3	6	21982	21987	0 %	0 %	50 %	50 %	56708815
64	NC_006569	CG	4	8	22643	22650	0 %	0 %	50 %	50 %	56708816
65	NC_006569	GC	3	6	22835	22840	0 %	0 %	50 %	50 %	56708816
66	NC_006569	GC	4	8	23217	23224	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
67	NC_006569	CG	4	8	23343	23350	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
68	NC_006569	GC	3	6	23452	23457	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
69	NC_006569	GC	4	8	23676	23683	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
70	NC_006569	CG	3	6	23927	23932	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
71	NC_006569	CG	3	6	24111	24116	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
72	NC_006569	CA	3	6	24213	24218	50 %	0 %	0 %	50 %	56708817
73	NC_006569	GC	3	6	24272	24277	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
74	NC_006569	GC	3	6	24361	24366	0 %	0 %	50 %	50 %	56708817
75	NC_006569	GA	3	6	24396	24401	50 %	0 %	50 %	0 %	56708817
76	NC_006569	GC	4	8	25148	25155	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
77	NC_006569	GC	3	6	25705	25710	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
78	NC_006569	GC	4	8	26082	26089	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
79	NC_006569	GC	3	6	26126	26131	0 %	0 %	50 %	50 %	56708818
80	NC_006569	GC	3	6	26742	26747	0 %	0 %	50 %	50 %	56708819
81	NC_006569	GC	3	6	27294	27299	0 %	0 %	50 %	50 %	56708819
82	NC_006569	GC	3	6	27437	27442	0 %	0 %	50 %	50 %	56708819
83	NC_006569	CG	3	6	27792	27797	0 %	0 %	50 %	50 %	56708820
84	NC_006569	GA	3	6	28240	28245	50 %	0 %	50 %	0 %	56708820
85	NC_006569	GC	3	6	29744	29749	0 %	0 %	50 %	50 %	56708823
86	NC_006569	GC	4	8	30446	30453	0 %	0 %	50 %	50 %	56708823
87	NC_006569	TG	3	6	30647	30652	0 %	50 %	50 %	0 %	56708823
88	NC_006569	GC	3	6	31035	31040	0 %	0 %	50 %	50 %	56708824
89	NC_006569	CG	4	8	31051	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	56708824
90	NC_006569	CT	3	6	31821	31826	0 %	50 %	0 %	50 %	56708826
91	NC_006569	GC	3	6	32161	32166	0 %	0 %	50 %	50 %	56708826
92	NC_006569	CG	3	6	32356	32361	0 %	0 %	50 %	50 %	56708826
93	NC_006569	GC	3	6	32416	32421	0 %	0 %	50 %	50 %	56708826
94	NC_006569	CG	4	8	32987	32994	0 %	0 %	50 %	50 %	56708827
95	NC_006569	TG	3	6	33093	33098	0 %	50 %	50 %	0 %	56708828
96	NC_006569	GA	3	6	33358	33363	50 %	0 %	50 %	0 %	56708828
97	NC_006569	GC	4	8	33732	33739	0 %	0 %	50 %	50 %	56708828
98	NC_006569	GC	3	6	33823	33828	0 %	0 %	50 %	50 %	56708828
99	NC_006569	GC	3	6	34118	34123	0 %	0 %	50 %	50 %	56708828
100	NC_006569	GA	3	6	34179	34184	50 %	0 %	50 %	0 %	56708828
101	NC_006569	GC	4	8	34817	34824	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
102	NC_006569	CG	4	8	35204	35211	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
103	NC_006569	GC	3	6	35539	35544	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
104	NC_006569	GC	3	6	35629	35634	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
105	NC_006569	CG	3	6	36269	36274	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
106	NC_006569	CG	4	8	36420	36427	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
107	NC_006569	GC	3	6	36511	36516	0 %	0 %	50 %	50 %	56708829
108	NC_006569	TG	3	6	37706	37711	0 %	50 %	50 %	0 %	56708832
109	NC_006569	GC	3	6	37920	37925	0 %	0 %	50 %	50 %	56708832
110	NC_006569	GC	3	6	38096	38101	0 %	0 %	50 %	50 %	56708832
111	NC_006569	TG	4	8	38157	38164	0 %	50 %	50 %	0 %	56708832
112	NC_006569	CG	3	6	38607	38612	0 %	0 %	50 %	50 %	56708833
113	NC_006569	CG	3	6	38873	38878	0 %	0 %	50 %	50 %	56708833
114	NC_006569	GC	3	6	39597	39602	0 %	0 %	50 %	50 %	56708834
115	NC_006569	GC	3	6	39916	39921	0 %	0 %	50 %	50 %	56708835
116	NC_006569	CA	3	6	40581	40586	50 %	0 %	0 %	50 %	56708836
117	NC_006569	GC	3	6	40685	40690	0 %	0 %	50 %	50 %	56708836
118	NC_006569	GC	3	6	40755	40760	0 %	0 %	50 %	50 %	56708836
119	NC_006569	CG	3	6	41094	41099	0 %	0 %	50 %	50 %	56708836
120	NC_006569	CG	4	8	41573	41580	0 %	0 %	50 %	50 %	56708837
121	NC_006569	GC	3	6	41824	41829	0 %	0 %	50 %	50 %	56708837
122	NC_006569	CG	3	6	42262	42267	0 %	0 %	50 %	50 %	56708837
123	NC_006569	CG	3	6	42915	42920	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
124	NC_006569	GC	3	6	43387	43392	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
125	NC_006569	CG	3	6	43409	43414	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
126	NC_006569	GC	3	6	43611	43616	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
127	NC_006569	GC	3	6	43984	43989	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
128	NC_006569	CG	4	8	44227	44234	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
129	NC_006569	GC	3	6	44990	44995	0 %	0 %	50 %	50 %	56708839
130	NC_006569	CG	4	8	45198	45205	0 %	0 %	50 %	50 %	56708840
131	NC_006569	CG	4	8	47460	47467	0 %	0 %	50 %	50 %	56708841
132	NC_006569	AC	3	6	48879	48884	50 %	0 %	0 %	50 %	56708842
133	NC_006569	GC	3	6	48935	48940	0 %	0 %	50 %	50 %	56708842
134	NC_006569	GC	3	6	49256	49261	0 %	0 %	50 %	50 %	56708843
135	NC_006569	GC	3	6	50050	50055	0 %	0 %	50 %	50 %	56708844
136	NC_006569	GC	3	6	50232	50237	0 %	0 %	50 %	50 %	56708844
137	NC_006569	GC	3	6	50281	50286	0 %	0 %	50 %	50 %	56708844
138	NC_006569	GC	3	6	50323	50328	0 %	0 %	50 %	50 %	56708844
139	NC_006569	CG	3	6	50375	50380	0 %	0 %	50 %	50 %	56708844
140	NC_006569	CG	4	8	50948	50955	0 %	0 %	50 %	50 %	56708846
141	NC_006569	CG	3	6	52339	52344	0 %	0 %	50 %	50 %	56708847
142	NC_006569	GC	3	6	52402	52407	0 %	0 %	50 %	50 %	56708847
143	NC_006569	GA	3	6	52436	52441	50 %	0 %	50 %	0 %	56708847
144	NC_006569	CG	3	6	53623	53628	0 %	0 %	50 %	50 %	56708849
145	NC_006569	CG	4	8	54476	54483	0 %	0 %	50 %	50 %	56708849
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