MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006569	G	6	6	800	805	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006569	G	6	6	1559	1564	0 %	0 %	100 %	0 %	56708792
3	NC_006569	G	6	6	3659	3664	0 %	0 %	100 %	0 %	56708794
4	NC_006569	C	6	6	4195	4200	0 %	0 %	0 %	100 %	56708795
5	NC_006569	T	6	6	4912	4917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006569	C	6	6	12798	12803	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_006569	G	6	6	13817	13822	0 %	0 %	100 %	0 %	56708806
8	NC_006569	G	6	6	19199	19204	0 %	0 %	100 %	0 %	56708812
9	NC_006569	C	6	6	21683	21688	0 %	0 %	0 %	100 %	56708815
10	NC_006569	G	6	6	23887	23892	0 %	0 %	100 %	0 %	56708817
11	NC_006569	C	6	6	24738	24743	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_006569	G	6	6	29772	29777	0 %	0 %	100 %	0 %	56708823
13	NC_006569	G	6	6	32060	32065	0 %	0 %	100 %	0 %	56708826
14	NC_006569	G	6	6	37786	37791	0 %	0 %	100 %	0 %	56708832
15	NC_006569	G	6	6	39723	39728	0 %	0 %	100 %	0 %	56708834
16	NC_006569	C	6	6	42875	42880	0 %	0 %	0 %	100 %	56708838
17	NC_006569	C	6	6	42954	42959	0 %	0 %	0 %	100 %	56708839
18	NC_006569	G	6	6	51693	51698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006569	C	6	6	56221	56226	0 %	0 %	0 %	100 %	56708849
20	NC_006569	G	6	6	56785	56790	0 %	0 %	100 %	0 %	56708850
21	NC_006569	G	6	6	67566	67571	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006569	G	6	6	70508	70513	0 %	0 %	100 %	0 %	56708861
23	NC_006569	T	7	7	71594	71600	0 %	100 %	0 %	0 %	56708863
24	NC_006569	T	6	6	72056	72061	0 %	100 %	0 %	0 %	56709228
25	NC_006569	G	7	7	73649	73655	0 %	0 %	100 %	0 %	56708865
26	NC_006569	C	6	6	74629	74634	0 %	0 %	0 %	100 %	56708868
27	NC_006569	A	6	6	75725	75730	100 %	0 %	0 %	0 %	56709231
28	NC_006569	T	6	6	76270	76275	0 %	100 %	0 %	0 %	56708869
29	NC_006569	T	6	6	79309	79314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006569	A	6	6	80019	80024	100 %	0 %	0 %	0 %	56708871
31	NC_006569	T	6	6	80069	80074	0 %	100 %	0 %	0 %	56708871
32	NC_006569	T	7	7	82764	82770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006569	A	7	7	87225	87231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006569	A	6	6	87930	87935	100 %	0 %	0 %	0 %	56708876
35	NC_006569	A	7	7	88041	88047	100 %	0 %	0 %	0 %	56708876
36	NC_006569	A	6	6	88917	88922	100 %	0 %	0 %	0 %	56708876
37	NC_006569	T	6	6	89185	89190	0 %	100 %	0 %	0 %	56708876
38	NC_006569	T	6	6	90212	90217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006569	G	6	6	91495	91500	0 %	0 %	100 %	0 %	56708878
40	NC_006569	T	6	6	92073	92078	0 %	100 %	0 %	0 %	56708879
41	NC_006569	T	6	6	94931	94936	0 %	100 %	0 %	0 %	56708881
42	NC_006569	G	7	7	97131	97137	0 %	0 %	100 %	0 %	56708883
43	NC_006569	T	6	6	105708	105713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006569	A	6	6	107059	107064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006569	A	6	6	110488	110493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006569	A	6	6	112420	112425	100 %	0 %	0 %	0 %	56708897
47	NC_006569	A	6	6	115931	115936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006569	A	6	6	122756	122761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006569	A	7	7	131140	131146	100 %	0 %	0 %	0 %	56708910
50	NC_006569	G	6	6	132214	132219	0 %	0 %	100 %	0 %	56708910
51	NC_006569	T	6	6	136161	136166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006569	G	6	6	138541	138546	0 %	0 %	100 %	0 %	56708915
53	NC_006569	G	6	6	141493	141498	0 %	0 %	100 %	0 %	56708917
54	NC_006569	G	6	6	146090	146095	0 %	0 %	100 %	0 %	56708921
55	NC_006569	T	7	7	147476	147482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006569	A	7	7	147514	147520	100 %	0 %	0 %	0 %	56708922
57	NC_006569	A	6	6	147648	147653	100 %	0 %	0 %	0 %	56708922
58	NC_006569	C	7	7	152007	152013	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_006569	A	7	7	154539	154545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006569	T	6	6	157969	157974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006569	C	6	6	167378	167383	0 %	0 %	0 %	100 %	56708941
62	NC_006569	C	6	6	172575	172580	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_006569	T	6	6	172756	172761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006569	G	7	7	173946	173952	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006569	G	6	6	175793	175798	0 %	0 %	100 %	0 %	56708945
66	NC_006569	T	6	6	180613	180618	0 %	100 %	0 %	0 %	56708950
67	NC_006569	T	6	6	181773	181778	0 %	100 %	0 %	0 %	56708950
68	NC_006569	A	6	6	193441	193446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006569	T	8	8	194397	194404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006569	C	6	6	194457	194462	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_006569	G	6	6	194874	194879	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006569	G	6	6	206696	206701	0 %	0 %	100 %	0 %	56708979
73	NC_006569	T	6	6	208102	208107	0 %	100 %	0 %	0 %	56708981
74	NC_006569	C	6	6	211625	211630	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_006569	A	7	7	212641	212647	100 %	0 %	0 %	0 %	56708984
76	NC_006569	G	6	6	219367	219372	0 %	0 %	100 %	0 %	56708987
77	NC_006569	C	6	6	220355	220360	0 %	0 %	0 %	100 %	56708988
78	NC_006569	G	6	6	223503	223508	0 %	0 %	100 %	0 %	56708989
79	NC_006569	G	6	6	229811	229816	0 %	0 %	100 %	0 %	56708992
80	NC_006569	G	6	6	231373	231378	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006569	G	6	6	231565	231570	0 %	0 %	100 %	0 %	56708994
82	NC_006569	C	6	6	231721	231726	0 %	0 %	0 %	100 %	56708994
83	NC_006569	G	6	6	236347	236352	0 %	0 %	100 %	0 %	56708998
84	NC_006569	G	6	6	239111	239116	0 %	0 %	100 %	0 %	56709001
85	NC_006569	C	6	6	239287	239292	0 %	0 %	0 %	100 %	56709001
86	NC_006569	C	6	6	244971	244976	0 %	0 %	0 %	100 %	56709006
87	NC_006569	C	6	6	247522	247527	0 %	0 %	0 %	100 %	56709009
88	NC_006569	G	6	6	251053	251058	0 %	0 %	100 %	0 %	56709013
89	NC_006569	T	6	6	253327	253332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006569	G	6	6	254400	254405	0 %	0 %	100 %	0 %	56709016
91	NC_006569	G	6	6	261583	261588	0 %	0 %	100 %	0 %	56709022
92	NC_006569	G	6	6	264063	264068	0 %	0 %	100 %	0 %	56709024
93	NC_006569	T	8	8	265813	265820	0 %	100 %	0 %	0 %	56709026
94	NC_006569	G	6	6	268923	268928	0 %	0 %	100 %	0 %	56709028
95	NC_006569	G	6	6	284781	284786	0 %	0 %	100 %	0 %	56709043
96	NC_006569	C	6	6	287279	287284	0 %	0 %	0 %	100 %	56709045
97	NC_006569	G	7	7	289269	289275	0 %	0 %	100 %	0 %	56709047
98	NC_006569	A	6	6	289850	289855	100 %	0 %	0 %	0 %	56709047
99	NC_006569	G	6	6	290398	290403	0 %	0 %	100 %	0 %	56709047
100	NC_006569	A	6	6	290872	290877	100 %	0 %	0 %	0 %	56709048
101	NC_006569	A	6	6	294216	294221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006569	C	6	6	301015	301020	0 %	0 %	0 %	100 %	56709057
103	NC_006569	C	6	6	304905	304910	0 %	0 %	0 %	100 %	56709060
104	NC_006569	C	6	6	306953	306958	0 %	0 %	0 %	100 %	56709062
105	NC_006569	C	7	7	312786	312792	0 %	0 %	0 %	100 %	56709067
106	NC_006569	G	6	6	313907	313912	0 %	0 %	100 %	0 %	56709068
107	NC_006569	C	6	6	317176	317181	0 %	0 %	0 %	100 %	56709071
108	NC_006569	C	6	6	319740	319745	0 %	0 %	0 %	100 %	56709073
109	NC_006569	G	7	7	319770	319776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006569	G	6	6	321882	321887	0 %	0 %	100 %	0 %	56709075
111	NC_006569	T	6	6	322083	322088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006569	C	6	6	322425	322430	0 %	0 %	0 %	100 %	56709076
113	NC_006569	C	6	6	334903	334908	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_006569	T	6	6	334925	334930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006569	G	6	6	335789	335794	0 %	0 %	100 %	0 %	56709089
116	NC_006569	C	6	6	337993	337998	0 %	0 %	0 %	100 %	56709090
117	NC_006569	A	6	6	339717	339722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006569	C	6	6	345419	345424	0 %	0 %	0 %	100 %	56709093
119	NC_006569	C	6	6	347037	347042	0 %	0 %	0 %	100 %	56709094
120	NC_006569	T	6	6	350288	350293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006569	A	6	6	351128	351133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006569	A	6	6	351540	351545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006569	A	6	6	351564	351569	100 %	0 %	0 %	0 %	56709097
124	NC_006569	G	6	6	353799	353804	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006569	G	6	6	355839	355844	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006569	G	6	6	356793	356798	0 %	0 %	100 %	0 %	56709100
127	NC_006569	C	6	6	366336	366341	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_006569	G	6	6	366840	366845	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006569	C	6	6	368199	368204	0 %	0 %	0 %	100 %	56709109
130	NC_006569	A	6	6	370444	370449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006569	T	6	6	370830	370835	0 %	100 %	0 %	0 %	56709111
132	NC_006569	C	6	6	370861	370866	0 %	0 %	0 %	100 %	56709112
133	NC_006569	C	6	6	371009	371014	0 %	0 %	0 %	100 %	56709112
134	NC_006569	C	6	6	372702	372707	0 %	0 %	0 %	100 %	56709114
135	NC_006569	T	6	6	374214	374219	0 %	100 %	0 %	0 %	56709114
136	NC_006569	C	6	6	375255	375260	0 %	0 %	0 %	100 %	56709115
137	NC_006569	A	6	6	376152	376157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006569	T	6	6	377324	377329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006569	A	7	7	377363	377369	100 %	0 %	0 %	0 %	56709118
140	NC_006569	A	7	7	386538	386544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006569	C	6	6	392582	392587	0 %	0 %	0 %	100 %	56709133
142	NC_006569	C	6	6	393215	393220	0 %	0 %	0 %	100 %	56709134
143	NC_006569	G	6	6	397970	397975	0 %	0 %	100 %	0 %	56709138
144	NC_006569	C	6	6	398760	398765	0 %	0 %	0 %	100 %	56709138
145	NC_006569	G	6	6	400577	400582	0 %	0 %	100 %	0 %	56709140
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.