MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006569	G	6	6	1559	1564	0 %	0 %	100 %	0 %	56708792
2	NC_006569	G	6	6	3659	3664	0 %	0 %	100 %	0 %	56708794
3	NC_006569	C	6	6	4195	4200	0 %	0 %	0 %	100 %	56708795
4	NC_006569	G	6	6	13817	13822	0 %	0 %	100 %	0 %	56708806
5	NC_006569	G	6	6	19199	19204	0 %	0 %	100 %	0 %	56708812
6	NC_006569	C	6	6	21683	21688	0 %	0 %	0 %	100 %	56708815
7	NC_006569	G	6	6	23887	23892	0 %	0 %	100 %	0 %	56708817
8	NC_006569	G	6	6	29772	29777	0 %	0 %	100 %	0 %	56708823
9	NC_006569	G	6	6	32060	32065	0 %	0 %	100 %	0 %	56708826
10	NC_006569	G	6	6	37786	37791	0 %	0 %	100 %	0 %	56708832
11	NC_006569	G	6	6	39723	39728	0 %	0 %	100 %	0 %	56708834
12	NC_006569	C	6	6	42875	42880	0 %	0 %	0 %	100 %	56708838
13	NC_006569	C	6	6	42954	42959	0 %	0 %	0 %	100 %	56708839
14	NC_006569	C	6	6	56221	56226	0 %	0 %	0 %	100 %	56708849
15	NC_006569	G	6	6	56785	56790	0 %	0 %	100 %	0 %	56708850
16	NC_006569	G	6	6	70508	70513	0 %	0 %	100 %	0 %	56708861
17	NC_006569	T	7	7	71594	71600	0 %	100 %	0 %	0 %	56708863
18	NC_006569	T	6	6	72056	72061	0 %	100 %	0 %	0 %	56709228
19	NC_006569	G	7	7	73649	73655	0 %	0 %	100 %	0 %	56708865
20	NC_006569	C	6	6	74629	74634	0 %	0 %	0 %	100 %	56708868
21	NC_006569	A	6	6	75725	75730	100 %	0 %	0 %	0 %	56709231
22	NC_006569	T	6	6	76270	76275	0 %	100 %	0 %	0 %	56708869
23	NC_006569	A	6	6	80019	80024	100 %	0 %	0 %	0 %	56708871
24	NC_006569	T	6	6	80069	80074	0 %	100 %	0 %	0 %	56708871
25	NC_006569	A	6	6	87930	87935	100 %	0 %	0 %	0 %	56708876
26	NC_006569	A	7	7	88041	88047	100 %	0 %	0 %	0 %	56708876
27	NC_006569	A	6	6	88917	88922	100 %	0 %	0 %	0 %	56708876
28	NC_006569	T	6	6	89185	89190	0 %	100 %	0 %	0 %	56708876
29	NC_006569	G	6	6	91495	91500	0 %	0 %	100 %	0 %	56708878
30	NC_006569	T	6	6	92073	92078	0 %	100 %	0 %	0 %	56708879
31	NC_006569	T	6	6	94931	94936	0 %	100 %	0 %	0 %	56708881
32	NC_006569	G	7	7	97131	97137	0 %	0 %	100 %	0 %	56708883
33	NC_006569	A	6	6	112420	112425	100 %	0 %	0 %	0 %	56708897
34	NC_006569	A	7	7	131140	131146	100 %	0 %	0 %	0 %	56708910
35	NC_006569	G	6	6	132214	132219	0 %	0 %	100 %	0 %	56708910
36	NC_006569	G	6	6	138541	138546	0 %	0 %	100 %	0 %	56708915
37	NC_006569	G	6	6	141493	141498	0 %	0 %	100 %	0 %	56708917
38	NC_006569	G	6	6	146090	146095	0 %	0 %	100 %	0 %	56708921
39	NC_006569	A	7	7	147514	147520	100 %	0 %	0 %	0 %	56708922
40	NC_006569	A	6	6	147648	147653	100 %	0 %	0 %	0 %	56708922
41	NC_006569	C	6	6	167378	167383	0 %	0 %	0 %	100 %	56708941
42	NC_006569	G	6	6	175793	175798	0 %	0 %	100 %	0 %	56708945
43	NC_006569	T	6	6	180613	180618	0 %	100 %	0 %	0 %	56708950
44	NC_006569	T	6	6	181773	181778	0 %	100 %	0 %	0 %	56708950
45	NC_006569	G	6	6	206696	206701	0 %	0 %	100 %	0 %	56708979
46	NC_006569	T	6	6	208102	208107	0 %	100 %	0 %	0 %	56708981
47	NC_006569	A	7	7	212641	212647	100 %	0 %	0 %	0 %	56708984
48	NC_006569	G	6	6	219367	219372	0 %	0 %	100 %	0 %	56708987
49	NC_006569	C	6	6	220355	220360	0 %	0 %	0 %	100 %	56708988
50	NC_006569	G	6	6	223503	223508	0 %	0 %	100 %	0 %	56708989
51	NC_006569	G	6	6	229811	229816	0 %	0 %	100 %	0 %	56708992
52	NC_006569	G	6	6	231565	231570	0 %	0 %	100 %	0 %	56708994
53	NC_006569	C	6	6	231721	231726	0 %	0 %	0 %	100 %	56708994
54	NC_006569	G	6	6	236347	236352	0 %	0 %	100 %	0 %	56708998
55	NC_006569	G	6	6	239111	239116	0 %	0 %	100 %	0 %	56709001
56	NC_006569	C	6	6	239287	239292	0 %	0 %	0 %	100 %	56709001
57	NC_006569	C	6	6	244971	244976	0 %	0 %	0 %	100 %	56709006
58	NC_006569	C	6	6	247522	247527	0 %	0 %	0 %	100 %	56709009
59	NC_006569	G	6	6	251053	251058	0 %	0 %	100 %	0 %	56709013
60	NC_006569	G	6	6	254400	254405	0 %	0 %	100 %	0 %	56709016
61	NC_006569	G	6	6	261583	261588	0 %	0 %	100 %	0 %	56709022
62	NC_006569	G	6	6	264063	264068	0 %	0 %	100 %	0 %	56709024
63	NC_006569	T	8	8	265813	265820	0 %	100 %	0 %	0 %	56709026
64	NC_006569	G	6	6	268923	268928	0 %	0 %	100 %	0 %	56709028
65	NC_006569	G	6	6	284781	284786	0 %	0 %	100 %	0 %	56709043
66	NC_006569	C	6	6	287279	287284	0 %	0 %	0 %	100 %	56709045
67	NC_006569	G	7	7	289269	289275	0 %	0 %	100 %	0 %	56709047
68	NC_006569	A	6	6	289850	289855	100 %	0 %	0 %	0 %	56709047
69	NC_006569	G	6	6	290398	290403	0 %	0 %	100 %	0 %	56709047
70	NC_006569	A	6	6	290872	290877	100 %	0 %	0 %	0 %	56709048
71	NC_006569	C	6	6	301015	301020	0 %	0 %	0 %	100 %	56709057
72	NC_006569	C	6	6	304905	304910	0 %	0 %	0 %	100 %	56709060
73	NC_006569	C	6	6	306953	306958	0 %	0 %	0 %	100 %	56709062
74	NC_006569	C	7	7	312786	312792	0 %	0 %	0 %	100 %	56709067
75	NC_006569	G	6	6	313907	313912	0 %	0 %	100 %	0 %	56709068
76	NC_006569	C	6	6	317176	317181	0 %	0 %	0 %	100 %	56709071
77	NC_006569	C	6	6	319740	319745	0 %	0 %	0 %	100 %	56709073
78	NC_006569	G	6	6	321882	321887	0 %	0 %	100 %	0 %	56709075
79	NC_006569	C	6	6	322425	322430	0 %	0 %	0 %	100 %	56709076
80	NC_006569	G	6	6	335789	335794	0 %	0 %	100 %	0 %	56709089
81	NC_006569	C	6	6	337993	337998	0 %	0 %	0 %	100 %	56709090
82	NC_006569	C	6	6	345419	345424	0 %	0 %	0 %	100 %	56709093
83	NC_006569	C	6	6	347037	347042	0 %	0 %	0 %	100 %	56709094
84	NC_006569	A	6	6	351564	351569	100 %	0 %	0 %	0 %	56709097
85	NC_006569	G	6	6	356793	356798	0 %	0 %	100 %	0 %	56709100
86	NC_006569	C	6	6	368199	368204	0 %	0 %	0 %	100 %	56709109
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88	NC_006569	C	6	6	370861	370866	0 %	0 %	0 %	100 %	56709112
89	NC_006569	C	6	6	371009	371014	0 %	0 %	0 %	100 %	56709112
90	NC_006569	C	6	6	372702	372707	0 %	0 %	0 %	100 %	56709114
91	NC_006569	T	6	6	374214	374219	0 %	100 %	0 %	0 %	56709114
92	NC_006569	C	6	6	375255	375260	0 %	0 %	0 %	100 %	56709115
93	NC_006569	A	7	7	377363	377369	100 %	0 %	0 %	0 %	56709118
94	NC_006569	C	6	6	392582	392587	0 %	0 %	0 %	100 %	56709133
95	NC_006569	C	6	6	393215	393220	0 %	0 %	0 %	100 %	56709134
96	NC_006569	G	6	6	397970	397975	0 %	0 %	100 %	0 %	56709138
97	NC_006569	C	6	6	398760	398765	0 %	0 %	0 %	100 %	56709138
98	NC_006569	G	6	6	400577	400582	0 %	0 %	100 %	0 %	56709140
99	NC_006569	T	6	6	416123	416128	0 %	100 %	0 %	0 %	56709153
100	NC_006569	C	6	6	416526	416531	0 %	0 %	0 %	100 %	56709154
101	NC_006569	C	6	6	423282	423287	0 %	0 %	0 %	100 %	56709159
102	NC_006569	C	6	6	423985	423990	0 %	0 %	0 %	100 %	56709160
103	NC_006569	G	6	6	431238	431243	0 %	0 %	100 %	0 %	56709165
104	NC_006569	G	6	6	433679	433684	0 %	0 %	100 %	0 %	56709168
105	NC_006569	C	6	6	435817	435822	0 %	0 %	0 %	100 %	56709169
106	NC_006569	T	6	6	437808	437813	0 %	100 %	0 %	0 %	56709170
107	NC_006569	C	6	6	440460	440465	0 %	0 %	0 %	100 %	56709172
108	NC_006569	T	6	6	441852	441857	0 %	100 %	0 %	0 %	56709174
109	NC_006569	G	6	6	459137	459142	0 %	0 %	100 %	0 %	56709193
110	NC_006569	G	6	6	466934	466939	0 %	0 %	100 %	0 %	56709200
111	NC_006569	G	6	6	467725	467730	0 %	0 %	100 %	0 %	56709202
112	NC_006569	G	6	6	468691	468696	0 %	0 %	100 %	0 %	56709203
113	NC_006569	G	6	6	468701	468706	0 %	0 %	100 %	0 %	56709203
114	NC_006569	G	6	6	474995	475000	0 %	0 %	100 %	0 %	56709209
115	NC_006569	C	6	6	476300	476305	0 %	0 %	0 %	100 %	56709210
116	NC_006569	C	6	6	480615	480620	0 %	0 %	0 %	100 %	56709213
117	NC_006569	C	6	6	483885	483890	0 %	0 %	0 %	100 %	56709217
118	NC_006569	C	6	6	488274	488279	0 %	0 %	0 %	100 %	56709222

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.