MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006530	AACTC	2	10	1752	1761	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_006530	AATTT	2	10	3110	3119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006530	GAAAT	2	10	4660	4669	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006530	AATTT	2	10	5593	5602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006530	TATAC	2	10	8105	8114	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_006530	TATGA	2	10	8115	8124	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006530	CTAAA	2	10	8678	8687	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_006530	TTTAG	2	10	8759	8768	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006530	TTGTA	2	10	9085	9094	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006530	ATGAC	2	10	11299	11308	40 %	20 %	20 %	20 %	56707150
11	NC_006530	AAGCG	2	10	12139	12148	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006530	CAAAG	2	10	12305	12314	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_006530	CGGAT	2	10	12951	12960	20 %	20 %	40 %	20 %	56707153
14	NC_006530	TAAAA	2	10	14395	14404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006530	CCTCA	2	10	14910	14919	20 %	20 %	0 %	60 %	56707154
16	NC_006530	TTTTG	2	10	17299	17308	0 %	80 %	20 %	0 %	56707157
17	NC_006530	CTTTT	2	10	22650	22659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_006530	TGTCC	2	10	22837	22846	0 %	40 %	20 %	40 %	56707166
19	NC_006530	CCTCA	2	10	23502	23511	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_006530	AGTCA	2	10	23818	23827	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_006530	AATTT	2	10	24079	24088	40 %	60 %	0 %	0 %	56707168
22	NC_006530	ATGTT	2	10	27222	27231	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006530	GATTC	2	10	29319	29328	20 %	40 %	20 %	20 %	56707170
24	NC_006530	TTGCC	2	10	33155	33164	0 %	40 %	20 %	40 %	56707174
25	NC_006530	AGCTA	2	10	37006	37015	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_006530	CTTTT	2	10	39183	39192	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_006530	TTAAA	2	10	39556	39565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006530	ATTAG	2	10	39865	39874	40 %	40 %	20 %	0 %	56707181
29	NC_006530	TATAA	2	10	39977	39986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006530	TACGA	2	10	40803	40812	40 %	20 %	20 %	20 %	56707182

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.