MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006530	TGGT	2	8	147	154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006530	CTTG	2	8	170	177	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_006530	GCCG	2	8	324	331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006530	TGAT	2	8	510	517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006530	TCAA	2	8	559	566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_006530	ATTC	2	8	683	690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006530	TAAA	2	8	922	929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006530	TTTA	2	8	970	977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006530	AATT	2	8	2367	2374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006530	TTTA	2	8	2791	2798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006530	GGTT	2	8	4703	4710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006530	CAAT	2	8	4848	4855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_006530	TTTA	2	8	5273	5280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006530	CTTT	2	8	7174	7181	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_006530	AATG	2	8	9048	9055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006530	AGCA	2	8	14460	14467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_006530	TCAA	2	8	14576	14583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006530	AAGC	2	8	15019	15026	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006530	ATTC	2	8	15518	15525	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_006530	TCGG	2	8	21552	21559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006530	TCCG	2	8	21735	21742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006530	TGGT	2	8	21763	21770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006530	CAGT	2	8	22049	22056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006530	TTCA	2	8	22107	22114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_006530	CCTT	2	8	22284	22291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006530	AGCA	2	8	23639	23646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_006530	CTTA	3	12	23867	23878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006530	AAAG	2	8	25287	25294	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006530	CTTG	2	8	25796	25803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_006530	TTGA	2	8	26106	26113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006530	GTTA	2	8	26483	26490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006530	TTGA	2	8	26664	26671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006530	TTTA	2	8	26987	26994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006530	ATGG	2	8	27127	27134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006530	TTTC	2	8	27279	27286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_006530	TTTA	2	8	28382	28389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006530	AGTT	2	8	30438	30445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006530	AACA	2	8	31452	31459	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_006530	TAAA	2	8	31656	31663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006530	GAAA	2	8	32127	32134	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006530	TAAG	2	8	32165	32172	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006530	TAGT	2	8	35288	35295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006530	TTTC	2	8	37979	37986	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_006530	AGAT	2	8	39195	39202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006530	AGCT	2	8	40068	40075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_006530	TTCC	2	8	41850	41857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_006530	ATCT	2	8	42917	42924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_006530	TAAC	2	8	43571	43578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_006530	TGGC	2	8	43717	43724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.