MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006530	GC	3	6	440	445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006530	AG	3	6	691	696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006530	CG	3	6	1167	1172	0 %	0 %	50 %	50 %	56707136
4	NC_006530	CT	3	6	1562	1567	0 %	50 %	0 %	50 %	56707136
5	NC_006530	AT	3	6	1910	1915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006530	AT	3	6	4152	4157	50 %	50 %	0 %	0 %	56707140
7	NC_006530	TC	3	6	4180	4185	0 %	50 %	0 %	50 %	56707140
8	NC_006530	CT	3	6	4311	4316	0 %	50 %	0 %	50 %	56707140
9	NC_006530	CA	3	6	4979	4984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006530	AC	3	6	7657	7662	50 %	0 %	0 %	50 %	56707146
11	NC_006530	AT	3	6	8089	8094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006530	AT	3	6	8099	8104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006530	CT	3	6	9118	9123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006530	GT	3	6	9135	9140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006530	CA	4	8	9740	9747	50 %	0 %	0 %	50 %	56707148
16	NC_006530	TA	3	6	9751	9756	50 %	50 %	0 %	0 %	56707148
17	NC_006530	AT	3	6	10694	10699	50 %	50 %	0 %	0 %	56707150
18	NC_006530	AT	3	6	10898	10903	50 %	50 %	0 %	0 %	56707150
19	NC_006530	AC	3	6	13168	13173	50 %	0 %	0 %	50 %	56707153
20	NC_006530	AT	3	6	15250	15255	50 %	50 %	0 %	0 %	56707155
21	NC_006530	TA	3	6	15509	15514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006530	TA	3	6	15587	15592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006530	TG	3	6	16340	16345	0 %	50 %	50 %	0 %	56707156
24	NC_006530	TA	3	6	16928	16933	50 %	50 %	0 %	0 %	56707157
25	NC_006530	AT	3	6	19413	19418	50 %	50 %	0 %	0 %	56707160
26	NC_006530	AC	3	6	21676	21681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006530	TC	3	6	21791	21796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006530	TG	3	6	22473	22478	0 %	50 %	50 %	0 %	56707165
29	NC_006530	AT	3	6	27172	27177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006530	TA	3	6	28001	28006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006530	TC	3	6	29454	29459	0 %	50 %	0 %	50 %	56707170
32	NC_006530	AT	3	6	32087	32092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006530	GC	3	6	32572	32577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_006530	AC	3	6	34942	34947	50 %	0 %	0 %	50 %	56707175
35	NC_006530	TG	3	6	37112	37117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006530	TC	3	6	37985	37990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006530	AG	3	6	38060	38065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006530	AT	3	6	38968	38973	50 %	50 %	0 %	0 %	56707179
39	NC_006530	AT	3	6	39927	39932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006530	TA	3	6	40555	40560	50 %	50 %	0 %	0 %	56707182
41	NC_006530	TA	3	6	40587	40592	50 %	50 %	0 %	0 %	56707182
42	NC_006530	AT	3	6	40603	40608	50 %	50 %	0 %	0 %	56707182
43	NC_006530	AT	3	6	40662	40667	50 %	50 %	0 %	0 %	56707182
44	NC_006530	TA	4	8	40828	40835	50 %	50 %	0 %	0 %	56707182
45	NC_006530	TA	3	6	42089	42094	50 %	50 %	0 %	0 %	56707185
46	NC_006530	GT	3	6	42173	42178	0 %	50 %	50 %	0 %	56707185
47	NC_006530	AT	3	6	42620	42625	50 %	50 %	0 %	0 %	56707185
48	NC_006530	TA	4	8	43021	43028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.