MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006530	CG	3	6	1167	1172	0 %	0 %	50 %	50 %	56707136
2	NC_006530	CT	3	6	1562	1567	0 %	50 %	0 %	50 %	56707136
3	NC_006530	AT	3	6	4152	4157	50 %	50 %	0 %	0 %	56707140
4	NC_006530	TC	3	6	4180	4185	0 %	50 %	0 %	50 %	56707140
5	NC_006530	CT	3	6	4311	4316	0 %	50 %	0 %	50 %	56707140
6	NC_006530	AC	3	6	7657	7662	50 %	0 %	0 %	50 %	56707146
7	NC_006530	CA	4	8	9740	9747	50 %	0 %	0 %	50 %	56707148
8	NC_006530	TA	3	6	9751	9756	50 %	50 %	0 %	0 %	56707148
9	NC_006530	AT	3	6	10694	10699	50 %	50 %	0 %	0 %	56707150
10	NC_006530	AT	3	6	10898	10903	50 %	50 %	0 %	0 %	56707150
11	NC_006530	AC	3	6	13168	13173	50 %	0 %	0 %	50 %	56707153
12	NC_006530	AT	3	6	15250	15255	50 %	50 %	0 %	0 %	56707155
13	NC_006530	TG	3	6	16340	16345	0 %	50 %	50 %	0 %	56707156
14	NC_006530	TA	3	6	16928	16933	50 %	50 %	0 %	0 %	56707157
15	NC_006530	AT	3	6	19413	19418	50 %	50 %	0 %	0 %	56707160
16	NC_006530	TG	3	6	22473	22478	0 %	50 %	50 %	0 %	56707165
17	NC_006530	TC	3	6	29454	29459	0 %	50 %	0 %	50 %	56707170
18	NC_006530	AC	3	6	34942	34947	50 %	0 %	0 %	50 %	56707175
19	NC_006530	AT	3	6	38968	38973	50 %	50 %	0 %	0 %	56707179
20	NC_006530	TA	3	6	40555	40560	50 %	50 %	0 %	0 %	56707182
21	NC_006530	TA	3	6	40587	40592	50 %	50 %	0 %	0 %	56707182
22	NC_006530	AT	3	6	40603	40608	50 %	50 %	0 %	0 %	56707182
23	NC_006530	AT	3	6	40662	40667	50 %	50 %	0 %	0 %	56707182
24	NC_006530	TA	4	8	40828	40835	50 %	50 %	0 %	0 %	56707182
25	NC_006530	TA	3	6	42089	42094	50 %	50 %	0 %	0 %	56707185
26	NC_006530	GT	3	6	42173	42178	0 %	50 %	50 %	0 %	56707185
27	NC_006530	AT	3	6	42620	42625	50 %	50 %	0 %	0 %	56707185

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.