MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006530	T	6	6	2290	2295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006530	A	6	6	4287	4292	100 %	0 %	0 %	0 %	56707140
3	NC_006530	T	7	7	5714	5720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006530	T	6	6	6718	6723	0 %	100 %	0 %	0 %	56707144
5	NC_006530	T	6	6	6837	6842	0 %	100 %	0 %	0 %	56707144
6	NC_006530	A	6	6	6884	6889	100 %	0 %	0 %	0 %	56707145
7	NC_006530	A	6	6	7222	7227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006530	T	6	6	8026	8031	0 %	100 %	0 %	0 %	56707146
9	NC_006530	A	7	7	8128	8134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006530	A	6	6	8335	8340	100 %	0 %	0 %	0 %	56707147
11	NC_006530	A	6	6	8392	8397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006530	T	6	6	8963	8968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006530	A	6	6	8982	8987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006530	A	7	7	9431	9437	100 %	0 %	0 %	0 %	56707148
15	NC_006530	A	8	8	10076	10083	100 %	0 %	0 %	0 %	56707148
16	NC_006530	T	6	6	11034	11039	0 %	100 %	0 %	0 %	56707150
17	NC_006530	A	6	6	11083	11088	100 %	0 %	0 %	0 %	56707150
18	NC_006530	A	7	7	11410	11416	100 %	0 %	0 %	0 %	56707150
19	NC_006530	A	6	6	11514	11519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006530	T	6	6	11770	11775	0 %	100 %	0 %	0 %	56707151
21	NC_006530	T	7	7	11983	11989	0 %	100 %	0 %	0 %	56707152
22	NC_006530	T	6	6	11999	12004	0 %	100 %	0 %	0 %	56707152
23	NC_006530	A	6	6	12882	12887	100 %	0 %	0 %	0 %	56707153
24	NC_006530	A	6	6	12901	12906	100 %	0 %	0 %	0 %	56707153
25	NC_006530	A	7	7	12939	12945	100 %	0 %	0 %	0 %	56707153
26	NC_006530	A	6	6	13033	13038	100 %	0 %	0 %	0 %	56707153
27	NC_006530	A	6	6	14401	14406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006530	A	6	6	14494	14499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006530	T	6	6	14773	14778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006530	A	7	7	15058	15064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006530	T	7	7	15257	15263	0 %	100 %	0 %	0 %	56707155
32	NC_006530	T	9	9	15330	15338	0 %	100 %	0 %	0 %	56707155
33	NC_006530	T	6	6	15365	15370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006530	A	6	6	15489	15494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006530	A	7	7	15852	15858	100 %	0 %	0 %	0 %	56707156
36	NC_006530	A	6	6	16508	16513	100 %	0 %	0 %	0 %	56707156
37	NC_006530	A	6	6	17009	17014	100 %	0 %	0 %	0 %	56707157
38	NC_006530	A	6	6	17859	17864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006530	T	6	6	18002	18007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006530	A	6	6	18172	18177	100 %	0 %	0 %	0 %	56707159
41	NC_006530	A	7	7	18652	18658	100 %	0 %	0 %	0 %	56707159
42	NC_006530	T	7	7	18670	18676	0 %	100 %	0 %	0 %	56707159
43	NC_006530	T	7	7	19057	19063	0 %	100 %	0 %	0 %	56707160
44	NC_006530	T	7	7	19103	19109	0 %	100 %	0 %	0 %	56707160
45	NC_006530	T	7	7	19358	19364	0 %	100 %	0 %	0 %	56707160
46	NC_006530	A	6	6	19709	19714	100 %	0 %	0 %	0 %	56707160
47	NC_006530	A	6	6	19882	19887	100 %	0 %	0 %	0 %	56707161
48	NC_006530	A	7	7	20068	20074	100 %	0 %	0 %	0 %	56707161
49	NC_006530	A	6	6	20337	20342	100 %	0 %	0 %	0 %	56707162
50	NC_006530	T	6	6	20397	20402	0 %	100 %	0 %	0 %	56707162
51	NC_006530	T	6	6	20656	20661	0 %	100 %	0 %	0 %	56707162
52	NC_006530	T	6	6	20751	20756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006530	T	6	6	20833	20838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006530	A	6	6	20949	20954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006530	A	6	6	26947	26952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006530	T	6	6	28815	28820	0 %	100 %	0 %	0 %	56707169
57	NC_006530	T	6	6	29398	29403	0 %	100 %	0 %	0 %	56707170
58	NC_006530	A	7	7	29524	29530	100 %	0 %	0 %	0 %	56707170
59	NC_006530	A	7	7	30354	30360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006530	A	6	6	30942	30947	100 %	0 %	0 %	0 %	56707172
61	NC_006530	A	7	7	35495	35501	100 %	0 %	0 %	0 %	56707176
62	NC_006530	A	6	6	37496	37501	100 %	0 %	0 %	0 %	56707177
63	NC_006530	G	6	6	38723	38728	0 %	0 %	100 %	0 %	56707179
64	NC_006530	T	6	6	38889	38894	0 %	100 %	0 %	0 %	56707179
65	NC_006530	T	6	6	39069	39074	0 %	100 %	0 %	0 %	56707179
66	NC_006530	T	6	6	39226	39231	0 %	100 %	0 %	0 %	56707180
67	NC_006530	T	6	6	39531	39536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006530	T	7	7	39781	39787	0 %	100 %	0 %	0 %	56707181
69	NC_006530	A	6	6	39850	39855	100 %	0 %	0 %	0 %	56707181
70	NC_006530	A	6	6	40096	40101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006530	T	6	6	40763	40768	0 %	100 %	0 %	0 %	56707182
72	NC_006530	T	6	6	40785	40790	0 %	100 %	0 %	0 %	56707182
73	NC_006530	A	6	6	42241	42246	100 %	0 %	0 %	0 %	56707185
74	NC_006530	A	7	7	42300	42306	100 %	0 %	0 %	0 %	56707185
75	NC_006530	A	7	7	42568	42574	100 %	0 %	0 %	0 %	56707185
76	NC_006530	T	7	7	42882	42888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006530	T	6	6	42893	42898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.