MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-20

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006529	CTAAG	2	10	459	468	40 %	20 %	20 %	20 %	56707108
2	NC_006529	GATCC	2	10	1492	1501	20 %	20 %	20 %	40 %	56707108
3	NC_006529	TCGCT	2	10	2254	2263	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_006529	TTGGT	2	10	4016	4025	0 %	60 %	40 %	0 %	56707112
5	NC_006529	GTTTT	2	10	4596	4605	0 %	80 %	20 %	0 %	56707113
6	NC_006529	ATTTG	2	10	5340	5349	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006529	GTTTT	2	10	6192	6201	0 %	80 %	20 %	0 %	56707115
8	NC_006529	TCGTT	2	10	7183	7192	0 %	60 %	20 %	20 %	56707116
9	NC_006529	GACAA	2	10	8421	8430	60 %	0 %	20 %	20 %	56707117
10	NC_006529	AGTAA	2	10	8655	8664	60 %	20 %	20 %	0 %	56707117
11	NC_006529	CTTAA	2	10	8805	8814	40 %	40 %	0 %	20 %	56707117
12	NC_006529	TTTTC	2	10	9500	9509	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_006529	ATCCT	2	10	10131	10140	20 %	40 %	0 %	40 %	56707118
14	NC_006529	TGGAG	2	10	11034	11043	20 %	20 %	60 %	0 %	56707119
15	NC_006529	TTTTG	2	10	11545	11554	0 %	80 %	20 %	0 %	56707120
16	NC_006529	TGGCA	2	10	12378	12387	20 %	20 %	40 %	20 %	56707122
17	NC_006529	TTCCA	2	10	13418	13427	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_006529	TTTTA	2	10	13644	13653	20 %	80 %	0 %	0 %	56707125
19	NC_006529	GGACA	2	10	17086	17095	40 %	0 %	40 %	20 %	56707129
20	NC_006529	AATTT	2	10	20234	20243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.