MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-20

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006529	CTAAG	2	10	459	468	40 %	20 %	20 %	20 %	56707108
2	NC_006529	GATCC	2	10	1492	1501	20 %	20 %	20 %	40 %	56707108
3	NC_006529	TTGGT	2	10	4016	4025	0 %	60 %	40 %	0 %	56707112
4	NC_006529	GTTTT	2	10	4596	4605	0 %	80 %	20 %	0 %	56707113
5	NC_006529	GTTTT	2	10	6192	6201	0 %	80 %	20 %	0 %	56707115
6	NC_006529	TCGTT	2	10	7183	7192	0 %	60 %	20 %	20 %	56707116
7	NC_006529	GACAA	2	10	8421	8430	60 %	0 %	20 %	20 %	56707117
8	NC_006529	AGTAA	2	10	8655	8664	60 %	20 %	20 %	0 %	56707117
9	NC_006529	CTTAA	2	10	8805	8814	40 %	40 %	0 %	20 %	56707117
10	NC_006529	ATCCT	2	10	10131	10140	20 %	40 %	0 %	40 %	56707118
11	NC_006529	TGGAG	2	10	11034	11043	20 %	20 %	60 %	0 %	56707119
12	NC_006529	TTTTG	2	10	11545	11554	0 %	80 %	20 %	0 %	56707120
13	NC_006529	TGGCA	2	10	12378	12387	20 %	20 %	40 %	20 %	56707122
14	NC_006529	TTTTA	2	10	13644	13653	20 %	80 %	0 %	0 %	56707125
15	NC_006529	GGACA	2	10	17086	17095	40 %	0 %	40 %	20 %	56707129

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.