MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-20

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006529	TTGC	2	8	531	538	0 %	50 %	25 %	25 %	56707108
2	NC_006529	CGTT	2	8	953	960	0 %	50 %	25 %	25 %	56707108
3	NC_006529	TTTA	2	8	1087	1094	25 %	75 %	0 %	0 %	56707108
4	NC_006529	TTAA	2	8	1178	1185	50 %	50 %	0 %	0 %	56707108
5	NC_006529	TAAC	2	8	1275	1282	50 %	25 %	0 %	25 %	56707108
6	NC_006529	ATTG	2	8	1333	1340	25 %	50 %	25 %	0 %	56707108
7	NC_006529	CAAC	2	8	1587	1594	50 %	0 %	0 %	50 %	56707108
8	NC_006529	TTGC	2	8	1636	1643	0 %	50 %	25 %	25 %	56707108
9	NC_006529	TCTT	2	8	1901	1908	0 %	75 %	0 %	25 %	56707108
10	NC_006529	ATTC	2	8	2224	2231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_006529	ATTA	2	8	2364	2371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006529	AGCA	2	8	2659	2666	50 %	0 %	25 %	25 %	56707110
13	NC_006529	TCAT	2	8	2931	2938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006529	TGTT	2	8	3374	3381	0 %	75 %	25 %	0 %	56707111
15	NC_006529	GTTT	2	8	3730	3737	0 %	75 %	25 %	0 %	56707111
16	NC_006529	CCTT	2	8	3795	3802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006529	GTTC	2	8	4943	4950	0 %	50 %	25 %	25 %	56707113
18	NC_006529	TTCT	2	8	5010	5017	0 %	75 %	0 %	25 %	56707113
19	NC_006529	CCTT	2	8	5294	5301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006529	ATTA	2	8	5818	5825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006529	AAAT	2	8	5829	5836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006529	TCTT	2	8	6040	6047	0 %	75 %	0 %	25 %	56707114
23	NC_006529	AGTC	2	8	6578	6585	25 %	25 %	25 %	25 %	56707115
24	NC_006529	AAAT	2	8	6979	6986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006529	ATCA	2	8	7296	7303	50 %	25 %	0 %	25 %	56707116
26	NC_006529	ACTC	2	8	7557	7564	25 %	25 %	0 %	50 %	56707116
27	NC_006529	AGTT	2	8	7849	7856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006529	GAGT	2	8	7894	7901	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006529	AGTA	2	8	8077	8084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006529	TTGA	2	8	8202	8209	25 %	50 %	25 %	0 %	56707117
31	NC_006529	TGCT	2	8	8563	8570	0 %	50 %	25 %	25 %	56707117
32	NC_006529	TTGA	2	8	9264	9271	25 %	50 %	25 %	0 %	56707117
33	NC_006529	GAAT	2	8	9916	9923	50 %	25 %	25 %	0 %	56707118
34	NC_006529	GATT	2	8	9971	9978	25 %	50 %	25 %	0 %	56707118
35	NC_006529	CTAA	2	8	10455	10462	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_006529	AGCA	2	8	10465	10472	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_006529	AATC	2	8	10659	10666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_006529	GGTT	2	8	10738	10745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006529	CAAA	2	8	10778	10785	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_006529	TTGG	3	12	10996	11007	0 %	50 %	50 %	0 %	56707119
41	NC_006529	GAAG	2	8	12100	12107	50 %	0 %	50 %	0 %	56707121
42	NC_006529	ACGA	2	8	12890	12897	50 %	0 %	25 %	25 %	56707124
43	NC_006529	ATAA	2	8	13023	13030	75 %	25 %	0 %	0 %	56707124
44	NC_006529	ACAT	2	8	14016	14023	50 %	25 %	0 %	25 %	56707125
45	NC_006529	ATTT	2	8	14070	14077	25 %	75 %	0 %	0 %	56707125
46	NC_006529	AATA	2	8	14405	14412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006529	CATT	2	8	14503	14510	25 %	50 %	0 %	25 %	56707126
48	NC_006529	AATT	2	8	15069	15076	50 %	50 %	0 %	0 %	56707126
49	NC_006529	ATCA	2	8	15240	15247	50 %	25 %	0 %	25 %	56707126
50	NC_006529	GTTG	2	8	15433	15440	0 %	50 %	50 %	0 %	56707126
51	NC_006529	TTCC	2	8	15454	15461	0 %	50 %	0 %	50 %	56707126
52	NC_006529	CTTA	2	8	16282	16289	25 %	50 %	0 %	25 %	56707127
53	NC_006529	GAAA	2	8	16767	16774	75 %	0 %	25 %	0 %	56707129
54	NC_006529	ATGG	2	8	16866	16873	25 %	25 %	50 %	0 %	56707129
55	NC_006529	GGAA	2	8	16958	16965	50 %	0 %	50 %	0 %	56707129
56	NC_006529	TCAT	2	8	17781	17788	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_006529	TCAC	2	8	17951	17958	25 %	25 %	0 %	50 %	56707131
58	NC_006529	AACA	2	8	18193	18200	75 %	0 %	0 %	25 %	56707132
59	NC_006529	ACTA	2	8	18607	18614	50 %	25 %	0 %	25 %	56707133
60	NC_006529	CAAT	2	8	19077	19084	50 %	25 %	0 %	25 %	56707134
61	NC_006529	GAAC	2	8	19164	19171	50 %	0 %	25 %	25 %	56707134
62	NC_006529	TTTA	2	8	19502	19509	25 %	75 %	0 %	0 %	56707134
63	NC_006529	ATGG	2	8	19628	19635	25 %	25 %	50 %	0 %	56707134
64	NC_006529	TGTT	2	8	19681	19688	0 %	75 %	25 %	0 %	56707134
65	NC_006529	ATTT	2	8	19834	19841	25 %	75 %	0 %	0 %	56707134

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.