MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4 chromosome

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006526	TTTGCC	2	12	50847	50858	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006526	GCTCTT	2	12	62087	62098	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006526	TTATTT	2	12	76592	76603	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006526	AAATAG	2	12	81627	81638	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006526	TTAATT	2	12	119282	119293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006526	GGGGCG	2	12	126561	126572	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_006526	TCTTTT	2	12	142755	142766	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_006526	TCCTTT	2	12	155205	155216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006526	TCCCTG	2	12	157260	157271	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006526	AAATAT	2	12	186115	186126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006526	ATTTTT	2	12	194012	194023	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006526	AATTTT	2	12	194305	194316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006526	ATTTGA	2	12	227790	227801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006526	GTCACT	2	12	229894	229905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006526	GCGATT	2	12	238925	238936	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_006526	CTGCTT	2	12	242727	242738	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006526	TTCCAT	2	12	297006	297017	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_006526	ATTTTT	2	12	364798	364809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006526	TTCCTA	2	12	379023	379034	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006526	TTTAAT	2	12	379071	379082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006526	ATTTTT	2	12	422810	422821	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006526	GGAAGG	2	12	434252	434263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006526	CAAAAG	2	12	449971	449982	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_006526	CTTTTT	2	12	454668	454679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_006526	CAATTT	2	12	458312	458323	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_006526	TTTTAA	2	12	476658	476669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006526	CTGTTC	2	12	496072	496083	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006526	TGTTTT	2	12	527126	527137	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006526	AAAGCG	2	12	527188	527199	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_006526	CTTTCT	2	12	527900	527911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006526	ATTTTT	2	12	556825	556836	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006526	ATAAAA	2	12	560592	560603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006526	TGATTT	2	12	571102	571113	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006526	GATCGT	2	12	601401	601412	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_006526	GGCAAA	2	12	616756	616767	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_006526	AATAAA	2	12	623502	623513	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006526	TAGATC	2	12	650152	650163	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_006526	ATCAAA	2	12	663653	663664	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_006526	AATATT	2	12	680305	680316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006526	CAAAAA	2	12	685522	685533	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_006526	GTTTTT	2	12	789633	789644	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006526	TATTGA	2	12	797128	797139	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006526	ATCTTT	2	12	823853	823864	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_006526	TAAAAT	2	12	858124	858135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006526	TTTCCA	2	12	859722	859733	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006526	AATTTT	2	12	895240	895251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006526	TTAAAT	2	12	896782	896793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006526	CTTTGT	2	12	929071	929082	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_006526	ATAATT	2	12	952724	952735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006526	ATTTTT	2	12	952749	952760	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006526	TACGAT	2	12	970878	970889	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_006526	GCCATA	2	12	1002033	1002044	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006526	ATAGAT	2	12	1010866	1010877	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006526	TATCTG	2	12	1017526	1017537	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_006526	GCCTTA	2	12	1024534	1024545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006526	GGCGCA	2	12	1066494	1066505	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006526	TTTATC	2	12	1068977	1068988	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_006526	TTCTCT	2	12	1072781	1072792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006526	ATTTCT	2	12	1105237	1105248	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_006526	TTTTTG	2	12	1174339	1174350	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006526	GCCAAG	2	12	1174504	1174515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006526	AAAAAG	2	12	1184354	1184365	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006526	GGATGC	2	12	1214688	1214699	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_006526	CAGTGC	2	12	1242986	1242997	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006526	CGGAAA	2	12	1266312	1266323	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_006526	AATTTT	2	12	1273785	1273796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006526	GAAAAA	2	12	1273807	1273818	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006526	GATGTC	2	12	1283822	1283833	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_006526	AAGAAT	2	12	1284334	1284345	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006526	TTTTCA	2	12	1327809	1327820	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_006526	TTTCGC	2	12	1355084	1355095	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006526	AAAAAT	2	12	1381976	1381987	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006526	ACTTAT	2	12	1419704	1419715	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_006526	TTATCA	2	12	1423170	1423181	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_006526	TTACCA	2	12	1429173	1429184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006526	TAAAAA	2	12	1441763	1441774	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006526	ATTAAA	2	12	1490050	1490061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006526	AAAATT	2	12	1494904	1494915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006526	AAAAAT	2	12	1519083	1519094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006526	ATTTTG	2	12	1524794	1524805	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006526	AATCAC	2	12	1560469	1560480	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006526	TAAAAA	2	12	1581268	1581279	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006526	TAAAAA	2	12	1590887	1590898	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006526	GATTTT	2	12	1594651	1594662	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006526	ATGATA	2	12	1623588	1623599	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006526	TTTGTT	2	12	1635869	1635880	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006526	CAAAAA	2	12	1635886	1635897	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_006526	AATAAA	2	12	1640985	1640996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006526	AAAAAT	2	12	1646288	1646299	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006526	ATAATC	2	12	1658269	1658280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_006526	GAAAAG	2	12	1658325	1658336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006526	TATTGA	2	12	1674580	1674591	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006526	AAAAGC	2	12	1744429	1744440	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_006526	AATAAA	2	12	1765707	1765718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006526	TCGATT	2	12	1766108	1766119	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_006526	ACAAAT	2	12	1774648	1774659	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_006526	CTTTTC	2	12	1789981	1789992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006526	GATGTT	2	12	1793821	1793832	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006526	AATTTT	2	12	1818384	1818395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006526	CTGTCA	2	12	1823971	1823982	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006526	TTAATT	2	12	1837735	1837746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006526	AGGAAA	2	12	1843545	1843556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006526	TACCGA	2	12	1860548	1860559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006526	CTTTAT	2	12	1887928	1887939	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_006526	ACTCAG	2	12	1909692	1909703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006526	TTATAA	2	12	1932426	1932437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006526	ATTAAA	2	12	1963314	1963325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006526	TGAGCC	2	12	1981603	1981614	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006526	CTATTT	2	12	2036269	2036280	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_006526	ATATAA	2	12	2045923	2045934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006526	TTAATT	2	12	2056267	2056278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.