MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4 chromosome

Total Repeats: 1505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006526	TTGAT	2	10	565	574	20 %	60 %	20 %	0 %	56550897
2	NC_006526	TCGCA	2	10	969	978	20 %	20 %	20 %	40 %	56550897
3	NC_006526	GCAAG	2	10	5527	5536	40 %	0 %	40 %	20 %	56550900
4	NC_006526	ACCAA	2	10	9363	9372	60 %	0 %	0 %	40 %	56550904
5	NC_006526	GCAGC	2	10	10592	10601	20 %	0 %	40 %	40 %	56550904
6	NC_006526	CAGGG	2	10	13524	13533	20 %	0 %	60 %	20 %	56550906
7	NC_006526	ATGCT	2	10	14178	14187	20 %	40 %	20 %	20 %	283856169
8	NC_006526	AGATC	2	10	15204	15213	40 %	20 %	20 %	20 %	56550908
9	NC_006526	GCTTC	2	10	15770	15779	0 %	40 %	20 %	40 %	56550909
10	NC_006526	CAGAT	2	10	15890	15899	40 %	20 %	20 %	20 %	56550909
11	NC_006526	GGCGA	2	10	16661	16670	20 %	0 %	60 %	20 %	56550910
12	NC_006526	GGAGC	2	10	17953	17962	20 %	0 %	60 %	20 %	56550911
13	NC_006526	TGATG	2	10	20660	20669	20 %	40 %	40 %	0 %	56550914
14	NC_006526	ATTTT	2	10	21707	21716	20 %	80 %	0 %	0 %	56550915
15	NC_006526	GGTCG	2	10	24157	24166	0 %	20 %	60 %	20 %	56550917
16	NC_006526	GGCTT	2	10	28854	28863	0 %	40 %	40 %	20 %	56550922
17	NC_006526	AAGGC	2	10	29059	29068	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_006526	CAACG	2	10	30597	30606	40 %	0 %	20 %	40 %	56550923
19	NC_006526	TAGAA	2	10	33748	33757	60 %	20 %	20 %	0 %	56550925
20	NC_006526	AATTT	2	10	37226	37235	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006526	CAAGC	2	10	39067	39076	40 %	0 %	20 %	40 %	56550933
22	NC_006526	GCCCA	2	10	39320	39329	20 %	0 %	20 %	60 %	56550933
23	NC_006526	CAACC	2	10	39634	39643	40 %	0 %	0 %	60 %	56550934
24	NC_006526	GCATG	2	10	40048	40057	20 %	20 %	40 %	20 %	56550934
25	NC_006526	CTGAT	2	10	43091	43100	20 %	40 %	20 %	20 %	56550939
26	NC_006526	AAATA	2	10	43472	43481	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006526	AATAT	2	10	44384	44393	60 %	40 %	0 %	0 %	56550940
28	NC_006526	TGAAA	2	10	45048	45057	60 %	20 %	20 %	0 %	56550940
29	NC_006526	CATCG	2	10	46315	46324	20 %	20 %	20 %	40 %	56550946
30	NC_006526	AAGGC	2	10	49700	49709	40 %	0 %	40 %	20 %	56550950
31	NC_006526	GCTTG	2	10	49863	49872	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_006526	GGATC	2	10	53012	53021	20 %	20 %	40 %	20 %	56550953
33	NC_006526	ATTCT	2	10	55068	55077	20 %	60 %	0 %	20 %	283856176
34	NC_006526	GATTT	2	10	55570	55579	20 %	60 %	20 %	0 %	56550957
35	NC_006526	CATCC	2	10	56047	56056	20 %	20 %	0 %	60 %	56550957
36	NC_006526	GACTG	2	10	56089	56098	20 %	20 %	40 %	20 %	56550957
37	NC_006526	GGATA	2	10	57700	57709	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006526	AGCCA	2	10	60423	60432	40 %	0 %	20 %	40 %	56550964
39	NC_006526	AATAT	2	10	60910	60919	60 %	40 %	0 %	0 %	56550964
40	NC_006526	ACGCC	2	10	62634	62643	20 %	0 %	20 %	60 %	283856178
41	NC_006526	GACGA	2	10	64135	64144	40 %	0 %	40 %	20 %	56550968
42	NC_006526	CGGGA	2	10	66505	66514	20 %	0 %	60 %	20 %	283856179
43	NC_006526	AAATC	2	10	67516	67525	60 %	20 %	0 %	20 %	56550973
44	NC_006526	TCGGT	2	10	68828	68837	0 %	40 %	40 %	20 %	283856180
45	NC_006526	AATCC	2	10	71212	71221	40 %	20 %	0 %	40 %	56550977
46	NC_006526	TAAAG	2	10	72738	72747	60 %	20 %	20 %	0 %	56550979
47	NC_006526	GACGA	2	10	73413	73422	40 %	0 %	40 %	20 %	56550979
48	NC_006526	AAAAT	2	10	76519	76528	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006526	CGCTC	2	10	77486	77495	0 %	20 %	20 %	60 %	56550982
50	NC_006526	TTTGA	2	10	78276	78285	20 %	60 %	20 %	0 %	56550982
51	NC_006526	TTGAT	2	10	80210	80219	20 %	60 %	20 %	0 %	56550984
52	NC_006526	ACATT	2	10	82207	82216	40 %	40 %	0 %	20 %	56550986
53	NC_006526	AAAAG	2	10	86060	86069	80 %	0 %	20 %	0 %	56550992
54	NC_006526	GGTTC	2	10	87484	87493	0 %	40 %	40 %	20 %	56550995
55	NC_006526	CGGTT	2	10	87540	87549	0 %	40 %	40 %	20 %	56550995
56	NC_006526	TGTGT	2	10	87887	87896	0 %	60 %	40 %	0 %	56550995
57	NC_006526	GGCAT	2	10	89402	89411	20 %	20 %	40 %	20 %	56550997
58	NC_006526	GAAAA	2	10	98473	98482	80 %	0 %	20 %	0 %	56551007
59	NC_006526	GCCGT	2	10	98928	98937	0 %	20 %	40 %	40 %	56551007
60	NC_006526	GAAGA	2	10	99985	99994	60 %	0 %	40 %	0 %	283856185
61	NC_006526	TAAAA	2	10	100463	100472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006526	AAGCC	2	10	103282	103291	40 %	0 %	20 %	40 %	283856187
63	NC_006526	CTTTT	2	10	106518	106527	0 %	80 %	0 %	20 %	283856188
64	NC_006526	TACCT	2	10	106718	106727	20 %	40 %	0 %	40 %	283856188
65	NC_006526	TTTCT	2	10	107777	107786	0 %	80 %	0 %	20 %	283856189
66	NC_006526	TCTCG	2	10	108369	108378	0 %	40 %	20 %	40 %	283856189
67	NC_006526	CTGGA	2	10	108512	108521	20 %	20 %	40 %	20 %	283856189
68	NC_006526	TTAAA	2	10	108718	108727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006526	GAGCC	2	10	114539	114548	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_006526	GAGCC	2	10	114552	114561	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_006526	GAGCC	2	10	114565	114574	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_006526	GAGCC	2	10	114578	114587	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_006526	CGGTT	2	10	115274	115283	0 %	40 %	40 %	20 %	56551023
74	NC_006526	ACCAC	2	10	117449	117458	40 %	0 %	0 %	60 %	283856192
75	NC_006526	ATCGG	2	10	117656	117665	20 %	20 %	40 %	20 %	283856192
76	NC_006526	TGCCA	2	10	119447	119456	20 %	20 %	20 %	40 %	283856193
77	NC_006526	GCCAT	2	10	119496	119505	20 %	20 %	20 %	40 %	283856193
78	NC_006526	AATTG	2	10	119726	119735	40 %	40 %	20 %	0 %	283856193
79	NC_006526	TTGAA	2	10	120603	120612	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006526	GTGAT	2	10	121459	121468	20 %	40 %	40 %	0 %	56551028
81	NC_006526	TTATC	2	10	121631	121640	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_006526	TGGGC	2	10	124996	125005	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_006526	TTATT	2	10	125118	125127	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006526	AAGGG	2	10	125453	125462	40 %	0 %	60 %	0 %	56551033
85	NC_006526	AAGGG	2	10	125561	125570	40 %	0 %	60 %	0 %	56551033
86	NC_006526	AATTT	2	10	125858	125867	40 %	60 %	0 %	0 %	56551033
87	NC_006526	AATTT	2	10	125966	125975	40 %	60 %	0 %	0 %	56551033
88	NC_006526	TGGGC	2	10	126452	126461	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_006526	TAGGA	2	10	126486	126495	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006526	CCATT	2	10	127159	127168	20 %	40 %	0 %	40 %	283856196
91	NC_006526	TCGGA	2	10	127996	128005	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_006526	TGGAA	2	10	130589	130598	40 %	20 %	40 %	0 %	56551040
93	NC_006526	ATCTA	2	10	130732	130741	40 %	40 %	0 %	20 %	56551040
94	NC_006526	ATTTT	2	10	134306	134315	20 %	80 %	0 %	0 %	56551044
95	NC_006526	GCTTT	2	10	136473	136482	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_006526	ACCAA	2	10	136833	136842	60 %	0 %	0 %	40 %	56551048
97	NC_006526	TGCGA	2	10	140703	140712	20 %	20 %	40 %	20 %	56551051
98	NC_006526	CTTTT	2	10	141457	141466	0 %	80 %	0 %	20 %	56551052
99	NC_006526	ATCCA	2	10	141867	141876	40 %	20 %	0 %	40 %	56551053
100	NC_006526	TAAGG	2	10	142290	142299	40 %	20 %	40 %	0 %	56551053
101	NC_006526	CTTTT	2	10	143845	143854	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_006526	GTTCT	2	10	144539	144548	0 %	60 %	20 %	20 %	283856201
103	NC_006526	TGATG	2	10	145289	145298	20 %	40 %	40 %	0 %	56551058
104	NC_006526	AAGCC	2	10	146110	146119	40 %	0 %	20 %	40 %	283856202
105	NC_006526	GAAAA	2	10	146356	146365	80 %	0 %	20 %	0 %	283856202
106	NC_006526	TTCGC	2	10	147326	147335	0 %	40 %	20 %	40 %	56551061
107	NC_006526	TGATC	2	10	147988	147997	20 %	40 %	20 %	20 %	56551061
108	NC_006526	AATAT	2	10	148734	148743	60 %	40 %	0 %	0 %	56551062
109	NC_006526	TCTTG	2	10	154334	154343	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_006526	GTCAC	2	10	155442	155451	20 %	20 %	20 %	40 %	56551068
111	NC_006526	TTTCT	2	10	158943	158952	0 %	80 %	0 %	20 %	56551071
112	NC_006526	TGTCG	2	10	161145	161154	0 %	40 %	40 %	20 %	56551072
113	NC_006526	ATTTT	2	10	164364	164373	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006526	CGATC	2	10	168090	168099	20 %	20 %	20 %	40 %	56551078
115	NC_006526	GATAA	2	10	168890	168899	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006526	ATTAT	2	10	170848	170857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006526	TATTT	2	10	171051	171060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006526	TAAAA	2	10	171119	171128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006526	TGAGG	2	10	171722	171731	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006526	TATTT	2	10	171772	171781	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006526	TCTGA	2	10	172135	172144	20 %	40 %	20 %	20 %	56551082
122	NC_006526	ATGGA	2	10	172417	172426	40 %	20 %	40 %	0 %	56551082
123	NC_006526	GAATG	2	10	173332	173341	40 %	20 %	40 %	0 %	56551082
124	NC_006526	TGGTC	2	10	174041	174050	0 %	40 %	40 %	20 %	56551083
125	NC_006526	TGGAT	2	10	174188	174197	20 %	40 %	40 %	0 %	56551083
126	NC_006526	ATTTT	2	10	175036	175045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006526	GGCGG	2	10	176470	176479	0 %	0 %	80 %	20 %	56551084
128	NC_006526	GCTTT	2	10	177432	177441	0 %	60 %	20 %	20 %	56551084
129	NC_006526	ATCCA	2	10	178300	178309	40 %	20 %	0 %	40 %	56551085
130	NC_006526	ATGTG	2	10	179346	179355	20 %	40 %	40 %	0 %	56551086
131	NC_006526	ATTTT	2	10	180282	180291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006526	AGAAT	2	10	180399	180408	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006526	CCCAT	2	10	180921	180930	20 %	20 %	0 %	60 %	56551087
134	NC_006526	TGGCT	2	10	183200	183209	0 %	40 %	40 %	20 %	56551089
135	NC_006526	TGTTT	2	10	183530	183539	0 %	80 %	20 %	0 %	56551089
136	NC_006526	GAAAA	2	10	186225	186234	80 %	0 %	20 %	0 %	283856204
137	NC_006526	TTCTG	2	10	187593	187602	0 %	60 %	20 %	20 %	56551093
138	NC_006526	CCGAT	2	10	189810	189819	20 %	20 %	20 %	40 %	56551093
139	NC_006526	AAAAG	2	10	192720	192729	80 %	0 %	20 %	0 %	56551096
140	NC_006526	CGGGT	2	10	193131	193140	0 %	20 %	60 %	20 %	56551096
141	NC_006526	GAAAA	2	10	193865	193874	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006526	ATTCT	2	10	194180	194189	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_006526	ATTTT	2	10	194381	194390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006526	AATAA	2	10	194718	194727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006526	GTTAT	2	10	194986	194995	20 %	60 %	20 %	0 %	56551098
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160	NC_006526	TATGA	2	10	215733	215742	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_006526	ATATT	2	10	215757	215766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_006526	TCAGC	2	10	218624	218633	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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166	NC_006526	ATAGA	2	10	228024	228033	60 %	20 %	20 %	0 %	56551129
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171	NC_006526	CATCC	2	10	231659	231668	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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188	NC_006526	TGAAG	2	10	261030	261039	40 %	20 %	40 %	0 %	283856215
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250	NC_006526	TCTTT	2	10	340754	340763	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_006526	GAAAG	2	10	357071	357080	60 %	0 %	40 %	0 %	56551252
262	NC_006526	TGGCT	2	10	357880	357889	0 %	40 %	40 %	20 %	283856239
263	NC_006526	TTGGC	2	10	359415	359424	0 %	40 %	40 %	20 %	283856239
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267	NC_006526	ATTTT	2	10	361101	361110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_006526	TCGGT	2	10	363043	363052	0 %	40 %	40 %	20 %	56551258
269	NC_006526	TCCCA	2	10	363208	363217	20 %	20 %	0 %	60 %	56551258
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271	NC_006526	ATGGG	2	10	365790	365799	20 %	20 %	60 %	0 %	283856241
272	NC_006526	GGGTC	2	10	366478	366487	0 %	20 %	60 %	20 %	56551260
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281	NC_006526	TTGTT	2	10	376891	376900	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
282	NC_006526	AATTT	2	10	377474	377483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_006526	GGGCT	2	10	390717	390726	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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393	NC_006526	CTTCA	2	10	538356	538365	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
394	NC_006526	CGGTT	2	10	538816	538825	0 %	40 %	40 %	20 %	56551442
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400	NC_006526	CGCTC	2	10	550097	550106	0 %	20 %	20 %	60 %	56551450
401	NC_006526	GGCTG	2	10	550693	550702	0 %	20 %	60 %	20 %	56551450
402	NC_006526	GTCTT	2	10	551313	551322	0 %	60 %	20 %	20 %	56551451
403	NC_006526	ATGGC	2	10	556626	556635	20 %	20 %	40 %	20 %	56551455
404	NC_006526	AAAAG	2	10	558088	558097	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_006526	AAAAG	2	10	561965	561974	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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