MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4 chromosome

Total Repeats: 313

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006526	AAGGC	2	10	29059	29068	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_006526	AATTT	2	10	37226	37235	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006526	AAATA	2	10	43472	43481	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006526	GCTTG	2	10	49863	49872	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006526	GGATA	2	10	57700	57709	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006526	AAAAT	2	10	76519	76528	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006526	TAAAA	2	10	100463	100472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006526	TTAAA	2	10	108718	108727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006526	GAGCC	2	10	114539	114548	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_006526	GAGCC	2	10	114552	114561	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_006526	GAGCC	2	10	114565	114574	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_006526	GAGCC	2	10	114578	114587	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_006526	TTGAA	2	10	120603	120612	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006526	TTATC	2	10	121631	121640	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_006526	TGGGC	2	10	124996	125005	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_006526	TTATT	2	10	125118	125127	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006526	TGGGC	2	10	126452	126461	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_006526	TAGGA	2	10	126486	126495	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006526	TCGGA	2	10	127996	128005	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_006526	GCTTT	2	10	136473	136482	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_006526	CTTTT	2	10	143845	143854	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_006526	TCTTG	2	10	154334	154343	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_006526	ATTTT	2	10	164364	164373	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006526	GATAA	2	10	168890	168899	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006526	ATTAT	2	10	170848	170857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006526	TATTT	2	10	171051	171060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006526	TAAAA	2	10	171119	171128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006526	TGAGG	2	10	171722	171731	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006526	TATTT	2	10	171772	171781	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006526	ATTTT	2	10	175036	175045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006526	ATTTT	2	10	180282	180291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006526	AGAAT	2	10	180399	180408	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006526	GAAAA	2	10	193865	193874	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006526	ATTCT	2	10	194180	194189	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_006526	ATTTT	2	10	194381	194390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006526	AATAA	2	10	194718	194727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006526	TTTTA	2	10	208144	208153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006526	ATTTT	2	10	214465	214474	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006526	TTTTA	2	10	215279	215288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006526	TATGA	2	10	215733	215742	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006526	ATATT	2	10	215757	215766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006526	TCAGC	2	10	218624	218633	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_006526	AAAAT	2	10	230133	230142	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006526	TTTAT	2	10	231601	231610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006526	CATCC	2	10	231659	231668	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_006526	ATATT	2	10	258387	258396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006526	TTGTT	2	10	261601	261610	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006526	TCTTT	2	10	298643	298652	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_006526	TTTAT	2	10	309992	310001	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006526	CTTTT	2	10	318626	318635	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_006526	CTTTC	2	10	319754	319763	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_006526	CTTTT	2	10	331814	331823	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_006526	TTTAC	2	10	335580	335589	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_006526	TCTTT	2	10	340754	340763	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_006526	ATTTT	2	10	361101	361110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006526	TAAAT	2	10	375069	375078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006526	ATGCC	2	10	375860	375869	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_006526	TTGTT	2	10	376891	376900	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006526	AATTT	2	10	377474	377483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006526	GGGCT	2	10	390717	390726	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_006526	TTATT	2	10	402465	402474	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006526	GTCCT	2	10	404366	404375	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_006526	ATTTT	2	10	404840	404849	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006526	TCTTT	2	10	422626	422635	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_006526	TTTGC	2	10	422895	422904	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_006526	TAAGA	2	10	432549	432558	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006526	GATTA	2	10	433776	433785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006526	AGATA	2	10	444015	444024	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006526	ATTAC	2	10	446802	446811	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_006526	ACAAG	2	10	454765	454774	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_006526	GATAG	2	10	478054	478063	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006526	GATAA	2	10	501870	501879	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006526	ATTCA	2	10	504246	504255	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_006526	TAATT	2	10	513298	513307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006526	GCGCG	2	10	516401	516410	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_006526	CAATA	2	10	516413	516422	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_006526	AAGGG	2	10	518146	518155	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006526	TAGGC	2	10	527704	527713	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_006526	TGAGA	2	10	530368	530377	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006526	CTTCA	2	10	538356	538365	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_006526	AGTCA	2	10	542171	542180	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_006526	AAAAG	2	10	558088	558097	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006526	TATAA	2	10	560613	560622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006526	AAAAG	2	10	561965	561974	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006526	TCAAA	2	10	567615	567624	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_006526	TTATT	2	10	571424	571433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006526	ATTTT	2	10	581369	581378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006526	TCTTT	2	10	598117	598126	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_006526	TGATT	2	10	598137	598146	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006526	ATGCT	2	10	600869	600878	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_006526	GCTTT	2	10	613010	613019	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_006526	ATTTT	2	10	623083	623092	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006526	TAAAA	2	10	624968	624977	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006526	AAAAT	2	10	680131	680140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006526	AGATG	2	10	691947	691956	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006526	TTTAT	2	10	719183	719192	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006526	TGCGG	2	10	729650	729659	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_006526	AGATT	2	10	737995	738004	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006526	CTTTT	2	10	739068	739077	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_006526	ATTTT	2	10	739982	739991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006526	TCATG	2	10	740108	740117	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_006526	TCTTT	2	10	746056	746065	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_006526	TAAAA	2	10	746133	746142	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006526	ATTTT	2	10	749412	749421	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006526	GGTTC	2	10	782203	782212	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_006526	AATAT	2	10	789141	789150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006526	TAACA	2	10	797367	797376	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_006526	TCCTA	2	10	798373	798382	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_006526	CATTT	2	10	817502	817511	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_006526	AGAAT	2	10	855424	855433	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006526	TAAAA	2	10	855977	855986	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006526	AATAA	2	10	858024	858033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006526	AAATC	2	10	859881	859890	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_006526	ATTTT	2	10	860010	860019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006526	AAAAC	2	10	860311	860320	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_006526	TATAT	2	10	860463	860472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006526	TAAAA	2	10	874357	874366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006526	TTAAA	2	10	888542	888551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006526	GATAT	2	10	896720	896729	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006526	ATAAC	2	10	911472	911481	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_006526	GATGA	2	10	911557	911566	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006526	AAACT	2	10	933154	933163	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_006526	AAAAT	2	10	936363	936372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006526	TTCTA	2	10	952705	952714	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_006526	AAGGG	2	10	953766	953775	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006526	GAAAA	2	10	960032	960041	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006526	AGGGC	2	10	971887	971896	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_006526	AGCGA	2	10	972043	972052	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_006526	TGCAT	2	10	975471	975480	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_006526	ACTTC	2	10	991015	991024	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_006526	GACAG	2	10	994488	994497	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_006526	ATGAA	2	10	1010164	1010173	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006526	TCTTT	2	10	1014813	1014822	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_006526	TTAAA	2	10	1024632	1024641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006526	TTCTT	2	10	1034708	1034717	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_006526	AGGGT	2	10	1037054	1037063	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006526	AAAAT	2	10	1052641	1052650	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006526	TATTT	2	10	1058904	1058913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006526	GATAA	2	10	1059503	1059512	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006526	AAATA	2	10	1065308	1065317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006526	GCCTT	2	10	1065462	1065471	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_006526	GTTTT	2	10	1074374	1074383	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006526	TTTTC	2	10	1082974	1082983	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_006526	CCTTT	2	10	1137474	1137483	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_006526	TTGGA	2	10	1139197	1139206	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006526	AGACC	2	10	1147182	1147191	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_006526	CCTAT	2	10	1149439	1149448	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_006526	ATAAA	2	10	1153679	1153688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006526	CACCC	2	10	1167029	1167038	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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152	NC_006526	TTAAA	2	10	1174290	1174299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_006526	AGAAA	2	10	1200035	1200044	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_006526	AACAT	2	10	1209510	1209519	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_006526	ATGAT	2	10	1229823	1229832	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_006526	GATAG	2	10	1231750	1231759	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_006526	TTATT	2	10	1238121	1238130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_006526	TTCTG	2	10	1241934	1241943	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
162	NC_006526	ATAGG	2	10	1260812	1260821	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
163	NC_006526	CTGAC	2	10	1266236	1266245	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_006526	GAAAC	2	10	1276399	1276408	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
165	NC_006526	AAGAC	2	10	1294243	1294252	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_006526	CCTGA	2	10	1303129	1303138	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
167	NC_006526	ATATA	2	10	1305400	1305409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_006526	CTTAG	2	10	1309189	1309198	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_006526	TGGGG	2	10	1310670	1310679	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_006526	GCTTT	2	10	1372148	1372157	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
178	NC_006526	CTTTT	2	10	1373113	1373122	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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180	NC_006526	AGAAA	2	10	1375991	1376000	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
181	NC_006526	ATTTT	2	10	1377456	1377465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_006526	TATTT	2	10	1377522	1377531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_006526	TTAGT	2	10	1377584	1377593	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_006526	TATTT	2	10	1384313	1384322	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_006526	GAAAC	2	10	1385505	1385514	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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197	NC_006526	ATTTT	2	10	1468388	1468397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_006526	TAAAA	2	10	1847339	1847348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_006526	CACGA	2	10	1902132	1902141	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
284	NC_006526	AAACC	2	10	1903519	1903528	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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286	NC_006526	AACTT	2	10	1906669	1906678	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_006526	AGCGC	2	10	1908724	1908733	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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289	NC_006526	ATCTT	2	10	1912228	1912237	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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310	NC_006526	AAAAT	2	10	2036211	2036220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_006526	TAAAA	2	10	2045639	2045648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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313	NC_006526	AAAGA	2	10	2052382	2052391	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.