MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Aromatoleum aromaticum EbN1 chromosome

Total Repeats: 2544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_006513	GGCGCG	2	12	4234045	4234056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479508
2502	NC_006513	GCGCTG	2	12	4234956	4234967	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56479509
2503	NC_006513	CAGCGC	2	12	4236096	4236107	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56479509
2504	NC_006513	CGACAG	2	12	4236162	4236173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479509
2505	NC_006513	GGCGAC	2	12	4236174	4236185	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56479509
2506	NC_006513	GCCCAC	2	12	4237552	4237563	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	56479510
2507	NC_006513	GGAAGA	2	12	4238683	4238694	50 %	0 %	50 %	0 %	56479511
2508	NC_006513	GTCGAA	2	12	4239751	4239762	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56479511
2509	NC_006513	CCGAAG	2	12	4240164	4240175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479511
2510	NC_006513	GTCGCC	2	12	4240703	4240714	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	56479511
2511	NC_006513	CGAGCG	2	12	4240759	4240770	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56479511
2512	NC_006513	CCGATG	2	12	4246026	4246037	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56479517
2513	NC_006513	TCATCC	2	12	4248060	4248071	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	56479520
2514	NC_006513	GACCGG	2	12	4251853	4251864	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56479524
2515	NC_006513	CGTATT	2	12	4252134	4252145	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56479524
2516	NC_006513	CAGCCG	2	12	4253658	4253669	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56479525
2517	NC_006513	GATTGC	2	12	4255396	4255407	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56479527
2518	NC_006513	GGCGAT	2	12	4256105	4256116	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56479527
2519	NC_006513	GGGCGC	2	12	4261054	4261065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479534
2520	NC_006513	TGAGCG	2	12	4266684	4266695	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56479538
2521	NC_006513	GCGCCG	2	12	4266975	4266986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2522	NC_006513	GGCGCG	2	12	4268396	4268407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479540
2523	NC_006513	GGCGTG	2	12	4268423	4268434	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56479540
2524	NC_006513	TGGCAT	2	12	4270326	4270337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56479542
2525	NC_006513	CGGCGA	2	12	4270944	4270955	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56479542
2526	NC_006513	CATGAC	2	12	4271908	4271919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56479543
2527	NC_006513	CAGCGT	2	12	4273765	4273776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56479543
2528	NC_006513	GAGCGT	2	12	4274497	4274508	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56479544
2529	NC_006513	GGTGAC	2	12	4276297	4276308	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56479545
2530	NC_006513	TTGGCC	2	12	4278221	4278232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_006513	GCCTTT	2	12	4279126	4279137	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56479547
2532	NC_006513	CATGCG	2	12	4280152	4280163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56479547
2533	NC_006513	GCTTGC	2	12	4281448	4281459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479548
2534	NC_006513	GCCGGA	2	12	4281959	4281970	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56479549
2535	NC_006513	GTGGCG	2	12	4282605	4282616	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56479550
2536	NC_006513	GGCGTC	2	12	4285861	4285872	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56479555
2537	NC_006513	CGTCGG	2	12	4286028	4286039	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56479555
2538	NC_006513	GGCCGC	2	12	4286335	4286346	0 %	0 %	50 %	50 %	56479555
2539	NC_006513	CCTCGG	2	12	4288161	4288172	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2540	NC_006513	TCGGCG	2	12	4288292	4288303	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_006513	TGGTGC	2	12	4290379	4290390	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56479560
2542	NC_006513	CACGCG	2	12	4290640	4290651	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56479561
2543	NC_006513	CGGCGT	2	12	4292929	4292940	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56479563
2544	NC_006513	GCGACC	2	12	4293705	4293716	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	56479563

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.