MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Aromatoleum aromaticum EbN1 chromosome

Total Repeats: 1160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006513	TCGC	2	8	3644238	3644245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_006513	CCAA	2	8	3650530	3650537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_006513	CCTG	2	8	3655625	3655632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_006513	GCAG	2	8	3655642	3655649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_006513	CCCG	2	8	3655969	3655976	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1006	NC_006513	CTGA	2	8	3655992	3655999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_006513	GGCG	2	8	3657838	3657845	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_006513	TCAG	2	8	3658620	3658627	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_006513	CGTG	2	8	3659859	3659866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_006513	CCGC	2	8	3663762	3663769	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1011	NC_006513	CCTT	2	8	3665284	3665291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_006513	ATGC	2	8	3665305	3665312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_006513	CCGG	2	8	3666363	3666370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_006513	CATG	2	8	3674822	3674829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_006513	CGGC	2	8	3674837	3674844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_006513	CGGG	2	8	3681098	3681105	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_006513	CCGC	2	8	3682143	3682150	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1018	NC_006513	GGTA	2	8	3684551	3684558	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_006513	TGAT	2	8	3685037	3685044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_006513	CGCC	2	8	3687930	3687937	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1021	NC_006513	GTGG	2	8	3691387	3691394	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_006513	ATCG	2	8	3691458	3691465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_006513	CGAG	2	8	3712754	3712761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_006513	CTCG	2	8	3721206	3721213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_006513	GCTC	2	8	3721218	3721225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_006513	ATCG	2	8	3725075	3725082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1029	NC_006513	CGAG	2	8	3740348	3740355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_006513	CGCT	2	8	3740689	3740696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_006513	AGGC	2	8	3741365	3741372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_006513	TGCT	2	8	3751392	3751399	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_006513	TTCG	2	8	3761679	3761686	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_006513	CCCT	2	8	3765210	3765217	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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1037	NC_006513	TCAC	2	8	3776678	3776685	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_006513	ATGA	2	8	3776716	3776723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1041	NC_006513	GGTC	2	8	3782188	3782195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_006513	CGGT	2	8	3792017	3792024	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_006513	CGGC	2	8	3818815	3818822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_006513	TGAG	2	8	3822448	3822455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1048	NC_006513	CCTC	2	8	3844052	3844059	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1049	NC_006513	CCGA	2	8	3844145	3844152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_006513	CCTC	2	8	3846629	3846636	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1051	NC_006513	ACCC	2	8	3854059	3854066	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1052	NC_006513	GCAG	2	8	3854896	3854903	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_006513	GGCG	2	8	3854923	3854930	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_006513	TCGC	2	8	3857522	3857529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_006513	TCTG	2	8	3859266	3859273	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1058	NC_006513	CGTC	2	8	3874935	3874942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_006513	ATCT	2	8	3874977	3874984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_006513	CATT	2	8	3875546	3875553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_006513	CCGC	2	8	3876087	3876094	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1062	NC_006513	CGGT	2	8	3884524	3884531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1064	NC_006513	CGGC	2	8	3890586	3890593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_006513	GGAA	2	8	3890624	3890631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_006513	GGCT	2	8	3911269	3911276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_006513	AACC	2	8	3911415	3911422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_006513	CGCT	2	8	3914406	3914413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_006513	GACC	2	8	3914436	3914443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_006513	CGTT	2	8	3927096	3927103	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1102	NC_006513	CGGC	2	8	4110596	4110603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1105	NC_006513	CGGC	2	8	4122372	4122379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1109	NC_006513	GCAG	2	8	4139220	4139227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1113	NC_006513	ATCG	2	8	4155521	4155528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_006513	GAAA	2	8	4155654	4155661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_006513	CGAT	2	8	4155820	4155827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_006513	CCCG	2	8	4162169	4162176	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1120	NC_006513	GGAA	2	8	4165176	4165183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_006513	GCCG	2	8	4167399	4167406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_006513	CCCA	2	8	4169499	4169506	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1123	NC_006513	CAGC	2	8	4182434	4182441	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_006513	ATCA	2	8	4185140	4185147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_006513	TTCC	2	8	4185277	4185284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_006513	CAAC	2	8	4185327	4185334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_006513	CGCC	2	8	4185525	4185532	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1128	NC_006513	GCCC	2	8	4186616	4186623	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1129	NC_006513	TCAA	2	8	4186765	4186772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1131	NC_006513	CCGA	2	8	4198207	4198214	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1135	NC_006513	ACGC	2	8	4208753	4208760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_006513	CGTT	2	8	4210643	4210650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_006513	GCCG	2	8	4211304	4211311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1138	NC_006513	GGCG	2	8	4211346	4211353	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1139	NC_006513	CGCC	2	8	4217134	4217141	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1140	NC_006513	AGGT	2	8	4217484	4217491	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_006513	GCAT	2	8	4227917	4227924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1142	NC_006513	GGGC	2	8	4228522	4228529	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1143	NC_006513	GTAA	2	8	4237951	4237958	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_006513	GGTC	2	8	4243638	4243645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1145	NC_006513	GCCG	2	8	4243723	4243730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1146	NC_006513	GCTG	2	8	4246719	4246726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1147	NC_006513	CAGG	2	8	4248018	4248025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1148	NC_006513	GTCC	2	8	4254242	4254249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1149	NC_006513	TCCC	2	8	4256206	4256213	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1150	NC_006513	CCGA	2	8	4256310	4256317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1151	NC_006513	GCCG	2	8	4256373	4256380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1152	NC_006513	CGCC	2	8	4256381	4256388	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1153	NC_006513	GCGT	2	8	4256399	4256406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1154	NC_006513	GTAT	2	8	4256442	4256449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1155	NC_006513	CGGG	2	8	4265569	4265576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1156	NC_006513	GGCG	2	8	4280343	4280350	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1157	NC_006513	GTCC	2	8	4288029	4288036	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1158	NC_006513	CTAC	2	8	4294482	4294489	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1159	NC_006513	GCAG	2	8	4295368	4295375	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1160	NC_006513	GCTG	2	8	4295650	4295657	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.