MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Idiomarina loihiensis L2TR chromosome

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006512	AAATTT	2	12	27455	27466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006512	CGGAGG	2	12	51842	51853	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_006512	CGGAGG	2	12	56641	56652	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_006512	ATTTGC	2	12	121837	121848	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_006512	AATTTA	2	12	173541	173552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006512	GGGGAA	2	12	206525	206536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006512	AGTGTC	2	12	224887	224898	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_006512	TATTCA	2	12	231390	231401	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_006512	GTTAAC	2	12	286258	286269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_006512	TTTTAA	2	12	486678	486689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006512	TTGATC	2	12	515511	515522	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_006512	ACGTCA	2	12	532355	532366	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006512	TGATGT	2	12	643215	643226	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006512	AATGAT	2	12	855676	855687	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006512	CTTTCG	2	12	865549	865560	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006512	AAGTTT	2	12	883870	883881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006512	AAAAAG	2	12	1033375	1033386	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006512	AGCTTT	2	12	1051617	1051628	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_006512	ATAAAA	2	12	1103536	1103547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006512	ATCAGA	2	12	1169753	1169764	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_006512	CAAAAA	2	12	1224904	1224915	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_006512	GTTTCA	2	12	1228841	1228852	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_006512	CTACTT	2	12	1229938	1229949	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006512	ACCCAA	2	12	1246518	1246529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006512	ATTTCA	2	12	1264048	1264059	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_006512	TGCGCT	2	12	1284121	1284132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_006512	AAAATA	2	12	1324674	1324685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006512	AAAGTT	2	12	1340014	1340025	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006512	TAACGC	2	12	1343585	1343596	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006512	AGTTAC	2	12	1345868	1345879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_006512	ATTTAA	2	12	1386451	1386462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006512	TTTTCC	2	12	1473854	1473865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006512	AGCTTT	2	12	1567301	1567312	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_006512	TTATTG	2	12	1592936	1592947	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006512	TTCTGA	2	12	1600362	1600373	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_006512	CATTAG	2	12	1644844	1644855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_006512	CTTCAG	2	12	1664536	1664547	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006512	ATGAAT	2	12	1686709	1686720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006512	CTTTAC	2	12	1800804	1800815	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006512	AGGCTC	2	12	1819870	1819881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006512	GAGTCA	2	12	1821579	1821590	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_006512	TGTAAA	2	12	1856723	1856734	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006512	ATTTCA	2	12	1990335	1990346	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_006512	ATTTCA	2	12	2024758	2024769	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_006512	TTTTTA	2	12	2054479	2054490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006512	TTTTTA	2	12	2055003	2055014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006512	TATTCT	2	12	2171151	2171162	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_006512	ACAAGT	2	12	2217309	2217320	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_006512	AATTTA	2	12	2286273	2286284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006512	ATTTGT	2	12	2294971	2294982	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006512	TGTAAA	2	12	2339961	2339972	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006512	CTGTGA	2	12	2351720	2351731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_006512	TAAAGG	2	12	2360557	2360568	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006512	GTATCT	2	12	2363429	2363440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_006512	ATGTGC	2	12	2420206	2420217	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_006512	ATTTCA	2	12	2433569	2433580	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_006512	CTAAAT	2	12	2679171	2679182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_006512	TATAGT	2	12	2688966	2688977	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006512	CGTTTT	2	12	2716883	2716894	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_006512	ATTTCA	2	12	2749912	2749923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_006512	ATTTTG	2	12	2797931	2797942	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006512	CATCTT	2	12	2798065	2798076	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006512	TATTAC	2	12	2831504	2831515	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.