MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Idiomarina loihiensis L2TR chromosome

Total Repeats: 1705

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006512	CACAA	2	10	4682	4691	60 %	0 %	0 %	40 %	56459116
2	NC_006512	GAAGT	2	10	4986	4995	40 %	20 %	40 %	0 %	56459116
3	NC_006512	GGCGA	2	10	5052	5061	20 %	0 %	60 %	20 %	56459116
4	NC_006512	GAACA	2	10	7473	7482	60 %	0 %	20 %	20 %	56459117
5	NC_006512	GCTCT	2	10	8532	8541	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_006512	CCCAG	2	10	9065	9074	20 %	0 %	20 %	60 %	56459118
7	NC_006512	TCTTT	2	10	10334	10343	0 %	80 %	0 %	20 %	56459120
8	NC_006512	GTTCA	2	10	11433	11442	20 %	40 %	20 %	20 %	56459122
9	NC_006512	TACCG	2	10	11658	11667	20 %	20 %	20 %	40 %	56459122
10	NC_006512	CTTGC	2	10	12680	12689	0 %	40 %	20 %	40 %	56459123
11	NC_006512	CGCTT	2	10	13893	13902	0 %	40 %	20 %	40 %	56459123
12	NC_006512	GGCAG	2	10	15013	15022	20 %	0 %	60 %	20 %	56459124
13	NC_006512	AAGAA	2	10	18659	18668	80 %	0 %	20 %	0 %	56459127
14	NC_006512	ATCGC	2	10	20635	20644	20 %	20 %	20 %	40 %	56459128
15	NC_006512	CGCGG	2	10	24669	24678	0 %	0 %	60 %	40 %	56459133
16	NC_006512	TTGAG	2	10	24866	24875	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006512	TCTGG	2	10	26174	26183	0 %	40 %	40 %	20 %	56459135
18	NC_006512	CCAAA	2	10	28106	28115	60 %	0 %	0 %	40 %	56459137
19	NC_006512	CAGAA	2	10	30723	30732	60 %	0 %	20 %	20 %	56459138
20	NC_006512	CAGAA	2	10	32173	32182	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_006512	AATGA	2	10	32737	32746	60 %	20 %	20 %	0 %	56459140
22	NC_006512	CAAAA	2	10	33590	33599	80 %	0 %	0 %	20 %	56459141
23	NC_006512	GCCAC	2	10	35288	35297	20 %	0 %	20 %	60 %	56459144
24	NC_006512	TTTCC	2	10	36675	36684	0 %	60 %	0 %	40 %	56459144
25	NC_006512	GTTAA	2	10	40433	40442	40 %	40 %	20 %	0 %	56459150
26	NC_006512	ATGGC	2	10	43424	43433	20 %	20 %	40 %	20 %	56459152
27	NC_006512	ACTGA	2	10	43519	43528	40 %	20 %	20 %	20 %	56459152
28	NC_006512	ATTGC	2	10	43996	44005	20 %	40 %	20 %	20 %	56459152
29	NC_006512	CGTGA	2	10	45994	46003	20 %	20 %	40 %	20 %	56459154
30	NC_006512	TGTGG	2	10	46351	46360	0 %	40 %	60 %	0 %	56459154
31	NC_006512	AAACT	2	10	48714	48723	60 %	20 %	0 %	20 %	56459157
32	NC_006512	GAAAA	2	10	49598	49607	80 %	0 %	20 %	0 %	56459157
33	NC_006512	ACCGG	2	10	50317	50326	20 %	0 %	40 %	40 %	56459158
34	NC_006512	AGCTC	2	10	50655	50664	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_006512	TTCTT	2	10	51931	51940	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_006512	CTAAT	2	10	52073	52082	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_006512	GTGAA	2	10	58061	58070	40 %	20 %	40 %	0 %	56459167
38	NC_006512	AGAGG	2	10	59687	59696	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006512	AAATG	2	10	60869	60878	60 %	20 %	20 %	0 %	56459170
40	NC_006512	TTGTT	2	10	61643	61652	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006512	TCTTT	2	10	61891	61900	0 %	80 %	0 %	20 %	56459171
42	NC_006512	AGCCT	2	10	65559	65568	20 %	20 %	20 %	40 %	56459174
43	NC_006512	TAGCG	2	10	69405	69414	20 %	20 %	40 %	20 %	56459178
44	NC_006512	AAGCT	2	10	71194	71203	40 %	20 %	20 %	20 %	56459180
45	NC_006512	TCGCC	2	10	72023	72032	0 %	20 %	20 %	60 %	56459180
46	NC_006512	GATTA	2	10	76372	76381	40 %	40 %	20 %	0 %	56459184
47	NC_006512	TTTGA	2	10	78965	78974	20 %	60 %	20 %	0 %	56459185
48	NC_006512	AGTCC	2	10	80726	80735	20 %	20 %	20 %	40 %	56459187
49	NC_006512	TTTCG	2	10	81698	81707	0 %	60 %	20 %	20 %	56459188
50	NC_006512	TTAAG	2	10	83681	83690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006512	GTATG	2	10	84140	84149	20 %	40 %	40 %	0 %	56459189
52	NC_006512	GGGGC	2	10	84582	84591	0 %	0 %	80 %	20 %	56459189
53	NC_006512	AACCG	2	10	85029	85038	40 %	0 %	20 %	40 %	56459190
54	NC_006512	ACGGT	2	10	85634	85643	20 %	20 %	40 %	20 %	56459190
55	NC_006512	GAACC	2	10	85758	85767	40 %	0 %	20 %	40 %	56459190
56	NC_006512	CTTGT	2	10	87403	87412	0 %	60 %	20 %	20 %	56459192
57	NC_006512	AATAA	2	10	87701	87710	80 %	20 %	0 %	0 %	56459192
58	NC_006512	GCAAA	2	10	87791	87800	60 %	0 %	20 %	20 %	56459192
59	NC_006512	GTTTC	2	10	89141	89150	0 %	60 %	20 %	20 %	56459193
60	NC_006512	AAAGC	2	10	91600	91609	60 %	0 %	20 %	20 %	56459196
61	NC_006512	AAAGA	2	10	94343	94352	80 %	0 %	20 %	0 %	56459199
62	NC_006512	TGGCA	2	10	97368	97377	20 %	20 %	40 %	20 %	56459203
63	NC_006512	TGCAA	2	10	99758	99767	40 %	20 %	20 %	20 %	56459206
64	NC_006512	AGCTG	2	10	100649	100658	20 %	20 %	40 %	20 %	56459207
65	NC_006512	GGTCA	2	10	102469	102478	20 %	20 %	40 %	20 %	56459210
66	NC_006512	GTGCA	2	10	103996	104005	20 %	20 %	40 %	20 %	56459212
67	NC_006512	GTTAA	2	10	105138	105147	40 %	40 %	20 %	0 %	56459212
68	NC_006512	ACAGA	2	10	107642	107651	60 %	0 %	20 %	20 %	56459213
69	NC_006512	GTTGT	2	10	107760	107769	0 %	60 %	40 %	0 %	56459213
70	NC_006512	GTGCG	2	10	111624	111633	0 %	20 %	60 %	20 %	56459218
71	NC_006512	TAACG	2	10	113745	113754	40 %	20 %	20 %	20 %	56459219
72	NC_006512	GTCCA	2	10	116138	116147	20 %	20 %	20 %	40 %	56459220
73	NC_006512	TGCGG	2	10	116395	116404	0 %	20 %	60 %	20 %	56459220
74	NC_006512	AGGGG	2	10	116576	116585	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006512	GTATT	2	10	117457	117466	20 %	60 %	20 %	0 %	56459221
76	NC_006512	ACGGC	2	10	118220	118229	20 %	0 %	40 %	40 %	56459222
77	NC_006512	GCCTT	2	10	119120	119129	0 %	40 %	20 %	40 %	56459222
78	NC_006512	ACTGT	2	10	119701	119710	20 %	40 %	20 %	20 %	56459223
79	NC_006512	GTTTC	2	10	121109	121118	0 %	60 %	20 %	20 %	56459223
80	NC_006512	TGCAA	2	10	123017	123026	40 %	20 %	20 %	20 %	56459225
81	NC_006512	GAACT	2	10	123979	123988	40 %	20 %	20 %	20 %	56459226
82	NC_006512	AGGTC	2	10	124720	124729	20 %	20 %	40 %	20 %	56459227
83	NC_006512	AACCG	2	10	126169	126178	40 %	0 %	20 %	40 %	56459228
84	NC_006512	GAATT	2	10	127835	127844	40 %	40 %	20 %	0 %	56459228
85	NC_006512	CAGAG	2	10	129881	129890	40 %	0 %	40 %	20 %	56459229
86	NC_006512	GTTAA	2	10	130265	130274	40 %	40 %	20 %	0 %	56459229
87	NC_006512	TCCCC	2	10	130292	130301	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
88	NC_006512	AGGAC	2	10	131568	131577	40 %	0 %	40 %	20 %	56459231
89	NC_006512	CGCAG	2	10	134302	134311	20 %	0 %	40 %	40 %	56459233
90	NC_006512	CGGTG	2	10	135532	135541	0 %	20 %	60 %	20 %	56459233
91	NC_006512	ACTGC	2	10	138035	138044	20 %	20 %	20 %	40 %	56459237
92	NC_006512	GGCGC	2	10	138470	138479	0 %	0 %	60 %	40 %	56459237
93	NC_006512	GAGTG	2	10	139756	139765	20 %	20 %	60 %	0 %	56459240
94	NC_006512	GTTTG	2	10	142490	142499	0 %	60 %	40 %	0 %	56459244
95	NC_006512	CTTGC	2	10	143801	143810	0 %	40 %	20 %	40 %	56459245
96	NC_006512	ATTCC	2	10	146377	146386	20 %	40 %	0 %	40 %	56459248
97	NC_006512	GTTAC	2	10	146813	146822	20 %	40 %	20 %	20 %	56459248
98	NC_006512	GGAAG	2	10	147232	147241	40 %	0 %	60 %	0 %	56459248
99	NC_006512	CATTG	2	10	147647	147656	20 %	40 %	20 %	20 %	56459248
100	NC_006512	CCGGC	2	10	147941	147950	0 %	0 %	40 %	60 %	56459249
101	NC_006512	GCTTT	2	10	148778	148787	0 %	60 %	20 %	20 %	56459249
102	NC_006512	CCGGT	2	10	150149	150158	0 %	20 %	40 %	40 %	56459251
103	NC_006512	ACGCA	2	10	151559	151568	40 %	0 %	20 %	40 %	161761293
104	NC_006512	TAACC	2	10	153172	153181	40 %	20 %	0 %	40 %	56459254
105	NC_006512	ACGCG	2	10	159102	159111	20 %	0 %	40 %	40 %	56459260
106	NC_006512	CATCG	2	10	159352	159361	20 %	20 %	20 %	40 %	56459261
107	NC_006512	CCGGA	2	10	161935	161944	20 %	0 %	40 %	40 %	56459263
108	NC_006512	GTAAG	2	10	164340	164349	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006512	GACAT	2	10	167142	167151	40 %	20 %	20 %	20 %	56459270
110	NC_006512	TTGAA	2	10	168829	168838	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006512	TGAGT	2	10	171580	171589	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006512	TTGCA	2	10	172291	172300	20 %	40 %	20 %	20 %	56459273
113	NC_006512	GAACC	2	10	172575	172584	40 %	0 %	20 %	40 %	56459273
114	NC_006512	ATTTT	2	10	173063	173072	20 %	80 %	0 %	0 %	56459273
115	NC_006512	TTTCT	2	10	174608	174617	0 %	80 %	0 %	20 %	56459274
116	NC_006512	GGCTG	2	10	176097	176106	0 %	20 %	60 %	20 %	56459276
117	NC_006512	CTTCA	2	10	176371	176380	20 %	40 %	0 %	40 %	56459276
118	NC_006512	CTGAC	2	10	177116	177125	20 %	20 %	20 %	40 %	56459278
119	NC_006512	TCGGG	2	10	177443	177452	0 %	20 %	60 %	20 %	56459278
120	NC_006512	CAACA	2	10	177949	177958	60 %	0 %	0 %	40 %	56459278
121	NC_006512	TGGGC	2	10	179274	179283	0 %	20 %	60 %	20 %	56459279
122	NC_006512	GTTCC	2	10	181925	181934	0 %	40 %	20 %	40 %	56459282
123	NC_006512	CGCTG	2	10	182693	182702	0 %	20 %	40 %	40 %	56459283
124	NC_006512	TCATG	2	10	185154	185163	20 %	40 %	20 %	20 %	56459284
125	NC_006512	ACCAC	2	10	185453	185462	40 %	0 %	0 %	60 %	56459285
126	NC_006512	AGTGG	2	10	186267	186276	20 %	20 %	60 %	0 %	56459286
127	NC_006512	ATTTA	2	10	186320	186329	40 %	60 %	0 %	0 %	56459286
128	NC_006512	GGAAA	2	10	186888	186897	60 %	0 %	40 %	0 %	56459286
129	NC_006512	AAGTG	2	10	187586	187595	40 %	20 %	40 %	0 %	56459286
130	NC_006512	AGCTC	2	10	188211	188220	20 %	20 %	20 %	40 %	56459286
131	NC_006512	GAATG	2	10	189090	189099	40 %	20 %	40 %	0 %	56459287
132	NC_006512	GCTTT	2	10	189626	189635	0 %	60 %	20 %	20 %	56459287
133	NC_006512	ACCCA	2	10	192689	192698	40 %	0 %	0 %	60 %	56459289
134	NC_006512	TCATC	2	10	193804	193813	20 %	40 %	0 %	40 %	56459290
135	NC_006512	GTCAT	2	10	196082	196091	20 %	40 %	20 %	20 %	56459293
136	NC_006512	CTTAA	2	10	196554	196563	40 %	40 %	0 %	20 %	56459294
137	NC_006512	CTGCT	2	10	199200	199209	0 %	40 %	20 %	40 %	56459295
138	NC_006512	AATTT	2	10	202347	202356	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_006512	GTTAC	2	10	430296	430305	20 %	40 %	20 %	20 %	56459526
270	NC_006512	ATCTT	2	10	431002	431011	20 %	60 %	0 %	20 %	56459527
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384	NC_006512	CCAGG	2	10	610196	610205	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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396	NC_006512	CCTGG	2	10	628720	628729	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
397	NC_006512	GCGTG	2	10	633882	633891	0 %	20 %	60 %	20 %	56459700
398	NC_006512	ACGTT	2	10	635205	635214	20 %	40 %	20 %	20 %	56459700
399	NC_006512	GGGCT	2	10	636876	636885	0 %	20 %	60 %	20 %	56459700
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