MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Idiomarina loihiensis L2TR chromosome

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006512	GCTCT	2	10	8532	8541	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_006512	TTGAG	2	10	24866	24875	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006512	CAGAA	2	10	32173	32182	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_006512	AGCTC	2	10	50655	50664	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_006512	TTCTT	2	10	51931	51940	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_006512	CTAAT	2	10	52073	52082	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_006512	AGAGG	2	10	59687	59696	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006512	TTGTT	2	10	61643	61652	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006512	TTAAG	2	10	83681	83690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006512	AGGGG	2	10	116576	116585	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006512	TCCCC	2	10	130292	130301	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
12	NC_006512	GTAAG	2	10	164340	164349	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006512	TTGAA	2	10	168829	168838	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006512	TGAGT	2	10	171580	171589	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006512	AATTT	2	10	202347	202356	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006512	GCTAA	2	10	229598	229607	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_006512	AGCAA	2	10	274836	274845	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_006512	CTGGT	2	10	298782	298791	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_006512	TAACC	2	10	307298	307307	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_006512	GTTTA	2	10	313713	313722	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006512	TTCTT	2	10	325830	325839	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_006512	ATTTT	2	10	326211	326220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006512	AAAAC	2	10	329352	329361	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_006512	GTAGG	2	10	349890	349899	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006512	AACTA	2	10	362175	362184	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_006512	ACTTA	2	10	366656	366665	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_006512	AAAAT	2	10	379749	379758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006512	TGGAA	2	10	397244	397253	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006512	AGGTG	2	10	485516	485525	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006512	CCAGG	2	10	499940	499949	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_006512	CCAGG	2	10	525405	525414	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_006512	TATTT	2	10	547278	547287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006512	GGGTT	2	10	548107	548116	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006512	ACAAA	2	10	548328	548337	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_006512	ATTAA	2	10	588634	588643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006512	TATTT	2	10	591366	591375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006512	GTTAC	2	10	608019	608028	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_006512	CCAGG	2	10	610196	610205	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_006512	CAAAA	2	10	620667	620676	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_006512	CCTGG	2	10	628720	628729	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_006512	CACCT	2	10	677629	677638	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_006512	ATCTT	2	10	681672	681681	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_006512	GAAAA	2	10	686269	686278	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006512	ATCTA	2	10	694458	694467	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_006512	GTAAA	2	10	715348	715357	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006512	TTGCT	2	10	738706	738715	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_006512	TGTTA	2	10	740879	740888	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006512	CAATT	2	10	748119	748128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_006512	TATAA	2	10	789067	789076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006512	CGTCT	2	10	798869	798878	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_006512	AAATT	2	10	813167	813176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006512	GGTCA	2	10	831351	831360	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_006512	CATTT	2	10	857999	858008	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_006512	AATAA	2	10	858070	858079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006512	TTTAT	2	10	858844	858853	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006512	GTTTT	2	10	864407	864416	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006512	TTAAA	2	10	878677	878686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006512	ACCCT	2	10	882300	882309	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_006512	AGCTA	2	10	883891	883900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_006512	TTTTC	2	10	945204	945213	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_006512	TTTTC	2	10	954814	954823	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_006512	AAATA	2	10	960903	960912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006512	TCAGA	2	10	964267	964276	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_006512	ATGAA	2	10	964934	964943	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006512	AGCAC	2	10	992611	992620	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_006512	GATAA	2	10	1011501	1011510	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006512	TGCTC	2	10	1051581	1051590	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_006512	GAAAA	2	10	1074935	1074944	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006512	TACAA	2	10	1075537	1075546	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_006512	AGTTT	2	10	1131065	1131074	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006512	TGCTT	2	10	1136330	1136339	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_006512	ATATT	2	10	1199676	1199685	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006512	TTCGT	2	10	1228853	1228862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_006512	AGTAA	2	10	1232229	1232238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006512	AAGCC	2	10	1249161	1249170	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_006512	CTCGT	2	10	1264541	1264550	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_006512	CGCCT	2	10	1264706	1264715	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_006512	TACCC	2	10	1264728	1264737	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_006512	CGACT	2	10	1264952	1264961	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_006512	GAAGA	2	10	1266266	1266275	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006512	AACAC	2	10	1267744	1267753	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_006512	GCTTG	2	10	1268340	1268349	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_006512	TTTCG	2	10	1268409	1268418	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_006512	AAAAC	2	10	1268453	1268462	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_006512	GTTAA	2	10	1272119	1272128	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006512	CTTCT	2	10	1305837	1305846	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_006512	GTTAA	2	10	1306613	1306622	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006512	AGTGA	2	10	1307482	1307491	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006512	ATAGT	2	10	1377063	1377072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006512	TAAAA	2	10	1383307	1383316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006512	TGTAG	2	10	1440604	1440613	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006512	TCACC	2	10	1482104	1482113	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_006512	AAACC	2	10	1484680	1484689	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_006512	TGAAA	2	10	1506532	1506541	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006512	TAAAT	2	10	1539669	1539678	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006512	AGTAA	2	10	1540571	1540580	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006512	AGCTT	2	10	1544168	1544177	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_006512	AACAA	2	10	1551257	1551266	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_006512	TGTTC	2	10	1597138	1597147	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_006512	CCCGC	2	10	1597848	1597857	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
101	NC_006512	ATTGC	2	10	1609330	1609339	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_006512	CTAAC	2	10	1617223	1617232	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_006512	AATAA	2	10	1650456	1650465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006512	TCACT	2	10	1660670	1660679	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_006512	AGTTA	2	10	1692772	1692781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006512	GCTTA	2	10	1694763	1694772	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_006512	ATTTA	2	10	1694820	1694829	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006512	TGTGT	2	10	1701110	1701119	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006512	AAGCT	2	10	1715632	1715641	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_006512	GTTTT	2	10	1717795	1717804	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006512	AGTTT	2	10	1722049	1722058	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006512	GACAA	2	10	1737398	1737407	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_006512	TCAAA	2	10	1737424	1737433	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_006512	AGCGC	2	10	1737509	1737518	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_006512	AATCC	2	10	1740032	1740041	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_006512	CGTAG	2	10	1740433	1740442	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_006512	TTCAT	2	10	1751600	1751609	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_006512	AAGAC	2	10	1761414	1761423	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_006512	TGGAT	2	10	1766641	1766650	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006512	AGTTT	2	10	1769149	1769158	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006512	CCTGG	2	10	1779678	1779687	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_006512	AATAA	2	10	1790689	1790698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006512	TCCTA	2	10	1855117	1855126	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_006512	TTAAT	2	10	1903233	1903242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006512	CATGC	2	10	1903527	1903536	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_006512	CAGGC	2	10	1904392	1904401	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_006512	CTTCT	2	10	1906098	1906107	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_006512	TACGC	2	10	1907212	1907221	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_006512	CCAGG	2	10	1910529	1910538	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_006512	TTAAC	2	10	1914008	1914017	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_006512	GCGGA	2	10	1914055	1914064	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_006512	CCTGG	2	10	1919543	1919552	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_006512	GAAAG	2	10	1921650	1921659	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006512	ATAAC	2	10	1927609	1927618	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_006512	AACCG	2	10	1927929	1927938	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_006512	AACAA	2	10	1953918	1953927	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_006512	TGCAC	2	10	1955115	1955124	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_006512	TAAAA	2	10	1955217	1955226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006512	CTCGT	2	10	2025251	2025260	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_006512	CGCCT	2	10	2025416	2025425	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_006512	TACCC	2	10	2025438	2025447	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
142	NC_006512	CGACT	2	10	2025662	2025671	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_006512	GAAGA	2	10	2026976	2026985	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006512	AACAC	2	10	2028599	2028608	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_006512	GCTTG	2	10	2029195	2029204	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_006512	TTTCG	2	10	2029264	2029273	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_006512	AAAAC	2	10	2029308	2029317	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_006512	GTTTA	2	10	2039090	2039099	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006512	TAGAG	2	10	2113852	2113861	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006512	CATTA	2	10	2116433	2116442	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_006512	CTGGA	2	10	2125890	2125899	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_006512	TCAAA	2	10	2139271	2139280	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_006512	AATAA	2	10	2150159	2150168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_006512	TATTT	2	10	2150190	2150199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_006512	CTAGC	2	10	2153825	2153834	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
156	NC_006512	TGAAA	2	10	2156628	2156637	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_006512	TAATG	2	10	2191408	2191417	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_006512	ATCGC	2	10	2193364	2193373	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
159	NC_006512	GCTTT	2	10	2205088	2205097	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_006512	AATAC	2	10	2205151	2205160	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_006512	GAAGC	2	10	2207999	2208008	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_006512	AATTT	2	10	2219170	2219179	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_006512	GCACA	2	10	2219213	2219222	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_006512	GTGCA	2	10	2219255	2219264	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_006512	AGTTA	2	10	2223203	2223212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
166	NC_006512	TTGTG	2	10	2223351	2223360	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
167	NC_006512	GAGCT	2	10	2230947	2230956	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
168	NC_006512	CTGAC	2	10	2266349	2266358	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
169	NC_006512	TCGCG	2	10	2274530	2274539	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
170	NC_006512	CAATT	2	10	2286338	2286347	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
171	NC_006512	TTTTC	2	10	2295136	2295145	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_006512	CCTGG	2	10	2314439	2314448	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
173	NC_006512	TAAAA	2	10	2323072	2323081	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_006512	ACGAT	2	10	2325551	2325560	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_006512	GTTAA	2	10	2339922	2339931	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
176	NC_006512	TAAGG	2	10	2397763	2397772	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
177	NC_006512	GGTGG	2	10	2430928	2430937	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
178	NC_006512	CCTGG	2	10	2431074	2431083	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
179	NC_006512	CTCGT	2	10	2434062	2434071	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
180	NC_006512	CGCCT	2	10	2434227	2434236	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
181	NC_006512	TACCC	2	10	2434249	2434258	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
182	NC_006512	CGACT	2	10	2434473	2434482	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
183	NC_006512	GAAGA	2	10	2435788	2435797	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
184	NC_006512	AACAC	2	10	2437411	2437420	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_006512	GCTTG	2	10	2438007	2438016	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
186	NC_006512	ATAAA	2	10	2456384	2456393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_006512	TGTTT	2	10	2518115	2518124	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_006512	TGAGA	2	10	2576841	2576850	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
189	NC_006512	ATCAA	2	10	2592784	2592793	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
190	NC_006512	CCTGG	2	10	2598752	2598761	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
191	NC_006512	AGGTG	2	10	2638599	2638608	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
192	NC_006512	CCTGG	2	10	2638723	2638732	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
193	NC_006512	GTTGG	2	10	2649168	2649177	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
194	NC_006512	TTAAG	2	10	2676882	2676891	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
195	NC_006512	TAAAA	2	10	2706561	2706570	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_006512	CCTGG	2	10	2747261	2747270	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
197	NC_006512	CTCGT	2	10	2750405	2750414	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
198	NC_006512	CGCCT	2	10	2750570	2750579	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
199	NC_006512	TACCC	2	10	2750592	2750601	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
200	NC_006512	CGACT	2	10	2750816	2750825	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
201	NC_006512	GCTTG	2	10	2754348	2754357	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
202	NC_006512	TATAA	2	10	2781625	2781634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_006512	TAAAA	2	10	2786535	2786544	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_006512	TAAGG	2	10	2796009	2796018	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
205	NC_006512	TGTGG	2	10	2800440	2800449	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
206	NC_006512	ATACT	2	10	2800462	2800471	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
207	NC_006512	TCACT	2	10	2800796	2800805	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
208	NC_006512	TTTTA	2	10	2801171	2801180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.