MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Idiomarina loihiensis L2TR chromosome

Total Repeats: 592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006512	TATT	2	8	6440	6447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006512	GAAG	2	8	10165	10172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006512	TGTT	2	8	11012	11019	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006512	ATGG	2	8	11051	11058	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006512	TCTG	2	8	27296	27303	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_006512	TTCC	2	8	27321	27328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006512	CAGA	2	8	33004	33011	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_006512	TAAA	2	8	37980	37987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006512	TTAA	2	8	44463	44470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006512	TGCT	2	8	44474	44481	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_006512	ATTT	2	8	50749	50756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006512	TTTA	2	8	52130	52137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006512	ACAT	2	8	72617	72624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006512	CAAA	2	8	72734	72741	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_006512	GCAG	2	8	72756	72763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_006512	TAAT	2	8	72820	72827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006512	AGCA	2	8	80357	80364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006512	ATCT	2	8	81603	81610	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006512	AGCC	2	8	86787	86794	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006512	CGAA	2	8	87352	87359	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006512	ACAA	2	8	87893	87900	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006512	TTAA	2	8	91477	91484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006512	TAAG	2	8	94458	94465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006512	ATGA	2	8	94981	94988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006512	ATCA	2	8	103807	103814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_006512	AGTA	2	8	112026	112033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006512	AAGG	2	8	112087	112094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006512	AATG	2	8	116605	116612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006512	ACAA	2	8	117553	117560	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_006512	TCAC	2	8	125434	125441	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_006512	AGGG	2	8	164545	164552	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006512	TTAA	2	8	174989	174996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006512	ATCT	2	8	185415	185422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_006512	CAAC	2	8	186186	186193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_006512	TTAC	2	8	196248	196255	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_006512	AACT	2	8	196314	196321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_006512	AAAG	2	8	199922	199929	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006512	ATAA	2	8	202337	202344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006512	TTTC	2	8	202468	202475	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_006512	TCTT	2	8	206868	206875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006512	TTGG	2	8	214052	214059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006512	TGTT	2	8	214118	214125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006512	TTTA	2	8	214150	214157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006512	CTTC	2	8	224773	224780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006512	TAAT	2	8	224783	224790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006512	ATCA	2	8	231277	231284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_006512	TTAA	2	8	235446	235453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006512	ACAG	2	8	235533	235540	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_006512	ATTT	2	8	237165	237172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006512	TTCA	2	8	237417	237424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_006512	GTTA	2	8	239031	239038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006512	TATC	2	8	241431	241438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_006512	CTGA	2	8	247906	247913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_006512	CGAT	2	8	257812	257819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_006512	CGAA	2	8	275021	275028	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_006512	GCCT	2	8	293015	293022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006512	TCAT	2	8	298473	298480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_006512	GGCG	2	8	302705	302712	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_006512	GTAT	2	8	304652	304659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006512	TTGT	2	8	307356	307363	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006512	CAGT	2	8	307391	307398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_006512	TGGG	2	8	312481	312488	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006512	AATT	2	8	312505	312512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006512	CATT	2	8	315153	315160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_006512	ACGC	2	8	316980	316987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006512	AGTG	2	8	317858	317865	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006512	TAAA	2	8	317866	317873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006512	ATGC	2	8	317902	317909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_006512	AAAT	2	8	319233	319240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006512	GAGT	2	8	319248	319255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006512	AATT	2	8	322083	322090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006512	ATGA	2	8	346554	346561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006512	TCAG	2	8	352226	352233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_006512	TTAA	2	8	353481	353488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006512	AGCT	2	8	353634	353641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_006512	GCTC	2	8	366604	366611	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_006512	TGAC	2	8	371685	371692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_006512	TTAG	2	8	373873	373880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006512	CTAA	2	8	373911	373918	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_006512	CTTC	2	8	414864	414871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006512	ACCA	2	8	419807	419814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_006512	AAGT	2	8	419826	419833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006512	AAAT	2	8	430440	430447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006512	AAAC	2	8	437751	437758	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_006512	ATGA	2	8	438973	438980	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006512	CGGC	2	8	439006	439013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_006512	AGGT	2	8	458186	458193	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006512	TAAT	2	8	460553	460560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006512	AATC	2	8	460620	460627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_006512	AGCG	2	8	485532	485539	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_006512	CCAT	2	8	485605	485612	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_006512	GCAA	2	8	491003	491010	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_006512	CCAT	2	8	493686	493693	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_006512	AAAG	2	8	493838	493845	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006512	GCGT	2	8	493852	493859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_006512	TAAT	2	8	495849	495856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006512	GAAC	2	8	495870	495877	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_006512	GGGC	2	8	498475	498482	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_006512	TGGC	2	8	498489	498496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_006512	CTCC	2	8	498676	498683	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_006512	TTCC	2	8	499814	499821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_006512	TTTA	2	8	501328	501335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006512	ATCA	2	8	504490	504497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_006512	AGCG	2	8	507908	507915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_006512	CCAT	2	8	507980	507987	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_006512	ATGG	2	8	508155	508162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006512	AGCG	2	8	509612	509619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_006512	CCAT	2	8	509684	509691	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_006512	AATT	2	8	514526	514533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006512	TCTG	2	8	515595	515602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_006512	ATGG	2	8	516061	516068	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006512	TTTG	2	8	516820	516827	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006512	TTTA	2	8	524111	524118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006512	CTCC	2	8	524141	524148	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_006512	TTCC	2	8	525279	525286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_006512	TAAT	2	8	534014	534021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006512	TTCT	2	8	547949	547956	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_006512	TGAA	2	8	547966	547973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006512	GAAT	2	8	549905	549912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006512	TTAA	2	8	554592	554599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006512	CCTC	2	8	558321	558328	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
122	NC_006512	CTTT	2	8	558390	558397	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_006512	TTTC	2	8	560230	560237	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_006512	CTGT	2	8	560380	560387	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_006512	TTGT	2	8	565952	565959	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006512	ATAC	2	8	565990	565997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_006512	AACC	2	8	567855	567862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_006512	AACC	2	8	592640	592647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_006512	GGTA	2	8	592701	592708	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006512	TTAA	2	8	598901	598908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006512	CTCC	2	8	608932	608939	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_006512	TTCC	2	8	610070	610077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_006512	ACTA	2	8	610815	610822	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_006512	TGGC	2	8	614915	614922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_006512	AGTG	2	8	617016	617023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006512	ATAA	2	8	617314	617321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006512	GAAT	2	8	623903	623910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006512	GGAA	2	8	628848	628855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006512	CCAT	2	8	637507	637514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_006512	CCAT	2	8	643011	643018	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_006512	TACC	2	8	643162	643169	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_006512	ATTT	2	8	663669	663676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006512	TATT	2	8	664962	664969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006512	GAAT	2	8	673419	673426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006512	ATGG	2	8	677544	677551	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006512	TCTT	2	8	678566	678573	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_006512	AAAT	2	8	681716	681723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006512	CAAT	2	8	684578	684585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_006512	ATTA	2	8	684586	684593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006512	GCTT	2	8	685533	685540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_006512	GAAA	2	8	686258	686265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_006512	GATG	2	8	2199396	2199403	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
440	NC_006512	AAGC	2	8	2206110	2206117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
441	NC_006512	ACCC	2	8	2206925	2206932	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
442	NC_006512	ACCC	2	8	2207018	2207025	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
443	NC_006512	GGAT	2	8	2207744	2207751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_006512	GGTT	2	8	2207990	2207997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
446	NC_006512	ACTC	2	8	2209134	2209141	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
447	NC_006512	GATG	2	8	2211445	2211452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
448	NC_006512	TGAC	2	8	2219189	2219196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
449	NC_006512	TGGT	2	8	2230976	2230983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
450	NC_006512	ATGG	2	8	2231012	2231019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
451	NC_006512	CAGC	2	8	2235963	2235970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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453	NC_006512	AATT	2	8	2256197	2256204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_006512	CCAT	2	8	2261783	2261790	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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461	NC_006512	GGAA	2	8	2314567	2314574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
462	NC_006512	AAGG	2	8	2329329	2329336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_006512	TTAT	2	8	2340939	2340946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_006512	ACTA	2	8	2347491	2347498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
467	NC_006512	TTTG	2	8	2354807	2354814	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_006512	ATAA	2	8	2362514	2362521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_006512	AAAG	2	8	2363406	2363413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
472	NC_006512	TTAA	2	8	2364533	2364540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_006512	AAAT	2	8	2375634	2375641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_006512	GCGA	2	8	2375657	2375664	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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476	NC_006512	GGTA	2	8	2384820	2384827	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
477	NC_006512	GGAA	2	8	2396521	2396528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_006512	AACA	2	8	2420318	2420325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
481	NC_006512	CCAT	2	8	2426661	2426668	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
482	NC_006512	TAAT	2	8	2426737	2426744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_006512	AGTT	2	8	2428328	2428335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
484	NC_006512	GGAA	2	8	2431202	2431209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
485	NC_006512	TTAT	2	8	2432408	2432415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_006512	ACTG	2	8	2432561	2432568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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488	NC_006512	GTCT	2	8	2433232	2433239	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
489	NC_006512	CTTT	2	8	2434497	2434504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
490	NC_006512	GTAC	2	8	2435059	2435066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
491	NC_006512	TCAG	2	8	2435185	2435192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_006512	TCGC	2	8	2435323	2435330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
493	NC_006512	TTGT	2	8	2435613	2435620	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
494	NC_006512	AGGC	2	8	2435843	2435850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
495	NC_006512	TTCC	2	8	2437159	2437166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
496	NC_006512	TACG	2	8	2437292	2437299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_006512	AAGC	2	8	2437786	2437793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_006512	TCAA	2	8	2437883	2437890	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_006512	TGCC	2	8	2438148	2438155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_006512	ACTG	2	8	2438230	2438237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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