MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus kaustophilus HTA426 plasmid pHTA426

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006509	AACAG	2	10	1499	1508	60 %	0 %	20 %	20 %	56410439
2	NC_006509	TGTTT	2	10	3654	3663	0 %	80 %	20 %	0 %	56410441
3	NC_006509	ATTTT	2	10	8499	8508	20 %	80 %	0 %	0 %	56410445
4	NC_006509	ATCAT	2	10	12422	12431	40 %	40 %	0 %	20 %	56410447
5	NC_006509	TTTGC	2	10	13957	13966	0 %	60 %	20 %	20 %	56410448
6	NC_006509	AGTGA	2	10	15092	15101	40 %	20 %	40 %	0 %	56410449
7	NC_006509	AGCGG	2	10	17906	17915	20 %	0 %	60 %	20 %	56410451
8	NC_006509	ATCAT	2	10	21125	21134	40 %	40 %	0 %	20 %	56410454
9	NC_006509	AGTAC	2	10	22729	22738	40 %	20 %	20 %	20 %	56410455
10	NC_006509	CTGAT	2	10	23353	23362	20 %	40 %	20 %	20 %	56410456
11	NC_006509	TCTTT	2	10	24314	24323	0 %	80 %	0 %	20 %	56410458
12	NC_006509	AATGT	2	10	26047	26056	40 %	40 %	20 %	0 %	56410458
13	NC_006509	CGGTG	2	10	26447	26456	0 %	20 %	60 %	20 %	56410458
14	NC_006509	TCCAT	2	10	27074	27083	20 %	40 %	0 %	40 %	56410459
15	NC_006509	CCTTC	2	10	28369	28378	0 %	40 %	0 %	60 %	56410460
16	NC_006509	ATCAT	2	10	29785	29794	40 %	40 %	0 %	20 %	56410462
17	NC_006509	CCAAA	2	10	31367	31376	60 %	0 %	0 %	40 %	56410463
18	NC_006509	ATTAA	2	10	32910	32919	60 %	40 %	0 %	0 %	56410464
19	NC_006509	CTTTG	2	10	32989	32998	0 %	60 %	20 %	20 %	56410464
20	NC_006509	ACAGT	2	10	34287	34296	40 %	20 %	20 %	20 %	56410465
21	NC_006509	TTTCC	2	10	37661	37670	0 %	60 %	0 %	40 %	56410467
22	NC_006509	TGTTT	2	10	38694	38703	0 %	80 %	20 %	0 %	56410468
23	NC_006509	ACGGC	2	10	41009	41018	20 %	0 %	40 %	40 %	56410469
24	NC_006509	GAAAC	2	10	41115	41124	60 %	0 %	20 %	20 %	56410469
25	NC_006509	TCATT	2	10	43821	43830	20 %	60 %	0 %	20 %	56410473

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.