MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Geobacillus kaustophilus HTA426 plasmid pHTA426

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006509	TTGT	2	8	253	260	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006509	TGGA	2	8	1557	1564	25 %	25 %	50 %	0 %	56410439
3	NC_006509	TGAA	2	8	1642	1649	50 %	25 %	25 %	0 %	56410439
4	NC_006509	GATC	2	8	1673	1680	25 %	25 %	25 %	25 %	56410439
5	NC_006509	AATA	2	8	2104	2111	75 %	25 %	0 %	0 %	56410440
6	NC_006509	AAAT	2	8	2655	2662	75 %	25 %	0 %	0 %	56410440
7	NC_006509	AGGG	2	8	2862	2869	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006509	GGAT	2	8	2963	2970	25 %	25 %	50 %	0 %	56410441
9	NC_006509	GTGG	2	8	3181	3188	0 %	25 %	75 %	0 %	56410441
10	NC_006509	GGTC	2	8	3411	3418	0 %	25 %	50 %	25 %	56410441
11	NC_006509	TGCT	2	8	4242	4249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006509	AAAG	2	8	4261	4268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006509	GATT	2	8	4411	4418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006509	ATTT	2	8	4889	4896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006509	GTTT	2	8	5148	5155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006509	ATGT	2	8	5311	5318	25 %	50 %	25 %	0 %	56410442
17	NC_006509	ACAA	2	8	5996	6003	75 %	0 %	0 %	25 %	56410442
18	NC_006509	AAGC	2	8	6158	6165	50 %	0 %	25 %	25 %	56410443
19	NC_006509	CTGT	2	8	6373	6380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_006509	TCAA	2	8	6494	6501	50 %	25 %	0 %	25 %	56410444
21	NC_006509	TCAA	2	8	6691	6698	50 %	25 %	0 %	25 %	56410444
22	NC_006509	GACG	2	8	6900	6907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_006509	GCCA	2	8	7190	7197	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_006509	TGGA	2	8	7773	7780	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006509	GAAA	2	8	8209	8216	75 %	0 %	25 %	0 %	56410445
26	NC_006509	TAGT	2	8	8949	8956	25 %	50 %	25 %	0 %	56410445
27	NC_006509	TTTG	2	8	9079	9086	0 %	75 %	25 %	0 %	56410445
28	NC_006509	TGCT	2	8	9705	9712	0 %	50 %	25 %	25 %	56410445
29	NC_006509	AGCA	2	8	10340	10347	50 %	0 %	25 %	25 %	56410446
30	NC_006509	AAAC	2	8	10588	10595	75 %	0 %	0 %	25 %	56410446
31	NC_006509	CTAC	2	8	10703	10710	25 %	25 %	0 %	50 %	56410446
32	NC_006509	ATTT	2	8	11391	11398	25 %	75 %	0 %	0 %	56410446
33	NC_006509	ATCG	2	8	11519	11526	25 %	25 %	25 %	25 %	56410446
34	NC_006509	TTTA	2	8	11635	11642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006509	TTCC	2	8	12508	12515	0 %	50 %	0 %	50 %	56410447
36	NC_006509	TTCA	2	8	12544	12551	25 %	50 %	0 %	25 %	56410447
37	NC_006509	GATC	2	8	12875	12882	25 %	25 %	25 %	25 %	56410447
38	NC_006509	ATCT	2	8	12904	12911	25 %	50 %	0 %	25 %	56410447
39	NC_006509	CAAA	2	8	12949	12956	75 %	0 %	0 %	25 %	56410447
40	NC_006509	TTGT	2	8	13498	13505	0 %	75 %	25 %	0 %	56410448
41	NC_006509	ACTT	2	8	13880	13887	25 %	50 %	0 %	25 %	56410448
42	NC_006509	CCGC	2	8	14585	14592	0 %	0 %	25 %	75 %	56410449
43	NC_006509	AAGG	2	8	15681	15688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006509	GAAA	2	8	15898	15905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006509	GCTG	2	8	16334	16341	0 %	25 %	50 %	25 %	56410450
46	NC_006509	ATCA	2	8	17155	17162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_006509	TAAT	2	8	17391	17398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006509	CCGT	2	8	17522	17529	0 %	25 %	25 %	50 %	56410451
49	NC_006509	CAAA	2	8	17642	17649	75 %	0 %	0 %	25 %	56410451
50	NC_006509	GCGG	2	8	18446	18453	0 %	0 %	75 %	25 %	56410451
51	NC_006509	CGGT	2	8	18460	18467	0 %	25 %	50 %	25 %	56410451
52	NC_006509	CTCC	2	8	18499	18506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_006509	TCCA	2	8	19112	19119	25 %	25 %	0 %	50 %	56410452
54	NC_006509	CGCA	2	8	20246	20253	25 %	0 %	25 %	50 %	56410453
55	NC_006509	CAAA	2	8	21877	21884	75 %	0 %	0 %	25 %	56410454
56	NC_006509	TTTA	2	8	22243	22250	25 %	75 %	0 %	0 %	56410454
57	NC_006509	TGTT	2	8	22529	22536	0 %	75 %	25 %	0 %	56410455
58	NC_006509	CAAC	2	8	22762	22769	50 %	0 %	0 %	50 %	56410455
59	NC_006509	ATCA	2	8	23626	23633	50 %	25 %	0 %	25 %	56410456
60	NC_006509	TAAC	2	8	24041	24048	50 %	25 %	0 %	25 %	56410457
61	NC_006509	ATCA	2	8	25238	25245	50 %	25 %	0 %	25 %	56410458
62	NC_006509	ATCC	2	8	25553	25560	25 %	25 %	0 %	50 %	56410458
63	NC_006509	ACAA	2	8	25729	25736	75 %	0 %	0 %	25 %	56410458
64	NC_006509	ATCA	2	8	25772	25779	50 %	25 %	0 %	25 %	56410458
65	NC_006509	ACCA	2	8	27790	27797	50 %	0 %	0 %	50 %	56410460
66	NC_006509	CTTT	2	8	27955	27962	0 %	75 %	0 %	25 %	56410460
67	NC_006509	CGAG	2	8	29083	29090	25 %	0 %	50 %	25 %	56410461
68	NC_006509	TTTG	2	8	29317	29324	0 %	75 %	25 %	0 %	56410461
69	NC_006509	CTAT	2	8	29430	29437	25 %	50 %	0 %	25 %	56410461
70	NC_006509	CTCC	2	8	29462	29469	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_006509	CTTT	2	8	29876	29883	0 %	75 %	0 %	25 %	56410462
72	NC_006509	CGGT	2	8	29892	29899	0 %	25 %	50 %	25 %	56410462
73	NC_006509	TTCA	2	8	30060	30067	25 %	50 %	0 %	25 %	56410462
74	NC_006509	TAGA	2	8	30267	30274	50 %	25 %	25 %	0 %	56410462
75	NC_006509	ATTC	2	8	30473	30480	25 %	50 %	0 %	25 %	56410462
76	NC_006509	CGTA	2	8	30926	30933	25 %	25 %	25 %	25 %	56410462
77	NC_006509	AAGA	2	8	31257	31264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006509	ATAC	2	8	31398	31405	50 %	25 %	0 %	25 %	56410463
79	NC_006509	AGAA	2	8	31776	31783	75 %	0 %	25 %	0 %	56410463
80	NC_006509	TCGA	2	8	31933	31940	25 %	25 %	25 %	25 %	56410463
81	NC_006509	TCCT	2	8	32239	32246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_006509	GAAC	2	8	32547	32554	50 %	0 %	25 %	25 %	56410464
83	NC_006509	TTTC	2	8	32729	32736	0 %	75 %	0 %	25 %	56410464
84	NC_006509	GGTA	2	8	33347	33354	25 %	25 %	50 %	0 %	56410464
85	NC_006509	CTTT	2	8	33409	33416	0 %	75 %	0 %	25 %	56410464
86	NC_006509	GATA	2	8	33647	33654	50 %	25 %	25 %	0 %	56410464
87	NC_006509	AATT	2	8	33739	33746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006509	CCAT	2	8	33937	33944	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_006509	TTGA	2	8	34202	34209	25 %	50 %	25 %	0 %	56410465
90	NC_006509	CAAC	2	8	34311	34318	50 %	0 %	0 %	50 %	56410465
91	NC_006509	GTTT	2	8	34605	34612	0 %	75 %	25 %	0 %	56410465
92	NC_006509	GTCT	2	8	35068	35075	0 %	50 %	25 %	25 %	56410465
93	NC_006509	TTTC	2	8	35236	35243	0 %	75 %	0 %	25 %	56410465
94	NC_006509	CTTT	2	8	35422	35429	0 %	75 %	0 %	25 %	56410465
95	NC_006509	CAAA	2	8	35707	35714	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_006509	GGCT	2	8	36397	36404	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_006509	TCCC	2	8	36758	36765	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_006509	TGAA	2	8	37530	37537	50 %	25 %	25 %	0 %	56410467
99	NC_006509	TAAC	2	8	37611	37618	50 %	25 %	0 %	25 %	56410467
100	NC_006509	ATCG	2	8	38293	38300	25 %	25 %	25 %	25 %	56410467
101	NC_006509	TTCC	2	8	39079	39086	0 %	50 %	0 %	50 %	56410468
102	NC_006509	GACC	2	8	39294	39301	25 %	0 %	25 %	50 %	56410468
103	NC_006509	GCTA	2	8	39467	39474	25 %	25 %	25 %	25 %	56410468
104	NC_006509	GATC	2	8	40655	40662	25 %	25 %	25 %	25 %	56410469
105	NC_006509	TGAC	2	8	42056	42063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_006509	ATCT	2	8	42388	42395	25 %	50 %	0 %	25 %	56410471
107	NC_006509	TCCT	2	8	42612	42619	0 %	50 %	0 %	50 %	56410471
108	NC_006509	CTTC	2	8	42641	42648	0 %	50 %	0 %	50 %	56410471
109	NC_006509	CATT	2	8	43014	43021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_006509	GATC	2	8	43151	43158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_006509	ATTA	2	8	43382	43389	50 %	50 %	0 %	0 %	56410472
112	NC_006509	AAAT	2	8	43435	43442	75 %	25 %	0 %	0 %	56410472
113	NC_006509	GTCC	2	8	43488	43495	0 %	25 %	25 %	50 %	56410472
114	NC_006509	CTTT	2	8	43515	43522	0 %	75 %	0 %	25 %	56410472
115	NC_006509	CTTT	2	8	43526	43533	0 %	75 %	0 %	25 %	56410472
116	NC_006509	CCTT	2	8	43534	43541	0 %	50 %	0 %	50 %	56410472
117	NC_006509	TTGG	2	8	43544	43551	0 %	50 %	50 %	0 %	56410472
118	NC_006509	GCTC	2	8	44022	44029	0 %	25 %	25 %	50 %	56410473
119	NC_006509	CCTT	2	8	44460	44467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_006509	GTTT	2	8	44477	44484	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006509	CTTC	2	8	44950	44957	0 %	50 %	0 %	50 %	56410474
122	NC_006509	ATGA	2	8	45795	45802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006509	TTCC	2	8	46478	46485	0 %	50 %	0 %	50 %	56410477
124	NC_006509	TCTA	2	8	46497	46504	25 %	50 %	0 %	25 %	56410477
125	NC_006509	GGGA	2	8	46600	46607	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006509	GCGG	2	8	47040	47047	0 %	0 %	75 %	25 %	56410478
127	NC_006509	GAAG	2	8	47176	47183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006509	ACAA	2	8	47709	47716	75 %	0 %	0 %	25 %	56410479
129	NC_006509	CCAG	2	8	47757	47764	25 %	0 %	25 %	50 %	56410479

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.