MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus kaustophilus HTA426 plasmid pHTA426

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006509	TGGA	2	8	1557	1564	25 %	25 %	50 %	0 %	56410439
2	NC_006509	TGAA	2	8	1642	1649	50 %	25 %	25 %	0 %	56410439
3	NC_006509	GATC	2	8	1673	1680	25 %	25 %	25 %	25 %	56410439
4	NC_006509	AATA	2	8	2104	2111	75 %	25 %	0 %	0 %	56410440
5	NC_006509	AAAT	2	8	2655	2662	75 %	25 %	0 %	0 %	56410440
6	NC_006509	GGAT	2	8	2963	2970	25 %	25 %	50 %	0 %	56410441
7	NC_006509	GTGG	2	8	3181	3188	0 %	25 %	75 %	0 %	56410441
8	NC_006509	GGTC	2	8	3411	3418	0 %	25 %	50 %	25 %	56410441
9	NC_006509	ATGT	2	8	5311	5318	25 %	50 %	25 %	0 %	56410442
10	NC_006509	ACAA	2	8	5996	6003	75 %	0 %	0 %	25 %	56410442
11	NC_006509	AAGC	2	8	6158	6165	50 %	0 %	25 %	25 %	56410443
12	NC_006509	TCAA	2	8	6494	6501	50 %	25 %	0 %	25 %	56410444
13	NC_006509	TCAA	2	8	6691	6698	50 %	25 %	0 %	25 %	56410444
14	NC_006509	GAAA	2	8	8209	8216	75 %	0 %	25 %	0 %	56410445
15	NC_006509	TAGT	2	8	8949	8956	25 %	50 %	25 %	0 %	56410445
16	NC_006509	TTTG	2	8	9079	9086	0 %	75 %	25 %	0 %	56410445
17	NC_006509	TGCT	2	8	9705	9712	0 %	50 %	25 %	25 %	56410445
18	NC_006509	AGCA	2	8	10340	10347	50 %	0 %	25 %	25 %	56410446
19	NC_006509	AAAC	2	8	10588	10595	75 %	0 %	0 %	25 %	56410446
20	NC_006509	CTAC	2	8	10703	10710	25 %	25 %	0 %	50 %	56410446
21	NC_006509	ATTT	2	8	11391	11398	25 %	75 %	0 %	0 %	56410446
22	NC_006509	ATCG	2	8	11519	11526	25 %	25 %	25 %	25 %	56410446
23	NC_006509	TTCC	2	8	12508	12515	0 %	50 %	0 %	50 %	56410447
24	NC_006509	TTCA	2	8	12544	12551	25 %	50 %	0 %	25 %	56410447
25	NC_006509	GATC	2	8	12875	12882	25 %	25 %	25 %	25 %	56410447
26	NC_006509	ATCT	2	8	12904	12911	25 %	50 %	0 %	25 %	56410447
27	NC_006509	CAAA	2	8	12949	12956	75 %	0 %	0 %	25 %	56410447
28	NC_006509	TTGT	2	8	13498	13505	0 %	75 %	25 %	0 %	56410448
29	NC_006509	ACTT	2	8	13880	13887	25 %	50 %	0 %	25 %	56410448
30	NC_006509	CCGC	2	8	14585	14592	0 %	0 %	25 %	75 %	56410449
31	NC_006509	GCTG	2	8	16334	16341	0 %	25 %	50 %	25 %	56410450
32	NC_006509	CCGT	2	8	17522	17529	0 %	25 %	25 %	50 %	56410451
33	NC_006509	CAAA	2	8	17642	17649	75 %	0 %	0 %	25 %	56410451
34	NC_006509	GCGG	2	8	18446	18453	0 %	0 %	75 %	25 %	56410451
35	NC_006509	CGGT	2	8	18460	18467	0 %	25 %	50 %	25 %	56410451
36	NC_006509	TCCA	2	8	19112	19119	25 %	25 %	0 %	50 %	56410452
37	NC_006509	CGCA	2	8	20246	20253	25 %	0 %	25 %	50 %	56410453
38	NC_006509	CAAA	2	8	21877	21884	75 %	0 %	0 %	25 %	56410454
39	NC_006509	TTTA	2	8	22243	22250	25 %	75 %	0 %	0 %	56410454
40	NC_006509	TGTT	2	8	22529	22536	0 %	75 %	25 %	0 %	56410455
41	NC_006509	CAAC	2	8	22762	22769	50 %	0 %	0 %	50 %	56410455
42	NC_006509	ATCA	2	8	23626	23633	50 %	25 %	0 %	25 %	56410456
43	NC_006509	TAAC	2	8	24041	24048	50 %	25 %	0 %	25 %	56410457
44	NC_006509	ATCA	2	8	25238	25245	50 %	25 %	0 %	25 %	56410458
45	NC_006509	ATCC	2	8	25553	25560	25 %	25 %	0 %	50 %	56410458
46	NC_006509	ACAA	2	8	25729	25736	75 %	0 %	0 %	25 %	56410458
47	NC_006509	ATCA	2	8	25772	25779	50 %	25 %	0 %	25 %	56410458
48	NC_006509	ACCA	2	8	27790	27797	50 %	0 %	0 %	50 %	56410460
49	NC_006509	CTTT	2	8	27955	27962	0 %	75 %	0 %	25 %	56410460
50	NC_006509	CGAG	2	8	29083	29090	25 %	0 %	50 %	25 %	56410461
51	NC_006509	TTTG	2	8	29317	29324	0 %	75 %	25 %	0 %	56410461
52	NC_006509	CTAT	2	8	29430	29437	25 %	50 %	0 %	25 %	56410461
53	NC_006509	CTTT	2	8	29876	29883	0 %	75 %	0 %	25 %	56410462
54	NC_006509	CGGT	2	8	29892	29899	0 %	25 %	50 %	25 %	56410462
55	NC_006509	TTCA	2	8	30060	30067	25 %	50 %	0 %	25 %	56410462
56	NC_006509	TAGA	2	8	30267	30274	50 %	25 %	25 %	0 %	56410462
57	NC_006509	ATTC	2	8	30473	30480	25 %	50 %	0 %	25 %	56410462
58	NC_006509	CGTA	2	8	30926	30933	25 %	25 %	25 %	25 %	56410462
59	NC_006509	ATAC	2	8	31398	31405	50 %	25 %	0 %	25 %	56410463
60	NC_006509	AGAA	2	8	31776	31783	75 %	0 %	25 %	0 %	56410463
61	NC_006509	TCGA	2	8	31933	31940	25 %	25 %	25 %	25 %	56410463
62	NC_006509	GAAC	2	8	32547	32554	50 %	0 %	25 %	25 %	56410464
63	NC_006509	TTTC	2	8	32729	32736	0 %	75 %	0 %	25 %	56410464
64	NC_006509	GGTA	2	8	33347	33354	25 %	25 %	50 %	0 %	56410464
65	NC_006509	CTTT	2	8	33409	33416	0 %	75 %	0 %	25 %	56410464
66	NC_006509	GATA	2	8	33647	33654	50 %	25 %	25 %	0 %	56410464
67	NC_006509	TTGA	2	8	34202	34209	25 %	50 %	25 %	0 %	56410465
68	NC_006509	CAAC	2	8	34311	34318	50 %	0 %	0 %	50 %	56410465
69	NC_006509	GTTT	2	8	34605	34612	0 %	75 %	25 %	0 %	56410465
70	NC_006509	GTCT	2	8	35068	35075	0 %	50 %	25 %	25 %	56410465
71	NC_006509	TTTC	2	8	35236	35243	0 %	75 %	0 %	25 %	56410465
72	NC_006509	CTTT	2	8	35422	35429	0 %	75 %	0 %	25 %	56410465
73	NC_006509	TGAA	2	8	37530	37537	50 %	25 %	25 %	0 %	56410467
74	NC_006509	TAAC	2	8	37611	37618	50 %	25 %	0 %	25 %	56410467
75	NC_006509	ATCG	2	8	38293	38300	25 %	25 %	25 %	25 %	56410467
76	NC_006509	TTCC	2	8	39079	39086	0 %	50 %	0 %	50 %	56410468
77	NC_006509	GACC	2	8	39294	39301	25 %	0 %	25 %	50 %	56410468
78	NC_006509	GCTA	2	8	39467	39474	25 %	25 %	25 %	25 %	56410468
79	NC_006509	GATC	2	8	40655	40662	25 %	25 %	25 %	25 %	56410469
80	NC_006509	ATCT	2	8	42388	42395	25 %	50 %	0 %	25 %	56410471
81	NC_006509	TCCT	2	8	42612	42619	0 %	50 %	0 %	50 %	56410471
82	NC_006509	CTTC	2	8	42641	42648	0 %	50 %	0 %	50 %	56410471
83	NC_006509	ATTA	2	8	43382	43389	50 %	50 %	0 %	0 %	56410472
84	NC_006509	AAAT	2	8	43435	43442	75 %	25 %	0 %	0 %	56410472
85	NC_006509	GTCC	2	8	43488	43495	0 %	25 %	25 %	50 %	56410472
86	NC_006509	CTTT	2	8	43515	43522	0 %	75 %	0 %	25 %	56410472
87	NC_006509	CTTT	2	8	43526	43533	0 %	75 %	0 %	25 %	56410472
88	NC_006509	CCTT	2	8	43534	43541	0 %	50 %	0 %	50 %	56410472
89	NC_006509	TTGG	2	8	43544	43551	0 %	50 %	50 %	0 %	56410472
90	NC_006509	GCTC	2	8	44022	44029	0 %	25 %	25 %	50 %	56410473
91	NC_006509	CTTC	2	8	44950	44957	0 %	50 %	0 %	50 %	56410474
92	NC_006509	TTCC	2	8	46478	46485	0 %	50 %	0 %	50 %	56410477
93	NC_006509	TCTA	2	8	46497	46504	25 %	50 %	0 %	25 %	56410477
94	NC_006509	GCGG	2	8	47040	47047	0 %	0 %	75 %	25 %	56410478
95	NC_006509	ACAA	2	8	47709	47716	75 %	0 %	0 %	25 %	56410479
96	NC_006509	CCAG	2	8	47757	47764	25 %	0 %	25 %	50 %	56410479

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.