MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus kaustophilus HTA426 plasmid pHTA426

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006509	TA	3	6	334	339	50 %	50 %	0 %	0 %	56410438
2	NC_006509	TA	3	6	368	373	50 %	50 %	0 %	0 %	56410438
3	NC_006509	AG	3	6	1386	1391	50 %	0 %	50 %	0 %	56410439
4	NC_006509	GT	3	6	5534	5539	0 %	50 %	50 %	0 %	56410442
5	NC_006509	GC	3	6	5817	5822	0 %	0 %	50 %	50 %	56410442
6	NC_006509	AT	3	6	6083	6088	50 %	50 %	0 %	0 %	56410443
7	NC_006509	TG	3	6	6744	6749	0 %	50 %	50 %	0 %	56410444
8	NC_006509	CA	3	6	6875	6880	50 %	0 %	0 %	50 %	56410444
9	NC_006509	AT	3	6	8068	8073	50 %	50 %	0 %	0 %	56410445
10	NC_006509	TA	3	6	8299	8304	50 %	50 %	0 %	0 %	56410445
11	NC_006509	GA	3	6	8476	8481	50 %	0 %	50 %	0 %	56410445
12	NC_006509	TC	4	8	10819	10826	0 %	50 %	0 %	50 %	56410446
13	NC_006509	AT	3	6	10908	10913	50 %	50 %	0 %	0 %	56410446
14	NC_006509	GT	3	6	11319	11324	0 %	50 %	50 %	0 %	56410446
15	NC_006509	TC	3	6	11844	11849	0 %	50 %	0 %	50 %	56410447
16	NC_006509	AT	3	6	11988	11993	50 %	50 %	0 %	0 %	56410447
17	NC_006509	AT	3	6	12345	12350	50 %	50 %	0 %	0 %	56410447
18	NC_006509	TG	3	6	12693	12698	0 %	50 %	50 %	0 %	56410447
19	NC_006509	TA	4	8	13313	13320	50 %	50 %	0 %	0 %	56410447
20	NC_006509	AT	3	6	13332	13337	50 %	50 %	0 %	0 %	56410447
21	NC_006509	TA	3	6	13543	13548	50 %	50 %	0 %	0 %	56410448
22	NC_006509	CG	3	6	16392	16397	0 %	0 %	50 %	50 %	56410450
23	NC_006509	GC	3	6	17605	17610	0 %	0 %	50 %	50 %	56410451
24	NC_006509	GC	3	6	17679	17684	0 %	0 %	50 %	50 %	56410451
25	NC_006509	GC	3	6	18841	18846	0 %	0 %	50 %	50 %	56410452
26	NC_006509	TG	3	6	18964	18969	0 %	50 %	50 %	0 %	56410452
27	NC_006509	AC	3	6	20111	20116	50 %	0 %	0 %	50 %	56410453
28	NC_006509	AT	3	6	20900	20905	50 %	50 %	0 %	0 %	56410454
29	NC_006509	TC	3	6	22070	22075	0 %	50 %	0 %	50 %	56410454
30	NC_006509	AG	3	6	22155	22160	50 %	0 %	50 %	0 %	56410454
31	NC_006509	GT	3	6	22770	22775	0 %	50 %	50 %	0 %	56410455
32	NC_006509	AC	3	6	24901	24906	50 %	0 %	0 %	50 %	56410458
33	NC_006509	TC	3	6	25589	25594	0 %	50 %	0 %	50 %	56410458
34	NC_006509	TA	3	6	25829	25834	50 %	50 %	0 %	0 %	56410458
35	NC_006509	GC	3	6	26561	26566	0 %	0 %	50 %	50 %	56410458
36	NC_006509	TA	3	6	26765	26770	50 %	50 %	0 %	0 %	56410459
37	NC_006509	AC	3	6	28274	28279	50 %	0 %	0 %	50 %	56410460
38	NC_006509	AC	3	6	28309	28314	50 %	0 %	0 %	50 %	56410460
39	NC_006509	AT	3	6	28460	28465	50 %	50 %	0 %	0 %	56410460
40	NC_006509	AT	3	6	28700	28705	50 %	50 %	0 %	0 %	56410461
41	NC_006509	AT	3	6	29560	29565	50 %	50 %	0 %	0 %	56410462
42	NC_006509	GA	3	6	30273	30278	50 %	0 %	50 %	0 %	56410462
43	NC_006509	AT	3	6	30449	30454	50 %	50 %	0 %	0 %	56410462
44	NC_006509	AT	3	6	32639	32644	50 %	50 %	0 %	0 %	56410464
45	NC_006509	GA	3	6	33608	33613	50 %	0 %	50 %	0 %	56410464
46	NC_006509	TA	3	6	34146	34151	50 %	50 %	0 %	0 %	56410465
47	NC_006509	TA	3	6	35026	35031	50 %	50 %	0 %	0 %	56410465
48	NC_006509	AT	3	6	35514	35519	50 %	50 %	0 %	0 %	56410465
49	NC_006509	CG	3	6	35983	35988	0 %	0 %	50 %	50 %	56410466
50	NC_006509	AT	3	6	38093	38098	50 %	50 %	0 %	0 %	56410467
51	NC_006509	TA	3	6	40091	40096	50 %	50 %	0 %	0 %	56410468
52	NC_006509	AT	3	6	44126	44131	50 %	50 %	0 %	0 %	56410473
53	NC_006509	AG	3	6	45578	45583	50 %	0 %	50 %	0 %	56410475
54	NC_006509	GA	3	6	47341	47346	50 %	0 %	50 %	0 %	56410479

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.