MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006462	ACCCC	2	10	3083	3092	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_006462	GACTT	2	10	17575	17584	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_006462	GAAAA	2	10	18448	18457	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006462	CGGGA	2	10	28343	28352	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006462	CCGGG	2	10	28398	28407	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_006462	GGGGC	2	10	28485	28494	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
7	NC_006462	CGGTG	2	10	35971	35980	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_006462	GGCCC	2	10	79486	79495	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_006462	TAGGG	2	10	89694	89703	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006462	GGGCC	2	10	99459	99468	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_006462	CCCCA	2	10	101258	101267	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
12	NC_006462	GGCCT	2	10	103791	103800	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_006462	GCGCC	2	10	103899	103908	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_006462	AGGGG	2	10	113583	113592	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006462	AGGGG	2	10	113696	113705	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006462	CGGGC	2	10	124513	124522	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_006462	CGGGG	2	10	124544	124553	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
18	NC_006462	TTTTC	2	10	133612	133621	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_006462	GCCCC	2	10	146086	146095	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_006462	CCTGG	2	10	158320	158329	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_006462	CGCGG	2	10	158473	158482	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_006462	AGGGG	2	10	167381	167390	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006462	CGGGC	2	10	171976	171985	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_006462	GCCCC	2	10	176544	176553	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
25	NC_006462	AAAGG	2	10	188486	188495	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006462	GGCCC	2	10	189603	189612	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_006462	GAAGG	2	10	214482	214491	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006462	AGGTG	2	10	214534	214543	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006462	GCAAG	2	10	214750	214759	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_006462	GGCGG	2	10	218203	218212	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
31	NC_006462	GCTGG	2	10	227893	227902	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_006462	AGGCC	2	10	249143	249152	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_006462	GGGGA	2	10	249320	249329	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.