MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006462	CCCT	2	8	96	103	0 %	25 %	0 %	75 %	55978184
2	NC_006462	CTCC	2	8	117	124	0 %	25 %	0 %	75 %	55978184
3	NC_006462	AAGG	2	8	1040	1047	50 %	0 %	50 %	0 %	55978186
4	NC_006462	TCCA	2	8	1120	1127	25 %	25 %	0 %	50 %	55978186
5	NC_006462	GTAG	2	8	1767	1774	25 %	25 %	50 %	0 %	55978187
6	NC_006462	CGTC	2	8	1916	1923	0 %	25 %	25 %	50 %	55978188
7	NC_006462	CCCT	2	8	2127	2134	0 %	25 %	0 %	75 %	55978188
8	NC_006462	GGGA	2	8	2984	2991	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006462	ACCG	2	8	3424	3431	25 %	0 %	25 %	50 %	55978191
10	NC_006462	CCCT	2	8	4543	4550	0 %	25 %	0 %	75 %	55978194
11	NC_006462	TTCC	2	8	5151	5158	0 %	50 %	0 %	50 %	55978195
12	NC_006462	AGGA	2	8	5317	5324	50 %	0 %	50 %	0 %	55978195
13	NC_006462	CGGG	2	8	5774	5781	0 %	0 %	75 %	25 %	55978196
14	NC_006462	CTCC	2	8	5862	5869	0 %	25 %	0 %	75 %	55978196
15	NC_006462	AGGG	2	8	6566	6573	25 %	0 %	75 %	0 %	55978197
16	NC_006462	CTTC	2	8	7005	7012	0 %	50 %	0 %	50 %	55978197
17	NC_006462	GGCG	2	8	7277	7284	0 %	0 %	75 %	25 %	55978198
18	NC_006462	CTTC	2	8	7692	7699	0 %	50 %	0 %	50 %	55978198
19	NC_006462	GCCC	2	8	7976	7983	0 %	0 %	25 %	75 %	55978198
20	NC_006462	GGAA	2	8	8002	8009	50 %	0 %	50 %	0 %	55978198
21	NC_006462	CGCC	2	8	8814	8821	0 %	0 %	25 %	75 %	55978199
22	NC_006462	CCCG	2	8	9245	9252	0 %	0 %	25 %	75 %	55978200
23	NC_006462	TCCT	2	8	9807	9814	0 %	50 %	0 %	50 %	55978200
24	NC_006462	CCAG	2	8	10481	10488	25 %	0 %	25 %	50 %	55978202
25	NC_006462	CCGT	2	8	10501	10508	0 %	25 %	25 %	50 %	55978202
26	NC_006462	CCCG	2	8	10883	10890	0 %	0 %	25 %	75 %	55978203
27	NC_006462	GGCC	2	8	11085	11092	0 %	0 %	50 %	50 %	55978203
28	NC_006462	GAAG	2	8	11758	11765	50 %	0 %	50 %	0 %	55978204
29	NC_006462	AGGC	2	8	11932	11939	25 %	0 %	50 %	25 %	55978204
30	NC_006462	CTCG	2	8	12102	12109	0 %	25 %	25 %	50 %	55978205
31	NC_006462	GCGG	2	8	12315	12322	0 %	0 %	75 %	25 %	55978205
32	NC_006462	GGTC	2	8	12680	12687	0 %	25 %	50 %	25 %	55978205
33	NC_006462	CCGC	2	8	13233	13240	0 %	0 %	25 %	75 %	55978206
34	NC_006462	GCCC	2	8	13295	13302	0 %	0 %	25 %	75 %	55978206
35	NC_006462	ACCG	2	8	13752	13759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_006462	AACC	2	8	13897	13904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006462	GGCT	2	8	14003	14010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_006462	GGGC	2	8	14184	14191	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_006462	CTCC	2	8	14244	14251	0 %	25 %	0 %	75 %	55978207
40	NC_006462	AGGC	2	8	14635	14642	25 %	0 %	50 %	25 %	55978207
41	NC_006462	CGCC	2	8	14980	14987	0 %	0 %	25 %	75 %	55978207
42	NC_006462	ACGG	2	8	15810	15817	25 %	0 %	50 %	25 %	55978208
43	NC_006462	GGAC	2	8	16038	16045	25 %	0 %	50 %	25 %	55978208
44	NC_006462	GTAA	2	8	16316	16323	50 %	25 %	25 %	0 %	55978208
45	NC_006462	CGTG	2	8	16327	16334	0 %	25 %	50 %	25 %	55978209
46	NC_006462	GGAA	2	8	17047	17054	50 %	0 %	50 %	0 %	55978209
47	NC_006462	CGGG	2	8	17964	17971	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_006462	GCCC	2	8	18931	18938	0 %	0 %	25 %	75 %	55978212
49	NC_006462	CACC	2	8	19093	19100	25 %	0 %	0 %	75 %	55978212
50	NC_006462	GAGG	2	8	19507	19514	25 %	0 %	75 %	0 %	55978212
51	NC_006462	ACCT	2	8	19602	19609	25 %	25 %	0 %	50 %	55978213
52	NC_006462	ACCA	2	8	19902	19909	50 %	0 %	0 %	50 %	55978213
53	NC_006462	CGGG	2	8	20124	20131	0 %	0 %	75 %	25 %	55978213
54	NC_006462	TGGG	2	8	20971	20978	0 %	25 %	75 %	0 %	55978215
55	NC_006462	CTGG	2	8	21279	21286	0 %	25 %	50 %	25 %	55978215
56	NC_006462	CTGG	2	8	21444	21451	0 %	25 %	50 %	25 %	55978215
57	NC_006462	AGGG	2	8	22944	22951	25 %	0 %	75 %	0 %	55978216
58	NC_006462	GCGG	2	8	22982	22989	0 %	0 %	75 %	25 %	55978216
59	NC_006462	CTCC	2	8	23165	23172	0 %	25 %	0 %	75 %	55978216
60	NC_006462	TGGG	2	8	23247	23254	0 %	25 %	75 %	0 %	55978216
61	NC_006462	GCGG	2	8	23453	23460	0 %	0 %	75 %	25 %	55978216
62	NC_006462	GAGG	2	8	23636	23643	25 %	0 %	75 %	0 %	55978216
63	NC_006462	CTGG	2	8	23792	23799	0 %	25 %	50 %	25 %	55978216
64	NC_006462	GCCC	2	8	23810	23817	0 %	0 %	25 %	75 %	55978216
65	NC_006462	GAGG	2	8	24968	24975	25 %	0 %	75 %	0 %	55978217
66	NC_006462	CTGG	2	8	25111	25118	0 %	25 %	50 %	25 %	55978217
67	NC_006462	ACCT	2	8	25124	25131	25 %	25 %	0 %	50 %	55978217
68	NC_006462	GGCT	2	8	25703	25710	0 %	25 %	50 %	25 %	55978217
69	NC_006462	CCCA	2	8	25757	25764	25 %	0 %	0 %	75 %	55978217
70	NC_006462	ACCC	2	8	25859	25866	25 %	0 %	0 %	75 %	55978217
71	NC_006462	CCCA	2	8	26042	26049	25 %	0 %	0 %	75 %	55978217
72	NC_006462	ACCT	2	8	27021	27028	25 %	25 %	0 %	50 %	55978219
73	NC_006462	AGGT	2	8	28957	28964	25 %	25 %	50 %	0 %	55978220
74	NC_006462	GCGG	2	8	29388	29395	0 %	0 %	75 %	25 %	55978220
75	NC_006462	GGCG	2	8	29597	29604	0 %	0 %	75 %	25 %	55978220
76	NC_006462	CTTC	2	8	29836	29843	0 %	50 %	0 %	50 %	55978220
77	NC_006462	GCCC	2	8	30330	30337	0 %	0 %	25 %	75 %	55978220
78	NC_006462	AGGG	2	8	30904	30911	25 %	0 %	75 %	0 %	55978220
79	NC_006462	GACG	2	8	31586	31593	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_006462	CCAG	2	8	31963	31970	25 %	0 %	25 %	50 %	55978222
81	NC_006462	AGGG	2	8	32053	32060	25 %	0 %	75 %	0 %	55978222
82	NC_006462	GGCC	2	8	32245	32252	0 %	0 %	50 %	50 %	55978222
83	NC_006462	GGGC	2	8	32321	32328	0 %	0 %	75 %	25 %	55978222
84	NC_006462	CCCG	2	8	32576	32583	0 %	0 %	25 %	75 %	55978222
85	NC_006462	CGCC	2	8	32698	32705	0 %	0 %	25 %	75 %	55978222
86	NC_006462	ACCT	2	8	32862	32869	25 %	25 %	0 %	50 %	55978222
87	NC_006462	GAGG	2	8	33110	33117	25 %	0 %	75 %	0 %	55978222
88	NC_006462	GAAG	2	8	33326	33333	50 %	0 %	50 %	0 %	55978223
89	NC_006462	CCTC	2	8	33647	33654	0 %	25 %	0 %	75 %	55978224
90	NC_006462	CAGG	2	8	34538	34545	25 %	0 %	50 %	25 %	55978225
91	NC_006462	CGGA	2	8	34827	34834	25 %	0 %	50 %	25 %	55978225
92	NC_006462	AGCG	2	8	35555	35562	25 %	0 %	50 %	25 %	55978225
93	NC_006462	CGGA	2	8	35923	35930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_006462	TGGA	2	8	35938	35945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006462	CCCT	2	8	36146	36153	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_006462	CCTA	2	8	36190	36197	25 %	25 %	0 %	50 %	55978226
97	NC_006462	CCCG	2	8	36296	36303	0 %	0 %	25 %	75 %	55978226
98	NC_006462	CCCA	2	8	36523	36530	25 %	0 %	0 %	75 %	55978226
99	NC_006462	AGCC	2	8	36994	37001	25 %	0 %	25 %	50 %	55978226
100	NC_006462	GGTG	2	8	37379	37386	0 %	25 %	75 %	0 %	55978226
101	NC_006462	GCCC	2	8	37773	37780	0 %	0 %	25 %	75 %	55978227
102	NC_006462	GCGG	2	8	37898	37905	0 %	0 %	75 %	25 %	55978227
103	NC_006462	GAGG	2	8	38870	38877	25 %	0 %	75 %	0 %	55978228
104	NC_006462	AGGA	2	8	38976	38983	50 %	0 %	50 %	0 %	55978229
105	NC_006462	GGAG	2	8	39509	39516	25 %	0 %	75 %	0 %	55978229
106	NC_006462	TCCC	2	8	39802	39809	0 %	25 %	0 %	75 %	55978230
107	NC_006462	GGCG	2	8	39816	39823	0 %	0 %	75 %	25 %	55978230
108	NC_006462	TTCC	2	8	40000	40007	0 %	50 %	0 %	50 %	55978230
109	NC_006462	CGGG	2	8	40122	40129	0 %	0 %	75 %	25 %	55978230
110	NC_006462	CGGG	2	8	40176	40183	0 %	0 %	75 %	25 %	55978230
111	NC_006462	CCCG	2	8	40215	40222	0 %	0 %	25 %	75 %	55978230
112	NC_006462	CCTC	2	8	40245	40252	0 %	25 %	0 %	75 %	55978230
113	NC_006462	CCCT	2	8	40511	40518	0 %	25 %	0 %	75 %	55978230
114	NC_006462	AAGG	2	8	40993	41000	50 %	0 %	50 %	0 %	55978230
115	NC_006462	AGGG	2	8	41075	41082	25 %	0 %	75 %	0 %	55978230
116	NC_006462	GAGG	2	8	41184	41191	25 %	0 %	75 %	0 %	55978230
117	NC_006462	CCCA	2	8	41278	41285	25 %	0 %	0 %	75 %	55978230
118	NC_006462	GGCG	2	8	41878	41885	0 %	0 %	75 %	25 %	55978231
119	NC_006462	GGGA	2	8	41963	41970	25 %	0 %	75 %	0 %	55978231
120	NC_006462	GGGA	2	8	42581	42588	25 %	0 %	75 %	0 %	55978232
121	NC_006462	GGAC	2	8	42602	42609	25 %	0 %	50 %	25 %	55978232
122	NC_006462	CTTC	2	8	42661	42668	0 %	50 %	0 %	50 %	55978232
123	NC_006462	GCGG	2	8	42948	42955	0 %	0 %	75 %	25 %	55978232
124	NC_006462	AAGG	2	8	43322	43329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006462	CGGG	2	8	43515	43522	0 %	0 %	75 %	25 %	55978233
126	NC_006462	AAGG	2	8	44177	44184	50 %	0 %	50 %	0 %	55978234
127	NC_006462	GCGA	2	8	44274	44281	25 %	0 %	50 %	25 %	55978234
128	NC_006462	AGCG	2	8	44631	44638	25 %	0 %	50 %	25 %	55978234
129	NC_006462	CTCC	2	8	44831	44838	0 %	25 %	0 %	75 %	55978234
130	NC_006462	CCGC	2	8	44905	44912	0 %	0 %	25 %	75 %	55978234
131	NC_006462	GGGC	2	8	45142	45149	0 %	0 %	75 %	25 %	55978235
132	NC_006462	GCCC	2	8	45585	45592	0 %	0 %	25 %	75 %	55978235
133	NC_006462	AGGG	2	8	45775	45782	25 %	0 %	75 %	0 %	55978235
134	NC_006462	CTCC	2	8	46146	46153	0 %	25 %	0 %	75 %	55978236
135	NC_006462	CGCC	2	8	46653	46660	0 %	0 %	25 %	75 %	55978236
136	NC_006462	GGAG	2	8	47104	47111	25 %	0 %	75 %	0 %	55978237
137	NC_006462	GGGC	2	8	48024	48031	0 %	0 %	75 %	25 %	55978238
138	NC_006462	CCCG	2	8	48302	48309	0 %	0 %	25 %	75 %	55978238
139	NC_006462	GGAC	2	8	49703	49710	25 %	0 %	50 %	25 %	55978240
140	NC_006462	CGCC	2	8	50645	50652	0 %	0 %	25 %	75 %	55978241
141	NC_006462	CACC	2	8	50660	50667	25 %	0 %	0 %	75 %	55978241
142	NC_006462	CACC	2	8	51197	51204	25 %	0 %	0 %	75 %	55978241
143	NC_006462	GAAG	2	8	51524	51531	50 %	0 %	50 %	0 %	55978242
144	NC_006462	GAGG	2	8	51641	51648	25 %	0 %	75 %	0 %	55978242
145	NC_006462	CGGG	2	8	52105	52112	0 %	0 %	75 %	25 %	55978243
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273	NC_006462	TGCT	2	8	109912	109919	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
274	NC_006462	CGGG	2	8	110342	110349	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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277	NC_006462	CCCG	2	8	110558	110565	0 %	0 %	25 %	75 %	55978305
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279	NC_006462	GAAA	2	8	111057	111064	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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