MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 4714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006462	GGC	2	6	18	23	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978184
2	NC_006462	CAC	2	6	62	67	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978184
3	NC_006462	GCC	2	6	146	151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978184
4	NC_006462	CGC	2	6	193	198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978184
5	NC_006462	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978184
6	NC_006462	AGG	2	6	322	327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006462	AGG	2	6	337	342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006462	GAC	2	6	420	425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006462	ACC	2	6	534	539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978185
10	NC_006462	AGG	2	6	540	545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978185
11	NC_006462	CCT	2	6	595	600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978185
12	NC_006462	AAC	2	6	726	731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55978185
13	NC_006462	TCA	2	6	823	828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006462	CGG	2	6	839	844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006462	TCC	2	6	909	914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_006462	TCC	2	6	923	928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_006462	CCT	2	6	939	944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_006462	GTT	2	6	1087	1092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55978186
19	NC_006462	GCC	4	12	1219	1230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978186
20	NC_006462	CCT	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978187
21	NC_006462	CTC	2	6	1380	1385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978187
22	NC_006462	GCC	2	6	1400	1405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978187
23	NC_006462	CGC	2	6	1429	1434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978187
24	NC_006462	CCA	2	6	1484	1489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978187
25	NC_006462	CCT	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978187
26	NC_006462	TCC	2	6	1517	1522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978187
27	NC_006462	CAC	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978187
28	NC_006462	CAC	2	6	1695	1700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978187
29	NC_006462	TCC	2	6	1832	1837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_006462	TCC	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978188
31	NC_006462	CCA	2	6	1957	1962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978188
32	NC_006462	TCC	2	6	2049	2054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978188
33	NC_006462	GGC	2	6	2060	2065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978188
34	NC_006462	GGA	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978188
35	NC_006462	GTG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978188
36	NC_006462	GCC	2	6	2217	2222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978188
37	NC_006462	CAT	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978188
38	NC_006462	TCT	2	6	2251	2256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978188
39	NC_006462	AGG	2	6	2286	2291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978188
40	NC_006462	TCC	2	6	2298	2303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978188
41	NC_006462	GCC	2	6	2331	2336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978188
42	NC_006462	GAT	2	6	2344	2349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006462	TCC	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978189
44	NC_006462	GAG	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978189
45	NC_006462	CCT	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978189
46	NC_006462	GCC	2	6	2467	2472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978189
47	NC_006462	AGG	2	6	2475	2480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978189
48	NC_006462	CCT	2	6	2605	2610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978189
49	NC_006462	TCC	2	6	2637	2642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978189
50	NC_006462	TGA	2	6	2728	2733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978190
51	NC_006462	GCC	2	6	2802	2807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978190
52	NC_006462	CTC	2	6	2813	2818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978190
53	NC_006462	CCT	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978190
54	NC_006462	CCG	2	6	2999	3004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_006462	CCT	2	6	3039	3044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_006462	CCG	2	6	3109	3114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_006462	AGG	2	6	3133	3138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006462	GGA	2	6	3273	3278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006462	CTC	2	6	3382	3387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978191
60	NC_006462	GCC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978191
61	NC_006462	GAG	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978191
62	NC_006462	CTC	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978191
63	NC_006462	GGA	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978192
64	NC_006462	GGT	2	6	3788	3793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978192
65	NC_006462	GCG	2	6	3923	3928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978192
66	NC_006462	GAG	2	6	3967	3972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006462	TAC	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006462	CAC	2	6	4137	4142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978193
69	NC_006462	CCT	2	6	4145	4150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978193
70	NC_006462	GCC	2	6	4175	4180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978193
71	NC_006462	CGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978193
72	NC_006462	CCA	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978194
73	NC_006462	TCC	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978194
74	NC_006462	GGC	2	6	4476	4481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978194
75	NC_006462	AAG	2	6	4552	4557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978194
76	NC_006462	GTG	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978194
77	NC_006462	GCC	2	6	4632	4637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_006462	CAT	2	6	4646	4651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006462	TCT	2	6	4666	4671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006462	AGG	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006462	TCC	2	6	4713	4718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_006462	TGG	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006462	TCC	2	6	5014	5019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_006462	CCT	2	6	5033	5038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_006462	TGT	2	6	5051	5056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55978195
86	NC_006462	CTC	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978195
87	NC_006462	TGG	2	6	5088	5093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978195
88	NC_006462	GAA	2	6	5142	5147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978195
89	NC_006462	GAA	2	6	5205	5210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978195
90	NC_006462	GAG	2	6	5272	5277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978195
91	NC_006462	GAG	2	6	5299	5304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978195
92	NC_006462	CTC	2	6	5368	5373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978195
93	NC_006462	TCC	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978195
94	NC_006462	GCG	2	6	5521	5526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978195
95	NC_006462	GCC	2	6	5637	5642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978195
96	NC_006462	AGT	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978195
97	NC_006462	AGG	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978195
98	NC_006462	GCC	2	6	5685	5690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978195
99	NC_006462	GCC	2	6	5803	5808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978196
100	NC_006462	GCG	2	6	5831	5836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978196
101	NC_006462	TCC	3	9	5872	5880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978196
102	NC_006462	CCG	2	6	5907	5912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978196
103	NC_006462	CCA	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978196
104	NC_006462	GAA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978196
105	NC_006462	CGG	2	6	6140	6145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978197
106	NC_006462	CCA	2	6	6193	6198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
107	NC_006462	CTC	3	9	6205	6213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
108	NC_006462	TCC	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
109	NC_006462	TCC	2	6	6335	6340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
110	NC_006462	CCA	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
111	NC_006462	CCA	2	6	6399	6404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
112	NC_006462	ACC	2	6	6434	6439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
113	NC_006462	GGT	2	6	6462	6467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978197
114	NC_006462	CCT	2	6	6537	6542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
115	NC_006462	AGG	2	6	6558	6563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978197
116	NC_006462	CTC	2	6	6625	6630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
117	NC_006462	CAC	2	6	6682	6687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
118	NC_006462	GGC	2	6	6714	6719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978197
119	NC_006462	GGA	2	6	6804	6809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978197
120	NC_006462	CTC	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
121	NC_006462	CGG	2	6	6866	6871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978197
122	NC_006462	CCT	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978197
123	NC_006462	CCA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978197
124	NC_006462	GGC	2	6	6991	6996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978197
125	NC_006462	AGA	2	6	7109	7114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978198
126	NC_006462	GGC	2	6	7257	7262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978198
127	NC_006462	CCT	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978198
128	NC_006462	TGG	2	6	7565	7570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978198
129	NC_006462	CCA	2	6	7610	7615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978198
130	NC_006462	GCC	2	6	7663	7668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978198
131	NC_006462	GGT	2	6	7680	7685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978198
132	NC_006462	CCG	2	6	7725	7730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978198
133	NC_006462	GGT	2	6	7734	7739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978198
134	NC_006462	GAG	2	6	7743	7748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978198
135	NC_006462	CGG	2	6	7808	7813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978198
136	NC_006462	CGC	2	6	7831	7836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978198
137	NC_006462	GCG	3	9	7891	7899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978198
138	NC_006462	CCT	2	6	7934	7939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978198
139	NC_006462	GCC	2	6	7958	7963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978198
140	NC_006462	CCG	2	6	8200	8205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978199
141	NC_006462	GGA	2	6	8213	8218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978199
142	NC_006462	GGC	2	6	8294	8299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978199
143	NC_006462	GGA	2	6	8339	8344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978199
144	NC_006462	GAA	2	6	8367	8372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978199
145	NC_006462	CCT	2	6	8449	8454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978199
146	NC_006462	GCC	2	6	8566	8571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978199
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148	NC_006462	CGG	2	6	8669	8674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978199
149	NC_006462	CTC	2	6	8706	8711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978199
150	NC_006462	CCT	2	6	8714	8719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978199
151	NC_006462	CCA	2	6	8825	8830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978199
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161	NC_006462	CCG	2	6	9178	9183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978200
162	NC_006462	CCT	2	6	9184	9189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
163	NC_006462	CTC	2	6	9296	9301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
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165	NC_006462	CCT	2	6	9364	9369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
166	NC_006462	GTA	2	6	9377	9382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978200
167	NC_006462	CTC	2	6	9455	9460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
168	NC_006462	GTG	2	6	9510	9515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978200
169	NC_006462	GGC	2	6	9530	9535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978200
170	NC_006462	CCT	2	6	9562	9567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
171	NC_006462	CCT	2	6	9577	9582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978200
172	NC_006462	TGC	2	6	9630	9635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978200
173	NC_006462	CCA	2	6	9664	9669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978200
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175	NC_006462	GGT	2	6	9764	9769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978200
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179	NC_006462	AGG	2	6	9977	9982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978201
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181	NC_006462	GGA	2	6	9999	10004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978201
182	NC_006462	ACC	2	6	10022	10027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978201
183	NC_006462	GAG	2	6	10039	10044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978201
184	NC_006462	CGG	2	6	10086	10091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978201
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188	NC_006462	CTC	2	6	10192	10197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978201
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192	NC_006462	CAC	2	6	10329	10334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978202
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214	NC_006462	AGT	2	6	11645	11650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978204
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217	NC_006462	GAG	2	6	11850	11855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978204
218	NC_006462	GTA	2	6	11871	11876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978204
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220	NC_006462	ACC	2	6	12010	12015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978204
221	NC_006462	GAT	2	6	12084	12089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978205
222	NC_006462	CTC	2	6	12165	12170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978205
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224	NC_006462	GCC	2	6	12223	12228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978205
225	NC_006462	CTT	2	6	12285	12290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978205
226	NC_006462	GCC	2	6	12295	12300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978205
227	NC_006462	GAG	2	6	12309	12314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978205
228	NC_006462	GGC	2	6	12342	12347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978205
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232	NC_006462	CCG	2	6	12849	12854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978205
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239	NC_006462	TCC	2	6	13066	13071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978205
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242	NC_006462	ATC	2	6	13268	13273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978206
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248	NC_006462	GTG	2	6	13615	13620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978206
249	NC_006462	GGC	2	6	13627	13632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978206
250	NC_006462	TGG	2	6	13671	13676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978206
251	NC_006462	GGC	2	6	13705	13710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978206
252	NC_006462	CTC	2	6	13711	13716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978206
253	NC_006462	TCG	3	9	13731	13739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978206
254	NC_006462	AGG	2	6	13806	13811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_006462	GAG	2	6	13817	13822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
256	NC_006462	GAG	2	6	13834	13839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_006462	ACC	2	6	13931	13936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
258	NC_006462	TTG	2	6	13990	13995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_006462	GCC	2	6	14014	14019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
260	NC_006462	CTC	2	6	14023	14028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
261	NC_006462	GGA	2	6	14031	14036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
262	NC_006462	CGC	2	6	14125	14130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_006462	GCG	2	6	14234	14239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978207
264	NC_006462	CCT	2	6	14292	14297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978207
265	NC_006462	AGG	3	9	14393	14401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978207
266	NC_006462	GGA	2	6	14469	14474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978207
267	NC_006462	CCA	2	6	14481	14486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978207
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269	NC_006462	CAC	2	6	14509	14514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978207
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401	NC_006462	TCC	2	6	22043	22048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978215
402	NC_006462	CCT	2	6	22074	22079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978215
403	NC_006462	ACG	2	6	22088	22093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978215
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407	NC_006462	GGA	2	6	22308	22313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978215
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499	NC_006462	GAG	3	9	26716	26724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_006462	GCG	2	6	26748	26753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978218

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