MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006462	AG	3	6	313	318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006462	TA	3	6	2965	2970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006462	AG	3	6	3264	3269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006462	GC	3	6	3973	3978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_006462	AC	3	6	17492	17497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006462	GC	3	6	43228	43233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006462	GA	3	6	63987	63992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006462	TA	3	6	65460	65465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006462	CG	3	6	71678	71683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006462	GC	4	8	79473	79480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006462	TG	3	6	96435	96440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006462	CG	3	6	111013	111018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006462	GC	4	8	120219	120226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006462	CG	3	6	124526	124531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006462	GT	3	6	133527	133532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006462	CT	3	6	134923	134928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006462	CT	3	6	145811	145816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_006462	CG	3	6	146465	146470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_006462	GC	3	6	146920	146925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006462	CG	3	6	146926	146931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006462	GC	3	6	167684	167689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006462	GT	3	6	189582	189587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006462	CG	3	6	189643	189648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_006462	TC	3	6	190343	190348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006462	AG	3	6	190826	190831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006462	TC	5	10	201784	201793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006462	AG	4	8	206217	206224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006462	GA	4	8	214718	214725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006462	GC	3	6	222571	222576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006462	GA	3	6	228034	228039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006462	AG	3	6	241746	241751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006462	GA	3	6	243119	243124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.