MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 1622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006461	GCCTC	2	10	320	329	0 %	20 %	20 %	60 %	55979970
2	NC_006461	GGGCC	2	10	1330	1339	0 %	0 %	60 %	40 %	55979971
3	NC_006461	CGGGA	2	10	1979	1988	20 %	0 %	60 %	20 %	55979971
4	NC_006461	TCCTC	2	10	2016	2025	0 %	40 %	0 %	60 %	55979971
5	NC_006461	GGGCC	2	10	2464	2473	0 %	0 %	60 %	40 %	55979971
6	NC_006461	GCCCC	2	10	3535	3544	0 %	0 %	20 %	80 %	55979972
7	NC_006461	GGAAG	2	10	4382	4391	40 %	0 %	60 %	0 %	55979973
8	NC_006461	TCCCC	2	10	4655	4664	0 %	20 %	0 %	80 %	55979973
9	NC_006461	CTCCA	2	10	7863	7872	20 %	20 %	0 %	60 %	55979976
10	NC_006461	CCCGG	2	10	13215	13224	0 %	0 %	40 %	60 %	55979980
11	NC_006461	TAGGA	2	10	13920	13929	40 %	20 %	40 %	0 %	55979981
12	NC_006461	CCTGG	2	10	15177	15186	0 %	20 %	40 %	40 %	55979982
13	NC_006461	GGCCC	2	10	16141	16150	0 %	0 %	40 %	60 %	55979984
14	NC_006461	CCCTC	2	10	20197	20206	0 %	20 %	0 %	80 %	55979988
15	NC_006461	CCCGG	2	10	20574	20583	0 %	0 %	40 %	60 %	55979989
16	NC_006461	GGAGC	2	10	20866	20875	20 %	0 %	60 %	20 %	55979989
17	NC_006461	CGCTC	2	10	21278	21287	0 %	20 %	20 %	60 %	55979990
18	NC_006461	GGGCC	2	10	23259	23268	0 %	0 %	60 %	40 %	55979992
19	NC_006461	AGGGC	2	10	23339	23348	20 %	0 %	60 %	20 %	55979992
20	NC_006461	ACCCC	2	10	23843	23852	20 %	0 %	0 %	80 %	55979992
21	NC_006461	AGGAG	2	10	25349	25358	40 %	0 %	60 %	0 %	55979993
22	NC_006461	GTCCC	2	10	25858	25867	0 %	20 %	20 %	60 %	55979993
23	NC_006461	CTTCC	2	10	26495	26504	0 %	40 %	0 %	60 %	55979993
24	NC_006461	GCGGG	2	10	26841	26850	0 %	0 %	80 %	20 %	55979993
25	NC_006461	CCCCA	2	10	27736	27745	20 %	0 %	0 %	80 %	55979994
26	NC_006461	CCTGG	2	10	29147	29156	0 %	20 %	40 %	40 %	55979996
27	NC_006461	TCTCC	2	10	29992	30001	0 %	40 %	0 %	60 %	55979997
28	NC_006461	CTCCC	2	10	31504	31513	0 %	20 %	0 %	80 %	55979998
29	NC_006461	GGCCT	2	10	34137	34146	0 %	20 %	40 %	40 %	55980000
30	NC_006461	CCGCC	2	10	34959	34968	0 %	0 %	20 %	80 %	55980002
31	NC_006461	CCCCT	2	10	38930	38939	0 %	20 %	0 %	80 %	55980006
32	NC_006461	CTTTC	2	10	39351	39360	0 %	60 %	0 %	40 %	55980006
33	NC_006461	CCCTT	2	10	39901	39910	0 %	40 %	0 %	60 %	55980007
34	NC_006461	CCGCC	2	10	40169	40178	0 %	0 %	20 %	80 %	55980007
35	NC_006461	CGGGG	2	10	40922	40931	0 %	0 %	80 %	20 %	55980008
36	NC_006461	CGAGG	2	10	41232	41241	20 %	0 %	60 %	20 %	55980009
37	NC_006461	CGGGG	2	10	41334	41343	0 %	0 %	80 %	20 %	55980009
38	NC_006461	GGGGC	2	10	45296	45305	0 %	0 %	80 %	20 %	55980013
39	NC_006461	CTCCC	2	10	46082	46091	0 %	20 %	0 %	80 %	55980014
40	NC_006461	AGGGA	2	10	48152	48161	40 %	0 %	60 %	0 %	55980016
41	NC_006461	GTGGC	2	10	49341	49350	0 %	20 %	60 %	20 %	55980018
42	NC_006461	CGGGC	2	10	49549	49558	0 %	0 %	60 %	40 %	55980019
43	NC_006461	CGCCC	2	10	49866	49875	0 %	0 %	20 %	80 %	55980019
44	NC_006461	GGCCA	2	10	49948	49957	20 %	0 %	40 %	40 %	55980019
45	NC_006461	CGGCC	2	10	51477	51486	0 %	0 %	40 %	60 %	55980021
46	NC_006461	AAGGG	2	10	51800	51809	40 %	0 %	60 %	0 %	55980021
47	NC_006461	CGCCT	2	10	52214	52223	0 %	20 %	20 %	60 %	55980022
48	NC_006461	CGCCC	2	10	52282	52291	0 %	0 %	20 %	80 %	55980022
49	NC_006461	CGGGC	2	10	58075	58084	0 %	0 %	60 %	40 %	55980029
50	NC_006461	ACCGC	2	10	58782	58791	20 %	0 %	20 %	60 %	55980031
51	NC_006461	CCCCG	2	10	58842	58851	0 %	0 %	20 %	80 %	55980031
52	NC_006461	GGCGC	2	10	59059	59068	0 %	0 %	60 %	40 %	55980031
53	NC_006461	CCTCC	2	10	59413	59422	0 %	20 %	0 %	80 %	55980031
54	NC_006461	CCTCC	2	10	59526	59535	0 %	20 %	0 %	80 %	55980031
55	NC_006461	GGGAA	2	10	60282	60291	40 %	0 %	60 %	0 %	55980032
56	NC_006461	GGGGC	2	10	61109	61118	0 %	0 %	80 %	20 %	55980032
57	NC_006461	TGGCG	2	10	61598	61607	0 %	20 %	60 %	20 %	55980032
58	NC_006461	CGGGC	2	10	64373	64382	0 %	0 %	60 %	40 %	55980036
59	NC_006461	CCGCC	2	10	65132	65141	0 %	0 %	20 %	80 %	55980037
60	NC_006461	GCGGA	2	10	65384	65393	20 %	0 %	60 %	20 %	55980038
61	NC_006461	CCTCG	2	10	65893	65902	0 %	20 %	20 %	60 %	55980038
62	NC_006461	GCCCT	2	10	66160	66169	0 %	20 %	20 %	60 %	55980039
63	NC_006461	ACGCC	2	10	68089	68098	20 %	0 %	20 %	60 %	55980041
64	NC_006461	GCGGG	2	10	69794	69803	0 %	0 %	80 %	20 %	55980043
65	NC_006461	CGAGG	2	10	70508	70517	20 %	0 %	60 %	20 %	55980043
66	NC_006461	CCCCA	2	10	76183	76192	20 %	0 %	0 %	80 %	55980044
67	NC_006461	ACCTC	2	10	76693	76702	20 %	20 %	0 %	60 %	55980044
68	NC_006461	CCACG	2	10	77339	77348	20 %	0 %	20 %	60 %	55980044
69	NC_006461	CGGCC	2	10	77547	77556	0 %	0 %	40 %	60 %	55980044
70	NC_006461	GGACG	2	10	79012	79021	20 %	0 %	60 %	20 %	55980046
71	NC_006461	CTCGG	2	10	79911	79920	0 %	20 %	40 %	40 %	55980047
72	NC_006461	GAAGG	2	10	81330	81339	40 %	0 %	60 %	0 %	55980049
73	NC_006461	CTCGC	2	10	82803	82812	0 %	20 %	20 %	60 %	55980052
74	NC_006461	CCCCG	2	10	84850	84859	0 %	0 %	20 %	80 %	55980055
75	NC_006461	GCACC	2	10	85496	85505	20 %	0 %	20 %	60 %	55980056
76	NC_006461	GCGCC	2	10	86589	86598	0 %	0 %	40 %	60 %	55980057
77	NC_006461	CGGGG	2	10	87258	87267	0 %	0 %	80 %	20 %	55980058
78	NC_006461	AAGGA	2	10	89695	89704	60 %	0 %	40 %	0 %	55980059
79	NC_006461	GCCCC	2	10	90257	90266	0 %	0 %	20 %	80 %	55980059
80	NC_006461	GGGGC	2	10	93317	93326	0 %	0 %	80 %	20 %	55980064
81	NC_006461	GGGCG	2	10	94888	94897	0 %	0 %	80 %	20 %	55980064
82	NC_006461	CGGGG	2	10	95172	95181	0 %	0 %	80 %	20 %	55980065
83	NC_006461	CCGGG	2	10	97466	97475	0 %	0 %	60 %	40 %	55980066
84	NC_006461	ACGGC	2	10	98590	98599	20 %	0 %	40 %	40 %	55980067
85	NC_006461	GGAGG	2	10	99631	99640	20 %	0 %	80 %	0 %	55980068
86	NC_006461	GAGGC	2	10	99847	99856	20 %	0 %	60 %	20 %	55980068
87	NC_006461	TCCCC	2	10	100663	100672	0 %	20 %	0 %	80 %	55980069
88	NC_006461	CCGGA	2	10	100835	100844	20 %	0 %	40 %	40 %	55980069
89	NC_006461	GGCCT	2	10	101345	101354	0 %	20 %	40 %	40 %	55980069
90	NC_006461	GCCGG	2	10	101509	101518	0 %	0 %	60 %	40 %	55980069
91	NC_006461	GCCCT	2	10	101924	101933	0 %	20 %	20 %	60 %	55980069
92	NC_006461	CCCTG	2	10	102329	102338	0 %	20 %	20 %	60 %	55980070
93	NC_006461	CCCCT	2	10	104627	104636	0 %	20 %	0 %	80 %	55980074
94	NC_006461	CCAGG	2	10	105687	105696	20 %	0 %	40 %	40 %	55980076
95	NC_006461	AGCCG	2	10	106184	106193	20 %	0 %	40 %	40 %	55980077
96	NC_006461	CGAGG	2	10	107622	107631	20 %	0 %	60 %	20 %	55980077
97	NC_006461	CGCCC	2	10	110875	110884	0 %	0 %	20 %	80 %	55980079
98	NC_006461	GCCCC	2	10	111676	111685	0 %	0 %	20 %	80 %	55980080
99	NC_006461	TCCCC	2	10	111757	111766	0 %	20 %	0 %	80 %	55980080
100	NC_006461	CACGC	2	10	112964	112973	20 %	0 %	20 %	60 %	55980081
101	NC_006461	CCGGG	2	10	113316	113325	0 %	0 %	60 %	40 %	55980082
102	NC_006461	CCCCG	2	10	113830	113839	0 %	0 %	20 %	80 %	55980083
103	NC_006461	CCGCC	2	10	114414	114423	0 %	0 %	20 %	80 %	55980083
104	NC_006461	GCCTC	2	10	114627	114636	0 %	20 %	20 %	60 %	55980083
105	NC_006461	GGCGG	2	10	115713	115722	0 %	0 %	80 %	20 %	55980084
106	NC_006461	CGAGG	2	10	117698	117707	20 %	0 %	60 %	20 %	55980085
107	NC_006461	CCCCG	2	10	118503	118512	0 %	0 %	20 %	80 %	55980087
108	NC_006461	TCCAC	2	10	118878	118887	20 %	20 %	0 %	60 %	55980087
109	NC_006461	CCCCG	2	10	122805	122814	0 %	0 %	20 %	80 %	55980091
110	NC_006461	TCCCC	2	10	124772	124781	0 %	20 %	0 %	80 %	55980093
111	NC_006461	CTCGT	2	10	126163	126172	0 %	40 %	20 %	40 %	55980096
112	NC_006461	CGGGG	2	10	128133	128142	0 %	0 %	80 %	20 %	55980099
113	NC_006461	GGGAA	2	10	129362	129371	40 %	0 %	60 %	0 %	55980100
114	NC_006461	CGGGG	2	10	133627	133636	0 %	0 %	80 %	20 %	55980105
115	NC_006461	CCCCG	2	10	134100	134109	0 %	0 %	20 %	80 %	55980105
116	NC_006461	GGGCG	2	10	135466	135475	0 %	0 %	80 %	20 %	55980107
117	NC_006461	CCCTC	2	10	140604	140613	0 %	20 %	0 %	80 %	55980113
118	NC_006461	CCCGG	2	10	141549	141558	0 %	0 %	40 %	60 %	55980114
119	NC_006461	CCCGG	2	10	141796	141805	0 %	0 %	40 %	60 %	55980114
120	NC_006461	TCCAG	2	10	141891	141900	20 %	20 %	20 %	40 %	55980114
121	NC_006461	GCCCC	2	10	141969	141978	0 %	0 %	20 %	80 %	55980114
122	NC_006461	ATGCG	2	10	145335	145344	20 %	20 %	40 %	20 %	55980120
123	NC_006461	CCCCT	2	10	145468	145477	0 %	20 %	0 %	80 %	55980120
124	NC_006461	CGGGC	2	10	146480	146489	0 %	0 %	60 %	40 %	55980121
125	NC_006461	GCCCC	2	10	147592	147601	0 %	0 %	20 %	80 %	55980121
126	NC_006461	AAGGG	2	10	153134	153143	40 %	0 %	60 %	0 %	55980127
127	NC_006461	GGCGG	2	10	153213	153222	0 %	0 %	80 %	20 %	55980127
128	NC_006461	CCCCG	2	10	154004	154013	0 %	0 %	20 %	80 %	55980127
129	NC_006461	GGGCG	2	10	154112	154121	0 %	0 %	80 %	20 %	55980127
130	NC_006461	TGGCC	2	10	154237	154246	0 %	20 %	40 %	40 %	55980127
131	NC_006461	GCGGT	2	10	156018	156027	0 %	20 %	60 %	20 %	55980130
132	NC_006461	CCGTC	2	10	157153	157162	0 %	20 %	20 %	60 %	55980130
133	NC_006461	AGGCC	2	10	157882	157891	20 %	0 %	40 %	40 %	55980130
134	NC_006461	ACCCC	2	10	160659	160668	20 %	0 %	0 %	80 %	55980132
135	NC_006461	CCCGC	2	10	167065	167074	0 %	0 %	20 %	80 %	55980142
136	NC_006461	GGGGC	2	10	168412	168421	0 %	0 %	80 %	20 %	55980143
137	NC_006461	GGGTC	2	10	169073	169082	0 %	20 %	60 %	20 %	55980144
138	NC_006461	GCCGG	2	10	169220	169229	0 %	0 %	60 %	40 %	55980144
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268	NC_006461	CCGGG	2	10	321656	321665	0 %	0 %	60 %	40 %	55980308
269	NC_006461	CCTCC	2	10	322164	322173	0 %	20 %	0 %	80 %	55980308
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