MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 3768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006461	ACCT	2	8	145	152	25 %	25 %	0 %	50 %	55979970
2	NC_006461	CCCG	2	8	664	671	0 %	0 %	25 %	75 %	55979970
3	NC_006461	GCCC	2	8	1005	1012	0 %	0 %	25 %	75 %	55979970
4	NC_006461	GCGG	2	8	1912	1919	0 %	0 %	75 %	25 %	55979971
5	NC_006461	CGAG	2	8	1965	1972	25 %	0 %	50 %	25 %	55979971
6	NC_006461	CGGG	2	8	2198	2205	0 %	0 %	75 %	25 %	55979971
7	NC_006461	GCGG	2	8	5242	5249	0 %	0 %	75 %	25 %	55979974
8	NC_006461	CCCG	2	8	6106	6113	0 %	0 %	25 %	75 %	55979975
9	NC_006461	GAGG	2	8	6984	6991	25 %	0 %	75 %	0 %	55979975
10	NC_006461	TTCC	2	8	7062	7069	0 %	50 %	0 %	50 %	55979975
11	NC_006461	TTCG	2	8	8814	8821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006461	CTGC	2	8	8855	8862	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006461	CACC	2	8	8884	8891	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_006461	CGGC	2	8	9367	9374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006461	CGGG	2	8	9515	9522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_006461	GCGA	2	8	10234	10241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_006461	GCCC	2	8	12018	12025	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_006461	GGGC	2	8	12315	12322	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006461	CTGC	2	8	13338	13345	0 %	25 %	25 %	50 %	55979980
20	NC_006461	AGGG	2	8	13757	13764	25 %	0 %	75 %	0 %	55979981
21	NC_006461	GAGG	2	8	13805	13812	25 %	0 %	75 %	0 %	55979981
22	NC_006461	CTGG	2	8	14078	14085	0 %	25 %	50 %	25 %	55979981
23	NC_006461	GCAG	2	8	14139	14146	25 %	0 %	50 %	25 %	55979981
24	NC_006461	GCCC	2	8	14601	14608	0 %	0 %	25 %	75 %	55979982
25	NC_006461	CGCC	2	8	14906	14913	0 %	0 %	25 %	75 %	55979982
26	NC_006461	CCCG	2	8	15069	15076	0 %	0 %	25 %	75 %	55979982
27	NC_006461	AGGT	2	8	15137	15144	25 %	25 %	50 %	0 %	55979982
28	NC_006461	GAAG	2	8	15915	15922	50 %	0 %	50 %	0 %	55979983
29	NC_006461	CCCG	2	8	16381	16388	0 %	0 %	25 %	75 %	55979984
30	NC_006461	GCAG	2	8	16395	16402	25 %	0 %	50 %	25 %	55979984
31	NC_006461	ACCG	2	8	17163	17170	25 %	0 %	25 %	50 %	55979985
32	NC_006461	GCCT	2	8	17433	17440	0 %	25 %	25 %	50 %	55979985
33	NC_006461	GCGG	2	8	17795	17802	0 %	0 %	75 %	25 %	55979985
34	NC_006461	TCCA	2	8	20370	20377	25 %	25 %	0 %	50 %	55979988
35	NC_006461	CCCG	2	8	20711	20718	0 %	0 %	25 %	75 %	55979989
36	NC_006461	GAGG	2	8	21558	21565	25 %	0 %	75 %	0 %	55979990
37	NC_006461	GGGA	2	8	21869	21876	25 %	0 %	75 %	0 %	55979991
38	NC_006461	GGAC	2	8	21997	22004	25 %	0 %	50 %	25 %	55979991
39	NC_006461	CCCT	2	8	22293	22300	0 %	25 %	0 %	75 %	55979991
40	NC_006461	GGGC	2	8	22744	22751	0 %	0 %	75 %	25 %	55979991
41	NC_006461	GCCC	2	8	23127	23134	0 %	0 %	25 %	75 %	55979992
42	NC_006461	GAGC	2	8	23152	23159	25 %	0 %	50 %	25 %	55979992
43	NC_006461	GAGG	2	8	23451	23458	25 %	0 %	75 %	0 %	55979992
44	NC_006461	CCGG	2	8	24596	24603	0 %	0 %	50 %	50 %	55979992
45	NC_006461	TCCC	2	8	25302	25309	0 %	25 %	0 %	75 %	55979993
46	NC_006461	CAGG	2	8	25677	25684	25 %	0 %	50 %	25 %	55979993
47	NC_006461	CCAG	2	8	26171	26178	25 %	0 %	25 %	50 %	55979993
48	NC_006461	CCCG	2	8	26347	26354	0 %	0 %	25 %	75 %	55979993
49	NC_006461	CTTC	2	8	26572	26579	0 %	50 %	0 %	50 %	55979993
50	NC_006461	CGGG	2	8	27672	27679	0 %	0 %	75 %	25 %	55979994
51	NC_006461	TTCC	2	8	27796	27803	0 %	50 %	0 %	50 %	55979994
52	NC_006461	CGGG	2	8	28266	28273	0 %	0 %	75 %	25 %	55979995
53	NC_006461	CCCG	2	8	28865	28872	0 %	0 %	25 %	75 %	55979996
54	NC_006461	GCCC	2	8	29548	29555	0 %	0 %	25 %	75 %	55979997
55	NC_006461	GGGC	2	8	29706	29713	0 %	0 %	75 %	25 %	55979997
56	NC_006461	CCTC	2	8	29778	29785	0 %	25 %	0 %	75 %	55979997
57	NC_006461	TGGC	2	8	30261	30268	0 %	25 %	50 %	25 %	55979997
58	NC_006461	CTTC	2	8	30491	30498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_006461	AAGG	2	8	30505	30512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006461	GGCC	2	8	30880	30887	0 %	0 %	50 %	50 %	55979998
61	NC_006461	CGCC	2	8	30912	30919	0 %	0 %	25 %	75 %	55979998
62	NC_006461	CCTT	2	8	31448	31455	0 %	50 %	0 %	50 %	55979998
63	NC_006461	AGGC	2	8	31559	31566	25 %	0 %	50 %	25 %	55979998
64	NC_006461	CCCA	2	8	32354	32361	25 %	0 %	0 %	75 %	55979999
65	NC_006461	CACC	2	8	33198	33205	25 %	0 %	0 %	75 %	55979999
66	NC_006461	TGCT	2	8	33268	33275	0 %	50 %	25 %	25 %	55980000
67	NC_006461	TGGG	2	8	33411	33418	0 %	25 %	75 %	0 %	55980000
68	NC_006461	TGGG	2	8	34084	34091	0 %	25 %	75 %	0 %	55980000
69	NC_006461	TGCT	2	8	34264	34271	0 %	50 %	25 %	25 %	55980000
70	NC_006461	TCCG	2	8	34533	34540	0 %	25 %	25 %	50 %	55980001
71	NC_006461	AGGG	2	8	34985	34992	25 %	0 %	75 %	0 %	55980002
72	NC_006461	TCCC	2	8	35317	35324	0 %	25 %	0 %	75 %	55980003
73	NC_006461	GTTG	2	8	35920	35927	0 %	50 %	50 %	0 %	55980003
74	NC_006461	CCTC	2	8	36270	36277	0 %	25 %	0 %	75 %	55980004
75	NC_006461	CTCG	2	8	36281	36288	0 %	25 %	25 %	50 %	55980004
76	NC_006461	CGGA	2	8	36377	36384	25 %	0 %	50 %	25 %	55980004
77	NC_006461	CTTT	2	8	36433	36440	0 %	75 %	0 %	25 %	55980004
78	NC_006461	CTCC	2	8	36713	36720	0 %	25 %	0 %	75 %	55980004
79	NC_006461	GCTG	2	8	36754	36761	0 %	25 %	50 %	25 %	55980004
80	NC_006461	AGGC	2	8	37121	37128	25 %	0 %	50 %	25 %	55980004
81	NC_006461	GCCG	2	8	37425	37432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_006461	CCCA	2	8	37648	37655	25 %	0 %	0 %	75 %	55980005
83	NC_006461	TGCG	2	8	38410	38417	0 %	25 %	50 %	25 %	55980005
84	NC_006461	GGGC	2	8	39303	39310	0 %	0 %	75 %	25 %	55980006
85	NC_006461	GCGG	2	8	39617	39624	0 %	0 %	75 %	25 %	55980006
86	NC_006461	GAGG	2	8	39636	39643	25 %	0 %	75 %	0 %	55980006
87	NC_006461	TGGG	2	8	39768	39775	0 %	25 %	75 %	0 %	55980007
88	NC_006461	CCCT	2	8	40117	40124	0 %	25 %	0 %	75 %	55980007
89	NC_006461	GAGG	2	8	40199	40206	25 %	0 %	75 %	0 %	55980007
90	NC_006461	CGGG	2	8	40347	40354	0 %	0 %	75 %	25 %	55980007
91	NC_006461	CGGG	2	8	40427	40434	0 %	0 %	75 %	25 %	55980007
92	NC_006461	GCGG	2	8	40571	40578	0 %	0 %	75 %	25 %	55980007
93	NC_006461	GGCT	2	8	40584	40591	0 %	25 %	50 %	25 %	55980007
94	NC_006461	AGCG	2	8	41194	41201	25 %	0 %	50 %	25 %	55980009
95	NC_006461	CGGG	2	8	41655	41662	0 %	0 %	75 %	25 %	55980009
96	NC_006461	GCCC	2	8	41934	41941	0 %	0 %	25 %	75 %	55980009
97	NC_006461	CTCC	2	8	42779	42786	0 %	25 %	0 %	75 %	55980010
98	NC_006461	AGGG	2	8	42988	42995	25 %	0 %	75 %	0 %	55980010
99	NC_006461	CAGG	2	8	42996	43003	25 %	0 %	50 %	25 %	55980010
100	NC_006461	GGGC	2	8	43864	43871	0 %	0 %	75 %	25 %	55980012
101	NC_006461	TCCT	2	8	43914	43921	0 %	50 %	0 %	50 %	55980012
102	NC_006461	CTCC	2	8	43988	43995	0 %	25 %	0 %	75 %	55980012
103	NC_006461	GTGG	2	8	44042	44049	0 %	25 %	75 %	0 %	55980012
104	NC_006461	CCTC	2	8	44071	44078	0 %	25 %	0 %	75 %	55980012
105	NC_006461	GGGT	2	8	45743	45750	0 %	25 %	75 %	0 %	55980014
106	NC_006461	CCGG	2	8	46320	46327	0 %	0 %	50 %	50 %	55980014
107	NC_006461	AGGA	2	8	46412	46419	50 %	0 %	50 %	0 %	55980014
108	NC_006461	CTGG	2	8	47069	47076	0 %	25 %	50 %	25 %	55980015
109	NC_006461	AGGA	2	8	47981	47988	50 %	0 %	50 %	0 %	55980016
110	NC_006461	CTGG	2	8	48419	48426	0 %	25 %	50 %	25 %	55980017
111	NC_006461	GCCC	2	8	48600	48607	0 %	0 %	25 %	75 %	55980018
112	NC_006461	CACC	2	8	49109	49116	25 %	0 %	0 %	75 %	55980018
113	NC_006461	TTCC	2	8	49797	49804	0 %	50 %	0 %	50 %	55980019
114	NC_006461	GGCG	2	8	49913	49920	0 %	0 %	75 %	25 %	55980019
115	NC_006461	GGGC	2	8	50396	50403	0 %	0 %	75 %	25 %	55980020
116	NC_006461	GGGC	2	8	50478	50485	0 %	0 %	75 %	25 %	55980020
117	NC_006461	GGAC	2	8	50646	50653	25 %	0 %	50 %	25 %	55980020
118	NC_006461	GGAG	2	8	51315	51322	25 %	0 %	75 %	0 %	55980021
119	NC_006461	GCCC	2	8	52779	52786	0 %	0 %	25 %	75 %	55980023
120	NC_006461	CCCT	2	8	53120	53127	0 %	25 %	0 %	75 %	55980024
121	NC_006461	CCCG	2	8	53436	53443	0 %	0 %	25 %	75 %	55980024
122	NC_006461	AGGG	2	8	54490	54497	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006461	GGCG	2	8	55622	55629	0 %	0 %	75 %	25 %	55980025
124	NC_006461	CGTC	2	8	56030	56037	0 %	25 %	25 %	50 %	55980026
125	NC_006461	CCCG	2	8	57081	57088	0 %	0 %	25 %	75 %	55980027
126	NC_006461	GGAC	2	8	57303	57310	25 %	0 %	50 %	25 %	55980028
127	NC_006461	CGGG	2	8	58089	58096	0 %	0 %	75 %	25 %	55980029
128	NC_006461	AGCC	2	8	58253	58260	25 %	0 %	25 %	50 %	55980030
129	NC_006461	AGGG	2	8	58609	58616	25 %	0 %	75 %	0 %	55980031
130	NC_006461	GGTG	2	8	59130	59137	0 %	25 %	75 %	0 %	55980031
131	NC_006461	CCGC	2	8	59172	59179	0 %	0 %	25 %	75 %	55980031
132	NC_006461	CGCC	2	8	59536	59543	0 %	0 %	25 %	75 %	55980031
133	NC_006461	CCCG	2	8	59623	59630	0 %	0 %	25 %	75 %	55980031
134	NC_006461	CGGC	2	8	60222	60229	0 %	0 %	50 %	50 %	55980032
135	NC_006461	GCGG	2	8	60519	60526	0 %	0 %	75 %	25 %	55980032
136	NC_006461	GCCC	2	8	60580	60587	0 %	0 %	25 %	75 %	55980032
137	NC_006461	AGGT	2	8	60700	60707	25 %	25 %	50 %	0 %	55980032
138	NC_006461	GGGC	2	8	61277	61284	0 %	0 %	75 %	25 %	55980032
139	NC_006461	AGGG	2	8	61615	61622	25 %	0 %	75 %	0 %	55980032
140	NC_006461	CTCC	2	8	61703	61710	0 %	25 %	0 %	75 %	55980032
141	NC_006461	AGGG	2	8	61718	61725	25 %	0 %	75 %	0 %	55980032
142	NC_006461	TCGG	2	8	62202	62209	0 %	25 %	50 %	25 %	55980033
143	NC_006461	CTCC	2	8	62266	62273	0 %	25 %	0 %	75 %	55980033
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145	NC_006461	CGCC	2	8	62929	62936	0 %	0 %	25 %	75 %	55980034
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497	NC_006461	CCCG	2	8	240623	240630	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
498	NC_006461	AGGG	2	8	241680	241687	25 %	0 %	75 %	0 %	55980221
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