MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 3494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006461	ACCT	2	8	145	152	25 %	25 %	0 %	50 %	55979970
2	NC_006461	CCCG	2	8	664	671	0 %	0 %	25 %	75 %	55979970
3	NC_006461	GCCC	2	8	1005	1012	0 %	0 %	25 %	75 %	55979970
4	NC_006461	GCGG	2	8	1912	1919	0 %	0 %	75 %	25 %	55979971
5	NC_006461	CGAG	2	8	1965	1972	25 %	0 %	50 %	25 %	55979971
6	NC_006461	CGGG	2	8	2198	2205	0 %	0 %	75 %	25 %	55979971
7	NC_006461	GCGG	2	8	5242	5249	0 %	0 %	75 %	25 %	55979974
8	NC_006461	CCCG	2	8	6106	6113	0 %	0 %	25 %	75 %	55979975
9	NC_006461	GAGG	2	8	6984	6991	25 %	0 %	75 %	0 %	55979975
10	NC_006461	TTCC	2	8	7062	7069	0 %	50 %	0 %	50 %	55979975
11	NC_006461	CTGC	2	8	13338	13345	0 %	25 %	25 %	50 %	55979980
12	NC_006461	AGGG	2	8	13757	13764	25 %	0 %	75 %	0 %	55979981
13	NC_006461	GAGG	2	8	13805	13812	25 %	0 %	75 %	0 %	55979981
14	NC_006461	CTGG	2	8	14078	14085	0 %	25 %	50 %	25 %	55979981
15	NC_006461	GCAG	2	8	14139	14146	25 %	0 %	50 %	25 %	55979981
16	NC_006461	GCCC	2	8	14601	14608	0 %	0 %	25 %	75 %	55979982
17	NC_006461	CGCC	2	8	14906	14913	0 %	0 %	25 %	75 %	55979982
18	NC_006461	CCCG	2	8	15069	15076	0 %	0 %	25 %	75 %	55979982
19	NC_006461	AGGT	2	8	15137	15144	25 %	25 %	50 %	0 %	55979982
20	NC_006461	GAAG	2	8	15915	15922	50 %	0 %	50 %	0 %	55979983
21	NC_006461	CCCG	2	8	16381	16388	0 %	0 %	25 %	75 %	55979984
22	NC_006461	GCAG	2	8	16395	16402	25 %	0 %	50 %	25 %	55979984
23	NC_006461	ACCG	2	8	17163	17170	25 %	0 %	25 %	50 %	55979985
24	NC_006461	GCCT	2	8	17433	17440	0 %	25 %	25 %	50 %	55979985
25	NC_006461	GCGG	2	8	17795	17802	0 %	0 %	75 %	25 %	55979985
26	NC_006461	TCCA	2	8	20370	20377	25 %	25 %	0 %	50 %	55979988
27	NC_006461	CCCG	2	8	20711	20718	0 %	0 %	25 %	75 %	55979989
28	NC_006461	GAGG	2	8	21558	21565	25 %	0 %	75 %	0 %	55979990
29	NC_006461	GGGA	2	8	21869	21876	25 %	0 %	75 %	0 %	55979991
30	NC_006461	GGAC	2	8	21997	22004	25 %	0 %	50 %	25 %	55979991
31	NC_006461	CCCT	2	8	22293	22300	0 %	25 %	0 %	75 %	55979991
32	NC_006461	GGGC	2	8	22744	22751	0 %	0 %	75 %	25 %	55979991
33	NC_006461	GCCC	2	8	23127	23134	0 %	0 %	25 %	75 %	55979992
34	NC_006461	GAGC	2	8	23152	23159	25 %	0 %	50 %	25 %	55979992
35	NC_006461	GAGG	2	8	23451	23458	25 %	0 %	75 %	0 %	55979992
36	NC_006461	CCGG	2	8	24596	24603	0 %	0 %	50 %	50 %	55979992
37	NC_006461	TCCC	2	8	25302	25309	0 %	25 %	0 %	75 %	55979993
38	NC_006461	CAGG	2	8	25677	25684	25 %	0 %	50 %	25 %	55979993
39	NC_006461	CCAG	2	8	26171	26178	25 %	0 %	25 %	50 %	55979993
40	NC_006461	CCCG	2	8	26347	26354	0 %	0 %	25 %	75 %	55979993
41	NC_006461	CTTC	2	8	26572	26579	0 %	50 %	0 %	50 %	55979993
42	NC_006461	CGGG	2	8	27672	27679	0 %	0 %	75 %	25 %	55979994
43	NC_006461	TTCC	2	8	27796	27803	0 %	50 %	0 %	50 %	55979994
44	NC_006461	CGGG	2	8	28266	28273	0 %	0 %	75 %	25 %	55979995
45	NC_006461	CCCG	2	8	28865	28872	0 %	0 %	25 %	75 %	55979996
46	NC_006461	GCCC	2	8	29548	29555	0 %	0 %	25 %	75 %	55979997
47	NC_006461	GGGC	2	8	29706	29713	0 %	0 %	75 %	25 %	55979997
48	NC_006461	CCTC	2	8	29778	29785	0 %	25 %	0 %	75 %	55979997
49	NC_006461	TGGC	2	8	30261	30268	0 %	25 %	50 %	25 %	55979997
50	NC_006461	GGCC	2	8	30880	30887	0 %	0 %	50 %	50 %	55979998
51	NC_006461	CGCC	2	8	30912	30919	0 %	0 %	25 %	75 %	55979998
52	NC_006461	CCTT	2	8	31448	31455	0 %	50 %	0 %	50 %	55979998
53	NC_006461	AGGC	2	8	31559	31566	25 %	0 %	50 %	25 %	55979998
54	NC_006461	CCCA	2	8	32354	32361	25 %	0 %	0 %	75 %	55979999
55	NC_006461	CACC	2	8	33198	33205	25 %	0 %	0 %	75 %	55979999
56	NC_006461	TGCT	2	8	33268	33275	0 %	50 %	25 %	25 %	55980000
57	NC_006461	TGGG	2	8	33411	33418	0 %	25 %	75 %	0 %	55980000
58	NC_006461	TGGG	2	8	34084	34091	0 %	25 %	75 %	0 %	55980000
59	NC_006461	TGCT	2	8	34264	34271	0 %	50 %	25 %	25 %	55980000
60	NC_006461	TCCG	2	8	34533	34540	0 %	25 %	25 %	50 %	55980001
61	NC_006461	AGGG	2	8	34985	34992	25 %	0 %	75 %	0 %	55980002
62	NC_006461	TCCC	2	8	35317	35324	0 %	25 %	0 %	75 %	55980003
63	NC_006461	GTTG	2	8	35920	35927	0 %	50 %	50 %	0 %	55980003
64	NC_006461	CCTC	2	8	36270	36277	0 %	25 %	0 %	75 %	55980004
65	NC_006461	CTCG	2	8	36281	36288	0 %	25 %	25 %	50 %	55980004
66	NC_006461	CGGA	2	8	36377	36384	25 %	0 %	50 %	25 %	55980004
67	NC_006461	CTTT	2	8	36433	36440	0 %	75 %	0 %	25 %	55980004
68	NC_006461	CTCC	2	8	36713	36720	0 %	25 %	0 %	75 %	55980004
69	NC_006461	GCTG	2	8	36754	36761	0 %	25 %	50 %	25 %	55980004
70	NC_006461	AGGC	2	8	37121	37128	25 %	0 %	50 %	25 %	55980004
71	NC_006461	CCCA	2	8	37648	37655	25 %	0 %	0 %	75 %	55980005
72	NC_006461	TGCG	2	8	38410	38417	0 %	25 %	50 %	25 %	55980005
73	NC_006461	GGGC	2	8	39303	39310	0 %	0 %	75 %	25 %	55980006
74	NC_006461	GCGG	2	8	39617	39624	0 %	0 %	75 %	25 %	55980006
75	NC_006461	GAGG	2	8	39636	39643	25 %	0 %	75 %	0 %	55980006
76	NC_006461	TGGG	2	8	39768	39775	0 %	25 %	75 %	0 %	55980007
77	NC_006461	CCCT	2	8	40117	40124	0 %	25 %	0 %	75 %	55980007
78	NC_006461	GAGG	2	8	40199	40206	25 %	0 %	75 %	0 %	55980007
79	NC_006461	CGGG	2	8	40347	40354	0 %	0 %	75 %	25 %	55980007
80	NC_006461	CGGG	2	8	40427	40434	0 %	0 %	75 %	25 %	55980007
81	NC_006461	GCGG	2	8	40571	40578	0 %	0 %	75 %	25 %	55980007
82	NC_006461	GGCT	2	8	40584	40591	0 %	25 %	50 %	25 %	55980007
83	NC_006461	AGCG	2	8	41194	41201	25 %	0 %	50 %	25 %	55980009
84	NC_006461	CGGG	2	8	41655	41662	0 %	0 %	75 %	25 %	55980009
85	NC_006461	GCCC	2	8	41934	41941	0 %	0 %	25 %	75 %	55980009
86	NC_006461	CTCC	2	8	42779	42786	0 %	25 %	0 %	75 %	55980010
87	NC_006461	AGGG	2	8	42988	42995	25 %	0 %	75 %	0 %	55980010
88	NC_006461	CAGG	2	8	42996	43003	25 %	0 %	50 %	25 %	55980010
89	NC_006461	GGGC	2	8	43864	43871	0 %	0 %	75 %	25 %	55980012
90	NC_006461	TCCT	2	8	43914	43921	0 %	50 %	0 %	50 %	55980012
91	NC_006461	CTCC	2	8	43988	43995	0 %	25 %	0 %	75 %	55980012
92	NC_006461	GTGG	2	8	44042	44049	0 %	25 %	75 %	0 %	55980012
93	NC_006461	CCTC	2	8	44071	44078	0 %	25 %	0 %	75 %	55980012
94	NC_006461	GGGT	2	8	45743	45750	0 %	25 %	75 %	0 %	55980014
95	NC_006461	CCGG	2	8	46320	46327	0 %	0 %	50 %	50 %	55980014
96	NC_006461	AGGA	2	8	46412	46419	50 %	0 %	50 %	0 %	55980014
97	NC_006461	CTGG	2	8	47069	47076	0 %	25 %	50 %	25 %	55980015
98	NC_006461	AGGA	2	8	47981	47988	50 %	0 %	50 %	0 %	55980016
99	NC_006461	CTGG	2	8	48419	48426	0 %	25 %	50 %	25 %	55980017
100	NC_006461	GCCC	2	8	48600	48607	0 %	0 %	25 %	75 %	55980018
101	NC_006461	CACC	2	8	49109	49116	25 %	0 %	0 %	75 %	55980018
102	NC_006461	TTCC	2	8	49797	49804	0 %	50 %	0 %	50 %	55980019
103	NC_006461	GGCG	2	8	49913	49920	0 %	0 %	75 %	25 %	55980019
104	NC_006461	GGGC	2	8	50396	50403	0 %	0 %	75 %	25 %	55980020
105	NC_006461	GGGC	2	8	50478	50485	0 %	0 %	75 %	25 %	55980020
106	NC_006461	GGAC	2	8	50646	50653	25 %	0 %	50 %	25 %	55980020
107	NC_006461	GGAG	2	8	51315	51322	25 %	0 %	75 %	0 %	55980021
108	NC_006461	GCCC	2	8	52779	52786	0 %	0 %	25 %	75 %	55980023
109	NC_006461	CCCT	2	8	53120	53127	0 %	25 %	0 %	75 %	55980024
110	NC_006461	CCCG	2	8	53436	53443	0 %	0 %	25 %	75 %	55980024
111	NC_006461	GGCG	2	8	55622	55629	0 %	0 %	75 %	25 %	55980025
112	NC_006461	CGTC	2	8	56030	56037	0 %	25 %	25 %	50 %	55980026
113	NC_006461	CCCG	2	8	57081	57088	0 %	0 %	25 %	75 %	55980027
114	NC_006461	GGAC	2	8	57303	57310	25 %	0 %	50 %	25 %	55980028
115	NC_006461	CGGG	2	8	58089	58096	0 %	0 %	75 %	25 %	55980029
116	NC_006461	AGCC	2	8	58253	58260	25 %	0 %	25 %	50 %	55980030
117	NC_006461	AGGG	2	8	58609	58616	25 %	0 %	75 %	0 %	55980031
118	NC_006461	GGTG	2	8	59130	59137	0 %	25 %	75 %	0 %	55980031
119	NC_006461	CCGC	2	8	59172	59179	0 %	0 %	25 %	75 %	55980031
120	NC_006461	CGCC	2	8	59536	59543	0 %	0 %	25 %	75 %	55980031
121	NC_006461	CCCG	2	8	59623	59630	0 %	0 %	25 %	75 %	55980031
122	NC_006461	CGGC	2	8	60222	60229	0 %	0 %	50 %	50 %	55980032
123	NC_006461	GCGG	2	8	60519	60526	0 %	0 %	75 %	25 %	55980032
124	NC_006461	GCCC	2	8	60580	60587	0 %	0 %	25 %	75 %	55980032
125	NC_006461	AGGT	2	8	60700	60707	25 %	25 %	50 %	0 %	55980032
126	NC_006461	GGGC	2	8	61277	61284	0 %	0 %	75 %	25 %	55980032
127	NC_006461	AGGG	2	8	61615	61622	25 %	0 %	75 %	0 %	55980032
128	NC_006461	CTCC	2	8	61703	61710	0 %	25 %	0 %	75 %	55980032
129	NC_006461	AGGG	2	8	61718	61725	25 %	0 %	75 %	0 %	55980032
130	NC_006461	TCGG	2	8	62202	62209	0 %	25 %	50 %	25 %	55980033
131	NC_006461	CTCC	2	8	62266	62273	0 %	25 %	0 %	75 %	55980033
132	NC_006461	GCCC	2	8	62335	62342	0 %	0 %	25 %	75 %	55980033
133	NC_006461	CGCC	2	8	62929	62936	0 %	0 %	25 %	75 %	55980034
134	NC_006461	CGGG	2	8	62982	62989	0 %	0 %	75 %	25 %	55980034
135	NC_006461	CGGG	2	8	63089	63096	0 %	0 %	75 %	25 %	55980034
136	NC_006461	CGGG	2	8	63202	63209	0 %	0 %	75 %	25 %	55980034
137	NC_006461	GGAA	2	8	63871	63878	50 %	0 %	50 %	0 %	55980035
138	NC_006461	CCCG	2	8	64784	64791	0 %	0 %	25 %	75 %	55980036
139	NC_006461	AGCG	2	8	64929	64936	25 %	0 %	50 %	25 %	55980037
140	NC_006461	CGGC	2	8	65009	65016	0 %	0 %	50 %	50 %	55980037
141	NC_006461	GGCC	2	8	65241	65248	0 %	0 %	50 %	50 %	55980038
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143	NC_006461	CACC	2	8	65614	65621	25 %	0 %	0 %	75 %	55980038
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