MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006461	AG	3	6	18	23	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006461	AG	3	6	9583	9588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006461	GC	3	6	10929	10934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006461	CT	3	6	11063	11068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_006461	TC	3	6	30497	30502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006461	GC	3	6	78083	78088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_006461	GC	3	6	80957	80962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006461	CG	3	6	80983	80988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006461	GC	3	6	104369	104374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006461	GT	3	6	131493	131498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006461	GC	3	6	132104	132109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_006461	GC	3	6	132151	132156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006461	AC	3	6	132506	132511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006461	AC	3	6	132676	132681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006461	GC	3	6	150132	150137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006461	CG	3	6	158406	158411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006461	GC	3	6	160323	160328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_006461	GC	3	6	167849	167854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_006461	GA	3	6	199018	199023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006461	GC	3	6	205968	205973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006461	GC	3	6	227310	227315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006461	GC	3	6	331867	331872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006461	GA	3	6	333824	333829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006461	TC	4	8	338627	338634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006461	AG	3	6	350202	350207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006461	CG	3	6	350335	350340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006461	CT	3	6	351682	351687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006461	GC	3	6	358906	358911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006461	GC	3	6	396610	396615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006461	AG	3	6	407195	407200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006461	GA	4	8	437265	437272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006461	TA	3	6	501621	501626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006461	TG	3	6	524520	524525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006461	CG	3	6	525365	525370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_006461	CG	3	6	564716	564721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_006461	CA	3	6	603827	603832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006461	CG	3	6	653162	653167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006461	GC	3	6	666126	666131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006461	CG	3	6	666371	666376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_006461	TG	3	6	666544	666549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006461	CG	3	6	688910	688915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_006461	GC	3	6	700185	700190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_006461	TC	3	6	727948	727953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_006461	CT	3	6	740723	740728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006461	TC	3	6	752271	752276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_006461	GA	3	6	792948	792953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006461	GC	3	6	822686	822691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006461	TC	3	6	857409	857414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_006461	GC	3	6	873074	873079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_006461	CT	3	6	874168	874173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_006461	GC	3	6	874812	874817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006461	GA	3	6	897294	897299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006461	GA	3	6	898941	898946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006461	GA	3	6	899566	899571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006461	CG	3	6	914083	914088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_006461	GC	3	6	964683	964688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006461	TC	3	6	967578	967583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_006461	AC	4	8	971437	971444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_006461	CG	3	6	973980	973985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_006461	CG	3	6	989923	989928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_006461	AC	3	6	1022567	1022572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_006461	AG	3	6	1022916	1022921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006461	GA	3	6	1023029	1023034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006461	GC	3	6	1032046	1032051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_006461	CG	3	6	1082060	1082065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006461	GC	3	6	1097309	1097314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_006461	CG	3	6	1101900	1101905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_006461	CG	3	6	1161273	1161278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006461	AG	3	6	1161311	1161316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006461	CG	3	6	1203137	1203142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_006461	CT	3	6	1286639	1286644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_006461	AT	3	6	1289856	1289861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006461	AC	3	6	1311498	1311503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006461	CG	3	6	1311709	1311714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006461	CG	3	6	1312033	1312038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_006461	CG	3	6	1356704	1356709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_006461	CG	3	6	1369545	1369550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_006461	GC	3	6	1380939	1380944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_006461	GC	3	6	1467177	1467182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_006461	GC	3	6	1467496	1467501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006461	CG	3	6	1468060	1468065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_006461	GC	3	6	1468162	1468167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_006461	CG	5	10	1468509	1468518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_006461	TG	3	6	1468578	1468583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006461	CG	3	6	1468629	1468634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_006461	TA	3	6	1468636	1468641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006461	AC	3	6	1477851	1477856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_006461	GC	3	6	1541255	1541260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_006461	CG	3	6	1556950	1556955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_006461	AG	3	6	1558250	1558255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006461	CG	3	6	1576253	1576258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_006461	GC	3	6	1614343	1614348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_006461	GC	3	6	1622605	1622610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_006461	GT	3	6	1633324	1633329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006461	GT	3	6	1633494	1633499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006461	GC	3	6	1633849	1633854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_006461	GC	3	6	1633896	1633901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_006461	AC	3	6	1634507	1634512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_006461	CG	3	6	1637665	1637670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_006461	GC	3	6	1643320	1643325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_006461	GC	3	6	1646445	1646450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_006461	GA	4	8	1647001	1647008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006461	GC	3	6	1668747	1668752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_006461	GC	3	6	1669195	1669200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_006461	GC	4	8	1676137	1676144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_006461	GC	3	6	1676602	1676607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_006461	GA	4	8	1683330	1683337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006461	GA	3	6	1705191	1705196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006461	AC	3	6	1718373	1718378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_006461	TC	4	8	1780603	1780610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_006461	CG	3	6	1796573	1796578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_006461	GC	3	6	1799786	1799791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_006461	GC	3	6	1800388	1800393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_006461	GC	3	6	1810653	1810658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_006461	TA	3	6	1819207	1819212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006461	TC	4	8	1825104	1825111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.