MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006449	TTCT	2	8	15969	15976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_006449	TAGA	2	8	16027	16034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006449	CAGT	2	8	17434	17441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_006449	ATTT	2	8	18013	18020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006449	GTGA	2	8	18223	18230	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006449	AGCG	2	8	18394	18401	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006449	TGGT	2	8	19059	19066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006449	AGCC	2	8	19275	19282	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006449	GTAA	2	8	19550	19557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006449	ATAG	2	8	19564	19571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006449	GCGA	2	8	19879	19886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006449	ATTC	2	8	20744	20751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_006449	CTAA	2	8	21098	21105	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006449	CTGA	2	8	21371	21378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_006449	TAGG	2	8	21753	21760	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006449	GCGT	2	8	23738	23745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_006449	ATTT	2	8	27310	27317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006449	GTTT	2	8	33073	33080	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006449	TCGT	2	8	37746	37753	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_006449	CTTT	2	8	42501	42508	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006449	AACT	2	8	42627	42634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006449	ACCT	2	8	44698	44705	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006449	GCGA	2	8	46281	46288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006449	AGTT	2	8	46468	46475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006449	AAAC	2	8	48334	48341	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_006449	AGGA	2	8	51042	51049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006449	ATGA	2	8	51138	51145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006449	TTGA	2	8	57030	57037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006449	AGAT	2	8	57088	57095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006449	AGTG	2	8	57197	57204	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006449	AGTC	2	8	57876	57883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_006449	AAAG	2	8	60861	60868	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006449	TTGA	2	8	62044	62051	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006449	AAAC	2	8	62079	62086	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_006449	AGAA	2	8	63418	63425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006449	ATTT	2	8	65781	65788	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006449	GTGA	2	8	65991	65998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006449	AGCG	2	8	66162	66169	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_006449	TGGT	2	8	66827	66834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006449	AGCC	2	8	67043	67050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_006449	GTAA	2	8	67318	67325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006449	ATAG	2	8	67332	67339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006449	GCGA	2	8	67647	67654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_006449	ATTC	2	8	68512	68519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_006449	CTAA	2	8	68866	68873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_006449	CTGA	2	8	69139	69146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_006449	TAGG	2	8	69521	69528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006449	GCGT	2	8	70908	70915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_006449	ATTT	2	8	71097	71104	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006449	TCCC	2	8	71179	71186	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_006449	AGTC	2	8	76006	76013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_006449	TTTG	2	8	76025	76032	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006449	CGAG	2	8	79655	79662	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_006449	TGGG	2	8	81669	81676	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006449	AAAT	2	8	82586	82593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006449	AATC	2	8	83686	83693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_006449	ATGA	2	8	90299	90306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006449	GAAA	2	8	94065	94072	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006449	AATT	2	8	94423	94430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006449	ATTT	2	8	97189	97196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006449	TTTA	2	8	100215	100222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006449	TTTA	2	8	100228	100235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006449	TAGC	2	8	100236	100243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_006449	GGTA	2	8	101332	101339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006449	GAAT	2	8	103277	103284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006449	AAAT	2	8	103303	103310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006449	ATTG	2	8	103470	103477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006449	TAAG	2	8	103993	104000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006449	ATTT	2	8	104002	104009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006449	ACAA	2	8	104084	104091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_006449	TATT	2	8	104265	104272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006449	CTGA	2	8	110287	110294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_006449	AATT	2	8	110448	110455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006449	AGTA	2	8	110889	110896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006449	ATTG	2	8	111335	111342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006449	TTAT	2	8	111651	111658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006449	TAAA	2	8	112903	112910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006449	GATT	2	8	112933	112940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006449	ATTA	2	8	114244	114251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006449	TAAA	2	8	115051	115058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006449	GCTA	2	8	119134	119141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_006449	AGAA	2	8	123207	123214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006449	AGAA	2	8	125126	125133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006449	AATA	2	8	125336	125343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006449	AGAT	2	8	125402	125409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006449	ATTT	2	8	129269	129276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006449	GTGA	2	8	129479	129486	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006449	AGCG	2	8	129650	129657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_006449	TGGT	2	8	130315	130322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006449	AGCC	2	8	130531	130538	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_006449	GTAA	2	8	130806	130813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006449	ATAG	2	8	130820	130827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006449	GCGA	2	8	131135	131142	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_006449	ATTC	2	8	132000	132007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_006449	CTAA	2	8	132354	132361	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_006449	CTGA	2	8	132627	132634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_006449	TAGG	2	8	133009	133016	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006449	ATTT	2	8	135076	135083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006449	GTGA	2	8	135286	135293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006449	AGCG	2	8	135457	135464	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_006449	TGGT	2	8	136122	136129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006449	AGCC	2	8	136338	136345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_006449	GTAA	2	8	136613	136620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006449	ATAG	2	8	136627	136634	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006449	GCGA	2	8	136942	136949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_006449	ATTC	2	8	137807	137814	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_006449	CTAA	2	8	138161	138168	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_006449	CTGA	2	8	138434	138441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_006449	TAGG	2	8	138816	138823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006449	AATC	2	8	140607	140614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_006449	TTAA	2	8	143719	143726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006449	TATG	2	8	144084	144091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006449	CAAG	2	8	146282	146289	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_006449	GTGA	2	8	146332	146339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006449	TGAT	2	8	147090	147097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006449	GTGG	2	8	147492	147499	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006449	TTAT	2	8	147539	147546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006449	GTTT	2	8	148158	148165	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006449	AATC	2	8	151447	151454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_006449	AAGA	2	8	153174	153181	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006449	GATG	2	8	153680	153687	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006449	CAAG	2	8	156268	156275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_006449	TTAC	2	8	159152	159159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_006449	TTAA	2	8	159179	159186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006449	GAAG	2	8	159194	159201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006449	TAGA	2	8	161985	161992	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006449	AAAG	2	8	162186	162193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006449	AACT	2	8	163078	163085	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_006449	AATA	2	8	164041	164048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006449	AAAG	2	8	167003	167010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006449	TGAA	2	8	168633	168640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006449	CCTT	2	8	169429	169436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_006449	AAAG	2	8	169476	169483	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006449	ATCA	2	8	169949	169956	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_006449	CAAA	2	8	170203	170210	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_006449	TAAA	2	8	180300	180307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006449	GATT	2	8	181853	181860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006449	ATTG	2	8	186527	186534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006449	TCAG	2	8	195824	195831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_006449	TGTC	2	8	195842	195849	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_006449	ATAA	2	8	200125	200132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006449	TTGT	2	8	202496	202503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006449	ATCT	2	8	207917	207924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_006449	ATAA	2	8	208256	208263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006449	GAGT	2	8	211647	211654	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006449	TTAA	2	8	214558	214565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006449	GTTT	2	8	214919	214926	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006449	TGTT	2	8	214970	214977	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006449	ATTT	2	8	215046	215053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006449	GTTT	2	8	215290	215297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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