MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006448	AAAGG	2	10	2050	2059	60 %	0 %	40 %	0 %	55820105
2	NC_006448	CAAAT	2	10	2387	2396	60 %	20 %	0 %	20 %	55820105
3	NC_006448	TGATT	2	10	2673	2682	20 %	60 %	20 %	0 %	55820105
4	NC_006448	GAGAT	2	10	5641	5650	40 %	20 %	40 %	0 %	55820109
5	NC_006448	TTATG	2	10	7448	7457	20 %	60 %	20 %	0 %	55820109
6	NC_006448	TCAGA	2	10	9231	9240	40 %	20 %	20 %	20 %	55820111
7	NC_006448	CAGTA	2	10	12769	12778	40 %	20 %	20 %	20 %	55820115
8	NC_006448	GGTAA	2	10	12849	12858	40 %	20 %	40 %	0 %	55820115
9	NC_006448	ACCGA	2	10	15573	15582	40 %	0 %	20 %	40 %	55820117
10	NC_006448	CTAGT	2	10	25535	25544	20 %	40 %	20 %	20 %	55820124
11	NC_006448	CAATC	2	10	25871	25880	40 %	20 %	0 %	40 %	55820125
12	NC_006448	ATTCA	2	10	27017	27026	40 %	40 %	0 %	20 %	55820125
13	NC_006448	TGATT	2	10	28236	28245	20 %	60 %	20 %	0 %	55820126
14	NC_006448	ACCTT	2	10	28982	28991	20 %	40 %	0 %	40 %	55820128
15	NC_006448	TTTTG	2	10	29866	29875	0 %	80 %	20 %	0 %	55820129
16	NC_006448	ATGAA	2	10	31219	31228	60 %	20 %	20 %	0 %	55820130
17	NC_006448	GTAGA	2	10	32582	32591	40 %	20 %	40 %	0 %	55820132
18	NC_006448	AAATG	2	10	38695	38704	60 %	20 %	20 %	0 %	55820135
19	NC_006448	AAAAT	2	10	40870	40879	80 %	20 %	0 %	0 %	55820138
20	NC_006448	GTGAA	2	10	41809	41818	40 %	20 %	40 %	0 %	55820138
21	NC_006448	AGTGG	2	10	41961	41970	20 %	20 %	60 %	0 %	55820138
22	NC_006448	TCAAA	2	10	42124	42133	60 %	20 %	0 %	20 %	55820138
23	NC_006448	TTGAT	2	10	45092	45101	20 %	60 %	20 %	0 %	55820143
24	NC_006448	GAAGC	2	10	48050	48059	40 %	0 %	40 %	20 %	55820145
25	NC_006448	ATTTT	2	10	48360	48369	20 %	80 %	0 %	0 %	55820146
26	NC_006448	GCTTG	2	10	49668	49677	0 %	40 %	40 %	20 %	55820148
27	NC_006448	TAGCT	2	10	64135	64144	20 %	40 %	20 %	20 %	55820161
28	NC_006448	TTGAT	2	10	66223	66232	20 %	60 %	20 %	0 %	55820163
29	NC_006448	CAAAT	2	10	75237	75246	60 %	20 %	0 %	20 %	55820164
30	NC_006448	GAATC	2	10	77576	77585	40 %	20 %	20 %	20 %	55820165
31	NC_006448	AGAAA	2	10	77630	77639	80 %	0 %	20 %	0 %	55820165
32	NC_006448	TCAAA	2	10	78510	78519	60 %	20 %	0 %	20 %	55820165
33	NC_006448	AATTT	2	10	79071	79080	40 %	60 %	0 %	0 %	55820167
34	NC_006448	AAGAT	2	10	79812	79821	60 %	20 %	20 %	0 %	55820168
35	NC_006448	TCAGC	2	10	85959	85968	20 %	20 %	20 %	40 %	55820178
36	NC_006448	GCTTC	2	10	96531	96540	0 %	40 %	20 %	40 %	55820186
37	NC_006448	AAGCC	2	10	96660	96669	40 %	0 %	20 %	40 %	55820186
38	NC_006448	CTGTT	2	10	96740	96749	0 %	60 %	20 %	20 %	55820186
39	NC_006448	AAATA	2	10	99714	99723	80 %	20 %	0 %	0 %	55820191
40	NC_006448	AAATG	2	10	100947	100956	60 %	20 %	20 %	0 %	55820193
41	NC_006448	AACAA	2	10	102711	102720	80 %	0 %	0 %	20 %	55820195
42	NC_006448	CACAC	2	10	102845	102854	40 %	0 %	0 %	60 %	55820195
43	NC_006448	TGATA	2	10	106067	106076	40 %	40 %	20 %	0 %	55820200
44	NC_006448	TTTAT	2	10	107596	107605	20 %	80 %	0 %	0 %	55820200
45	NC_006448	TATTT	2	10	109100	109109	20 %	80 %	0 %	0 %	55820202
46	NC_006448	GACGA	2	10	109527	109536	40 %	0 %	40 %	20 %	55820202
47	NC_006448	ATGGC	2	10	110887	110896	20 %	20 %	40 %	20 %	55820203
48	NC_006448	TTTGT	2	10	113235	113244	0 %	80 %	20 %	0 %	55820205
49	NC_006448	TAACT	2	10	113528	113537	40 %	40 %	0 %	20 %	55820205
50	NC_006448	TCTGT	2	10	118768	118777	0 %	60 %	20 %	20 %	55820211
51	NC_006448	CGGTT	2	10	119763	119772	0 %	40 %	40 %	20 %	55820213
52	NC_006448	CAGTT	2	10	121907	121916	20 %	40 %	20 %	20 %	55820216
53	NC_006448	AAGGT	2	10	122129	122138	40 %	20 %	40 %	0 %	55820216
54	NC_006448	TTAGT	2	10	122378	122387	20 %	60 %	20 %	0 %	55820216
55	NC_006448	GTATC	2	10	124565	124574	20 %	40 %	20 %	20 %	55820218
56	NC_006448	AAAGG	2	10	126394	126403	60 %	0 %	40 %	0 %	55820219
57	NC_006448	TCCTT	2	10	141248	141257	0 %	60 %	0 %	40 %	55820223
58	NC_006448	GGATC	2	10	141363	141372	20 %	20 %	40 %	20 %	55820223
59	NC_006448	GGATG	2	10	145397	145406	20 %	20 %	60 %	0 %	55820226
60	NC_006448	AAATT	2	10	149040	149049	60 %	40 %	0 %	0 %	55820229
61	NC_006448	GGTTT	2	10	153577	153586	0 %	60 %	40 %	0 %	55820233
62	NC_006448	TTTGG	2	10	156859	156868	0 %	60 %	40 %	0 %	55820239
63	NC_006448	AAGGT	2	10	156885	156894	40 %	20 %	40 %	0 %	55820239
64	NC_006448	CTGGT	2	10	158469	158478	0 %	40 %	40 %	20 %	55820241
65	NC_006448	TGATT	2	10	159986	159995	20 %	60 %	20 %	0 %	55820243
66	NC_006448	GAGAT	2	10	161038	161047	40 %	20 %	40 %	0 %	55820243
67	NC_006448	ATTGA	2	10	161343	161352	40 %	40 %	20 %	0 %	55820243
68	NC_006448	AATGA	2	10	164411	164420	60 %	20 %	20 %	0 %	55820248
69	NC_006448	GGTTG	2	10	166098	166107	0 %	40 %	60 %	0 %	55820249
70	NC_006448	AAGTA	2	10	169182	169191	60 %	20 %	20 %	0 %	55820253
71	NC_006448	CGTAG	2	10	173499	173508	20 %	20 %	40 %	20 %	55820258
72	NC_006448	GTCTT	2	10	177568	177577	0 %	60 %	20 %	20 %	55820263
73	NC_006448	AAGTT	2	10	177919	177928	40 %	40 %	20 %	0 %	55820263
74	NC_006448	CTCAG	2	10	180714	180723	20 %	20 %	20 %	40 %	55820266
75	NC_006448	TTGAT	2	10	183737	183746	20 %	60 %	20 %	0 %	55820270
76	NC_006448	CAGAT	2	10	185647	185656	40 %	20 %	20 %	20 %	55820276
77	NC_006448	AGCTT	2	10	187559	187568	20 %	40 %	20 %	20 %	55820278
78	NC_006448	GGGAA	2	10	189434	189443	40 %	0 %	60 %	0 %	55820280
79	NC_006448	AGTAT	2	10	191787	191796	40 %	40 %	20 %	0 %	55820281
80	NC_006448	TCCAA	2	10	193415	193424	40 %	20 %	0 %	40 %	55820282
81	NC_006448	TTGCC	2	10	196009	196018	0 %	40 %	20 %	40 %	55820286
82	NC_006448	GAAAT	2	10	196957	196966	60 %	20 %	20 %	0 %	55820287
83	NC_006448	CAAGT	2	10	198649	198658	40 %	20 %	20 %	20 %	55820290
84	NC_006448	TTGGT	2	10	198874	198883	0 %	60 %	40 %	0 %	55820290
85	NC_006448	ATCGT	2	10	202730	202739	20 %	40 %	20 %	20 %	55820294
86	NC_006448	ATAAA	2	10	208375	208384	80 %	20 %	0 %	0 %	55820299
87	NC_006448	TGGCT	2	10	210092	210101	0 %	40 %	40 %	20 %	55820299
88	NC_006448	TTTCT	2	10	214729	214738	0 %	80 %	0 %	20 %	55820306
89	NC_006448	TGGTA	2	10	214882	214891	20 %	40 %	40 %	0 %	55820306
90	NC_006448	AGTTC	2	10	219866	219875	20 %	40 %	20 %	20 %	55820312
91	NC_006448	TTTGG	2	10	220947	220956	0 %	60 %	40 %	0 %	55820314
92	NC_006448	ATGGG	2	10	223413	223422	20 %	20 %	60 %	0 %	55820318
93	NC_006448	CAACA	2	10	223559	223568	60 %	0 %	0 %	40 %	55820318
94	NC_006448	GCAAC	2	10	223841	223850	40 %	0 %	20 %	40 %	55820318
95	NC_006448	GCTTT	2	10	225911	225920	0 %	60 %	20 %	20 %	55820319
96	NC_006448	TACAT	2	10	228700	228709	40 %	40 %	0 %	20 %	55820323
97	NC_006448	ATCAA	2	10	229195	229204	60 %	20 %	0 %	20 %	161611299
98	NC_006448	TGTCA	3	15	231838	231852	20 %	40 %	20 %	20 %	55820326
99	NC_006448	TGGTT	2	10	232942	232951	0 %	60 %	40 %	0 %	55820327
100	NC_006448	CCATG	2	10	233085	233094	20 %	20 %	20 %	40 %	55820327
101	NC_006448	AAATT	2	10	235761	235770	60 %	40 %	0 %	0 %	55820328
102	NC_006448	TGGAT	2	10	236577	236586	20 %	40 %	40 %	0 %	55820330
103	NC_006448	ATAAA	2	10	238831	238840	80 %	20 %	0 %	0 %	55820332
104	NC_006448	ATTGA	2	10	241894	241903	40 %	40 %	20 %	0 %	55820334
105	NC_006448	TTTGA	2	10	242167	242176	20 %	60 %	20 %	0 %	55820334
106	NC_006448	GAAGA	2	10	244048	244057	60 %	0 %	40 %	0 %	55820334
107	NC_006448	TCTTA	2	10	247949	247958	20 %	60 %	0 %	20 %	55820338
108	NC_006448	GCCAG	2	10	252607	252616	20 %	0 %	40 %	40 %	55820344
109	NC_006448	ATCTT	2	10	254395	254404	20 %	60 %	0 %	20 %	55820347
110	NC_006448	TTTGG	2	10	255087	255096	0 %	60 %	40 %	0 %	55820348
111	NC_006448	GATTT	2	10	256530	256539	20 %	60 %	20 %	0 %	55820349
112	NC_006448	TGTCC	2	10	258094	258103	0 %	40 %	20 %	40 %	55820352
113	NC_006448	GTGAT	2	10	259651	259660	20 %	40 %	40 %	0 %	55820354
114	NC_006448	TCCTT	2	10	260287	260296	0 %	60 %	0 %	40 %	55820355
115	NC_006448	ATGAA	2	10	270325	270334	60 %	20 %	20 %	0 %	55820367
116	NC_006448	TTGGT	2	10	271312	271321	0 %	60 %	40 %	0 %	55820368
117	NC_006448	TATGG	2	10	272377	272386	20 %	40 %	40 %	0 %	55820370
118	NC_006448	CTTTT	2	10	274232	274241	0 %	80 %	0 %	20 %	55820374
119	NC_006448	AGTAG	2	10	274349	274358	40 %	20 %	40 %	0 %	55820374
120	NC_006448	GTTTA	2	10	275747	275756	20 %	60 %	20 %	0 %	55820375
121	NC_006448	TGGTA	2	10	275823	275832	20 %	40 %	40 %	0 %	55820375
122	NC_006448	TTCTT	2	10	283083	283092	0 %	80 %	0 %	20 %	55820385
123	NC_006448	GATGT	2	10	284923	284932	20 %	40 %	40 %	0 %	55820387
124	NC_006448	ATTTA	2	10	285669	285678	40 %	60 %	0 %	0 %	55820387
125	NC_006448	ATTTT	2	10	286899	286908	20 %	80 %	0 %	0 %	55820387
126	NC_006448	ATTCC	2	10	287320	287329	20 %	40 %	0 %	40 %	55820387
127	NC_006448	TTGAT	2	10	288964	288973	20 %	60 %	20 %	0 %	55820388
128	NC_006448	AAACT	2	10	289792	289801	60 %	20 %	0 %	20 %	55820389
129	NC_006448	CTTTT	2	10	290489	290498	0 %	80 %	0 %	20 %	55820389
130	NC_006448	TTGAT	2	10	290999	291008	20 %	60 %	20 %	0 %	55820390
131	NC_006448	TATCG	2	10	295742	295751	20 %	40 %	20 %	20 %	55820397
132	NC_006448	GTCTT	2	10	297098	297107	0 %	60 %	20 %	20 %	55820398
133	NC_006448	TTTGG	2	10	297915	297924	0 %	60 %	40 %	0 %	55820399
134	NC_006448	CAATT	2	10	298750	298759	40 %	40 %	0 %	20 %	55820401
135	NC_006448	GACTT	2	10	299756	299765	20 %	40 %	20 %	20 %	55820404
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