MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 4632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006448	AGTA	2	8	534	541	50 %	25 %	25 %	0 %	55820104
2	NC_006448	GTTT	2	8	761	768	0 %	75 %	25 %	0 %	55820104
3	NC_006448	TGAA	2	8	964	971	50 %	25 %	25 %	0 %	55820104
4	NC_006448	TGCT	2	8	1489	1496	0 %	50 %	25 %	25 %	55820104
5	NC_006448	ATTA	2	8	1905	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	55820105
6	NC_006448	TGAA	2	8	2636	2643	50 %	25 %	25 %	0 %	55820105
7	NC_006448	ACTT	2	8	2698	2705	25 %	50 %	0 %	25 %	55820105
8	NC_006448	AATT	2	8	2813	2820	50 %	50 %	0 %	0 %	55820105
9	NC_006448	AAAT	3	12	3286	3297	75 %	25 %	0 %	0 %	55820107
10	NC_006448	TCGT	2	8	3603	3610	0 %	50 %	25 %	25 %	55820107
11	NC_006448	ATCT	2	8	4686	4693	25 %	50 %	0 %	25 %	55820108
12	NC_006448	TACT	2	8	4965	4972	25 %	50 %	0 %	25 %	55820108
13	NC_006448	GGAA	2	8	5482	5489	50 %	0 %	50 %	0 %	55820109
14	NC_006448	CAGC	2	8	6090	6097	25 %	0 %	25 %	50 %	55820109
15	NC_006448	CAAA	2	8	6743	6750	75 %	0 %	0 %	25 %	55820109
16	NC_006448	AAGC	2	8	6755	6762	50 %	0 %	25 %	25 %	55820109
17	NC_006448	TTGG	2	8	6960	6967	0 %	50 %	50 %	0 %	55820109
18	NC_006448	CCTT	2	8	8105	8112	0 %	50 %	0 %	50 %	55820109
19	NC_006448	TTGA	2	8	8208	8215	25 %	50 %	25 %	0 %	55820109
20	NC_006448	AAGA	2	8	8463	8470	75 %	0 %	25 %	0 %	55820109
21	NC_006448	TAAG	2	8	8561	8568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006448	GAAG	2	8	9191	9198	50 %	0 %	50 %	0 %	55820111
23	NC_006448	TCTA	2	8	9336	9343	25 %	50 %	0 %	25 %	55820111
24	NC_006448	TAGC	2	8	9620	9627	25 %	25 %	25 %	25 %	55820112
25	NC_006448	ATTA	2	8	9825	9832	50 %	50 %	0 %	0 %	55820112
26	NC_006448	GTCT	2	8	10232	10239	0 %	50 %	25 %	25 %	55820112
27	NC_006448	ACCT	2	8	11355	11362	25 %	25 %	0 %	50 %	55820113
28	NC_006448	CAGA	2	8	11499	11506	50 %	0 %	25 %	25 %	55820113
29	NC_006448	TCAA	2	8	11578	11585	50 %	25 %	0 %	25 %	55820113
30	NC_006448	AAGC	2	8	12490	12497	50 %	0 %	25 %	25 %	55820114
31	NC_006448	TATG	2	8	12561	12568	25 %	50 %	25 %	0 %	55820114
32	NC_006448	CCTT	2	8	12632	12639	0 %	50 %	0 %	50 %	55820114
33	NC_006448	CCTT	2	8	13115	13122	0 %	50 %	0 %	50 %	55820115
34	NC_006448	GATG	2	8	13631	13638	25 %	25 %	50 %	0 %	55820115
35	NC_006448	AACC	2	8	13676	13683	50 %	0 %	0 %	50 %	55820115
36	NC_006448	AAGA	2	8	13980	13987	75 %	0 %	25 %	0 %	55820115
37	NC_006448	GTTG	2	8	15096	15103	0 %	50 %	50 %	0 %	55820117
38	NC_006448	GTCC	2	8	15402	15409	0 %	25 %	25 %	50 %	55820117
39	NC_006448	GATA	2	8	15416	15423	50 %	25 %	25 %	0 %	55820117
40	NC_006448	TCTT	2	8	15427	15434	0 %	75 %	0 %	25 %	55820117
41	NC_006448	TTCT	2	8	15969	15976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_006448	AACT	2	8	16068	16075	50 %	25 %	0 %	25 %	55820119
43	NC_006448	GATT	2	8	16182	16189	25 %	50 %	25 %	0 %	55820119
44	NC_006448	TGAT	2	8	16260	16267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006448	CCTA	2	8	16501	16508	25 %	25 %	0 %	50 %	55820120
46	NC_006448	TCTT	2	8	17241	17248	0 %	75 %	0 %	25 %	55820122
47	NC_006448	TCAC	2	8	17294	17301	25 %	25 %	0 %	50 %	55820122
48	NC_006448	AATT	2	8	17417	17424	50 %	50 %	0 %	0 %	55820122
49	NC_006448	CAGT	2	8	17438	17445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_006448	ATTT	2	8	18017	18024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006448	GTGA	2	8	18227	18234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006448	AGCG	2	8	18398	18405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_006448	TGGT	2	8	19063	19070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006448	AGCC	2	8	19279	19286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_006448	GTAA	2	8	19554	19561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006448	ATAG	2	8	19568	19575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006448	GCGA	2	8	19883	19890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_006448	ATTC	2	8	20748	20755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_006448	CTAA	2	8	21102	21109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_006448	CTGA	2	8	21375	21382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_006448	TAGG	2	8	21757	21764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006448	GCGT	2	8	23742	23749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_006448	GGTT	2	8	24929	24936	0 %	50 %	50 %	0 %	55820123
64	NC_006448	TGAT	2	8	25006	25013	25 %	50 %	25 %	0 %	55820123
65	NC_006448	CTAT	2	8	25236	25243	25 %	50 %	0 %	25 %	55820124
66	NC_006448	TTGT	2	8	25289	25296	0 %	75 %	25 %	0 %	55820124
67	NC_006448	TAAA	2	8	25620	25627	75 %	25 %	0 %	0 %	55820124
68	NC_006448	ATTT	2	8	27281	27288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006448	CAAT	2	8	27605	27612	50 %	25 %	0 %	25 %	55820126
70	NC_006448	GTTG	2	8	27684	27691	0 %	50 %	50 %	0 %	55820126
71	NC_006448	TTGA	2	8	28012	28019	25 %	50 %	25 %	0 %	55820126
72	NC_006448	TGAT	2	8	28025	28032	25 %	50 %	25 %	0 %	55820126
73	NC_006448	TGAT	2	8	28205	28212	25 %	50 %	25 %	0 %	55820126
74	NC_006448	TTGT	2	8	28540	28547	0 %	75 %	25 %	0 %	55820127
75	NC_006448	CAAT	2	8	29492	29499	50 %	25 %	0 %	25 %	55820129
76	NC_006448	CCAA	2	8	29945	29952	50 %	0 %	0 %	50 %	55820129
77	NC_006448	AACT	2	8	30051	30058	50 %	25 %	0 %	25 %	55820129
78	NC_006448	GAAA	2	8	31791	31798	75 %	0 %	25 %	0 %	55820131
79	NC_006448	AATG	2	8	32323	32330	50 %	25 %	25 %	0 %	55820131
80	NC_006448	GTTT	2	8	33046	33053	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006448	TTCT	2	8	33402	33409	0 %	75 %	0 %	25 %	55820133
82	NC_006448	TTGA	2	8	33622	33629	25 %	50 %	25 %	0 %	55820133
83	NC_006448	TTTG	2	8	34021	34028	0 %	75 %	25 %	0 %	55820134
84	NC_006448	CTTT	2	8	34116	34123	0 %	75 %	0 %	25 %	55820134
85	NC_006448	TTCA	2	8	34463	34470	25 %	50 %	0 %	25 %	55820134
86	NC_006448	TACT	2	8	34528	34535	25 %	50 %	0 %	25 %	55820134
87	NC_006448	GCAA	2	8	34618	34625	50 %	0 %	25 %	25 %	55820134
88	NC_006448	GATT	2	8	36370	36377	25 %	50 %	25 %	0 %	55820134
89	NC_006448	TGAA	2	8	36906	36913	50 %	25 %	25 %	0 %	55820134
90	NC_006448	CCAA	2	8	37206	37213	50 %	0 %	0 %	50 %	55820134
91	NC_006448	CAAG	2	8	37464	37471	50 %	0 %	25 %	25 %	55820134
92	NC_006448	TCGT	2	8	37719	37726	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_006448	CCAA	2	8	38743	38750	50 %	0 %	0 %	50 %	55820135
94	NC_006448	ATTG	2	8	38980	38987	25 %	50 %	25 %	0 %	55820135
95	NC_006448	ACTT	2	8	39041	39048	25 %	50 %	0 %	25 %	55820135
96	NC_006448	TTGA	2	8	39062	39069	25 %	50 %	25 %	0 %	55820135
97	NC_006448	TGCT	2	8	39444	39451	0 %	50 %	25 %	25 %	55820136
98	NC_006448	GTAT	2	8	39669	39676	25 %	50 %	25 %	0 %	55820136
99	NC_006448	ACTC	2	8	39810	39817	25 %	25 %	0 %	50 %	55820136
100	NC_006448	GTTT	2	8	40486	40493	0 %	75 %	25 %	0 %	55820137
101	NC_006448	TGAA	2	8	40824	40831	50 %	25 %	25 %	0 %	55820138
102	NC_006448	AGAA	2	8	40850	40857	75 %	0 %	25 %	0 %	55820138
103	NC_006448	TTGG	2	8	40951	40958	0 %	50 %	50 %	0 %	55820138
104	NC_006448	AAAG	2	8	42027	42034	75 %	0 %	25 %	0 %	55820138
105	NC_006448	CCAA	2	8	42065	42072	50 %	0 %	0 %	50 %	55820138
106	NC_006448	TCCG	2	8	42201	42208	0 %	25 %	25 %	50 %	55820138
107	NC_006448	CTTT	2	8	42474	42481	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_006448	CAAC	2	8	42658	42665	50 %	0 %	0 %	50 %	55820139
109	NC_006448	GATT	2	8	42714	42721	25 %	50 %	25 %	0 %	55820139
110	NC_006448	TGAT	2	8	42792	42799	25 %	50 %	25 %	0 %	55820139
111	NC_006448	AATC	2	8	43207	43214	50 %	25 %	0 %	25 %	55820140
112	NC_006448	TCAC	2	8	43594	43601	25 %	25 %	0 %	50 %	55820141
113	NC_006448	TGGT	2	8	44027	44034	0 %	50 %	50 %	0 %	55820142
114	NC_006448	ACCT	2	8	44671	44678	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_006448	AGCA	2	8	45449	45456	50 %	0 %	25 %	25 %	55820143
116	NC_006448	GCGA	2	8	46254	46261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_006448	AGTT	2	8	46441	46448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006448	CTAT	2	8	47118	47125	25 %	50 %	0 %	25 %	55820145
119	NC_006448	CAGA	2	8	47724	47731	50 %	0 %	25 %	25 %	55820145
120	NC_006448	AAAC	2	8	48307	48314	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_006448	CTAT	2	8	49241	49248	25 %	50 %	0 %	25 %	55820147
122	NC_006448	AATA	2	8	49656	49663	75 %	25 %	0 %	0 %	55820148
123	NC_006448	ACAA	2	8	49921	49928	75 %	0 %	0 %	25 %	55820148
124	NC_006448	TTGA	2	8	50559	50566	25 %	50 %	25 %	0 %	55820148
125	NC_006448	TTGA	2	8	50685	50692	25 %	50 %	25 %	0 %	55820148
126	NC_006448	CTCA	2	8	50811	50818	25 %	25 %	0 %	50 %	55820148
127	NC_006448	AGGA	2	8	51015	51022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006448	ATGA	2	8	51111	51118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006448	AATC	2	8	51546	51553	50 %	25 %	0 %	25 %	55820149
130	NC_006448	TTGA	2	8	51711	51718	25 %	50 %	25 %	0 %	55820149
131	NC_006448	CGGT	2	8	51772	51779	0 %	25 %	50 %	25 %	55820149
132	NC_006448	GCTT	2	8	51916	51923	0 %	50 %	25 %	25 %	55820149
133	NC_006448	CAAG	2	8	52256	52263	50 %	0 %	25 %	25 %	55820149
134	NC_006448	CCTT	2	8	52376	52383	0 %	50 %	0 %	50 %	55820149
135	NC_006448	TGTA	2	8	53281	53288	25 %	50 %	25 %	0 %	55820150
136	NC_006448	AGAT	2	8	53323	53330	50 %	25 %	25 %	0 %	55820150
137	NC_006448	CAAG	2	8	53557	53564	50 %	0 %	25 %	25 %	55820150
138	NC_006448	CTTT	2	8	53884	53891	0 %	75 %	0 %	25 %	55820150
139	NC_006448	CATC	2	8	53911	53918	25 %	25 %	0 %	50 %	55820150
140	NC_006448	TGAT	2	8	54234	54241	25 %	50 %	25 %	0 %	55820150
141	NC_006448	CTGG	2	8	55415	55422	0 %	25 %	50 %	25 %	55820152
142	NC_006448	GCAG	2	8	55501	55508	25 %	0 %	50 %	25 %	55820152
143	NC_006448	TTCG	2	8	56818	56825	0 %	50 %	25 %	25 %	55820153
144	NC_006448	AGCG	2	8	57646	57653	25 %	0 %	50 %	25 %	55820153
145	NC_006448	TTGA	2	8	58248	58255	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_006448	AGTG	2	8	58415	58422	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006448	TAGC	2	8	58465	58472	25 %	25 %	25 %	25 %	55820154
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261	NC_006448	TTTA	2	8	101433	101440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_006448	TTTA	2	8	101446	101453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_006448	TAGC	2	8	101454	101461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
264	NC_006448	ATCA	2	8	101688	101695	50 %	25 %	0 %	25 %	55820194
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270	NC_006448	CAGA	2	8	102371	102378	50 %	0 %	25 %	25 %	55820194
271	NC_006448	GGTA	2	8	102550	102557	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
272	NC_006448	CACT	2	8	102938	102945	25 %	25 %	0 %	50 %	55820195
273	NC_006448	CAAC	2	8	103325	103332	50 %	0 %	0 %	50 %	55820196
274	NC_006448	ATTC	2	8	103902	103909	25 %	50 %	0 %	25 %	55820197
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283	NC_006448	AATT	2	8	106898	106905	50 %	50 %	0 %	0 %	55820200
284	NC_006448	ATAA	2	8	107040	107047	75 %	25 %	0 %	0 %	55820200
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