MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006448	TAAG	2	8	8561	8568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006448	TTCT	2	8	15969	15976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_006448	TGAT	2	8	16260	16267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006448	CAGT	2	8	17438	17445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_006448	ATTT	2	8	18017	18024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006448	GTGA	2	8	18227	18234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006448	AGCG	2	8	18398	18405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_006448	TGGT	2	8	19063	19070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006448	AGCC	2	8	19279	19286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006448	GTAA	2	8	19554	19561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006448	ATAG	2	8	19568	19575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006448	GCGA	2	8	19883	19890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_006448	ATTC	2	8	20748	20755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006448	CTAA	2	8	21102	21109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_006448	CTGA	2	8	21375	21382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_006448	TAGG	2	8	21757	21764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006448	GCGT	2	8	23742	23749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006448	ATTT	2	8	27281	27288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006448	GTTT	2	8	33046	33053	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006448	TCGT	2	8	37719	37726	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006448	CTTT	2	8	42474	42481	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006448	ACCT	2	8	44671	44678	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006448	GCGA	2	8	46254	46261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006448	AGTT	2	8	46441	46448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006448	AAAC	2	8	48307	48314	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_006448	AGGA	2	8	51015	51022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006448	ATGA	2	8	51111	51118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006448	TTGA	2	8	58248	58255	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006448	AGAT	2	8	58306	58313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006448	AGTG	2	8	58415	58422	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006448	AGTC	2	8	59094	59101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_006448	AAAG	2	8	62079	62086	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006448	TTGA	2	8	63261	63268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006448	AAAC	2	8	63296	63303	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_006448	AGAA	2	8	64635	64642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006448	ATTT	2	8	66998	67005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006448	GTGA	2	8	67208	67215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006448	AGCG	2	8	67379	67386	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_006448	TGGT	2	8	68044	68051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006448	AGCC	2	8	68260	68267	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_006448	GTAA	2	8	68535	68542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006448	ATAG	2	8	68549	68556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006448	GCGA	2	8	68864	68871	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_006448	ATTC	2	8	69729	69736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_006448	CTAA	2	8	70083	70090	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_006448	CTGA	2	8	70356	70363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_006448	TAGG	2	8	70738	70745	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006448	GCGT	2	8	72125	72132	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_006448	ATTT	2	8	72314	72321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006448	TCCC	2	8	72396	72403	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_006448	AGTC	2	8	77223	77230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_006448	TTTG	2	8	77242	77249	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006448	TGGG	2	8	82885	82892	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006448	AAAT	2	8	83802	83809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006448	AATC	2	8	84902	84909	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_006448	CAGA	2	8	89937	89944	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_006448	ATGA	2	8	91516	91523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006448	GAAA	2	8	95282	95289	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006448	AATT	2	8	95640	95647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006448	ATTT	2	8	98406	98413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006448	TAGT	2	8	101389	101396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006448	TTTA	2	8	101433	101440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006448	TTTA	2	8	101446	101453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006448	TAGC	2	8	101454	101461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_006448	GGTA	2	8	102550	102557	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006448	GAAT	2	8	104483	104490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006448	AAAT	2	8	104509	104516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006448	ATTG	2	8	104676	104683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006448	ATTT	2	8	109913	109920	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006448	TTAG	2	8	109952	109959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006448	TTAC	2	8	110098	110105	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_006448	ATTG	2	8	112535	112542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006448	TTAT	2	8	112850	112857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006448	TAAA	2	8	114103	114110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006448	GATT	2	8	114133	114140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006448	ATTA	2	8	114200	114207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006448	AGAC	2	8	114608	114615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_006448	TAAA	2	8	115007	115014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006448	GCTA	2	8	119090	119097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_006448	AGAA	2	8	123181	123188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006448	AGAA	2	8	125099	125106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006448	AATA	2	8	125309	125316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006448	AGAT	2	8	125375	125382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006448	ATTT	2	8	129242	129249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006448	GTGA	2	8	129452	129459	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006448	AGCG	2	8	129623	129630	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_006448	TGGT	2	8	130288	130295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006448	AGCC	2	8	130504	130511	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_006448	GTAA	2	8	130779	130786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006448	ATAG	2	8	130793	130800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006448	GCGA	2	8	131108	131115	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_006448	ATTC	2	8	131973	131980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_006448	CTAA	2	8	132327	132334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_006448	CTGA	2	8	132600	132607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_006448	TAGG	2	8	132982	132989	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006448	ATTT	2	8	135049	135056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006448	GTGA	2	8	135259	135266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006448	AGCG	2	8	135430	135437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_006448	TGGT	2	8	136095	136102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006448	AGCC	2	8	136311	136318	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_006448	GTAA	2	8	136586	136593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006448	ATAG	2	8	136600	136607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006448	GCGA	2	8	136915	136922	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_006448	ATTC	2	8	137780	137787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_006448	CTAA	2	8	138134	138141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_006448	CTGA	2	8	138407	138414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_006448	TAGG	2	8	138789	138796	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006448	AATC	2	8	140581	140588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_006448	TTAA	2	8	143693	143700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006448	TATG	2	8	144057	144064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006448	CAAG	2	8	146277	146284	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_006448	GTGA	2	8	146327	146334	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006448	ATTG	2	8	147083	147090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006448	GTGG	2	8	147487	147494	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006448	TTAT	2	8	147534	147541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006448	GTTT	2	8	148153	148160	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006448	AATC	2	8	151442	151449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_006448	AAGA	2	8	153169	153176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006448	TTAC	2	8	159143	159150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_006448	TTAA	2	8	159170	159177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006448	GAAG	2	8	159185	159192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006448	TAGA	2	8	161976	161983	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006448	AAAG	2	8	162177	162184	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006448	TTCT	2	8	162730	162737	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_006448	AACT	2	8	163069	163076	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_006448	AATA	2	8	164032	164039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006448	TGAA	2	8	168624	168631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006448	AGCT	2	8	168701	168708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_006448	CCTT	2	8	169420	169427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_006448	AAAG	2	8	169467	169474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006448	ATCA	2	8	169941	169948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_006448	CAAA	2	8	170195	170202	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_006448	TAAA	2	8	180294	180301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006448	GATT	2	8	181847	181854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006448	ATTG	2	8	186521	186528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006448	TCAG	2	8	195818	195825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_006448	TGTC	2	8	195836	195843	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_006448	ATAA	2	8	200119	200126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006448	TTGT	2	8	202489	202496	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006448	ATCT	2	8	207909	207916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_006448	ATAA	2	8	208248	208255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006448	GAGT	2	8	211639	211646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006448	AACT	2	8	213368	213375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_006448	TTAA	2	8	214551	214558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006448	GTTT	2	8	214912	214919	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006448	TGTT	2	8	214963	214970	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006448	ATTT	2	8	215039	215046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006448	GTTT	2	8	215283	215290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006448	GAGT	2	8	216299	216306	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006448	TGCT	2	8	219988	219995	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_006448	CATT	2	8	220078	220085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_006448	AAAG	2	8	220143	220150	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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