MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 2228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006448	AC	3	6	2426	2431	50 %	0 %	0 %	50 %	55820105
2	NC_006448	TC	3	6	5883	5888	0 %	50 %	0 %	50 %	55820109
3	NC_006448	CA	3	6	6161	6166	50 %	0 %	0 %	50 %	55820109
4	NC_006448	TC	3	6	6668	6673	0 %	50 %	0 %	50 %	55820109
5	NC_006448	TC	3	6	8347	8352	0 %	50 %	0 %	50 %	55820109
6	NC_006448	TA	3	6	8573	8578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006448	TG	3	6	12252	12257	0 %	50 %	50 %	0 %	55820114
8	NC_006448	GA	3	6	12410	12415	50 %	0 %	50 %	0 %	55820114
9	NC_006448	CT	3	6	14061	14066	0 %	50 %	0 %	50 %	55820115
10	NC_006448	AC	3	6	14482	14487	50 %	0 %	0 %	50 %	55820115
11	NC_006448	TC	3	6	14729	14734	0 %	50 %	0 %	50 %	55820116
12	NC_006448	AT	3	6	16094	16099	50 %	50 %	0 %	0 %	55820119
13	NC_006448	AT	3	6	16171	16176	50 %	50 %	0 %	0 %	55820119
14	NC_006448	CA	3	6	16976	16981	50 %	0 %	0 %	50 %	55820122
15	NC_006448	TC	3	6	17039	17044	0 %	50 %	0 %	50 %	55820122
16	NC_006448	GA	3	6	17593	17598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006448	AG	3	6	17683	17688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006448	AG	3	6	17890	17895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006448	AT	3	6	18527	18532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006448	CT	3	6	18558	18563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006448	AC	3	6	19048	19053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006448	AC	3	6	19217	19222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006448	AG	3	6	19990	19995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006448	CT	3	6	20104	20109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006448	TC	3	6	20482	20487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006448	AT	3	6	20682	20687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006448	GA	3	6	21021	21026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006448	TA	3	6	21075	21080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006448	GA	3	6	21316	21321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006448	CT	3	6	21432	21437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_006448	GA	3	6	21639	21644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006448	GA	3	6	22454	22459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006448	AT	3	6	22554	22559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006448	AT	3	6	22983	22988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006448	TA	3	6	23574	23579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006448	AT	3	6	23663	23668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006448	AG	3	6	28365	28370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006448	AG	3	6	32635	32640	50 %	0 %	50 %	0 %	55820132
39	NC_006448	AT	3	6	33040	33045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006448	TG	3	6	33063	33068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006448	AT	3	6	34042	34047	50 %	50 %	0 %	0 %	55820134
42	NC_006448	AT	3	6	34636	34641	50 %	50 %	0 %	0 %	55820134
43	NC_006448	TG	3	6	35411	35416	0 %	50 %	50 %	0 %	55820134
44	NC_006448	TA	3	6	37758	37763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006448	TC	3	6	37897	37902	0 %	50 %	0 %	50 %	55820135
46	NC_006448	TC	3	6	37945	37950	0 %	50 %	0 %	50 %	55820135
47	NC_006448	CT	3	6	38786	38791	0 %	50 %	0 %	50 %	55820135
48	NC_006448	CA	3	6	38996	39001	50 %	0 %	0 %	50 %	55820135
49	NC_006448	TG	3	6	39110	39115	0 %	50 %	50 %	0 %	55820135
50	NC_006448	TG	3	6	39488	39493	0 %	50 %	50 %	0 %	55820136
51	NC_006448	TG	3	6	39498	39503	0 %	50 %	50 %	0 %	55820136
52	NC_006448	TG	3	6	39617	39622	0 %	50 %	50 %	0 %	55820136
53	NC_006448	CA	3	6	41409	41414	50 %	0 %	0 %	50 %	55820138
54	NC_006448	AT	3	6	42626	42631	50 %	50 %	0 %	0 %	55820139
55	NC_006448	AT	3	6	42703	42708	50 %	50 %	0 %	0 %	55820139
56	NC_006448	AT	3	6	44185	44190	50 %	50 %	0 %	0 %	55820142
57	NC_006448	TC	3	6	44723	44728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_006448	AC	3	6	44837	44842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_006448	TC	4	8	45548	45555	0 %	50 %	0 %	50 %	55820143
60	NC_006448	GT	3	6	47178	47183	0 %	50 %	50 %	0 %	55820145
61	NC_006448	GT	3	6	47566	47571	0 %	50 %	50 %	0 %	55820145
62	NC_006448	CT	3	6	47681	47686	0 %	50 %	0 %	50 %	55820145
63	NC_006448	CT	3	6	47771	47776	0 %	50 %	0 %	50 %	55820145
64	NC_006448	CA	3	6	47844	47849	50 %	0 %	0 %	50 %	55820145
65	NC_006448	AC	3	6	47895	47900	50 %	0 %	0 %	50 %	55820145
66	NC_006448	GA	3	6	48231	48236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006448	TC	4	8	48260	48267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_006448	CA	3	6	48603	48608	50 %	0 %	0 %	50 %	55820146
69	NC_006448	TC	3	6	50512	50517	0 %	50 %	0 %	50 %	55820148
70	NC_006448	AT	3	6	51257	51262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006448	TA	3	6	52684	52689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006448	GT	3	6	53128	53133	0 %	50 %	50 %	0 %	55820150
73	NC_006448	AG	3	6	54865	54870	50 %	0 %	50 %	0 %	55820151
74	NC_006448	TC	3	6	56219	56224	0 %	50 %	0 %	50 %	55820153
75	NC_006448	AG	3	6	56807	56812	50 %	0 %	50 %	0 %	55820153
76	NC_006448	AC	3	6	57819	57824	50 %	0 %	0 %	50 %	55820153
77	NC_006448	GA	3	6	57994	57999	50 %	0 %	50 %	0 %	55820153
78	NC_006448	TC	4	8	58075	58082	0 %	50 %	0 %	50 %	55820153
79	NC_006448	TG	4	8	59566	59573	0 %	50 %	50 %	0 %	55820156
80	NC_006448	TA	3	6	60425	60430	50 %	50 %	0 %	0 %	55820157
81	NC_006448	AG	3	6	60632	60637	50 %	0 %	50 %	0 %	55820157
82	NC_006448	TG	3	6	61320	61325	0 %	50 %	50 %	0 %	55820157
83	NC_006448	TA	3	6	62054	62059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006448	AT	3	6	62174	62179	50 %	50 %	0 %	0 %	55820159
85	NC_006448	AT	3	6	62654	62659	50 %	50 %	0 %	0 %	55820159
86	NC_006448	CA	3	6	63461	63466	50 %	0 %	0 %	50 %	55820161
87	NC_006448	AT	3	6	64549	64554	50 %	50 %	0 %	0 %	55820161
88	NC_006448	AC	3	6	65738	65743	50 %	0 %	0 %	50 %	55820162
89	NC_006448	AG	3	6	65972	65977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006448	GA	3	6	66575	66580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006448	AG	3	6	66664	66669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006448	AG	3	6	66871	66876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006448	AT	3	6	67508	67513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006448	CT	3	6	67539	67544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_006448	AC	3	6	68029	68034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_006448	AC	3	6	68198	68203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_006448	AG	3	6	68971	68976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006448	CT	3	6	69085	69090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_006448	TC	3	6	69463	69468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_006448	AT	3	6	69663	69668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006448	GA	3	6	70002	70007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006448	TA	3	6	70056	70061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006448	GA	3	6	70297	70302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006448	CT	3	6	70413	70418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_006448	GA	3	6	70620	70625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006448	GA	3	6	71435	71440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006448	AT	3	6	71535	71540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006448	TA	3	6	72772	72777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006448	AT	3	6	73015	73020	50 %	50 %	0 %	0 %	55820164
110	NC_006448	AG	3	6	73190	73195	50 %	0 %	50 %	0 %	55820164
111	NC_006448	GA	3	6	73205	73210	50 %	0 %	50 %	0 %	55820164
112	NC_006448	CT	3	6	73297	73302	0 %	50 %	0 %	50 %	55820164
113	NC_006448	AT	3	6	73531	73536	50 %	50 %	0 %	0 %	55820164
114	NC_006448	CT	3	6	74817	74822	0 %	50 %	0 %	50 %	55820164
115	NC_006448	AT	3	6	75428	75433	50 %	50 %	0 %	0 %	55820164
116	NC_006448	GA	3	6	77213	77218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006448	CA	3	6	77430	77435	50 %	0 %	0 %	50 %	55820165
118	NC_006448	TA	3	6	78907	78912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006448	GA	3	6	79274	79279	50 %	0 %	50 %	0 %	55820167
120	NC_006448	GA	3	6	80463	80468	50 %	0 %	50 %	0 %	55820170
121	NC_006448	TG	3	6	80526	80531	0 %	50 %	50 %	0 %	55820170
122	NC_006448	AT	3	6	81022	81027	50 %	50 %	0 %	0 %	55820172
123	NC_006448	AC	3	6	82298	82303	50 %	0 %	0 %	50 %	55820174
124	NC_006448	AC	3	6	82648	82653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_006448	CA	3	6	83443	83448	50 %	0 %	0 %	50 %	55820175
126	NC_006448	GA	4	8	85008	85015	50 %	0 %	50 %	0 %	55820177
127	NC_006448	AT	3	6	85722	85727	50 %	50 %	0 %	0 %	55820178
128	NC_006448	AG	3	6	85839	85844	50 %	0 %	50 %	0 %	55820178
129	NC_006448	AT	3	6	86152	86157	50 %	50 %	0 %	0 %	55820179
130	NC_006448	GC	3	6	87160	87165	0 %	0 %	50 %	50 %	55820179
131	NC_006448	CT	3	6	90953	90958	0 %	50 %	0 %	50 %	55820182
132	NC_006448	TC	3	6	91388	91393	0 %	50 %	0 %	50 %	55820182
133	NC_006448	TC	3	6	91927	91932	0 %	50 %	0 %	50 %	55820183
134	NC_006448	AC	3	6	93562	93567	50 %	0 %	0 %	50 %	55820183
135	NC_006448	GA	3	6	93858	93863	50 %	0 %	50 %	0 %	55820184
136	NC_006448	TA	3	6	95506	95511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006448	GA	3	6	96236	96241	50 %	0 %	50 %	0 %	55820186
138	NC_006448	CT	3	6	98113	98118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_006448	GT	3	6	98695	98700	0 %	50 %	50 %	0 %	55820190
140	NC_006448	TC	3	6	98720	98725	0 %	50 %	0 %	50 %	55820190
141	NC_006448	TG	3	6	99365	99370	0 %	50 %	50 %	0 %	55820191
142	NC_006448	AT	3	6	99729	99734	50 %	50 %	0 %	0 %	55820192
143	NC_006448	TC	3	6	100122	100127	0 %	50 %	0 %	50 %	55820192
144	NC_006448	CT	3	6	101130	101135	0 %	50 %	0 %	50 %	55820193
145	NC_006448	TA	4	8	102691	102698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006448	CA	3	6	103042	103047	50 %	0 %	0 %	50 %	55820195
147	NC_006448	TG	3	6	103842	103847	0 %	50 %	50 %	0 %	55820197
148	NC_006448	TA	3	6	104899	104904	50 %	50 %	0 %	0 %	55820200
149	NC_006448	GT	3	6	105274	105279	0 %	50 %	50 %	0 %	55820200
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