MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006397	TAGA	2	8	62	69	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006397	ATGA	2	8	617	624	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006397	CCTA	2	8	1378	1385	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006397	GTTG	2	8	1806	1813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006397	TCCA	2	8	2227	2234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006397	CGTT	2	8	3065	3072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006397	CAGT	2	8	3873	3880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_006397	GCGG	2	8	4146	4153	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_006397	TTCC	2	8	4289	4296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006397	AAAT	2	8	5904	5911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006397	TGGT	2	8	6770	6777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006397	GCGG	2	8	7114	7121	0 %	0 %	75 %	25 %	55380076
13	NC_006397	GCGA	2	8	7276	7283	25 %	0 %	50 %	25 %	55380076
14	NC_006397	TGAG	2	8	8077	8084	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006397	GAAA	2	8	8669	8676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006397	AGTT	2	8	8999	9006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006397	GAAC	2	8	9320	9327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_006397	CTGG	3	12	12032	12043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006397	TCGA	2	8	12585	12592	25 %	25 %	25 %	25 %	55380080
20	NC_006397	GAAC	2	8	13142	13149	50 %	0 %	25 %	25 %	55380080
21	NC_006397	ACGC	2	8	13184	13191	25 %	0 %	25 %	50 %	55380080
22	NC_006397	CACG	2	8	13205	13212	25 %	0 %	25 %	50 %	55380080
23	NC_006397	GTTG	2	8	13712	13719	0 %	50 %	50 %	0 %	55380081
24	NC_006397	GCAA	2	8	14450	14457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_006397	ACGA	2	8	14598	14605	50 %	0 %	25 %	25 %	55380082
26	NC_006397	GCTG	2	8	15287	15294	0 %	25 %	50 %	25 %	55380084
27	NC_006397	GACA	2	8	15823	15830	50 %	0 %	25 %	25 %	55380084
28	NC_006397	GACG	2	8	16596	16603	25 %	0 %	50 %	25 %	55380085
29	NC_006397	CGGA	2	8	16708	16715	25 %	0 %	50 %	25 %	55380085
30	NC_006397	GACC	2	8	16833	16840	25 %	0 %	25 %	50 %	55380085
31	NC_006397	CAAG	2	8	17391	17398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_006397	TCTG	2	8	18231	18238	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_006397	GGCC	2	8	18461	18468	0 %	0 %	50 %	50 %	55380088
34	NC_006397	TTTG	2	8	18643	18650	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006397	CGGC	2	8	18758	18765	0 %	0 %	50 %	50 %	55380089
36	NC_006397	TCAA	2	8	18792	18799	50 %	25 %	0 %	25 %	55380089
37	NC_006397	ACAG	2	8	18807	18814	50 %	0 %	25 %	25 %	55380089
38	NC_006397	TCTG	2	8	18954	18961	0 %	50 %	25 %	25 %	55380089
39	NC_006397	CGGT	2	8	19607	19614	0 %	25 %	50 %	25 %	55380090
40	NC_006397	AGCG	2	8	20501	20508	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006397	GGGA	2	8	22204	22211	25 %	0 %	75 %	0 %	55380093
42	NC_006397	TGAC	2	8	22247	22254	25 %	25 %	25 %	25 %	55380093
43	NC_006397	ACGG	2	8	22544	22551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_006397	ACAT	2	8	22758	22765	50 %	25 %	0 %	25 %	55380094
45	NC_006397	CAAC	2	8	23341	23348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_006397	ACGG	2	8	24610	24617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_006397	GATG	2	8	24678	24685	25 %	25 %	50 %	0 %	55380096
48	NC_006397	ATAA	2	8	25251	25258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006397	TGGT	2	8	25398	25405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006397	GTCA	2	8	25436	25443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_006397	AGCA	2	8	26048	26055	50 %	0 %	25 %	25 %	55380098
52	NC_006397	CGTG	2	8	26424	26431	0 %	25 %	50 %	25 %	55380099
53	NC_006397	GCGT	2	8	26445	26452	0 %	25 %	50 %	25 %	55380099
54	NC_006397	GTTC	2	8	26487	26494	0 %	50 %	25 %	25 %	55380099
55	NC_006397	TCGA	2	8	27044	27051	25 %	25 %	25 %	25 %	55380099
56	NC_006397	TTCC	2	8	27604	27611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006397	GACA	2	8	27715	27722	50 %	0 %	25 %	25 %	55380100
58	NC_006397	GCCA	2	8	28309	28316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_006397	CCAA	2	8	28511	28518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_006397	CTGT	2	8	29307	29314	0 %	50 %	25 %	25 %	55380101
61	NC_006397	AGCT	2	8	29389	29396	25 %	25 %	25 %	25 %	55380101
62	NC_006397	CGCT	2	8	29946	29953	0 %	25 %	25 %	50 %	55380101
63	NC_006397	CAGT	2	8	30171	30178	25 %	25 %	25 %	25 %	55380102
64	NC_006397	CGAC	2	8	30368	30375	25 %	0 %	25 %	50 %	55380102
65	NC_006397	CACC	2	8	30537	30544	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_006397	GTCC	2	8	31078	31085	0 %	25 %	25 %	50 %	55380103
67	NC_006397	TGAC	2	8	31302	31309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_006397	CGAG	2	8	31405	31412	25 %	0 %	50 %	25 %	55380104
69	NC_006397	CGGT	2	8	32088	32095	0 %	25 %	50 %	25 %	55380105
70	NC_006397	ACGG	2	8	32177	32184	25 %	0 %	50 %	25 %	55380105
71	NC_006397	GCCG	2	8	32593	32600	0 %	0 %	50 %	50 %	55380105
72	NC_006397	TCGC	2	8	32789	32796	0 %	25 %	25 %	50 %	55380105
73	NC_006397	CGTC	2	8	34270	34277	0 %	25 %	25 %	50 %	55380107
74	NC_006397	TGAG	2	8	34522	34529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006397	TCCG	2	8	34962	34969	0 %	25 %	25 %	50 %	55380108
76	NC_006397	TGAA	2	8	36133	36140	50 %	25 %	25 %	0 %	55380109
77	NC_006397	ACCG	2	8	36860	36867	25 %	0 %	25 %	50 %	55380109
78	NC_006397	TCTG	2	8	37025	37032	0 %	50 %	25 %	25 %	55380109
79	NC_006397	ACTG	2	8	37082	37089	25 %	25 %	25 %	25 %	55380109
80	NC_006397	GCTT	2	8	37210	37217	0 %	50 %	25 %	25 %	55380109
81	NC_006397	GACC	2	8	37279	37286	25 %	0 %	25 %	50 %	55380110
82	NC_006397	CGAA	2	8	37341	37348	50 %	0 %	25 %	25 %	55380110
83	NC_006397	AGCT	2	8	37392	37399	25 %	25 %	25 %	25 %	55380110
84	NC_006397	GGTG	2	8	37809	37816	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006397	CCCG	2	8	38053	38060	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_006397	GCAG	2	8	38138	38145	25 %	0 %	50 %	25 %	55380111
87	NC_006397	CGGC	2	8	38215	38222	0 %	0 %	50 %	50 %	55380111
88	NC_006397	GAGT	2	8	38495	38502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006397	GGTT	2	8	38508	38515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006397	TTCT	2	8	38621	38628	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_006397	AAAT	2	8	39042	39049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006397	TGAG	2	8	39211	39218	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006397	ATTA	2	8	39606	39613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006397	GTAG	2	8	39870	39877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006397	GTCA	2	8	39900	39907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_006397	TCGT	2	8	39915	39922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_006397	AATA	2	8	40556	40563	75 %	25 %	0 %	0 %	55380113
98	NC_006397	TGGT	2	8	41470	41477	0 %	50 %	50 %	0 %	55380114
99	NC_006397	CGAC	2	8	42213	42220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_006397	TCGC	2	8	42602	42609	0 %	25 %	25 %	50 %	55380116
101	NC_006397	GTCA	2	8	42776	42783	25 %	25 %	25 %	25 %	55380116
102	NC_006397	CGAA	2	8	42807	42814	50 %	0 %	25 %	25 %	55380116
103	NC_006397	CGTG	2	8	43532	43539	0 %	25 %	50 %	25 %	55380117
104	NC_006397	GCTG	2	8	45899	45906	0 %	25 %	50 %	25 %	55380121
105	NC_006397	GCTG	2	8	45923	45930	0 %	25 %	50 %	25 %	55380121
106	NC_006397	ACGA	2	8	46418	46425	50 %	0 %	25 %	25 %	55380122
107	NC_006397	CGTT	2	8	46772	46779	0 %	50 %	25 %	25 %	55380123
108	NC_006397	CACG	2	8	46800	46807	25 %	0 %	25 %	50 %	55380123
109	NC_006397	CGCT	2	8	47312	47319	0 %	25 %	25 %	50 %	55380124
110	NC_006397	GGTC	2	8	47351	47358	0 %	25 %	50 %	25 %	55380124
111	NC_006397	TGAA	2	8	47538	47545	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006397	TCGT	2	8	47639	47646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_006397	GCTC	2	8	48325	48332	0 %	25 %	25 %	50 %	55380126
114	NC_006397	GTTT	2	8	48738	48745	0 %	75 %	25 %	0 %	55380126
115	NC_006397	CTTG	2	8	48875	48882	0 %	50 %	25 %	25 %	55380127
116	NC_006397	TCGT	2	8	49329	49336	0 %	50 %	25 %	25 %	55380127
117	NC_006397	CAGA	2	8	49806	49813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_006397	TGTC	2	8	50085	50092	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_006397	GTAA	2	8	50102	50109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006397	GTTC	2	8	50840	50847	0 %	50 %	25 %	25 %	55380128
121	NC_006397	CGGT	2	8	51122	51129	0 %	25 %	50 %	25 %	55380128
122	NC_006397	GATA	2	8	51495	51502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006397	AGAT	2	8	51710	51717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006397	TCCC	2	8	51797	51804	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_006397	CATC	2	8	51906	51913	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_006397	CACT	2	8	51992	51999	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_006397	GACG	2	8	52556	52563	25 %	0 %	50 %	25 %	55380129
128	NC_006397	CAAG	2	8	53266	53273	50 %	0 %	25 %	25 %	55380130
129	NC_006397	GTCG	2	8	53425	53432	0 %	25 %	50 %	25 %	55380130
130	NC_006397	GATT	2	8	55823	55830	25 %	50 %	25 %	0 %	55380131
131	NC_006397	GTCT	2	8	56130	56137	0 %	50 %	25 %	25 %	55380131
132	NC_006397	CGTA	2	8	56361	56368	25 %	25 %	25 %	25 %	55380132
133	NC_006397	CGAC	2	8	56645	56652	25 %	0 %	25 %	50 %	55380132
134	NC_006397	GCCA	2	8	56814	56821	25 %	0 %	25 %	50 %	55380132
135	NC_006397	TACA	2	8	57127	57134	50 %	25 %	0 %	25 %	55380132
136	NC_006397	CGAG	2	8	57535	57542	25 %	0 %	50 %	25 %	55380133
137	NC_006397	CATC	2	8	57625	57632	25 %	25 %	0 %	50 %	55380133
138	NC_006397	TGGA	2	8	57730	57737	25 %	25 %	50 %	0 %	55380134
139	NC_006397	ATTT	2	8	58191	58198	25 %	75 %	0 %	0 %	55380134
140	NC_006397	TGCT	2	8	58674	58681	0 %	50 %	25 %	25 %	55380134
141	NC_006397	GCAG	2	8	58689	58696	25 %	0 %	50 %	25 %	55380134
142	NC_006397	GTCT	2	8	59284	59291	0 %	50 %	25 %	25 %	55380134
143	NC_006397	AACG	2	8	59516	59523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_006397	GCAG	2	8	59755	59762	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_006397	ATTG	2	8	60081	60088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006397	CAGC	2	8	60134	60141	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_006397	GACA	2	8	60785	60792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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