MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 4381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006397	CTG	3	9	40	48	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006397	ACA	2	6	100	105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006397	CGA	2	6	137	142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006397	CAA	2	6	149	154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006397	TGG	2	6	359	364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006397	TGG	2	6	417	422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006397	GCC	2	6	473	478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_006397	CGA	2	6	579	584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006397	TCG	2	6	591	596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006397	CGG	2	6	718	723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_006397	AAC	2	6	808	813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006397	CCA	2	6	828	833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_006397	AGC	2	6	896	901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006397	ACG	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006397	AAC	2	6	954	959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006397	GAC	2	6	1048	1053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006397	TCA	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_006397	GAA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006397	TCC	3	9	1286	1294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_006397	GTA	2	6	1322	1327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006397	TGC	2	6	1386	1391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006397	TAC	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006397	CCG	2	6	1596	1601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_006397	TGT	2	6	1699	1704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006397	CTT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_006397	CGC	2	6	1835	1840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_006397	CCG	2	6	1922	1927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_006397	CAG	2	6	2111	2116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006397	GCT	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006397	GGT	2	6	2287	2292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006397	GCT	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006397	ACC	2	6	2405	2410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_006397	GTT	2	6	2461	2466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006397	CCT	2	6	2469	2474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_006397	CTC	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_006397	CGG	2	6	2606	2611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006397	CGG	2	6	2814	2819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006397	ACT	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006397	TCG	2	6	3239	3244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006397	TGA	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006397	TCC	2	6	3358	3363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_006397	TTC	2	6	3445	3450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006397	TCA	2	6	3496	3501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006397	CCA	2	6	3520	3525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_006397	TAG	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006397	CGT	2	6	3543	3548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006397	TGG	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006397	GTC	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006397	AGT	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006397	GTT	2	6	3889	3894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006397	CAA	2	6	3900	3905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006397	AGG	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006397	TAC	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006397	TCC	2	6	4316	4321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_006397	ACC	2	6	4333	4338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_006397	CGG	2	6	4418	4423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006397	CCT	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_006397	GTC	2	6	4456	4461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006397	TAC	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006397	CTC	2	6	4530	4535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_006397	GGC	2	6	4595	4600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006397	TGG	2	6	4761	4766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006397	AAT	2	6	4918	4923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006397	CGG	2	6	4956	4961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006397	ACC	2	6	4995	5000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_006397	CTG	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006397	TGG	2	6	5169	5174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006397	CCA	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_006397	GCG	2	6	5437	5442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006397	ACT	2	6	5496	5501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006397	CGG	2	6	5539	5544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006397	TGC	2	6	5654	5659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006397	GGT	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006397	AGT	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006397	GGA	2	6	5856	5861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006397	CGA	2	6	5942	5947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006397	TGC	2	6	5985	5990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006397	CGT	2	6	6018	6023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006397	CGG	2	6	6063	6068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006397	ACG	2	6	6178	6183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006397	GAT	2	6	6282	6287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380075
82	NC_006397	GTC	2	6	6352	6357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380075
83	NC_006397	ACG	2	6	6472	6477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006397	TTC	2	6	6489	6494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006397	TCT	2	6	6511	6516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_006397	GCT	2	6	6659	6664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006397	GGT	2	6	6705	6710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006397	GTG	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006397	CTC	2	6	6841	6846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55380076
90	NC_006397	AAT	2	6	6898	6903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55380076
91	NC_006397	GCA	2	6	7136	7141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380076
92	NC_006397	CAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380076
93	NC_006397	GTT	2	6	7410	7415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380076
94	NC_006397	TTC	2	6	7432	7437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380076
95	NC_006397	GTT	2	6	7567	7572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55380076
96	NC_006397	ATC	2	6	7603	7608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380076
97	NC_006397	TCG	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380076
98	NC_006397	GAT	2	6	7636	7641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380076
99	NC_006397	CAG	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380076
100	NC_006397	AGC	2	6	7945	7950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380076
101	NC_006397	CAA	2	6	7980	7985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380076
102	NC_006397	ATC	2	6	7987	7992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380076
103	NC_006397	GTC	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380076
104	NC_006397	GTT	2	6	8097	8102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006397	ACC	2	6	8106	8111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_006397	GGA	2	6	8164	8169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006397	ATT	2	6	8509	8514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006397	AAC	2	6	8547	8552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006397	CGA	2	6	8560	8565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006397	TAA	2	6	8602	8607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006397	GTA	2	6	8626	8631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006397	GTT	2	6	8645	8650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006397	CTA	2	6	8704	8709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006397	CTT	2	6	8749	8754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_006397	TAG	2	6	8777	8782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006397	CTT	2	6	8853	8858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006397	CTC	2	6	8944	8949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_006397	GAA	2	6	9024	9029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006397	GTA	2	6	9218	9223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55380077
120	NC_006397	CTG	2	6	9568	9573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006397	CAC	2	6	9621	9626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_006397	CAA	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006397	AGG	2	6	9883	9888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006397	GCG	2	6	9939	9944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_006397	TAA	2	6	10065	10070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006397	CAT	2	6	10082	10087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_006397	GTA	2	6	10125	10130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006397	TTA	2	6	10150	10155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006397	AAT	2	6	10176	10181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006397	CAA	2	6	10283	10288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006397	CAA	2	6	10296	10301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_006397	CGA	2	6	10380	10385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55380078
133	NC_006397	CAA	2	6	10407	10412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55380078
134	NC_006397	CCG	2	6	10727	10732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55380078
135	NC_006397	GGT	2	6	10741	10746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55380078
136	NC_006397	CCA	2	6	10757	10762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55380078
137	NC_006397	TCT	2	6	10793	10798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55380078
138	NC_006397	ATC	2	6	10823	10828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55380078
139	NC_006397	TCG	2	6	10913	10918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380078
140	NC_006397	CGT	2	6	10942	10947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380078
141	NC_006397	AGG	2	6	11075	11080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55380078
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399	NC_006397	CTG	2	6	29100	29105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55380101
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